同济大学973项目发表StemCells文章
来自同济大学生命科学与技术学院,第二军医大学等处的研究人员发表了题为“miR-138 Promotes Induced Pluripotent Stem Cell Generation through the Regulation of the p53 Signaling”的文章,首次发现小鼠胚胎成纤维细胞内源性的一个小非编码RNA能够在诱导过程中特异性地作用于p53,在一定程度上降低P53的表达,从而提高诱导效率。相关成果公布在干细胞研究领域国际著名刊物Stem Cells杂志上。 文章通讯作者是同济大学生命科学与技术学院康九红教授,第一作者为叶丹,此项研究工作得到科技部973项目、科技部国际合作项目、自然科学基金委、教育部创新团队以及上海市科委项目的支持。 通过过表达四因子Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc重编程体细胞可获得iPS细胞。iPS在细胞倍增能力、分化能力等方面都与胚胎干细胞相似。......阅读全文
生化与细胞所揭示酵母转录中介复合物调控端粒机制
真核生物的端粒(Telomere)对于保证染色体正常复制以及维持基因组的稳定性有重要作用,也是研究基因组中异染色质(Heterochromatin)结构的重要模型。 9月19日,Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所周金秋研
生命中心欧光朔研究组在 Developmental Cell 发文
2017 年 4 月 11 日,生命中心欧光朔研究组在《Developmental Cell》杂志在线发表了题为“Spectraplakin 蛋白诱导微丝骨架与融合蛋白形成正反馈促进细胞融合” (Spectraplakin Induces Positive Feedback between Fu
Cell子刊:一种新的基因组保护机制
来自北京生命科学研究所的研究人员发表了题为“SUMO-Targeted DNA Translocase Rrp2 Protects the Genome from Top2-Induced DNA Damage”的文章,发现一个名为 Rrp2 的 DNA 移位酶通过阻止 DNA 拓扑异构酶Ⅱ(T
北大科学家解析小鼠着床前胚胎中的单碱基分辨率5fC谱图
2017年3月23日,北京大学BIOPIC中心汤富酬课题组与生命科学学院伊成器课题组合作在《Cell Stem Cell》杂志上发表了题为“Single-Cell 5-Formylcytosine Landscapes of Mammalian Early Embryos and ESCs at
细胞表面RNA分子由细胞核内的基因组编码产生
人类细胞的外表面上有很多不同的蛋白质、脂质、糖蛋白。然而除了这些已知类型的分子,近日科学家们发现,人类细胞的外表面还稳定附着了一类过去鲜有人知的RNA分子。 加州大学圣地亚哥分校(UCSD)钟声教授与其合作者张良方教授、陈真教授共同的研究团队,利用专门开发的检测和测序技术鉴定出,这类细
刘光慧研究员荣获第十一届谈家桢生命科学创新奖
11月19日,第十一届“谈家桢生命科学奖”颁奖典礼在湘雅医院国际学术报告厅隆重举行。作为中国生命科学领域最具有影响力的奖项之一,“谈家桢生命科学奖”旨在秉承谈家桢先生对生命科学事业的奉献精神,促进中国生命科学研究原创性和科研成果产业化、推进中国生命科学领域学术交流,激励中国生命科学工作者不断创新
生命科学大会开幕:我国生命科学处在突破的前夜
我相信,这次汇聚,将成为国际生命科学领域一次令人难忘的盛会。1日,2016世界生命科学大会在国家会议中心拉开帷幕。全国人大常委会副委员长陈竺在致辞中这样说道,生命科学,正引领世界科学发展的新潮流。 这是在中国举行的规模最大、层次最高的生命科学领域学术盛会。10位诺奖得主、4位世界粮食奖得主
施一公教授荣获“谈家桢生命科学成就奖”
由国家科技部批准的“谈家桢生命科学奖”12月20日上午在沪举行第三届颁奖仪式。中科院院士、复旦大学生物医学研究院院长贺林和清华大学生命科学学院院长施一公教授,获得“谈家桢生命科学成就奖”,刘廷析等10名教授获得“谈家桢生命科学创新奖”。 生物产业是当今世界的战略性新兴产业。世界上越来
同济大学973项目PNAS解析iPS机制
2012年,诺贝尔生理学与医学奖授予了包括iPSC在内的细胞重编程技术研究领域。其中iPSC具有和胚胎干细胞(ESC)类似的特征和功能,却极大程度避免了ESC研究和应用中面临的伦理和排斥等诸多障碍。不过虽然诺奖得主Yamanaka教授及后来的大量研究都表明Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc
单细胞测序推进了基因组的发展领域
单细胞测序能够帮助我们了解那些难以培养的微生物的基因组功能、了解遗传镶嵌功能在普通生物学功能或是疾病发生中的作用、肿瘤内在异质性对肿瘤发展以及耐药性的影响、重新定义细胞亚型等等。 单细胞测序可以揭示出每个细胞独特的微妙变化,甚至可以揭示全新的细胞类型,测序技术可谓是科技发展的一大创举,它推进了基因
细胞质雄性不育与叶绿体基因组
CMS 与叶绿体的关系还存在很大的争议。相对于植物线粒体而言,叶绿体基因组较为保守也较小(120~160 kb),因此对它的认识要比对线粒体深入的多。研究发现植物叶绿体一般分为4个区:两个反向重复区,大单拷贝区和小单拷贝区。已有多种植物叶绿体的物理图谱被构建。对高粱的 CMS 系及相应保持系的叶绿体
基因组测序揭示多细胞生物进化之谜
最近,研究人员通过对各种绿藻进行基因组测序,已经接近于解开了“引起多细胞生物的遗传变化”的谜团。 从单细胞生物到多细胞生物的过渡,是地球上生命进化的关键进步;在不同的系统发育谱系中,这种改变已经独立地发生了多次。了解“有多少基因以及有哪些基因,对单细胞祖先成为多细胞来说是必要的”,是一个有趣的
HIV基因组是怎么被清理出细胞的
HIV病毒是一种擅于“打入内部”的病毒。作为一种反转录病毒,它的单链RNA在进入细胞后会被反转录成双链DNA,并被整合进宿主T细胞的基因组里。一经激活,这些源自病毒的基因组能够操纵宿主T细胞大量复制HIV病毒。而这些受感染的T细胞也通过各种机制失去了应有的功能,造成人类免疫力锐减。 目前能够控
Nature发布单细胞基因组学新技术
胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。 一开始是一团相同的细胞,随着增殖不断地改变形状和功能,最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。
Cell子刊:生殖干细胞高效基因组编辑
精原干细胞(SSC)是成年雄性动物曲细精管中唯一能进行终生自我更新的二倍体永生细胞群。这些细胞既具有自我更新潜能,又能定向分化产生精子。对体外培养的精原干细胞进行基因修饰,能将外源基因稳定遗传到后代基因组,不过这一过程还存在一定的技术困难。 日本横滨城市大学的生殖生物学家Takehiko Og
Nature:用单细胞基因组探索多样性
宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而,环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装,因此,大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今,两个新的大规模研究利用单细胞基因组,直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。 Rinke等人利用荧光活化性细胞分
细胞质雄性不育与核基因组
对胞质遗传物质的研究无疑加深了人们对 CMS 现象分子机制的认识,但是 CMS 是一种核质互作的结果,因此核基因组在 CMS 发生过程的作用是不容忽视的。研究表明在核基因组中可能存在育性恢复(restorer of fertility,Rf)基因。在 Rf 基因存在下,与 CMS 相关的线粒体等胞质
放大四千倍细胞解开基因组秘密
基因调控是发生在分子水平上的过程,传统显微镜很难观察到。在最新一期《科学》杂志在线发表的一篇论文中,美国耶鲁大学研究人员开发了一种名为染色质扩张显微镜(ChromExM)的新技术,成功地将斑马鱼胚胎细胞核的物理体积扩大了4000倍,从而大幅提高了图像分辨率。这项技术让研究人员第一次看到了单个分子
新方法:超低细胞数表观基因组研究
日本九州大学和东京理工学院的科学家们研发了一种使用非常少量的细胞,范围从100到1000的细胞,来分析DNA-蛋白质相互作用的新技术。他们的方法可以捕获前所未有的细胞内表观遗传组信息,该技术奖促进生物标记的发现并为精准医学开辟新道路。 这项被称为染色质整合标记测序(Chromatin Inte
细胞质雄性不育与线粒体基因组
根据研究,线粒体基因组的变异重组与 CMS 的关系最为密切。通过对不同材料的 CMS 系和保持系线粒体 DNA 的 RFLP、RAPD、AFLP 等多态性分析表明,CMS 系和保持系在线粒体基因组结构上具有显著差异。这可能与植物线粒体基因组自身的特点有关。与动物和真菌的线粒体基因组比起来,植物线粒体
光滑双脐螺免疫细胞基因组图谱完成
科技日报北京12月20日电 (记者张梦然)施普林格自然出版社旗下《免疫遗传学》杂志近日公布了世界上第一份曼氏血吸虫中间宿主免疫细胞的单细胞RNA测序(scRNA-seq)的比较基因组学和转录组学科学成果,该成果是由中国北部湾大学和加拿大阿尔伯塔大学共同主持。 光滑双脐螺是世界上排名第二的最重大
国际研究小组完成多细胞团藻基因组测序
德国比勒费尔德大学7月9日报告说,一个国际研究小组最近完成了对最简单的多细胞生物团藻的基因组测序。科研人员希望以此帮助探寻单细胞生物向多细胞生物演变的奥秘。 单细胞生物怎么能演变为多细胞生物乃至人这样高度复杂的生物,一直是生物研究的重要课题。一个由德国、美国、加拿大和日本科研人员组成
单细胞全基因组扩增技术大比武
2013年,权威技术期刊《Nature Methods》将年度技术授予了单细胞测序。正如社论中所说,每个细胞都是独一无二的--它占据了独特的空间位置,它的复制基因组中携带了独特的错误。然而,过去以细胞群体为对象的研究只获得了平均值,而忽略了异质性。目前多种新型分析技术,如NGS,都是为细胞群
一个细胞-可以进行基因组测序吗
单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增,获得高覆盖率的完整的基因组后进行高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。从方法学角度来看,获得高覆盖率高保真性的全基因组扩增产物是准确全面的测序结果的保障。相较于以往
Science:梳理患儿肿瘤细胞的基因组寻求答案
组蛋白翻译后修饰方式出现异常,以及组蛋白修饰位置出现异常都会导致肿瘤发生。 高通量DNA测序技术的快速扩张让我们能够以前所未有的速度和精细度对人体疾病展开遗传学分析,尤其是对罕见的小儿疾病进行全基因组测序(whole-genome sequencing)更是有助于我们对儿童发育,以及多
“十二五”基因组和蛋白质组技术发展战略研究启动
6月9日至10日,科技部中国生物技术发展中心在深圳组织召开了“基因组和蛋白质组技术发展战略研讨会”,标志着该领域的“十二五”发展战略规划研究正式启动。国内从事基因组学和蛋白质组学研究的院士、专家、学者共40多人参加了会议。科技部基础司张先恩司长应邀出席会议,生物中心马宏建副主任、深圳市委常委、常
十二五基因组和蛋白质组技术发展战略研究启动
6月9日至10日,科技部中国生物技术发展中心在深圳组织召开了“基因组和蛋白质组技术发展战略研讨会”,标志着该领域的“十二五”发展战略规划研究正式启动。国内从事基因组学和蛋白质组学研究的院士、专家、学者共40多人参加了会议。科技部基础司张先恩司长应邀出席会议,生物中心马宏建副主任、深圳市委常委、常
武汉大学发现一个新的结直肠癌的致癌转录因子
结直肠癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。近日,武汉大学生命科学学院的一项最新研究成果,揭示了一个新的结直肠癌的致癌转录因子,为结直肠癌的研究提供了重要的表观基因组数据和新的关键调控因子,相关论文近日在线发表于《自然—通讯》。 据介绍,目前关于结直肠癌的多组学研究广泛集中在基因组学和转
北大团队发展最新单细胞多重组学测序技术
单细胞三重组学测序技术(scTrio-seq)单细胞中三种组学之间的对应关系癌症中两个细胞亚群的DNA拷贝数差异 2016年2月23日,《细胞研究》(Cell Research)杂志在线发表了北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组、黄岩谊研究组和首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大
新一代单细胞itChIP技术解析早期胚胎细胞命运决定机制
2019年9月3日,北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬组在《Nature Cell Biology》在线发表了题为Profiling chromatin state by single-cell itChIP-seq的文章,报道了利用一种全新的普适性,易操作的单细胞ChIP