“非编码RNA在重大生物学过程中的功能和机制”
会议现场 6月5日至7日，主题为“非编码RNA在重大生物学过程中的功能和机制”的香山科学会议第426次学术研讨会在北京召开，会议邀请了多学科跨领域的专家学者与会，中心议题为非编码RNA系统发现、功能鉴定及进化；非编码 RNA与细胞分化发育与功能调控；非编码RNA与重大疾病；非编码RNA生成、加工与作用机理。来自中国科学院生物物理研究所、中国科技大学、中国科学院上海生命科学院、中国医科院、清华大学、北京大学、中山大学、美国加州大学圣地亚哥分校、中国科学院动物研究所、复旦大学、解放军总医院、南京大学、美国杜克大学等的52名人员参加了本次会议。 上午9：00，香山科学会议组委会副主任杨炳忻教授致欢迎词并介绍了香山会议的发展历史以及会议期间发言讨论需要注意的问题，并预祝本次会议取得圆满成功。 之后，本次会议执行主席施蕴渝教授讲话，表示会议从筹备开始就得到相关领域专家的热烈响应，纷纷对本次会议主题表示出强烈......阅读全文
连接非编码突变和肿瘤基因表达的转录组全网络
肿瘤基因组中充满了非编码突变，这些突变对肿瘤的影响研究还不是很清晰。加州大学圣地亚戈分校的科学家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez，Trey Ideker，在最近国际顶级期刊Nature Genetics发表文章 A global transcriptiona
非编码序列内含子子长度多度性((ILPs)
实验概要本实验中运用Perl脚本用于比较Nipponbare和93-11基因组序列，从而开发潜在的ILP标记，通过EPIC-PCR开发候选ILP标记，最后用实验验证及评价了ILP标记。实验步骤1. 水稻釉粳亚种基因组比较搜索ILP我们运用Perl脚本用于比较Nipponbare和93-11基因组序列
中国科大在动物长链非编码RNA研究中取得进展
中国科学技术大学生命科学学院非编码RNA功能及功能机理研究团队近日在国际期刊《基因组生物学》（Genome Biology）发表了题为Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章，报道了
曹雪涛团队再发Nature——揭示新型非编码RNA调控网络
先天性免疫反应可保护宿主免受病原体感染，并向病原体施加进化压力，以减弱这些反应并确保其存活和复制的策略。这些不断变化的压力导致了跨宿主-病原体相互作用的先天性免疫稳态的复杂机制，但尚未得到全面了解。尤其是，更好地了解控制宿主与病原体相互作用并促进入侵病原体清除或逃逸的调节剂，可以确定传染病和慢性
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
仅需1个长非编码RNA变化足以逆转细胞衰老
随着时间推移，细胞慢慢老化，许多疾病发病都跟细胞衰老有关。诱导细胞再生是对抗细胞衰老相关疾病的核心策略之一。然而，老化细胞往往高度抵抗任何旨在诱导再生的操作。（老年成纤维细胞重编程效果低下） 虽然众所周知RNA负责细胞内蛋白质合成，但是一类被称为非编码RNA的特殊分子从来不会被转化为蛋白质，事
基因组所发表长非编码RNA分类问题综述文章
近日，中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的“百人计划”研究员章张及其团队，与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology)开展科研合作，对长非编码RNA的分类问题进行了系统综述，相关论文在RN
中科院Nature子刊发表非编码RNA研究重要发现
来自中科院动物研究所生物膜与膜生物功能国家重点实验室的研究人员在新研究中证实，CARL lncRNA通过破坏miR-539依赖性的PHB2下调，抑制了心肌细胞中缺氧诱导的线粒体分裂和凋亡。 领导这一研究的是中科院动物研究所细胞增殖与信号调控研究组组长李培峰(Pei-Feng Li)
研究发现空气污染诱发肺癌关键长链非编码RNA
中科院动物所周光飚研究组通过深入研究，发现了空气污染诱发肺癌的关键长链非编码RNA。相关成果日前发表于肿瘤学杂志Oncotarge。 据了解，肺癌已成为全球发病率最高、致死人数最多的癌症，其中90%的肺癌由吸烟、空气污染等环境因素引起。然而，空气污染诱发肺癌的分子机制目前尚不清楚。 此前研究
“非编码RNA调控作用”重大研究计划2015项目指南
国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2015年度项目指南，请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事项申报。 附件：“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2015年度项目指南 国家自然科学基金委员会
长链非编码RNA对脑生长起重要作用
“长非编码RNA通常被描述为‘基因组的暗物质’。在这里，我们系统地研究了它们对大脑发育、长期记忆储存、衰老和痴呆导致的记忆力下降的分子机制，”Puthanveettil说。 RNA是细胞的主要调节因子，是读取、转录和调节DNA表达以及构建蛋白质的小型核苷酸链，虽然科学家们已经掌握了脑细胞之间如
从心脏病到癌症——长非编码RNA到底发挥了什么作用？
直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA，非编码RNA不能翻译为蛋白质，但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一，她最近获得了欧洲研究委员会（ERC）的ERC高级研究员资助，这使她能够对另一群非编码
非编码MiRNA双重调控作用的全新分子机制研究获系列进展
根据印尼肥料生产协会（APPI）公布的数据，今年前四个月印尼农业生产共消耗化学肥料310万吨。其中，尿素消耗量最大，达130万吨,氮磷钾肥料（NPK）次之，达110万吨，而同期有机肥使用量仅22万吨。 印尼科学院研究人员表示，土壤需要源源不断的有机物质来提供碳资源，如果土壤失去了碳，肥力将会降
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得成果
12月4日，中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果，在线发表在eLife上。LAST调控CCND1 mRNA稳定性的示意图 细胞生长依赖于精确的细胞周期调控，一旦该体系中的某一环节出现问题，就有可能导致肿瘤的发生。细胞一旦通过G1/S检查点，只能进行分裂，G1/S期的转换点是细胞周期进程中的
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得成果
12月4日，中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果，以LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA stability in human cells为题，在线发表在e
新发现！非编码DNA突变也可引发癌症－|－Nature子刊
基因与癌症的关系远比人类已了解的更加复杂。近日，美国科学家在一项新研究中鉴定出了近200个在不同的癌症中发挥作用的非编码DNA突变。 image.png 图片来源：Nature Genetics（doi:10.1038/s41588-018-0091-2） 在人类基因组中，有9
上海生科院总结多种基因内部来源的非编码RNA生成机制
10月1日，中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所研究员杨力受邀在WIREs RNA 发表了题为Splicing noncoding RNAs from the inside out 的综述论文，系统总结了多种来自于前体RNA内部序列的非编码RNA分子及其产生机制和潜在功能作用。 真核基
科研人员开发内源基因非编码区定向进化新技术
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517501.shtm近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队开发了核酸酶LbCas12a介导的内源基因非编码区定向进化技术。相关研究成果发表在《植物通讯 (Plant Comm
第二军医大学Hepatology解析癌症与非编码RNA
来自第二军医大学的研究人员发现，一种癌胚胎非编码RNA通过稳定NOP2促进了肝癌细胞增殖以及获得干细胞样特性。这项研究已被在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology（最新影响因子12.003）接受并在线发布。 第二军医大学的孙树汉（Shu-Han Sun）教授、李文（Wen Li）副教授以及李
华人学者Cancer－Cell：首张人类癌症非编码RNA综合图谱
随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加，从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因（占总数的不到2%），而70%的基因组被转录为非编码RNA。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发
新发现！非编码DNA突变也可引发癌症－|－Nature子刊
基因与癌症的关系远比人类已了解的更加复杂。近日，美国科学家在一项新研究中鉴定出了近200个在不同的癌症中发挥作用的非编码DNA突变。 图片来源：Nature Genetics（doi:10.1038/s41588-018-0091-2） 在人类基因组中，有98%的信息是看似无用的“垃
李培峰教授Cell、Nature子刊非编码RNA研究重要发现
青岛大学转化医学研究院院长李培峰（Pei-Feng Li）教授曾在国际上首先提出“抗氧化酶自身被氧化”的新理论，是国际上少数几个最早将细胞凋亡引入心血管研究的科学家之一。近日李培峰教授领导的研究小组连接在非编码RNA研究领域取得重要研究发现，相关论文发表在《分子细胞》（Molecular Cel
Science发布涵盖19种癌症类型的体细胞非编码突变图谱
2022年4月26日获悉，哈佛医学院研究团队在《Science》杂志上发表了文章。研究团队开发了一种全基因组检测方法，能够在整个癌症基因组中识别点突变、小片段插入和缺失等体细胞突变事件，但不包括其在基因组中的位置或对蛋白质编码序列的影响。基于该策略，研究团队建立了包括19种癌症类型的3949名患者全
陈润生院士：长非编码核糖核酸需更多关注
核糖核酸(RNA)是一类重要的遗传物质，经编码转录成蛋白质则是它的重要功能之一。不过，研究发现，非编码RNA占人类基因组转录产物的90%以上。由于不参与编码，这类RNA曾被认为是人类基因组的“暗物质”或者“垃圾”。 近年来，大量新研究成果表明非编码RNA是许多生命过程中富有活力的参与者。2
非编码RNA结合肌细胞增强因子2D调控肌肉发育
近日，农科院特产研究所李光玉研究员带领的研究团队发现了一个新的在肌肉发育过程中发挥重要功能的长非编码RNA，该非编码RNA-Irm通过直接结合肌细胞增强因子2D来调节肌源性基因的转录，进而调节肌生成。该研究结果为动物肌肉生长发育研究提供了新的调节因子和表观调控机制，对深入解析肌肉生长发育的分子调
基因组密码被解锁：深度学习模型破解非编码区奥秘
人类基因组中超98%的遗传变异位于非编码区，这些变异通过调控染色质可及性、三维构象、剪接加工等多种分子机制影响基因表达，最终导致疾病发生。由于调控机制的复杂性和细胞类型特异性，目前解读非编码变异的分子效应仍是重大挑战。现有深度学习模型在预测功能基因组特征时，往往在输入序列长度与预测分辨率之间难以兼顾
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得新成果
12月4日，中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果，以LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA stability in human cells为题，在线发表在e
微生物所揭示CMV非编码卫星RNA的起源和发生
烟草植物感染黄瓜花叶病毒（Cucumber mosaic virus，CMV）以后，随着连续继代和病毒感染，一个长链非编码RNA（long non-coding RNA）神奇地出现并被称为CMV卫星RNA（satellite RNA，satRNA）。satRNA因能够利用CMV编码的复制酶进行复
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs, lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27
科学家通过多种方法探究长链非编码RNA
直到今天，针对lncRNA的简洁且合理的分类系统仍遥不可及。长链非编码RNA的概念模型 2013年，一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系，并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一，但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是，其中有1