我国科学家完成谷子基因组测序
5月14日由深圳华大基因和河北省张家口市农科院等单位完成的谷子基因组研究成果于《自然·生物技术》在线发表。科研人员成功构建了谷子全基因组序列图谱，为揭示谷子抗旱节水、丰产、耐瘠和高光合作用效率等生理机制的研究提供了新的途径，并为高产优质、抗逆谷子新品种的培育奠定了坚实的基础。 谷子是重要的禾本科作物，具有生育期短、单株籽粒多、适应性广、抗旱、耐瘠、采用C4光合途径等特点，是很好的抗旱机理及C4光合系统发育与调控研究的作物。科研人员利用两个不同品系亲本的F2代群体，绘制了高密度的遗传图谱。 谷子和水稻大约在5000万年前开始分化，分化之后的基因组结构仍存在明显的共线性。研究人员发现谷子的2号和9号染色体分别由水稻的7号和9号、3号和10号染色体融合而成。同时，他们发现这两次融合事件也发生在高粱的染色体中，由此，研究人员推测这两次染色体融合事件应该发生在谷子和高粱分化之前。研究人员还发现了谷子独立......阅读全文
空间构象揭示基因组的奥秘
基因组测序项目为人们提供了丰富的信息，让人们可以解析基因表达的调控序列，研究不同基因序列对疾病的影响。不过除了基因组序列之外，还存在着一个关键元素，即基因组的空间构象。空间构象一直被视为基因表达的重要调控因素，在基因组中调控元件往往并不再目标基因附近，近年来科学家们开始借助新兴技术研究远距离染色
章鱼有已知最古老的性染色体
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518457.shtm研究人员在动物身上发现了已知最古老的性染色体——章鱼Z染色体，它最早在大约3.8亿年前的章鱼祖先上进化而来。这一发现回答了一个长期存在的问题，即鱿鱼和章鱼等海洋生物是如何进行性发育的。
章鱼有已知最古老的性染色体
研究人员在动物身上发现了已知最古老的性染色体——章鱼Z染色体，它最早在大约3.8亿年前的章鱼祖先上进化而来。这一发现回答了一个长期存在的问题，即鱿鱼和章鱼等海洋生物是如何进行性发育的。相关成果2月29日公布于bioRxiv。加利福尼亚双斑章鱼“我们偶然发现了可能是迄今为止已知最古老的动物性染色体。”
没有Dna2，基因就会“乱蹦乱跳”
贝勒医学院等机构的研究人员在《Nature》发表的一项研究显示，缺失Dna2后，小DNA片段就会从整个基因组中跳跃到染色体断裂处。这种新机制可以解释癌症或抗体多样化过程出现的类似事件。 “我们实验室的兴趣之一是了解DNA复制的基本机制，”文章通讯作者、分子和人类遗传学副教授Greg Ira说。
科学家首次成功合成酵母染色体
由美、英、法等多国研究人员组成的科研小组27日宣布，他们成功合成了第一条能正常工作的酵母染色体。这一成果被誉为攀上了合成生物学的新高峰，也是向合成人造微生物等生命体迈出的一大步。 研究人员在新一期《科学》杂志上报告说，他们利用计算机辅助设计技术，历时7年成功构造了源于酿酒酵母的被称作ｓｙｎ
非人灵长类动物完整性染色体序列首次发布
由美国宾夕法尼亚州立大学、国家人类基因组研究所和华盛顿大学的研究人员领导的一个国际合作团队，为5种灵长类动物和一种与人类关系较远的灵长类动物的性染色体新生成了完整的“端粒到端粒”参考基因组，凸显了非人灵长类动物物种中雄性Y染色体特异性的极快变化。相关论文5月29日发表于《自然》。这一发现揭示了性染色
Cancer－Cell：不破不立，癌症与染色体异常
健康的基因组包括23对染色体，这个结构上发生甚至一点小变化，如单一染色体额外拷贝都能导致严重的体格缺陷。所以，染色体结构是导致癌症发生的一个促进因素，这并不奇怪。 近期研究人员发现异常染色体的形成源自于染色体自发的灾难性“爆炸”。那些破碎的残骸随机装配在一起，并且发生了疯狂的扩增和删除。癌症发
科学家成功模拟漫长演化的染色体重排事件
近日，中科院院士、中科院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）研究员李劲松研究组开发出基于类精子干细胞技术的小鼠染色体改造研究系统。利用该技术，可以建立染色体融合小鼠品系，成功模拟了自然界中经由漫长时间演化才会发生的染色体重排事件，为实现哺乳动物的染色体重排改造迈出关键一步。9月21
PacBio发布目前最连续的二倍体人类基因组组装
图片来源于网络 Pacific Biosciences公司本周一宣布，它已经产生了到目前为止最连续的单个人二倍体人类基因组组装，表示遗传自父母双方的46条染色体的DNA序列近乎完整。 此次使用的样本来自一名波多黎各的女性，她参与了之前的群体遗传学研究，如千人基因组计划。基因组测序在PacBio的
Science医学：捕捉癌症的蛛丝马迹
约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家们在一项测试中将血液癌症DNA检测与基因组测序技术结合到一起，证实其可用于筛查癌症，监控癌症患者复发，以及寻找手术后的残留癌。 “这种方法利用了基因组测序能够检测血液中循环肿瘤DNA的能力,为我们提供了一种敏感的途径来检测和监控癌症，”约翰霍普金
Nature解析基因组的水平转移
在自然界中，两种不同的植物偶尔会发生杂交。这可能会引发一些问题，因为父本和母本的遗传信息并不相配。不过这个问题很容易解决。 只要亲本植物将完整的遗传信息传递给下一代（而不是一半），这样染色体就能够在减数分裂中正确配对，减数分裂是生殖细胞的形成途径。在这种情况下，杂交形成的植物仍有繁殖能力，并形成
科学家成功绘制－首幅小麦基因组物理图谱
一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱，这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传
Nature子刊解码中国仓鼠基因组
在Alfred Pühler教授的领导下，来自比勒菲尔德大学生物技术中心(CeBiTec)的基因组研究人员，成功地对中国仓鼠(Chinese hamster)的基因组进行了测序。研究人员现将他们的结果发表了在国际期刊《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。
我国获得国际首个染色体级别的橡胶树GT1参考基因组图谱
记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉，由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队，历经6年，利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术，在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列，并揭示大戟植物基因组的
佘群新：真核生物3D基因组揭示更高级的染色体结构
iNature 2019年9月19号，山东大学生物技术研究院佘群新团队在Cell发表了题为Crenarchaeal 3D Genome: A Prototypical Chromosome Architecture for Eukaryotes的评论性文章。在本期Cell中，Takemata等
昆明动物所首个高质量染色体水平的哀牢髭蟾参考基因组
哀牢髭蟾（Vibrissaphora ailaonica）[Amphibiaweb（2019），Frost（2019）和中国两栖类（2019）将其归为Leptobrachium ailaonicum的同物异名] 俗称“胡子蛙”、“深山角怪”，属两栖纲、无尾目、角蟾科，是中国特有种。该物种具有多个
科学家获取染色体级别的高质量橡胶树参考基因组图谱。
橡胶树（Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Muell. Arg. ）是大戟科（Euphorbiaceae）植物。在植物界大约2,500种产胶植物中（如杜仲Eucommia ulmoides Oliver和橡胶草 Taraxacum kok-sagh
中国学者Nature子刊：清冽梅花香
对于梅花(Prunus mume)，中国人寄托了太多的情感，这一早在三千多年前就已经被驯化的植物光是诗词绝句，就可以上万来计算，更别说“梅须逊雪三分白，雪却输梅一段香” 这样的名家名句了。12月27日Nature Communications杂志公布了由北京林业大学，深圳华大基因等处
中山大学贺雄雷PNAS新文章
中山大学生命科学学院贺雄雷教授带领的研究小组日前在国际顶尖学术期刊PNAS上发表论文证实在进化过程中哺乳动物X染色体基因表达减少，从而驳斥了Ohno提出的性染色体与常染色体间的剂量补偿假说。 性别的产生是生物进化的重要事件。哺乳动物的性别是由性染色体决定，因此关于性染色体的起源与演化是生物
6388例临床样本证实，NIPT可延伸至常见三体之外的检测
由于NIPT筛查罕见非整倍体和罕见疾病等的灵敏度较低，其检测范围的扩张一直存在争议，然而，6月30日发表在Nature子刊《Genetics in Medicine》中的研究提供证据表明，NIPT扩大检测范围具有实际意义。在这项新研究中，瑞士研究人员已将NIPT扩展至目前多数NIPT筛查无法达到
《Nature－Biotechnology》CRISPR疗法可能损害基因组的新证据
研究人员解释说，CRISPR是一项用于编辑DNA的突破性技术——在特定位置切割DNA序列，以删除不需要的片段，或交替修复或插入有益的片段。这项技术在大约10年前开发出来，已经被证明在治疗一系列疾病方面非常有效——癌症、肝病、遗传综合征等等。首次批准使用CRISPR的临床试验于2020年在宾夕法尼亚大
测序先锋Craig－Venter完整测定自身基因组
基因遗传密码比之前预想的复杂的多 科学网 备受争议的基因组研究先锋Craig Venter又有新动作！他的研究小组详细地测定了他自己的基因组序列，使得人们能够观测单个基因组中基因的变化。初步分析报告发表在最新一期的《PLoS生物学》上。 此次研究的领导者、美国J. Craig Venter研究所
中外科学家成功解析西瓜基因组助力新品种培育及遗传改良
2012年11月26日，由北京市农林科学院、深圳华大基因研究院和康奈尔大学等多家单位合作完成的西瓜基因组相关研究成果在《自然•遗传学》(Nature Genetics)杂志发表。这项研究为西瓜基础生物学研究及其种质资源培育、抗病及遗传改良提供了宝贵资源，同时，也为葫芦科植物的进化和比较基因组
中外科学家成功解析西瓜基因组
2012年11月26日，由北京市农林科学院、深圳华大基因研究院和康奈尔大学等多家单位合作完成的西瓜基因组相关研究成果在《自然•遗传学》(Nature Genetics)杂志发表。这项研究为西瓜基础生物学研究及其种质资源培育、抗病及遗传改良提供了宝贵资源，同时，也为葫芦科植物的进化和比较基因组
科学家绘制出首幅小麦基因组物理图谱
《科学》：有助于培育出更高产和抗旱的小麦新品种 一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱，这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的DNA分子进行
研究发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构
近日，纪念斯隆?凯特林癌症中心等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，发现染色体外环状DNA驱动神
Nature子刊：癌症治疗是否有效，这14个基因来决定
一项新研究发现了14个基因可以预测患者对肿瘤治疗的反应，尤其是对化疗和放射治疗的反应，相关研究结果于近日发表在《Nature Communications》。这些生物标志物的发现有助于临床医生为患者量身定制治疗方案，还能帮助患者避免接受可能导致不良影响的治疗方法。 染色体不稳定性，给科学家带来
Chem－Soc－Rev综述酿酒酵母染色体人工合成的技术和方法
DNA测序技术的迅猛发展，使得我们可以比以往任何时候都更加方便地“阅读”生物体的遗传编码序列，但是很多复杂生命信息很难单纯通过DNA测序获知，如果能够人工合成染色体，实现DNA认知从“阅读时代”到“书写时代”的转变，将有助于对复杂生命现象的理解。近日Chem Soc Rev杂志刊登了天津大学元英
中国学者证实测序在诊断中的作用
华大基因、香港中文大学以及南京医科大学附属南京妇幼保健院等机构的研究人员近日在《Genetics in Medicine》期刊上发表论文称，低覆盖度的全基因组测序也许能替代染色体芯片，来寻找临床相关的拷贝数变异。 人们通常利用比较基因组杂交芯片和SNP芯片来寻找疾病背后的致病CNV，如DiGe
古代染色体数字化重建揭示哺乳动物进化
人类有46条染色体，狗有78条，而一种位于南美洲的被称为红兔鼠的小型啮齿类动物，拥有惊人的104条染色体。数十年来，遗传学家们一直对染色体在哺乳类动物之间展现出的多样性感到惊讶，现在他们有可能弄清楚这些差异是如何发生的。 目前，一项针对所有胎盘类哺乳动物祖先的染色体数字重组研究，揭示了这些紧凑