MolecularOncology：废物利用！新方法使乳腺癌诊断更精准
一项发表在《Molecular Oncology》上的新研究表明对乳腺癌常规检测剩下的组织进行蛋白质和RNA检测可能会使检测结果更准确。图片来源于网络 通过使用细针抽吸25名乳腺癌病人和33名良性肿瘤病人的组织样品，研究人员发现通过蛋白质和RNA分析竟然可以完全将所有恶性肿瘤病人和良性病人区分开。 这项研究表明除了提供结论性诊断信息之外，通过微创技术对乳腺癌进行分型很重要，这样有助于决定每个病人最适合的疗法、监控疾病进程以及对治疗的反应。......阅读全文
PNAS：芹菜素杀伤癌细胞
近日，一项新研究表明，地中海饮食中丰富的化合物可以剥夺癌细胞逃避死亡的 “超级动能”。这项由美国Ohio State大学的研究人员发现，一种化合物芹菜素能诱导乳腺癌细胞死亡。 但是，这些健康食品在体内工作的实际分子机制在许多情况下仍是一个谜。香菜，芹菜和甘菊茶是芹菜素最常见的来源，它被
如何分离DNA蛋白质复合体与RNA蛋白质复合体的混合物
可以借助一些多组分抽提试剂，比如TRIzol可以将RNA/DNA/蛋白质分开。经TRIzol处理后，RNA位于上层水相中，DNA处于中间层，蛋白质则在下层。可分别取出水相用异丙醇沉淀回收RNA；用乙醇沉淀中间层回收DNA；用异丙醇沉淀有机相回收蛋白质。
UW团队完成了三阴乳腺癌的大规模蛋白质组学分析
通过20种人衍生的乳腺癌细胞系和4个患者的肿瘤样本，该研究鉴定了各种乳腺癌亚型的蛋白质，并且确定了潜在的治疗靶标，这些结果近日发表在了《Cell Reports》上。 这项工作还强调了TNBC的高异质性和由此导致该疾病治疗的困难性。 乳腺癌通常根据患者的受体状态进行分类-雌激素受体、表皮生长
乳制品中的一种蛋白质刺激乳腺癌生长和扩散
《Cancer Research》报道，Massey癌症中心Charles Clevenger课题组发现，亲环素A（cyclophilin）调节Jak2/Stat5遗传途径，该途径负责乳腺癌细胞。“这项研究鉴定出亲环素A是乳腺癌治疗干预靶点，因为现存FDA批准药物可以抑制CypA，所以临床上转化应该
－siRNA联合纳米技术为难治型乳腺癌重拳出击
据世卫组织2013最新报告，乳腺癌的发病率目前在西方发达国家属于高位稳定的状态。全球年发病新增乳腺癌患者在130万左右，死亡率在欧美国家占到女性的16%，发病率和死亡率占女性第一位。对于我国来说，乳腺癌局势也不容乐观。乳腺癌已居我国女性恶性肿瘤之首，且近年发病呈年轻化，发病率每年递增约 3%
我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康，甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质，在致病过程中发挥着关键作用，但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期，我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络，研究成果发表在《Cell Research
多聚腺苷酸聚合酶的本质是蛋白质还是RNA
不对,多聚腺苷酸聚合酶是mRNA转录后加工过程用来加多聚腺苷酸尾巴的,既不需要摸板也不要引物,还有RNA聚合酶不需要引物
我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康，甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质，在致病过程中发挥着关键作用，但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期，我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络，研究成果发表在《Cell Research
服了！一种新药打尽所有癌症相关DNA、RNA和蛋白质
今年癌症研究成果格外引人注目，各领域英雄大显神通，早前几个月我们刚报道过：Benjamin F. Cravatt蛋白质组学研究组与辉瑞公司历时多年研制而成的肺癌小分子抑制剂；Marcus Peter课题组发现的人体天然存在的广谱癌症杀手siRNAs；欧竞雄肝癌研究课题组报道的能绕开肿瘤耐药的自噬
直接RNA测序、串联质谱法揭示新冠转录组和蛋白质组特征
此前，南开大学高山、阮吉寿等在中国预印本ChinaXiv网站发表论文，称新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点。近日，发表在预印本网站bioRxiv上的一篇论文使用直接RNA测序和串联质谱法表明了SARS-CoV-2的转录组和蛋白质组的特征，揭示了细胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位点的
生物物理所果蝇生殖发育关键蛋白质与RNA研究获进展
mRNA的时空定位是mRNA转录后调控的重要步骤之一，在生殖细胞发育以及身体非对称性的形成中发挥着重要作用。一个典型的例子是oskarmRNA的定位与翻译的位置决定了果蝇生殖质组装的位置。 oskarmRNA在滋养细胞中转录，并通过微管等细胞骨架运输到卵母细胞的后极。新转录的mRNA通常不翻译
我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康，甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质，在致病过程中发挥着关键作用，但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期，我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络，研究成果发表在《Cell Research
Nature揭示癌细胞转移的推手
利用创新性的工具来捕获迄今为止隐藏的细胞调控途径，来自洛克菲勒大学的科学家们鉴别出了一种蛋白质，证实其使得乳腺癌细胞更易发生转移。 更重要的是，他们发现这一蛋白似乎是通过在某种程度上阻断两个通常与神经退行性变相关的蛋白来触动了癌症扩散。这一研究发现表明两种疾病过程可能有着意想不到的关联。 这
RNA干扰技术(RNA－interference，RNAi)
1995年，康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫（C. elegans）中的par-1基因时，发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达，而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA（sense RNA）以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（2）
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上，但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释，使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足，Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动，将目的基因之标的序列以反向重复的方式，由
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（1）
基因沉默（gene silencing）是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面，基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物（genetically modified organisms）的障碍，另一方面，它又是植物抵抗外来核酸入侵（如病毒）的一种反应，为植物抗病毒的遗传育
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞： 裂解液的量不足，使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织： 某些含有内源性核酸酶的样品，很难避免RNA酶的降解，建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎，并且，匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品： 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放，然后转移到-70℃冰箱存
RNAi筛选抓住乳腺癌致癌性的关键“毒瘤”
在一项最新研究中，科学家们发现USP21酶可以保护蛋白质FOXM1，后者与基底样乳腺癌发生，转移和患者预后不良有着密切的关联。 基底样乳腺癌（basal-like breast cancer，BLBC）是乳腺癌中最具攻击性和难以治疗的亚型，而且这种疾病与三阴性分类有很大程度上重叠，迫切需要新的
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（二）
针对一些乳腺癌亚型和携带常见突变如PIK3CA和TP53突变的肿瘤，分析结果揭示出了一些新的蛋白质标记物和信号通路。另外将一些基因中的拷贝数改变与蛋白质水平联系一起，从而鉴别出了10个新的候选调控因子。其中两个候选基因SKP1和 CETN3可能与癌基因EGFR有关联。EGFR是一种特别具有侵
补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用
实验材料 蛋白酶K 试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液 非变性胶电泳缓冲液 结合缓冲液
补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间作用实验
基于补骨脂素光化学反应的 RNA-蛋白分子复合物分析法，能够在数据相对缺乏的情况下分析生理条件下的 RNA-蛋白复合物的拓扑构象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验材料蛋白酶K试剂、试剂盒变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙
硝酸纤维素滤膜结合实验确定RNA蛋白质解离常数实验
实验方法原理 利用硝酸纤维素滤膜结合可以测定蛋白与 DNA、RNA 间的结合，该方法的基础在于大多数蛋白可以与硝酸纤维素滤膜结合，如果蛋白质和核酸结合，那么该复合物也可以与硝酸纤维素滤膜结合，但是这种结合必须能够 承受过滤压力，并且蛋白质在结合到硝酸纤维素滤膜上时还能够保持与核酸的结合，
硝酸纤维素滤膜结合实验确定RNA蛋白质解离常数实验
实验方法原理 利用硝酸纤维素滤膜结合可以测定蛋白与 DNA、RNA 间的结合，该方法的基础在于大多数蛋白可以与硝酸纤维素滤膜结合，如果蛋白质和核酸结合，那么该复合物也可以与硝酸纤维素滤膜结合，但是这种结合必须能够 承受过滤压力，并且蛋
硝酸纤维素滤膜结合实验确定RNA蛋白质解离常数实验
利用硝酸纤维素滤膜结合可以测定蛋白与 DNA、RNA 间的结合，该方法的基础在于大多数蛋白可以与硝酸纤维素滤膜结合，如果蛋白质和核酸结合，那么该复合物也可以与硝酸纤维素滤膜结合，但是这种结合必须能够承受过滤压力，并且蛋白质在结合到硝酸纤维素滤膜上时还能够保持与核酸的结合。在本实验来源「RNA 实验指
浙大揭示新冠病毒RNA非编码区域与宿主蛋白质互作网络
近日，浙江大学生命科学研究院冯新华、蒋超、任艾明、杨兵实验室在美国微生物协会（American Society for Microbiology）旗下的期刊mSystems杂志上合作发表了题为“High-sensitivity profiling of SARS-CoV-2 noncoding
中外学者Nature子刊发文：环状RNA翻译出抑癌蛋白质！
由中山大学、复旦大学、暨南大学、美国安德森癌症中心等多家单位发表一项发现：使用翻译组测序技术，在脑胶质瘤细胞中发现了数千种可能翻译的环状RNA（circRNA），其中320个有差异表达现象，并具体验证了一种名为LINC-PINT的环状RNA可编码长度为87个氨基酸的蛋白质PINT87aa。 近
RNA提取心得（组织RNA提取和培养细胞的RNA提取）
一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织，这样RNA提取的效果比较好，这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的（最好在半年之内，-80℃或者液氮中冻存的）组织，注意不要反复冻融，从冰冻状态拿到0-4℃，注意不要拿到常温，待组织解冻后，用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织，称重后，放到预冷的匀浆器中，然后
RNA干扰相关知识RNARITS）
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液，用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀，每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚，充分混匀，于 60
RNA干扰相关知识RNARISC
RNA-induced silencing complex（RISC）：一种RNA-蛋白质复合物，通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC，miRNA组装miRISC。RISCs（无论siRISC还是miRISC）包括两种类型：切割型和不切割型。