MolecularOncology:废物利用!新方法使乳腺癌诊断更精准

一项发表在《Molecular Oncology》上的新研究表明对乳腺癌常规检测剩下的组织进行蛋白质和RNA检测可能会使检测结果更准确。图片来源于网络 通过使用细针抽吸25名乳腺癌病人和33名良性肿瘤病人的组织样品,研究人员发现通过蛋白质和RNA分析竟然可以完全将所有恶性肿瘤病人和良性病人区分开。 这项研究表明除了提供结论性诊断信息之外,通过微创技术对乳腺癌进行分型很重要,这样有助于决定每个病人最适合的疗法、监控疾病进程以及对治疗的反应。......阅读全文

Nature:小分子RNA调控免疫系统抗击乳腺癌

  日前,英国科学家在《自然》杂志上发表论文称,人体自身免疫系统对抗乳腺癌是由小分子RNA控制,后者对不同乳腺癌亚型的影响是不一样的。   此前剑桥大学在2012年发表的一项研究表明,乳腺癌可以细分成十个不同的遗传亚型,此后研究人员一直在寻找这些不同类型乳腺癌与小分子RNA行为模式之间的关系。

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

中科大研究发现小分子RNA可以抑制乳腺癌

  中国科学技术大学生命学院柳素玲教授在肿瘤干细胞领域研究中取得新突破,发现一种叫做 microRNA100(miR-100)的核糖核酸小分子可以抑制乳腺肿瘤干细胞的更新和增殖,从而扼制乳腺癌的生长和迁移。相关论文以长文形式于近日在线发表在国际著名学术期刊《癌症研究》上。  在此项研究中,中国科大科

RNA-蛋白质的相互作用1

叶绿体RNA的体外加工与紫外交联分析RNARNA的合成l      DNA模板的线性化1.根据供应商的指导用合适的限制酶酶解含有DNA模板(如亚克隆在转录载体如pBluescript®(Stratagene)上的菠菜叶绿体psbA基因)的质粒(Schuster and Gruissem1991)。2

《Nature》RNA调节蛋白质合成的隐藏信号

  RNA以A、U、C和G等基本核苷酸在细胞的蛋白质加工厂中指挥蛋白质生产。为了制造蛋白质,机器的一端先锁定在RNA上,然后扫描整条RNA,直到AUG字符串后停止扫描,AUG是将遗传密码翻译成蛋白质的开始信号。  在巡查第一个AUG位点时,蛋白质制造机器经常会遇到一个与AUG不同的字符串(如AUA)

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质4

注意事项:1. DNA在中间层和有机相中时可在2~8℃保存过夜。2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8℃可保存几个月。3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置过夜,如长期保存需用HEPES调节pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或-20℃长期保存。常见问题分析:得率低:A.样品匀浆和裂解的

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质3

DNA污染:A. 样品匀浆时加的试剂量太少。B.样品中含有有机溶剂(如乙醇,DMSO等),强缓冲液或碱性溶液。蛋白聚糖和多糖污染:沉淀RNA的过程中作以下改进可去除这些污染,步骤7中,每使用1ml TRIzol在水相中加0.25ml异丙醇和0.25ml高盐溶液(0.8M柠檬酸钠和1.2MNaCl)混

RNA-蛋白质的相互作用2

叶绿体mRNA3’末端的体外加工l      RNA加工反应1.在1.5ml微量离心管中加入下列反应液:缓冲液IVT(20×)                            0.5μl叶绿体蛋白提取物(20μg)                      Lμl缓冲液E           

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质2

5. 2-8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。6. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(一)

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(二)

DNA的分离准备试剂:乙醇0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)、 75%乙醇、8mM NaOH操作步骤:1. 样品加氯仿分层后,移去上层水相,用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。每使用1mlTRIzol加0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3分钟,2~8℃不超过2000×g离心5分钟。2. 移去上清,(如需

小分子RNA调控免疫系统-抗击乳腺癌引起广泛关注

  英国科学家最近在《自然》杂志上发表论文称,人体自身免疫系统对抗乳腺癌是由小分子RNA控制,后者对不同乳腺癌亚型的影响是不一样的。   2012年英国剑桥大学科学家一项研究表明,乳腺癌可以细分成十个不同的遗传亚型,此后研究人员一直在寻找这些不同类型乳腺癌与小分子RNA行为模式之间的关系。英

RNA蛋白质印迹法的技术应用

中文名称RNA-蛋白质印迹法英文名称Northwestern blotting定  义将经过电泳分离的蛋白质转移到膜上再与某种特异的RNA探针杂交,是研究蛋白质与RNA特异结合的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

酵母蛋白质和-RNA-的制备(稀碱法)

实验概要本实验介绍了从酵母中分离制备蛋白质和 RNA 的原理和方法。实验原理酵母细胞富含蛋白质和核酸。用稀碱液(0.2% 的氢氧化钠)处理酵母使细胞裂解,离心收集上清液,得到酵母核蛋白抽提液。用盐酸调节抽提液 pH 至 3.0 (核蛋白的等电点),核蛋白溶解度下降大量沉出,离心收集沉淀物为酵母蛋白质

研究蛋白质RNA相互作用的新工具

  近日,赛默飞世尔科技全新推出了一款Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit,让研究人员能够以末端标记的RNA作为诱饵,轻松富集蛋白质-RNA的相互作用。与抗体捕获相比,这种方法的优势在于脱硫生物素化的目标RNA能够直接富集RBP(或复合物)。  蛋白

提取的DNA中含有蛋白质和RNA污染

提取的时候饱和酚,氯仿需要定量,这些可以去蛋白。去除RNA污染,RNA酶活性,定量。凝胶电泳,试剂最好是即用型的,因为有些东西放久了会长菌。然后是染料的热稳定性和灵敏度。

C/D-RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理

上海光源用户研究发现C/D RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理  1月27日,北京生命科学研究所叶克穷实验室在《自然》杂志发表了题为Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA

凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验

            实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋

凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验

实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别

凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验

凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别的序列,建立反应常数(如亲

RNA翻译与蛋白质折叠之间的微妙舞蹈

  在蛋白质的合成过程中,RNA翻译会影响蛋白质的折叠,而蛋白质折叠也会影响RNA的翻译。  在过去的十年里,我们对细胞内蛋白质合成方式的认知取得了快速的增长,其中包括蛋白质合成的各个基本步骤:转运RNA(transfer RNA, tRNA)是如何高保真、高速率地对信使RNA(messenger

蛋白质和脂质,RNA都可以糖基化

  众所周知,糖基化是在各种酶的作用下将糖添加到蛋白质或脂质中的过程。这个过程开始于内质网,结束于高尔基体。例如,糖在糖基转移酶的作用下转移到蛋白质上,与蛋白质上的氨基酸残基形成糖苷键,最终形成糖蛋白。最近,一项名为“Small RNAs are modified with N-glycans an

Molecular-Oncology:废物利用!新方法使乳腺癌诊断更精准

  一项发表在《Molecular Oncology》上的新研究表明对乳腺癌常规检测剩下的组织进行蛋白质和RNA检测可能会使检测结果更准确。 图片来源于网络   通过使用细针抽吸25名乳腺癌病人和33名良性肿瘤病人的组织样品,研究人员发现通过蛋白质和RNA分析竟然可以完全将所有恶性肿瘤病

Nature:E钙粘蛋白是多种乳腺癌转移必需的蛋白质

  转移是癌症患者死亡的主要原因。根据体外迁移与E-钙粘蛋白水平的负相关关系,有人提出细胞间黏附蛋白E-钙粘蛋白丢失后,周围组织的侵袭和转移就开始了。然而,这一假设与大多数乳腺癌为浸润性导管癌并在原发肿瘤和转移中表达E-钙粘蛋白的观察结果不一致。  为了解决这个现象和理论矛盾的问题,来自美国约翰霍普

Cell-Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比

在蛋白质合成中涉及到主要的RNA是哪些?

1、信使RNA(mRNA)功能:携带着决定氨基酸排列顺序的信息,在蛋白质合成过程中起模板作用。2、转运RNA(tRNA)功能:转运特定的氨基酸,识别信使RNA上的遗传信息。3、核糖体RNA(rRNA)功能:是组成核糖体的成分。核糖体是蛋白质合成的场所。不同的组织细胞具有不同的生理功能,是因为它们表达

Science聚焦:球形RNA让RNA疗法重获新生

  几十年来,RNA疗法在治疗遗传疾病的道路上走得并不顺遂。不过,随着新型RNA(球形核酸SNA)在人体试验中取得成功,这一领域似乎焕发出新的活力。Science网站特别撰文介绍了这项重要突破。  RNA疗法一般是用反义RNA破坏疾病相关蛋白的生产。在美国化学学会(ACS)上周的一次会议上,研究人员

Milo单细胞蛋白质检测技术解析乳腺癌发生的细胞基础

乳腺癌起源于乳腺上皮细胞,原因是乳腺上皮细胞发生基因改变,导致随后组织稳态的丧失。科学家们经过大量研究将乳腺上皮细胞分为几个不同的亚群,但依然无法完全了解上皮细胞异质性和分化谱加州大学欧文分校(University of California, Irvine)的科学家,在最新一期Nature Com

Cell子刊:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

   RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,