《Nature》发布小鼠细胞的开源数据库TabulaMuris
近日,斯坦福大学、陈-扎克伯格生物中心以及加州大学旧金山分校的研究人员建立了一个名为Tabula Muris的开源数据库,收录了小鼠的多个细胞类型及其基因表达数据。这项成果于上周发表在《Nature》杂志上。 研究团队利用荧光活化细胞分选(FACS)方法和微流体液滴捕获方法,从小鼠20个不同器官中分离出超过10万个细胞,并开展单细胞RNA测序。这些数据让人们能够比较各个细胞类型和组织间的基因表达,从而更深入地了解细胞多样性。 共同通讯作者、陈-扎克伯格生物中心的Spyros Darmanis表示:“我们相信这一丰富的注释细胞集合将会成为生物医学研究的宝贵资源。通过这个项目,我们揭开了基因表达模式,能够鉴定各种组织的不同细胞类型,这可用于细胞选择、靶向和重编程。” 研究人员以三只雌性小鼠和四只雄性小鼠为研究对象,利用FACS方法分离出44,949个细胞,并利用微流体方法分离出55,656个细胞。这些小鼠为三个月大,大约相......阅读全文
小鼠腹腔巨噬细胞原代培养
实验方法原理 巨噬细胞属免疫细胞,有多种功能,是研究细胞吞噬、细胞免疫和分子免疫学的重要对象。巨噬细胞容易获得,便于培养,并可进行纯化。巨噬细胞属不繁殖细胞群,在条件适宜下可生活2-3周,多用做原代培养,难以长期生存。 巨噬细胞也建有无限细胞系,大多来自小鼠,如P331、S774A.1、RAW309
小鼠角质细胞的分离和培养
实验试剂HBSS: NaCl 8g/LKCl 400mg/LKH2PO4 60mg/L无水Na2PO4 47.86mg/L无水葡萄糖 1000mg/LNaHCO3 350mg/L实验材料妊娠期BALB/c小鼠实验步骤将1~2天龄新生裸鼠窒息后,置于培养皿中,用1%碘聚乙烯吡咯烷酮液洗净裸鼠,流水彻底
小鼠角质细胞的分离和培养
实验步骤 1) 将 1~2 天龄新生裸鼠窒息后,置于培养皿中,用 1% 碘聚乙烯吡咯烷酮液洗净裸鼠, 流水彻底冲洗,然后用 70% 乙醇洗两次。2) 上除小鼠的四肢和尾巴。3)
小鼠胚胎干细胞的培养
实验概要了解小鼠胚胎干细胞的培养方法。主要试剂1. 贮存液 DMEM(高糖) 胎牛血清 L-谷氨酰胺(200mM) MEM NEAA(10mM) HEPES(1M) β-巯基乙醇(55Mm) 转铁蛋白50mg/ml 胰岛素5mg/ml 亚硒酸钠300μM 黄体酮(20μM) 腐
小鼠腹腔巨噬细胞培养实验
细胞培养技术 实验方法原理 取小鼠腹腔巨噬细胞与乳胶颗粒在不同培养条件下混合后定量加入24孔板,37 ℃,5% CO2 培养箱中孵育后,荧光显微镜下计数吞噬百
小鼠腹腔巨噬细胞培养实验
小鼠腹腔巨噬细胞培可以:(1)吞噬与清除异物;(2)分泌生物活性物质;(3)对仿生全降解材料,降解后的无机产物与生命过程中有机物的合成作用。实验方法原理取小鼠腹腔巨噬细胞与乳胶颗粒在不同培养条件下混合后定量加入24孔板,37 ℃,5% CO2 培养箱中孵育后,荧光显微镜下计数吞噬百分率和吞噬指数。实
小鼠肝细胞原代培养实验
小鼠肝细胞原代培养可以:(1)用于细胞保种;(2)用于分子生物学研究;(3)用于基因治疗研究。实验方法胰酶消化法实验方法原理将小鼠的肝细胞从机体中取出,经胰酶、螯合剂(常用EDTA)处理,分散成单细胞,置合适的培养基中培养,使细胞得以生存、生长和繁殖。实验材料小鼠试剂、试剂盒DMEM 无血清DMEM
小鼠精原细胞的分离和纯化
【摘要】 目的 探讨小鼠精原细胞的分离纯化。 方法 用组合酶消化法制备7~8d小鼠的生殖细胞悬液;用Percoll不连续密度梯度法分离精原细胞。 结果 所获细胞悬液内活细胞、死细胞及细胞团的百分比分别为90.08%、9.92%及8.91%;平均每个睾丸可获得4.136×105个细胞;精原细胞主要分布
小鼠腹腔巨噬细胞培养实验
实验方法原理 取小鼠腹腔巨噬细胞与乳胶颗粒在不同培养条件下混合后定量加入24孔板,37 ℃,5% CO2 培养箱中孵育后,荧光显微镜下计数吞噬百分率和吞噬指数。 实验材料
Nature:细胞程序可控癌症干细胞
近日,来自怀特黑德研究所的研究人员在国际杂志Nature上刊登了他们的最新研究成果,研究者表示,在乳腺癌中,癌症干细胞和正常干细胞往往来自不同的细胞类型,但二者却利用不同但非常相关的干细胞程序,两种干细胞程序间的差异或许可以帮助研究者后期开发新型的癌症治疗手段。 致命性肿瘤起始细胞的“种子”会
Nature重磅:人类脐带血让衰老小鼠更聪明
2014年,斯坦福大学神经学家Tony Wyss-Coray发现,反复输入年轻血浆能够使老年小鼠的大脑变年轻。4月19日, Tony Wyss-Coray的团队在Nature杂志上发表的一项新研究进一步证明了年轻血液的抗衰老效应。研究发现,人类脐带血中的蛋白质TIMP2可以改善老年小鼠的大脑功能
Nature子刊构建小鼠基因组CRISPR导向RNAs文库
研究人员开发出一种方法,构建出了一个可诱导小鼠基因组全基因靶向突变的CRISPR导向RNA(gRNAs)综合文库。人们可利用这一文库来调查不同细胞类型中每个基因的作用。这一突破性的研究成果在线发表在12月23日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。 CR
Nature:寨卡病毒导致小鼠睾丸体积缩小结构破坏
大部分针对寨卡病毒(Zika Virus)的研究发现,寨卡病毒感染的影响主要集中在孕妇和出生缺陷。但在小鼠中,新的研究发现了寨卡病毒对于小鼠雄性生殖系统的严重损伤,引起了人们对人类男性可能遭受得到的威胁的严重关切。美国华盛顿大学医学院的研究人员们,通过在《Nature》上的研究文章,报道了寨卡病
大鼠、小鼠心脏干细胞(祖细胞)分离培养方法
心脏病是引起人类死因的一种代表性疾病,如果失去了心肌细胞,就会引起心力衰竭等心脏疾病。心肌细胞几乎没有再生能力,一旦失去就不能再生。从前认为心脏当中没有干细胞,所以心肌没有再生能力,但是近年的研究表明,成体心脏内部也会存在一些心肌干细胞。细胞培养操作:1.摘取出心脏,去掉心脏包膜,把心尖部分剪下来(
磁珠法分离小鼠T细胞和B细胞
PriCells: 磁珠法分离小鼠T细胞和B细胞 基本方案用AUTOMACS系统进行总T细胞、CD4+细胞或CD8+T细胞的自动分离 实验材料1、小鼠2、HBSS洗涤缓冲液3、MACS缓冲液4、磁珠5、RPMI-10完全培养基6、AUTOMACS系统和分选柱7、30μm尼龙网或40μm预分离滤膜 实
小鼠肝细胞培养实验——细胞培养技术
实验方法原理直接从生物体内获取组织细胞进行的首次培养称为原代细胞培养。原代培养是建立各种细胞系的第一步,是从事培养工作的人员应熟悉和掌握的最基本的技术。根据培养方法不同分为组织块培养法和单层细胞培养法。实验材料小鼠试剂、试剂盒DMEMDMEM胰酶PBS仪器、耗材饭盒纱布小剪子小镊子大镊子大烧杯平皿研
流式细胞术急性分离小鼠小胶质细胞
实验概要本文主要讲述了:从成年小鼠脑中分离单细胞,制成单细胞悬液,我们一个单细胞分离成单细胞悬液,除去髓鞘碎片,然后染色标记,以确定小胶质细胞的成分。细胞被固定,在多色流式细胞仪上读取。实验步骤1. 小鼠用pH值7.4,0.1M PBS彻底穿心灌注。 2. 用剪刀去头。 3. 剥开头骨的软组织。 4
流式细胞术急性分离小鼠小胶质细胞
实验步骤1. 小鼠用pH值7.4,0.1M PBS彻底穿心灌注。2. 用剪刀去头。3. 剥开头骨的软组织。4. 除去下颌骨。5. 除去头骨延髓到上颌骨之间的组织。6. 手术剪刀,取出头骨顶部,顺时针方向切割,开始和结束于右后鼓膜钩。7. 舀出大脑,维持组织的完整性。8. 立即将脑组织置于预冷的流式细
小鼠神经干细胞分化为星形胶质细胞
实验概要小鼠神经干细胞分化为星形胶质细胞主要试剂无菌水、DPBS、0.05%胰蛋白酶胰蛋白酶、细胞基础培养液、 PDL、laminin、小鼠神经分化培养液(Neuron M)、小鼠神经干细胞向星形胶质细胞分化培养液主要设备4孔板、12mm细胞培养玻片实验步骤 在4孔板每个孔中放置一块12mm细胞培养
细胞技术专题:小鼠腹腔巨噬细胞培养实验
小鼠腹腔巨噬细胞培可以:(1)吞噬与清除异物;(2)分泌生物活性物质;(3)对仿生全降解材料,降解后的无机产物与生命过程中有机物的合成作用。实验方法细胞培养技术实验方法原理取小鼠腹腔巨噬细胞与乳胶颗粒在不同培养条件下混合后定量加入24孔板,37 ℃,5% CO2 培养箱中孵育后,荧光显微镜下计数吞噬
Nature:单细胞测序(上)
Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年,冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织,一并将这些DNA进行测序,生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序
Nature:单细胞测序(下)
随着技术的飞速发展,成本大大降低,使得基因组测序成为常规技术。然而,大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序,它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。 该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序,研究小
Nature:癌细胞不死之谜
癌症最可怕的特点之一就是在治疗后能够复发。对于许多类型的癌症,包括称之为黑色素瘤的皮肤癌,个体化药物能够在实验室中根除癌细胞,然而在患者体内却只生成局部的暂时的反应。长期以来癌症研究领域急待解析的一个问题就是:癌症是如何逃避药物治疗的? 来自博德研究所、达纳法伯癌症研究所和麻省总医院的研究
Science:全球首个活人脑细胞数据库公布
据美国《科学》杂志在线版29日消息称,艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库,该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上,这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源,同时以前所未有的独特性,帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。 2002年,微软公司共同创始人之一保罗·艾
B细胞表位数据库简介与预测方法
抗原表位预测适用于已知一级结构的蛋白质或多肽抗原的线性表位的预测。人们通过观察抗原表位与已知氨基酸序列的蛋白质某些结构特征关系,发现一些蛋白质的序列或结构特征与抗原表位有关。在抗原抗体的结合反应中,抗原参与结合的部位称为 B 细胞抗原决定簇或者表位。从空间结构上看,B 细胞表位可分为线性表位(也
Nature:最大白血病数据库,辅助治疗药物的最优选择
10月17日,《Nature》杂志以“Functional genomic landscape of acute myeloid leukaemia”为题报道了这项研究。 在美国,每年约有20,000人被诊断为AML。这种癌症始于骨髓的造血细胞,最常见于老年人,且在所有血癌中预后最差。 过去
Nature子刊公布世界最大的自闭症基因组数据库
自闭症,或称为自闭症谱系障碍,是指包括了社会技能、重复行为、语言和非语言交流、以及与众不同的优势或差异等多表征型障碍。我们现在得知,自闭症分好多亚型,大多数由遗传和环境共同作用造成。据估计,每68名儿童中就有一人患有自闭症。虽然,目前自闭症的干预方法很多。但是大多数缺乏循证医学的证据。尚无最优治
科学家绘制出哺乳动物大脑运动皮层细胞图谱
美国BRAIN计划于2017年设立了“大脑细胞普查网络”项目(BICCN),旨在对人类、猴和小鼠大脑中的不同细胞进行识别和分类。目前该项目第一部分已经完成,在分子水平上对哺乳动物初级运动皮层细胞类型进行了全面的定位和图谱绘制。近期,该研究成果在《Nature》期刊上同时发表了16篇文章,并以合集
科学家绘制出哺乳动物大脑运动皮层细胞图谱
美国BRAIN计划于2017年设立了“大脑细胞普查网络”项目(BICCN),旨在对人类、猴和小鼠大脑中的不同细胞进行识别和分类。目前该项目第一部分已经完成,在分子水平上对哺乳动物初级运动皮层细胞类型进行了全面的定位和图谱绘制。近期,该研究成果在《Nature》期刊上同时发表了16篇文章,并以合集
Nature:细胞失忆或促进干细胞产生
成体细胞,比如皮肤或血液细胞,其都有一种特殊的细胞记忆,或者记录细胞如何从未定型的胚胎细胞进化到特殊的成体细胞;如今刊登于国际著名杂志Nature上的一项研究论文中,来自哈佛干细胞研究所等处的研究人员通过研究鉴别出了新型基因,当该基因被抑制时就会有效地擦除细胞的记忆,使细胞被重编程更加敏感,进开