中国科学家主导完成盐芥基因组研究
由中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院等多家单位共同完成的盐芥(Thellungiella salsuginea)基因组研究成果在《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表(http://www.pnas.org/content/early/2012/07/05/1209954109.abstract?sid=548ade97-58d5-4c0a-a1e4-e1a43a9c9c21)。本研究在基因组层面为解析盐芥极端环境耐受机制和探索适应性进化机制提供了非常有价值的线索。 盐芥是一种十字花科一年生草本盐生植物，与植物分子生物学研究中广泛使用的模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)具有很近的亲缘关系。拟南芥是甜土植物，对非生物胁迫的耐受性较低，而盐芥对高盐、干旱和低温等非生物胁迫具有极高的耐受能力，如果能将两者在基因组水平上进行比较分析，将会更加全面的揭示非生物胁迫耐受机制。此外盐......阅读全文
转基因拟南芥研究能提高作物生长速度
加拿大圭尔夫大学研究人员发现，在一种叫做拟南芥（Arabidopsis）的小花植物中插入一种特殊的玉米酶，会使其生长速度加倍，种子产量达到原来的4倍。 这一发现有望提高油菜籽、大豆等重要油料作物和生物燃料作物亚麻荠的产量，也会捕获更多大气二氧化碳，有可能给食用作物和生物燃料种植带来变革。
拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验
试剂、试剂盒HEPES-KOH山梨醇抗坏血酸维生素 C半胱氨酸PF-Percoll仪器、耗材浓缩离心设备实验步骤建议在短日照条件下培养材料以诱导营养生长，并在照光的早期收取材料以提高获得完整叶绿体的产率。所以试剂应在收集材料之前准备好，并连同其他一些设备，如离心机转头及离心管等在冰箱或冰上冷却至 0
科学家为模式植物拟南芥绘制“蓝图”
任何生物体的每个细胞都包含完整的遗传信息，或者说是一个生物的“蓝图”，编码所谓的DNA核苷酸构建块序列。但是植物是如何创造出各种各样的组织的呢？比如将光能转化成化学能并产生氧气的叶子，或者从土壤中吸收养分的根？答案就在各自组织细胞的蛋白质模式。科学家为模式植物拟南芥绘制“蓝图”。图片来源：Cha
《科学》：乙烯能调节拟南芥根部干细胞分化
乙烯是一种能够催熟果实的气态植物激素。在最新一期的《科学》杂志上，由瑞典、法国、英国的研究人员联合发表的文章报告说，他们发现乙烯还能够调节拟南芥根部的干细胞分化。 已经知道，多细胞生物的构建依赖于能兼顾自我更新和产生分化的子细胞的特殊细胞——干细胞。在这项新的研究中，研究人员证实对植物生长很重要的气
拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验
试剂、试剂盒HEPES-KOH 山梨醇
概述泛素缀合酶在拟南芥中的研究
泛素缀合酶是由150-200个氨基酸组成，具有研究拟南芥中Ubc6的功能的物质。 在拟南芥中，大约有一半的E2s成员的生化特征被描述，并且有很大一部分的拟南芥E2s成员都可以在酵母细胞中找到相应的同源物。然而，在拟南芥中有三种E2s基因家族表达的蛋白并没有在芽殖酵母中找到同源物，但是却在哺乳动
拟南芥种子休眠机制最新研究进展
近日，中科院植物研究所研究员刘永秀团队发现拟南芥转录后调控的重要分子机器pre-mRNA 3'末端加工复合体参与种子休眠调控。相关研究成果发表于《植物杂志》。种子休眠是指完整有活力的种子在适宜环境条件下仍不能萌发的生物学特性，受环境和遗传因素影响，是典型的多基因调控的复杂数量性状。目前已发现
拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验
试剂、试剂盒 HEPES-KOH山梨醇抗坏血酸维生素 C半胱氨酸PF-Percoll仪器、耗材 浓缩离心设备实验步骤 建议在短日照条件下培养材料以诱导营养生长，并在照光的早期收取材料以提高获得完整叶绿体的产率。所以试剂应在收集材料之前准备好，并连同其他一些设备，如离心机转头及离心管等在冰箱或冰上冷却
拟南芥突变体纯合植株的获得
实验概要本实验利用农杆菌转化侵染野生型拟南芥获得变体纯合植株。实验材料拟南芥(Arabidopsis thaliana, Col-0)，培养条件，长日照为16h光照/8h黑暗，22oC；短日照为8h光照/16h黑暗，22oC。实验步骤1. 拟南芥基因组的小量提取 1) 取0.2 g拟南芥叶片，
中国科学家主导完成盐芥基因组研究
由中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院等多家单位共同完成的盐芥(Thellungiella salsuginea)基因组研究成果在《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表(http://www.pnas.org/content/early/2012/07/05/12099541
中国科学家主导完成盐芥基因组研究
由中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院等多家单位共同完成的盐芥(Thellungiella salsuginea)基因组研究成果在《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表(http://www.pnas.org/content/early/2012/07/05/12099541
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
DNA甲基化与拟南芥的免疫力
DNA甲基化有助于拟南芥的免疫力，它动态调控了某些基因的表达，让植物能够抵御细菌感染。近日，一篇在线发表于《PNAS》上的文章阐述了以上研究成果。 美国加州索尔克生物学研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人员利用MethylC测序鉴
拟南芥中应对硫胁迫的硫的逆向过程
长期以来，植物中的主要（次要）代谢途径一直被认为是将主要代谢产物的前体转化为具有生物活性终产物的一种途径。然而，在环境刺激（如括营养胁迫条件）下，植物组织会出现内源性的终产物降解现象。因此，是否可以将专门的代谢物特别是富含氮和硫的代谢物重新整合到初级代谢中以回收投入其中的资源，对植物来说具有普遍
花序真空渗透法转化拟南芥及其抗性筛选
实验概要本实验利用了花序真空渗透法转化拟南芥，并进行了抗性筛选。主要试剂卡那霉素，YEB培养基，菌株EHA105，1/2 MS液体培养基，表面活性物质L-77 Silwet主要设备摇瓶，摇床，高速离心机，生长室实验步骤1. 将表达载体pBI121::AtMYBl，导入农杆菌EHA105本研究选用农杆
拟南芥种子萌发和非生物胁迫的相关研究
2021年6月15日，Cell Reports在线发表了西班牙萨拉曼卡大学生物系Oscar Lorenzo教授团队完成的题为“Redox feedback regulation of ANAC089 signaling alters seed germination and stress res
Nature－Plants文章：精准高通量检测Rloop分布的新方法
来自清华大学生科院，清华-北大生命科学联合中心的研究人员发表了题为“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章，首次报道了精准、高效、高通量检测R-loop的方法，并利用此方法首次揭示模式植物拟南芥
华大基因再发PNAS文章
作为基因组测序领域的排头兵，近期深圳华大基因研究院与中科院系统，以及韩国，美国等处的科学家合作，发表了题为“Insights into salt tolerance from the genome of Thellungiella salsuginea(《小盐芥基因组研究揭示其耐逆奥妙》
中科院PNAS发表测序新成果
来自中国科学院遗传与发育生物学研究所、深圳湖大基因研究所、美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校和美国普渡大学的研究人员联合发表了题为 “Insights into salt tolerance from the genome of Thellungiella salsuginea”的论文，解
我科学家主导完成白菜全基因组研究
8月29日，由多国科学家共同合作完成的白菜全基因组研究成果在《自然—遗传学》上在线发表。这是由中国科学家主导，通过国际合作完成的又一重大成果。 白菜类蔬菜包括结球白菜、小白菜、菜心和芜菁等形态各异的一大类蔬菜。据了解，科学家开展了白菜基因组注释、比较基因组学、基因组进化和各种
不同植物SBPbox基因家族的比较分析
实验概要本研究利用生物信息学资源和工具，对双子叶和单子叶模式生物拟南芥和水稻中的SBP-box基因家族进行了比较分析。利用两个物种的SBP-box基因编码的蛋白质序列构建了系统发生树。在系统发生树的末端节点上鉴定出12对旁系同源基因。利用非同义替换率与同义替换率(KalKs)分析了同源基因分离之后所
科学家开发高性能大片段插入删除变异鉴定工具
10月13日，华中农业大学生物信息团队杨庆勇课题组联合新加坡国立大学Sung Wing-Kin（宋永健）课题组在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表论文，开发出高性能的大片段插入删除变异（InDel）鉴定工具IndelEnsembler，使大片段InDel鉴定准确
遗传发育所等解析盐芥全基因组序列
盐芥是十字花科盐芥属的一种盐生植物，与双子叶植物研究中所常用的模式植物拟南芥亲缘关系较近。盐芥具有作为模式植物的一系列良好特征，如个体较小、生活周期短、自花授粉、种子量大、基因组较小，而且易于转化。最重要的是，盐芥具有对高盐、干旱和低温等非生物胁迫极高的耐受能力，这使其成为研究植物耐受非生物胁迫
科学家建立碳四禾谷类研究的模式植物体系
模式植物拟南芥、xiaomi和谷子遗传转化流程图 中国农科院供图 近日，中国农业科学院作物科学研究所与山西农业大学等单位合作，利用迷你谷子构建碳四（C4）禾谷类作物研究的模式植物体系。相关研究成果在线发表在《自然—植物》（Nature Plants）上。 论文
在拟南芥生殖细胞DNA复制研究中取得进展
被子植物雄配子发生过程中，单倍体小孢子经历一次不对称有丝分裂（PMI）产生营养细胞和生殖细胞，之后生殖细胞再进行一次对称的有丝分裂（PMII）形成两个精细胞。拟南芥花粉常被看作一个理想的发育生物学模型，这个简单的系统不仅经历了细胞的分裂、分化、细胞命运的决定等重要生物学过程，还涉及大量花粉特异基
实验室“标配”拟南芥研磨提取核酸引发的讨论
给大家分享的内容是——拟南芥研磨提取核酸。那接下来，就让我们先睹为快，看看这个案例的情况。 实验：拟南芥研磨提取核酸 实验地点：某大学 实验样品：拟南芥 实验步骤：1、在2ml圆底离心管底放入拟南芥样品，每管样品量不超过单管体积的1/3； 2、在离心管中加入3mm硬质不锈钢研磨珠2颗； 3、接下来的
揭秘拟南芥种子的萌发和胁迫响应的运作机制
2021年6月15日，Cell Reports在线发表了西班牙萨拉曼卡大学生物系Oscar Lorenzo教授团队完成的题为“Redox feedback regulation of ANAC089 signaling alters seed germination and stress res
研究揭示拟南芥孤儿基因调节花粉发育的分子机制
开花植物中，花粉的形成以及随后的花粉管生长和受精在植物的育性中具有关键作用。花粉的适当发育和成熟对种子植物的遗传多样性具有重要影响，对农业作物生产产生重要作用。植物中孤儿基因的出现可能是植物不断适应环境的进化结果，其功能可能促进植物的生存。近年来，拟南芥特异性孤儿基因Qua Quine Starch
通过拟南芥揭示高温下植物基因突变的原理
团队以拟南芥为对象研究多代高温下植物基因突变的原理（扬州大学供图） 近日，扬州大学园植学院教授校金飚和农学院徐辰武在《基因组生物学》期刊在线发表题为“多代高温胁迫下拟南芥全基因组DNA突变研究”的最新研究成果。该研究首次从种群遗传谱系和单粒种子遗传谱系两个层面揭示了长期多代高温下植物的DN
PLoS－Genet：何新建等模式植物拟南芥研究获进展
2014年1月22日，北京生命科学研究所何新建实验室在《PLOS Genetics》杂志在线发表题为“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me