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未解析碎片离子的检索实验

实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 数据库同样可以检索一个单个肽段及其碎片离子的质量。肽段质量同它的碎片离子质量一起提供了非常具有鉴别力的判断标准,可用于在序列数据库中检索,包括由表达序列标签翻译的序列数据库(图 5.3) 。这一手段已被广泛用于凝胶分离蛋白质酶水斛后产生的肽段鉴定。肽段通常用上文所述的一些方法,在质谱仪气相中被诱导产生碎片离子,例如 PSD-MALDI-MS, 或三级四极质谱及离子阱中的 CID。在这些仪器中,肽段离子断裂的方式具有序列特异性,主要沿肽骨架的肽键断裂,见图 5.4 所示。如果肽离子的正电荷保留在碎片离子的 N 末端,此离子被称为 b 系列离子,用下行数字代表这一碎片离子中的氨基酸残基数目,从 N 末端起为1 。因此, b 离子代表 C 末端缺失, N 未端完整的碎片离子。如果电荷保留在 C 末端,离子被称为 y 系列离子:与 b 系列离子一样有下标数字......阅读全文

未解析碎片离子的检索实验——方案优化

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤除了人工解析碎片离子谱外,还有两种基本检索手段用于匹配数据库中序列产生的碎片离子谱。第一种方法依靠人工解析部分谱图来鉴别某一特定系列 (b 或v) 离子的连续离子元素(例如鉴别出相互之间相差一个氨基酸残基质量的碎片离子),解析出部分序列信息,再结合以下参数:①

未解析碎片离子的检索实验

基本方案 方案优化             实验方法原理 实验材料

未解析碎片离子的检索实验——基本方案

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤数据库同样可以检索一个单个肽段及其碎片离子的质量。肽段质量同它的碎片离子质量一起提供了非常具有鉴别力的判断标准,可用于在序列数据库中检索,包括由表达序列标签翻译的序列数据库(图 5.3) 。这一手段已被广泛用于凝胶分离蛋白质酶水斛后产生的肽段鉴定。肽段通常用上

Mass Frontier碎片离子检索功能(FISh)在士的宁...(二)

3.3士的宁完整裂解机理LTQ Orbitrap XL的线性离子阱相比传统三维离子阱具有更高的离子容量,故具有优异的多级质谱能力,能够高效的捕获前级离子进行碎裂,并获得高灵敏度的碎片离子信息,在对士的宁母离子的采集过程中,获得了其四级有效质谱信息(MS4)。通过多级质谱解析,总结出士的宁完整裂解

计算机辅助鉴定药物代谢产物

随着分析仪器的发展,单个代谢样品中即可检测到成千甚至上万个化合物,如此庞大的数据亟需无监督的自动化鉴定过程。计算机的引入有效解决了大数据处理难题,同时加速了无标准谱图化合物的解析过程,在一定程度上实现了药物代谢产物的自动化鉴定。计算机辅助鉴定方法多种多样,根据其工作原理,现分为化学结构数据库基础上的

几道例题让你从质谱图小白变大神

  一张化合物的质谱包含着有关化合物的丰富信息,大多数情况下,仅依靠质谱就可以确定化合物的分子量、分子式和分子结构。而且,质谱分析的样品用量极微,因此,质谱法是进行有机物鉴定的有力工具。接下来咱们就利用具体的例子来解析质谱图。   当然,对于复杂的有机化合物的定性,还要借助于红外光谱、

AB SCIEX公司携5500LC/MS/MS系统亮相微全分析学术会议

  2013年5月17日,由中国化学会主办、厦门大学承办、复旦大学、浙江大学协办的第八届全国微全分析系统学术会议、第三届全国微纳尺度生物分离分析学术会议暨第五届国际微化学与微系统学术会议在美丽的海滨城市厦门隆重召开,400余名国内外学者参加了这一盛会

Qtrap 5500:生物标志物确证分析的最佳技术平台

  2010年5月15日~17日,在云南丽江召开的蛋白质组数据处理暨第三届全国生物质谱学术交流会上, AB SCIEX公司于15日中午举办了新技术推广&午餐招待会。来自AB SCIEX公司质谱市场产品经理刘麟先生,向大家介绍了AB公司Qtrap 5500在蛋白质组学定量分析中的新技

气相色谱-质谱联用技术讲解

  转眼一周过半,继续与小伙伴们分享专业技术知识。今天分享的话题是有关气相色谱-质谱联用技术的,今天推送的主要内容有——  仪器系统|一  (一)GC-MS系统的组成  气质联用仪是分析仪器中较早实现联用技术的仪器。自1957年霍姆斯和莫雷尔首次实现气相色谱和质谱联用以后,这一技术得到长足的发展。在

Mass Frontier碎片离子检索功能(FISh)在士的宁...(一)

Mass Frontier碎片离子检索功能(FISh)在士的宁代谢物鉴定中的应用1.引言 马钱子为马钱科植物马钱Strychnos nux-Vomical L.的干燥成熟种子, 其主要活性成分是生物碱,具有通经络、消肿痛、止痛的功效, 是中医临床常用药物。其中主要有效成分士的宁(s

线性离子阱多种解离技术对阿德福韦酯杂质谱的全(二)

结果与讨论 I. 全扫—Top5 HCD dd MS/MS 与“FISh”ADP 杂质谱分析流程由两次连续的LCMS实验构成。分析目标是为杂质鉴定和结构解析收集尽可能多的信息。第一个 MS 实验包括全扫描和后续的 Top5 HCD 数据依赖MS/MS 扫描(图1)。 接下来,数据通过M

应用LCQ 离子阱质谱仪和Mass Frontier 软件分析药物...(一)

应用LCQ 离子阱质谱仪和Mass Frontier 软件分析药物中间体的痕量杂质成分前言由于将一个新药带入市场的成本非常高,药物公司能够开发的药物数量就会受到限制。为此,在药物研发的早期,大多使用复杂的筛选技术来剔除那些没有潜力的候选药物。若要成功,必须对代谢物和杂质的吸收、分布、代谢、排泄和毒性

Cerno发布新型Rx平台 加速MassWorks普及应用

  苹果公司的IOS、谷歌的Android、腾讯的微信,都是我们熟知的平台,它们可以更好地接入和调用第三方的工具,并加速实现各种基于平台的应用。MassWorks软件具有独特的精确质量和谱图准确度校正方法,使人们在使用单四极杆质谱时,也可获得被国际期刊认可的精确质量和元素组成,准确地进行化合物鉴定;

2013 赛默飞Orbitrap用户会在广州隆重举行

  2013年12月9日-11日,2013年全国生物质谱应用技术研讨会暨第二届赛默飞世尔科技Orbitrap用户会在广州中山大学举办,本次会议由高校分析测试中心研究会主办、中山大学分析测试中心承办,旨在积极推动生物质谱技术的发展和应用,建立质谱技术交流平台,加强同行之间

利用双压线性离子阱质谱仪多重解离技术对API杂...(一)

利用双压线性离子阱质谱仪多重解离技术对API杂质谱进行全面分析Theresa Lynch 1 ; Kate Comstock 2 ; Jack Cunniff 21 Gilead Sciences, 333 Lakeside Dr, Foster City, CA;  2 Thermo F

质谱沙龙第十七期活动报道

      色谱质谱界著名专家为您揭示:我们还需做出什么努力,来迎接痕量分析的挑战?AB总部Qtrap产品线经理现场介绍5500新看点……       2009年3月28日下午,质谱沙龙第十七期活动

用质谱数据对肽段从头测序实验

实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列,即相邻肽段间相差一个氨基酸残基,用质谱分析肽阶梯,通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱,但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生,由 C 未端或N未端

用质谱数据对肽段从头测序实验

方案一 方案二 方案三             实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列,即相邻

用质谱数据对肽段从头测序实验(一)

实验方法原理单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列,即相邻肽段间相差一个氨基酸残基,用质谱分析肽阶梯,通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱,但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生,由 C 未端或N未端断

MassWorks RX GC/ID,为定性提供“双保险“

  2020年,Cerno Bioscience公司正式发布全新的质谱定性分析软件MassWorks Rx GC/ID(简称“GC/ID”),GC/ID是专为GC/MS定性分析而设计的一款自动化的软件工具包,它将为您全面改进GC/MS定性分析的准确度,全自动的运行方式,使得分析人员不必花费冗长的时间

运用到【制备液相色谱】的10篇文献,我下载啦。

高效液相-单四级杆质谱仪结合同位素峰形校正检索技术快速确定头孢呋辛水溶液降解杂质探索一种利用同位素峰形校正检索技术(CLIPS),在低分辨率单四极杆液质联用仪上,实现对未知杂质元素组成的分析,进而快速推断降解杂质结构的方法。方法:头孢呋辛对照品经水浴降解获得未知杂质混合样品,用HPLC-MS进行分离

高分辨液质药物杂质分析解决方案(二)

超高分辨率解锁杂质同位素信息高分辨高质量精度(HRAM)的一级和二级质谱数据是未知杂质分析的有力工具,但这并非是用来结构解析的唯一依据, Q Exactive Focus 具有比常规高分辨更高的分辨率(70,000 FWHM),超高的分辨率可用于进一步解锁同位素信息,如下图中,可将 15N 与 13

质谱沙龙第二十一期活动报道

【导语】在药物分析的技术讨论之外,拓展了质谱沙龙的涉及范围:增加了质谱相关新技术MassWorks的讨论;GC/MS在公安法医中的应用;以及蛋白质组学同位素标记、磷酸化翻译后修饰鉴定的最新研究进展。   2009年7月25日下午,质谱沙龙第二十一期活动在第二炮兵总医院胃食管返流中心示教室举行。除了

备战冬奥!北京疾控发布千万质谱采购大单

  分析测试百科网讯 北京市疾病预防控制中心公布2022北京冬奥会应急保障能力建设(代报医政处)质谱仪采购项目,项目采购液相色谱高分辨质谱仪一台、气相色谱高分辨质谱仪一台,项目预算金额960万元(人民币),详情如下:  项目编号:PXM2020_026323_000018-JH001-XM001  

赛默飞世尔科技发布一个包括五个软件解决方案的新系列

赛默飞世尔科技于国际蛋白质组学大会(HUPO)上宣布发布一个包括五个软件解决方案的新系列,可提高定性和定量蛋白质组学工作流程  澳大利亚悉尼(2010年9月20日)  -全球科学服务领域的领导者赛默飞世尔科技公司,于2010年国际蛋白质组学大会(HU

气相色谱词条

  1色谱法 chromatography 又称色层法、层析法,是一种对混合物进行分离、分析的方法。1903年俄国植物学家茨威特在分离植物色素时,得到了各种不同颜色的谱带,故得名色谱法。以后此法虽逐渐应用于无色物质的分离,但“色谱”一词仍被人们沿用至今。色谱法的原理是基于混合物中各组分在两

代谢组学全流程解决方案

赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱(Orbitrap)质谱平台结合其功能强大的软件平台,提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求,而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标

高分辨率是进行化合物检测的可靠保证

前言分析实验室始终面对着这样的挑战,就是既要保证最高水准准确度,也要在数据充分可靠的基础上不断提高检测效率。此类实验室大多采用气相色谱、液相色谱和三重四极杆质谱仪(MS)联用来实现目标化合物检测。以上分析技术可在一定的灵敏度水平和选择性要求范围内检测性质差异较大的多种化合物,但是,其局限性在于需要确

蛋白质组学实用分析技术一览

分析其实也属于技术的一部分,且在蛋白质组学研究中显得尤为重要,因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的,而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性,因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。

江苏省公安厅物证鉴定中心高分辨液质检测苯二氮卓类药

  分析测试百科网讯 苯二氮卓类如安定、三唑仑、氯硝安定、艾司唑仑、阿普唑仑、咪达唑仑等药物,都具有镇静、催眠和抗焦虑作用,常用作失眠、焦虑、惊厥、癫痫等病症以及手术前的辅助用药,一直作为处方药进行管理使用,不得在普通药店售卖,并且其中三唑仑作为国家一类管制药物,被严格限制乱用。犯罪分子从网上购买所