使用谱库检索时应注意的问题

为了使检索结果正确,在使用谱库检索时应注意以下几个问题。①质谱库中的标准质谱图都是在电子轰击电离源中,用70eV电子束轰击得到的,所以被检索的质谱图也必须是在电子轰击电离源中,用70eV电子束轰击得到的,否则检索结果是不可靠的。②质谱谱库中标准质谱图都是用纯化合物得到的,所以被检索的质谱图也应该是纯化合物的。本底的干扰往往使被检索的质谱图发生畸变,所以扣除本底的干扰对检索的正确与否十分重要。现在的质谱数据系统都带有本底扣除功能,重要的是如何确定(即选择)本底,这就要靠实践经验。在GC-MS分析中,有时要扣除色谱峰一侧的本底,有时要扣除峰两侧的本底。本底扣除时扣除的都是某一段本底的平均值,选择这一段的长短及位置也是凭经验决定。③在总离子流图中选择哪次扫描的质谱图进行检索,对检索结果的影响也很重要。当总离子流的峰很强时,选择峰顶的扫描进行检索,可能由于峰顶时进入离子源的样品量太大,在离子源内发生分子-离子反应,使质谱图发生畸变,得不......阅读全文

质谱谱库检索si-rsi什么意思

SI是用化合物的MS谱图与谱图库中的标准谱图比较得到的相似度。RSI则是用标准谱图与化合物反相比较得到的相似度。

使用谱库检索时应注意的问题

为了使检索结果正确,在使用谱库检索时应注意以下几个问题。①质谱库中的标准质谱图都是在电子轰击电离源中,用70eV电子束轰击得到的,所以被检索的质谱图也必须是在电子轰击电离源中,用70eV电子束轰击得到的,否则检索结果是不可靠的。②质谱谱库中标准质谱图都是用纯化合物得到的,所以被检索的质谱图也应该是纯

红外教学篇之谱库的建立与检索

  由于有机物绝大部分在中红外区 (波长为 4000~400cm-1)都有明显吸收峰 ,因此红外光谱是鉴别有机物的常用方法之一。在药企中,通常应用红外光谱法进行定性分析,采用已知标准样品对照法,即在完全相同的条件下,分别测试出样品图谱以及对照品图谱,然后通过肉眼比对的方法进行对比,此法人为误差较大。

红外教学篇之谱库的建立与检索

由于有机物绝大部分在中红外区 (波长为 4000~400cm-1)都有明显吸收峰 ,因此红外光谱是鉴别有机物的常用方法之一。在药企中,通常应用红外光谱法进行定性分析,采用已知标准样品对照法,即在完全相同的条件下,分别测试出样品图谱以及对照品图谱,然后通过肉眼比对的方法进行对比,此法人为误差较大。因此

AB-SCIEX与GeneBio合作提高质谱库互动检索能力

SmileMS软件增强了 LC/MS/MS 系统对小分子的识别能力   生命科学分析技术的全球领先者——AB Sciex公司与Geneva Bioinformatics (GeneBio) SA 公司在今天宣布,他们将联手开发解决方案,以提高科学家快速筛选大量分子的能力。GeneBio公

特种兵式检测:MRM谱模式结合库检索,让兽药残留无所遁形

导读以上情况,您的实验室有遇到过吗?的确,针对动物性食品中兽药残留量的检测,液相色谱串联质谱的多反应监测模式(MRM)是大家一贯使用的方法,它灵敏度高,检测结果准确,但是假阳性的情况也并不能完全避免。为避免假阳性,MRM谱模式结合库搜索应运而生。在做兽药残留检测时,除了具有MRM常规方法效率高、成本

我农业工程领域期刊首被世界权威检索数据库SCI收录

  记者1月7日获悉,由王应宽博士主编的开放存取(OA)国际英文刊International Journal of Agricultural and Biological Engineering(IJABE)已正式入选汤姆森路透的相关产品和服务,并被世界权威检索数据库《科学引文索引》(SCI)等收录

上海应物所生物医学图像数据库检索研究取得重要进展

  近日,中国科学院上海应用物理研究所李勇平研究组在医学图像检索方面的文章Bag-of-Features Based Medical Image Retrieval via Multiple Assignment and Visual Words Weighting (doi: 10.110

肽质量检索实验

基本方案 其他方案             实验方法原理 实验材料 蛋白样品

肽质量检索实验

实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被

核酸序列的检索实验

实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法;熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义;了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义;熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存;实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1.  使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608

从Internet检索色谱科学信息

Internet是一个国际性的计算机网络系统,利用Internet可在全球范围内迅速方便地实现信息数据共享、数据传输、信息管理和查寻等。1 Internet资源指南Internet上可提供的色谱资料极为丰富,要进行检索,首先要了解其上有哪些主题及服务形式以及它们的网址,这些内容可由网上的搜索引擎(s

植物分类检索表的应用

植物分类检索表是鉴定植物的工具。检索表的编制是根据法国人拉马克(Lamardk)的二歧分类原则,把原来的一群植物选用明显而相关的形态特征分成相对应的两个分支,再把每个分支中的分类群再用相对的性状分成相对应的两个分支,依次下去,直到将所有分类群分开为止。为了便于使用,各分支按其出现的先后顺序,前边加上

CAS号检索注意事项

在搜索框中,可以看到支持CAS号、名称、化学式三种查询方式,当输入什么类型的字符窜为判定输入的是CAS号,并按照字符CAS好方式进行检索!可以参看如下例子。第一、什么也不输入或者只输入空格:将会随机按照CAS号中的头三位数字作为关键词进行检索。第二、输入一个错误的CAS号,如:0000050-0、

GCMS定性分析

目前,色质联用仪数据库中,一般贮存有近30万个化合物标准质谱图。因此,GC-MS最主要的定性方式是库检索。由总离子色谱图可以得到任一组分的质谱图,由质谱图可以利用计算机在数据库中检索。检索结果,可以给出几种最可能的化合物。包括:化合物名称、分子式、分子量、基峰及可靠程度。表4是由计算机给出的某未知物

肽质量检索实验_其他方案

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤用肽质量数据鉴定蛋白质所控制的实验参数中,最具决定性的参数是肽质量测量的精确度 。质量精确度越高,结果判定越可信。另一决定性参数是所用酶(或化学试剂)的专一性。酶越纯,专一性胞高,检索结果可信。常用的酶是胰蛋内酶。但是要注意的是,即便是高纯度的胰蛋白酶也会在非

肽质量检索实验_基本方案

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被实验中所用水解试剂水

未解析碎片离子的检索实验

基本方案 方案优化             实验方法原理 实验材料 蛋白样品

未解析碎片离子的检索实验

实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 数据库同样可以检索一个单个肽段及其碎片离子的质量。肽段质量同它的碎片离子质量一起提供了非常具有鉴别力的判断标准,可用于在序列数据库中检索,包括由表达序列标签翻译的序列数据库(图 5.3) 。这一手段已被广泛用于凝胶分离蛋白质酶水斛后产生

GCMS数据库都告诉我们什么?

现在我们越来越多的需要GC-MS进行相关的分析检测工作,但是,GC-MS在定量之余更能给我们许多定性未知物的信息,各种数据库则是其强大的后援,今天,我们就来说说这数据库检索的门道。GC-MS常见数据库介绍谱库检索是定性分析最为广泛的辅助手段之一。通常GC-MS仪器的数据系统软件都配有不同的质谱数据库

Thermo-Scientific-Omnic-Specta-软件介绍网络视频讲座

  红外和拉曼光谱技术因其不需要样品制备便可快速无损得到分析结果而广泛使用。现在,拥有Thermo Scientific OMNIC Specta,数据采集将变得更加轻松,从分析样品,解析结果,到获得解决方案,分析过程一气呵成。2011年5月19日下午,赛默飞世尔科技在分析测试百科网举行了

质谱数据库与自动质谱退卷积定性系统如何安装

一般是先装NIST谱库,再装仪器软件。退卷积系统是NIST自带的,不用单独安装。如果是公司自带的退卷积系统,那安装仪器软件时选择就行了。

大型衰老相关基因表达谱数据库建成

  英国《自然·通讯》杂志30日发表的一项研究称,包括人类在内的4个物种的大型衰老相关基因表达谱数据库建成。德国科学家团队分析数据后发现,衰老相关基因的表达变化与退行性慢性病相关基因的表达变化轨迹一致,但与癌症的相反。  对衰老及衰老相关疾病的研究,一直是人类医学的难题。但随着“衰老基因”的确定,衰

气相色谱质谱联用技术讲解

  转眼一周过半,继续与小伙伴们分享专业技术知识。今天分享的话题是有关气相色谱-质谱联用技术的,今天推送的主要内容有——  仪器系统|一  (一)GC-MS系统的组成  气质联用仪是分析仪器中较早实现联用技术的仪器。自1957年霍姆斯和莫雷尔首次实现气相色谱和质谱联用以后,这一技术得到长足的发展。在

离子阱离子反应会导致什么结果

离子阱的定性问题:空间电荷效应是离子阱一切问题的根源。不管什么样的离子阱,不管怎么去控制阱里面的离子数量,这个效应一直存在。离子互相碰撞会产生离子反应,离子反应的结果导致: (1)创造出样品中不存在的离子,给定性带来大大的困扰,专业术语叫“鬼峰(ghost peak)”。 (2)谱库检索匹配度低,质

离子阱的定性问题描述

  离子阱的定性问题:空间电荷效应是离子阱一切问题的根源。不管什么样的离子阱,不管怎么去控制阱里面的离子数量,这个效应一直存在。离子互相碰撞会产生离子反应,离子反应的结果导致:  (1)创造出样品中不存在的离子,给定性带来极大的困扰,专业术语叫“鬼峰(ghost peak)”。  (2)谱库检索匹配

GCMS得到的信息

计算机可以将采集到每个质谱的所有离子相加得到总离子强度,总离子强度随时间变化曲线就是总离子色谱图(图9.21),总离子色谱图的横座标是出峰时间,纵座标是峰高。图中每个峰表示样品的一种组份,由每个峰可以得到相应化合物质谱图;峰面积与该组份含量成正比,可用于定量。由GC-MS得到的总离子色谱图与一般色谱

未解析碎片离子的检索实验——方案优化

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤除了人工解析碎片离子谱外,还有两种基本检索手段用于匹配数据库中序列产生的碎片离子谱。第一种方法依靠人工解析部分谱图来鉴别某一特定系列 (b 或v) 离子的连续离子元素(例如鉴别出相互之间相差一个氨基酸残基质量的碎片离子),解析出部分序列信息,再结合以下参数:①

使用全扫描及农药质谱库对农药进行筛选

气质联用仪被用于农产品中农药存在性的筛选。这是因为气质联用仪可以将农产品中的农药残留与其他化合物分开,并给出可以确认农药结构的农药的质谱图。为了这个目的,气质联用仪的离子化模式通常被设为电子轰击电离模式,采集方式被设为全扫描。 使用全扫描及农药质谱库对农药进行筛选

免费试用:-Sadtler(萨特勒)红外谱库和KnowItAll®解析软件

  为让大家了解自己的红外解谱需求以及最简捷的途径,Bio-Rad Laboratories特为中国用户推出为期两周的全部Sadtler(萨特勒)红外谱库及KnowItAll软件免费试用。试用期为2012年11月1日至2012年11月15日。   您将在试用期内拥有以下权限: