中国科学家主导完成盐芥基因组研究
由中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院等多家单位共同完成的盐芥(Thellungiella salsuginea)基因组研究成果在《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表(http://www.pnas.org/content/early/2012/07/05/1209954109.abstract?sid=548ade97-58d5-4c0a-a1e4-e1a43a9c9c21)。本研究在基因组层面为解析盐芥极端环境耐受机制和探索适应性进化机制提供了非常有价值的线索。 盐芥是一种十字花科一年生草本盐生植物，与植物分子生物学研究中广泛使用的模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)具有很近的亲缘关系。拟南芥是甜土植物，对非生物胁迫的耐受性较低，而盐芥对高盐、干旱和低温等非生物胁迫具有极高的耐受能力，如果能将两者在基因组水平上进行比较分析，将会更加全面的揭示非生物胁迫耐受机制。此外盐......阅读全文
拟南芥RNA核糖甲基化修饰研究方面获进展
3月30日，中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组、北京大学现代农学院博士王玉秋和中科院遗传与发育研究所研究员李家洋课题组合作在Nucleic Acids Research上发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
研究发现拟南芥表皮毛时序性发育的分子机理
3月6日，国际学术期刊The EMBO Journal 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所王佳伟研究组题为A spatiotemporally regulated transcriptional complex underlies heteroblastic dev
实验室“标配”拟南芥研磨提取核酸引发的讨论
给大家分享的内容是——拟南芥研磨提取核酸。那接下来，就让我们先睹为快，看看这个案例的情况。实验：拟南芥研磨提取核酸实验地点：某大学实验样品：拟南芥实验仪器：TL2020高通量组织研磨仪实验步骤：1、在2ml圆底离心管底放入拟南芥样品，每管样品量不超过单管体积的1/3；2、在离心管中加入3mm硬质不锈
拟南芥花粉管苯胺蓝染色方法和试剂
母液1. 冰醋酸2. 乙醇3. 1 M NaOH(氢氧化钠)4. 100 ml 1 M K2HPO4（磷酸氢二钾）5. 100 ml 1 M KH2PO4（磷酸二氢钾）6. 苯胺蓝（Fisher）7. 甘油工作溶液1. 冰醋酸含量为10%的乙醇溶液（固定组织使用）2. 50 mM 偏磷酸钾溶液：4.
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验
实验步骤 ##一、 cDNA 宏阵列的样品制备培养基： I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 养 基（GibcoBRL， Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料（Hypon
PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素...
PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素运输功能基因研究信号分子的运输在调节植物生长、发育和环境应答方面起到非常重要的作用。最显著的例子就是植物激素的空间分布控制植物发育模式。以色列特拉维夫大学Eilon Shani研究团队使用amiRNA进行转录组多目标正向遗传筛
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的，近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析，从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
一项新研究挑战基因随机突变理论
长期以来，基因突变的随机性一直是生物演化理论的基础，然而这个生物学经典观点受到一项新研究的挑战。 来自美国加利福尼亚大学戴维斯分校和德国马克斯·普朗克发育生物学研究所的研究人员日前在英国《自然》杂志上发表论文说，他们通过拟南芥实验发现，基因突变并非是随机的，而是以某种对植物有益的方式进行。这一
lncRNA在农业领域的研究成果（三）
【结论】①通过lncRNA测序，在上万条白菜中候选的lncRNA中挑出了1,300余条与花粉授粉相关的lncRNAs。分析结果显示一部分lncRNA在花蕾到授粉受精整个发育过程中持续表达，其余的部分为阶段、部位特异性表达。lncRNA在白菜不同发育阶段花蕾种的表达呈现出较明显的差异，在V级花蕾中特异
一项新研究挑战基因随机突变理论
新华社北京1月15日电（记者张莹）长期以来，基因突变的随机性一直是生物演化理论的基础，然而这个生物学经典观点受到一项新研究的挑战。 来自美国加利福尼亚大学戴维斯分校和德国马克斯·普朗克发育生物学研究所的研究人员日前在英国《自然》杂志上发表论文说，他们通过拟南芥实验发现，基因突变并非是随机的，而是
版纳植物园转录调控因子Alfinlike基因家族研究获进展
通过比较基因组学，在基因组层次上研究特定基因家族的进化，进而揭示其变化的原因和机制，已成为目前进化生物学关注的热点问题。中科院西双版纳热带植物园生态进化生物学研究组研究人员利用模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)及其近缘物种琴叶拟南芥(A. lyrata)和小盐芥(Th
昆明植物所建立全新植物基因链接与克隆系统
随着高通量测序技术的普及与基因组信息爆炸式的增长，解析基因与基因组孕藏的功能信息成为我们了解生命密码的必需步骤。功能基因研究是破解基因组信息这部天书的重要手段之一，而功能基因的研究离不开载体的构建与转基因方法。传统的载体构建耗时耗力，伴随着烦琐的酶切与连接手段，成功地构建一个用于植物转化的载体往
研究揭示模式植物适应高海拔环境机制
青藏高原具有低温、强风和强辐射等极端环境特点，是全球生物多样性的热点地区。模式植物拟南芥在全球广泛分布。西藏地区自然分布的拟南芥为探讨植物如何适应极端环境提供了理想材料。中国科学院植物研究所研究员郭亚龙与徐永超团队，联合北京大学教授顾红雅，聚焦青藏高原海拔约4000米的拟南芥自然群体材料，将其与海拔
用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法（二）
2 结果与讨论2.1 PCR模板DNA的快速制备本方法是将少量植物叶片在TE溶液或去离子水中，经钨合金珠在离心管内的振荡破碎，直接获得DNA溶液。用多功能组织细胞研磨器（MTM-60）一次可操作60个样品。琼脂糖凝胶电泳表明，用TE和去离子水都可获得分子量较大的DNA片段（图1A）。用TE制备的DN
新研究挑战DNA随机突变进化理论
根据美国加州大学戴维斯分校和德国马克斯普朗克发育生物学研究所开展的一项新研究，拟南芥可能是理解和预测DNA突变的关键。这一发表在12日《自然》杂志上的新发现，将从根本上改变人们对进化的理解，有朝一日或可帮助研究人员培育出更好的作物，甚至帮助人类对抗癌症。 当DNA受损且未修复时，就会发生突变，从
经5年攻关,朱健康研究组在CRISPR领域取得重大进展,
2018年5月17日，朱健康研究组在Nature Communications在线发表了题为“CRISPR/Cas9-mediated gene targeting in Arabidopsis using sequential transformation”的研究论文，该论文报道了拟南芥中基因
拟南芥转录复合物参与调控植物盐害反应机制
在自然界中植物的生长发育往往受到各种环境胁迫(Environmental stresses)的影响，如高温、低温及干旱等。其中土壤的盐碱化(Salinity stress)是限制农作物栽培及产量的重要环境因子，但是人们对植物耐盐害的潜在分子机制仍不十分清楚。WRKY家族是一类植物特有的转
拟南芥研究揭密被子植物阻止多精受精分子机制
三个受体负责阻止多花粉管穿出受精。（瞿礼嘉供图） 1月20日，《科学》刊发北大生命科学学院教授瞿礼嘉实验室研究成果，揭示了模式植物拟南芥通过小肽信号及其受体介导的信号通路防止多精受精的分子机制，即每个胚珠仅允许一根花粉管穿出花柱道的隔膜进入其内进行受精。 正常情况下，
研究发现拟南芥调控种子休眠和萌发的新成员
研究种子休眠和萌发的调控机理对于植物生存和农业生产具有重要的理论意义。种子休眠属于数量性状，受环境因素和遗传因子的共同调控。拟南芥DOG1（DELAY OF GERMINATION 1）基因是控制种子休眠数量性状位点（QTL）的主效基因，DOG1功能缺失突变体的种子休眠彻底丧失，并且DOG1相关
我国学者研究发现拟南芥为油菜育种开辟新路径
对于油菜种植者来说，收获油菜种子是他们一年的辛劳获得回报的时刻。然而由于油菜果荚的开裂，他们实际收获的种子往往达不到预期产量。他们更担心收收获时遇到反常气候，因为极端气候变化会导致果荚过早开裂，进一步降低种子产量，从而影响经济收入。因此，他们更倾向于选择抗开裂的油菜品种，这也对于油菜育种家提出了
拟南芥花粉管苯胺蓝染色的仪器和步骤
一、仪器1. 紫外显微镜二、步骤1. 在1.5 ml 离心管里加入250 μl 冰醋酸，将雄蕊浸泡到冰醋酸里至少固定1.5小时。如果需要可将组织过夜固定。2. 将固定完的组织浸泡在1 M 氢氧化钠溶液里过夜处理，是组织软化。3. 用偏磷酸钾洗植物组织三次。（在这个阶段植物组织是易碎的）4. 用200
拟南芥超级增强子鉴定与功能验证研究获进展
近日，东北地理所农田有害生物控制学科组孟凡立研究员团队与美国密歇根州立大学（Michigan State University）Jiming Jiang团队和英国约翰英纳斯中心（John Innes Centre）Anne Osbourn团队合作，在国际权威SCI期刊PROCEEDINGS OF
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验（二）
11.用 mRNA 纯 化 试 剂 盒（Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) 将 Poly.(A )+ RNA从总R N A 中分离出来（见注释5)。####（2） c D N A 文 库 的 构 建1.取1. 5 〜7. 5 μg poly (A )+ R
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(一)
除 cDNA 微阵列外，基于尼龙膜支持物的 cDNA 宏阵列方法是又一被广泛应用的大规模基因表达数据的收集方法。从新基因的发现到基因表达谱的分析， cDNA 宏阵列被应用于分子生物学研究领域的各个方面。尽 管 cDNA 宏阵列的点阵密度低于微阵列，但由于应用灵敏度较高的同位素标记的 cDNA 探针，
云序生物最新“RNA－甲基化”研究汇总拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上频频亮相，并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者，许多学者将它作为研究对象，并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合，证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期，
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(二)
注意事项1.所有的试剂必须用电阻高于 17. 6 的双蒸水配制。2.提取 RNA 所用的玻璃器具必须于 180°C 烘烤至少 8 h 以灭活 RNase。除缓冲液外的所有溶液都要用 0 •1 % DEPC水 配 制（见注释 3)。 RNase 的污染主要来源于实验人员的手，所以进行 RN A 实验时
拟南芥根毛中线粒体和微丝双标活体实时观察
实验概要本研究用稳定表达微丝标记GFP-FABD2的拟南芥材料，结合线粒体活体标记染料Mitotracker RedCMXRos，对拟南芥根毛和线粒体作了活体动态同步观察。而且利用隐失波显微镜和spinning disc confocal显微镜比较了稳定表达标记线粒体GFP-mito和GFP
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验（一）
实验步骤 ##一、 cDNA 宏阵列的样品制备培养基： I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 养 基（GibcoBRL， Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料（Hyponex 10 : 5 : 10; Hyponex Japan
云序生物最新“RNA－甲基化”研究汇总拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上频频亮相，并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者，许多学者将它作为研究对象，并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合，证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期，
研究建立植物高特异性抵御DNA病毒新方法
双生病毒（Geminiviruses）是存在于植物中唯一一类具有孪生颗粒形态的单链DNA病毒，也是目前已知的最大的单链DNA病毒家族。据ICTV(International Committee on Taxonomy of Viruses)报道该类病毒目前已增至九个属，其在单子叶和双子叶植物中具