我国科学家完成谷子基因组测序

5月14日由深圳华大基因和河北省张家口市农科院等单位完成的谷子基因组研究成果于《自然·生物技术》在线发表。科研人员成功构建了谷子全基因组序列图谱,为揭示谷子抗旱节水、丰产、耐瘠和高光合作用效率等生理机制的研究提供了新的途径,并为高产优质、抗逆谷子新品种的培育奠定了坚实的基础。 谷子是重要的禾本科作物,具有生育期短、单株籽粒多、适应性广、抗旱、耐瘠、采用C4光合途径等特点,是很好的抗旱机理及C4光合系统发育与调控研究的作物。科研人员利用两个不同品系亲本的F2代群体,绘制了高密度的遗传图谱。 谷子和水稻大约在5000万年前开始分化,分化之后的基因组结构仍存在明显的共线性。研究人员发现谷子的2号和9号染色体分别由水稻的7号和9号、3号和10号染色体融合而成。同时,他们发现这两次融合事件也发生在高粱的染色体中,由此,研究人员推测这两次染色体融合事件应该发生在谷子和高粱分化之前。研究人员还发现了谷子独立......阅读全文

利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘进行荧光原位杂交

实验材料SSCD-PBSA糖原RNase多聚甲醛甲酰胺试剂、试剂盒固定液乙醇杂交缓冲液标记探针橡胶乳黏剂封固剂实验步骤含有重复序列探针的沉淀:大分子量黏粒探针往往含有重复序列,如果在杂交前不能封闭这些序列,将导致严重的非特异性杂交背景。人 Cot1 DNA 富含重复序列,可对黏粒的重复序列产生竞争性

破解了香气之谜-蜡梅的染色体水平精细基因组图谱公布

  “一花香十里,更值满枝开。”凌寒怒放的蜡梅,是万花凋零的寒冬里一道亮丽的风景,其香味浓郁而独特,成为历代文人墨客挥笔高歌的对象。蜡梅为何冬季开花?其独特香味由何而来?蜡梅 华中农大供图  近日,华中农业大学刘秀群、赵凯歌研究组和金双侠研究组联合西南林业大学陈龙清研究组,在《基因组生物学》在线发表

Cell:染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展

  近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了

单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法进行荧光原位杂交

            实验材料 SSC D-PBSA 糖原 RNase 多聚甲醛 甲酰胺 试剂、试剂

中国获首个染色体级别橡胶树参考基因组图谱-利于育种

  从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的染色体进化

“半人造”菌株中合成DNA过半,向世界首个合成酵母迈出重要一步

  美英两国研究人员将实验室制造的超过7条合成染色体组合到一个酵母细胞中,产生了一种“半人造”菌株,其合成DNA超过50%。它具有和天然酵母菌株一样的生存和复制能力。该团队现已合成并调试了所有16条酵母染色体,这意味着距离创造出世界上第一个合成酵母基因组,解开生命的基本组成部分又近了一步。研究成果8

东北师范大学PNAS遗传学新文章

  近日来自东北师范大学、威斯康星大学、华盛顿州立大学等机构的研究人员,在新研究中探讨了异源多倍体化对于小麦染色体的影响。相关研究成果发表在2月11日的《美国科学院院刊》上。   来自东北师范大学的刘宝(Bao Liu)教授、威斯康星大学Jiming Jiang教授以及华盛顿州立大学的Diter

太平洋潜泥蛤染色体水平基因组研究获新进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516537.shtm

历时6年-获首个染色体级别的橡胶树参考基因组图谱

  记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的

哺乳动物“共同祖先”基因组重建完成

  从鸭嘴兽到蓝鲸,每一种现代哺乳动物都是生活在大约1.8亿年前的“共同祖先”的后裔。人们对“共同祖先”知之甚少,现在,一个国际研究小组通过计算重建了其基因组。该成果将发表在《美国国家科学院院刊》上,对理解哺乳动物的进化和保护工作具有重要意义。  研究人员利用了来自32个活物种的高质量基因组序列,这

解析四倍体攸茶(Camellia-meiocarpa-Hu)单倍型基因组

在植物的奇妙世界里,油茶作为重要的木本食用油料植物,有着超 2300 年的栽培历史,其用途广泛,在全球粮食危机的大背景下愈发受到关注。攸茶(Camellia meiocarpa Hu)是其中一员,它叶茂花大果丰,极具农业利用潜力。然而,四倍体攸茶的染色体水平基因组数据匮乏,且多倍体油茶物种高质量基因

科学家首次改造了真核生物超过50%的DNA

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511977.shtm11月8日,合成酵母基因组计划(Sc2.0)的研究人员在《细胞》和《细胞基因组学》上发表了3篇研究,表示制造出了一种基因组中超过50%的DNA序列均是人工合成的酿酒酵母菌株。标准酿酒

PNAS最新介绍测序组装染色体技术

  你有没有试过在不知道最终图案的情况下玩拼图游戏?这正是一些基因组研究人员在尝试通过新一代DNA测序数据,拼接成染色体时所面临的同样问题。这些染色体能提供基因组组织和结构变异方面的信息,有助于解析进化历史。为了能拼凑出这些染色体来,科学家们可以通过物理或者遗传图谱完成,但是对于许多物种而言,这种指

破译农业害虫粘虫染色体级基因组密码:为害虫防治策略升级提供关键助力

研究背景在广袤的农田里,有一种害虫正悄无声息地威胁着农作物的生长,它就是粘虫(Mythimna separata)。粘虫堪称农业界的 “破坏大王”,凭借着强大的迁飞能力和不挑食的习性,所到之处,水稻、玉米、小麦等众多农作物都难逃厄运。在亚洲和澳大利亚的大片农田中,常常能看到它肆虐的身影,给农业生产带

天津大学元英进团队首实现对人造环形染色体基因组重排

   天津大学合成生物学元英进教授团队首次将自主设计合成的5号酿酒酵母环形染色体进行基因组重排,为探索环形染色体结构变异和功能提供了新的研究思路和模型。17日,在最新一期上线的国际学术期刊《自然·通讯》上刊载了这一名为《环形5号染色体基因组重排》的论文。图片来源于网络染色体结构变异对生物性状多样性具

用血浆游离DNA全基因组测序对胎儿染色体异常的产前筛查

  利用孕妇血浆游离DNA检测胎儿常见染色体非整倍体(21三体、18三体、13三体)的无创产前筛查具有较高的灵敏度和特异性,已经在临床检测中普遍应用。然而,在产前诊断发现的胎儿染色体异常中,21三体、18三体、13三体等常见的染色体非整倍体只是一部分,另外还存在一些相对罕见的胎儿染色体异常。例如,研

揭示麂属动物染色体融合的分子机制及基因组三维构象

  麂属动物是鲸偶蹄目、反刍亚目、鹿科、麂亚科下的一类哺乳动物,属内各物种间差异巨大的染色体数目而受到生物学家关注,是研究哺乳动物成种机制和染色体演化的优异模型。小麂、黑麂是我国特有的物种,黑麂和贡山麂是我国重点保护野生动物。黑麂和贡山麂都有8条(雌性)和9条(雄性)染色体,它们的核型却不相同,而小

研究发布首个高质量染色体水平的哀牢髭蟾参考基因组

  哀牢髭蟾(Vibrissaphora ailaonica)[Amphibiaweb(2019),Frost(2019)和中国两栖类(2019)将其归为Leptobrachium ailaonicum的同物异名] 俗称“胡子蛙”、“深山角怪”,属两栖纲、无尾目、角蟾科,是中国特有种。该物种具有多个

一个高质量的黄连染色体规模的基因组组装和注释

  黄连 (Coptis chinensis Franch.) 是毛茛科的一员,代表了一个重要的早期分叉双子叶植物谱系,具有多种药用价值。  2021年6月2日,湖北省食品药品监督检验研究院聂晶,华中农业大学王学奎,中国中医科学院陈士林及湖北中医药大学Liu Yifei(湖北中医药大学为第一单位)共

四篇Science文章公布最新基因组序列

  小麦是全球最重要的粮食作物之一,提供了20%人类所需的热量。2010年英国科学家宣布他们绘制出了小麦基因组草图,但这一序列并不完整。在7月17日Science杂志上,两个研究组分别公布了Chinese Spring小麦品种的每个染色体臂的基因组序列,以及小麦染色体3B基因组序列,另外两个研究小组

Y染色体的染色体结构

Y染色体(Y chromosome)是决定生物个体性别的性染色体的一种。男性的一对性染色体是一条x染色体和一条较小的y染色体。在雄性是异质型的性决定的生物中,雄性所具有的而雌性所没有的那条性染色体叫Y染色体。由于Y染色体传男不传女的特性,因此在Y染色体上留下了基因的族谱,Y-DNA分析现在已应用于家

x染色体的染色体结构

研究确认了X染色体上有1098个蛋白质编码基因,有趣的是,这1098个基因中只有54个在对应的Y染色体上有相应功能的等位基因,而且Y染色体比X染色体小得多。在2003年6月完成的详细分析研究报告中指出Y染色体上仅有大约78个基因,Y染色体甚至被戏称为X染色体的“错误版本”。X染色体中大约有10%的基

首个韩国人基因组图谱绘制成功

据韩国联合通讯报道,韩国研究机构日前宣布,第一个完整的韩国人基因组图谱已经绘制成功。 报道指出,这是人类染色体碱基序列第四次被完整破译,这项成果是由韩国嘉泉医科大学和韩国生命工程研究院的两个研究团队通过共同研究取得的。研究人员宣布,分析测序中使用的基因物质来自于嘉泉医科大学教授金圣镇。 研究的目的是

“自私超基因”严重破坏遗传多样性

美国罗切斯特大学的生物学家首次使用群体基因组学来阐明一种被称为分离变相因子(SD)的“自私遗传元素”的进化和后果。发表在《eLife》杂志上的论文表明,SD已导致染色体组织和遗传多样性发生了巨大变化。 人类基因组中充斥着“自私”的遗传元素,这些元素似乎对宿主没有好处,而只是寻求自我繁殖。 研

我国科学家完成谷子基因组测序

  5月14日由深圳华大基因和河北省张家口市农科院等单位完成的谷子基因组研究成果于《自然·生物技术》在线发表。科研人员成功构建了谷子全基因组序列图谱,为揭示谷子抗旱节水、丰产、耐瘠和高光合作用效率等生理机制的研究提供了新的途径,并为高产优质、抗逆谷子新品种的培育奠定了坚实的基础。

Y染色体完整测序揭开,有望破解遗传、疾病难题

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507590.shtm 图片来源:N.哈纳切克/美国国家标准与技术研究院8月23日,两篇发表在《自然》杂志的论文宣告:科学家组装了人类Y染色体的第一个完整序列,补齐了人类基因组这部“生命天书”。多年

测序“垃圾”数据变身宝藏

  基因组测序中曾经被视为是垃圾的数据,现在能够用来为人们提供重要的疾病线索。St. Jude儿童研究医院——华盛顿大学儿童癌症基因组项目的研究人员独辟蹊径,在染色体末端DNA重复片段的测序数据中,挖掘到了宝贵的癌症信息。   染色体末端的DNA重复片段被称为端粒,此前这种重复片段往往在二代测

专家:基因编辑疗法并非绝对安全

以色列一项新研究发现,已用于治疗癌症等疾病的CRISPR基因编辑技术虽然非常有效,但并非绝对安全,该技术可能导致遗传物质损失,进而影响基因组稳定性,长远来看甚至可能致癌。研究人员建议在使用CRISPR基因编辑疗法时应注意安全隐患。  CRISPR是一种用于编辑DNA(脱氧核糖核酸)的开创性技术,可通

中国学者参与发表Science里程碑式研究成果

  当遗传学家Ronald Davis十年前建议他的同事尝试构建一个人工酵母染色体,并将其整合进活细胞中的时候,Jef Boeke其实并没有特别在意,然而时隔多年,Boeke终于完成了这一构想,合成了第一个酵母功能性染色体,这是合成生物学领域的一项里程碑式成果。   研究人员在3月27日Sci

Nature:-原来X染色体不是X形

科学家们利用一种新方法显像染色体,绘制出了更真实的染色体形状图片   日前,来自英国剑桥巴布拉汉研究所(Babraham Institute)等机构的研究人员构建出了漂亮的染色体 3D 模型,这些模型更准确地显示出了染色体的复杂形状以及 DNA 在其中折叠的方式。结果表明,我们通常用来描述染色