非编码RNA调控的新的胃癌促癌基因

近日,重庆医科大学药学院肖斌教授团队与陆军军医大学(原第三军医大学)国家免疫生物制品工程技术研究中心邹全明教授团队在肿瘤学领域权威杂志《Oncogene》(JCR 1区)在线发表了题为“The miR-29c-KIAA1199 axis regulates gastric cancer migration by binding with WBP11 and PTP4A3”的研究论文。 这一研究揭示了胃癌中一个新的促癌基因KIAA1199,其在胃癌中表达显著上调,且与胃癌的分期、淋巴结转移和预后相关;体内外实验证实,KIAA1199能够显著促进胃癌的转移和增殖。KIAA1199的作用机制和表达调控示意图(图片来自原文) 此外,研究人员通过质谱(MS )分析和免疫沉淀(IP)技术,鉴定出与KIAA1199结合的下游蛋白为:WBP11 (WW domain binding protein 11)和PTP4A3(protein......阅读全文

微RNA的作用

人类基因组计划结束后,人们发现编码蛋白质的基因只占总基因组的约2%。而占人类基因组95%的非编码序列竟是产生大量非编码RNA的源泉,这些非编码RNA主要充当调控者的角色,在细胞分化凋亡、生物发育、疾病发生等方面均起重要作用。其实,RNA比DNA更为古老,它组成了地球上最早的生命。生命起源初期,没有由

IGF2BP3的蛋白诱饵,调控MYC和SNAIL的表达,抑制胃癌的转移

  胃癌(Gastric cancer, GC)仍是我国最常见的胃肠道恶性肿瘤,肿瘤转移是预后不良的主要原因。环状rna (circrna)是一种具有重要调控作用的有趣的非编码rna。然而,circrna在胃癌转移中的作用尚未完全阐明。在这里,作者报道了与匹配的非癌组织相比,在103对GC组织中ci

Coimbra基因和华大基因联合发起胃癌基因组研究计划

  2013年9月30日,华大基因和来自葡萄牙的一家新兴生物公司Coimbra基因联合发起了一项胃癌基因组研究计划,以解密胃癌背后的遗传奥秘。该项目的启动经费达90万美元,将成为胃癌领域内首个大规模基因组研究项目。该项目的科研团队包括来自葡萄牙波尔图顶级癌症研究所 ――IPATIMUP的遗传学家

微生物所发现植物保护内源编码基因避免RNA沉默的新机制

  在真核生物中,RNA沉默是一个具有核苷酸序列特异性的,能够导致RNA降解、DNA甲基化,异染色质形成,以及蛋白翻译抑制的调控机制。在植物中,诱发高效的RNA沉默还包括siRNA和甲基化在靶序列上的漂移、沉默信号在细胞间和整株植物的扩散并产生由信号诱导的RNA沉默(非自主性沉默)。植

我国发现一类新型长非编码RNA-基因组“暗物质”不断“正名”

  国际著名学术期刊Molecular Cell近日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新进展。该研究发现,一类新型长非编码RNA,或与小胖威利综合征的发生发展密切相关。  人类基因组中存在大量被称为基因组“暗物质”的非编码序列,包括基因

宁波大学Sci-Rep解析癌相关ceRNAs

  来自宁波大学医学院的研究人员,针对胃癌中长链非编码RNA(lncRNAs)相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)展开了调查,研究结果发布在8月15日的《Scientific Reports》杂志上。  宁波大学医学院的郭俊明(Junming Guo

北京生科院发表环形非编码RNA识别新技术

   2月28日,国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因为目前在环形RNA识别方面存

长链非编码RNA:-从科研到临床(一)

概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子;根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA;它具有多种作用机制,比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结

非编码RNA的调控作用研究计划项目指南

  基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制重大研究计划2016年度项目指南  非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究,有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络,从不同于蛋白质编码基因的角度注释和

JCI:促发儿童骨肿瘤的非编码RNA

  尤文氏肉瘤是骨或其周围软组织癌症,主要影响儿童和年轻成人。尤文氏肉瘤的特点是易位事件的发生,即RNA结合蛋白——EWS与转录因子如FLI1的融合。  以前的研究工作表明,该融合蛋白EWS-FLI1通过改变基因表达,促进癌症,但融合蛋白作用的靶基因是未知的。  发表在Journal of Clin

关键非编码RNA分子促进皮肤癌恶化

  在最近一项研究中,图尔库大学中心医院和西方癌症中心(FICAN West)的研究人员发现了一种新的RNA分子PRECSIT,它参与调节了皮肤鳞状细胞癌的生长和侵袭过程。将来,PRECSIT可能会成为检测快速进展或扩散的鳞状细胞癌的新标志物,以及有可能成为新疗法的靶标。  皮肤癌是世界上最常见的癌

中科院Cell子刊解析非编码RNA

  来自中科院、福建农林大学等机构的研究人员在新研究中证实,一种叫做NRAV的长链非编码RNA(lncRNA)通过抑制干扰素刺激基因转录调控了抗病毒反应。这一研究发现发表在11月12日的《Cell, Host & Microbe》杂志上。  中科院微生物研究所的陈吉龙(Ji-Long Chen)研究

Nature:像海绵一样的非编码RNA

  一种称为RsmZ的小分子RNA具有特殊的功能:屏蔽细菌中抑制翻译的蛋白的作用,最新一项研究揭示了这种RNA如何能完成其功能的分子机制,指出RsmZ像海绵一样能吸收多种阻遏蛋白(repressor proteins)。  小 RNA(small RNAs 或 sRNAs)是一类长度为40-400个

出人意料的新才能:非编码RNA

  在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到:人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质(dark matter)”的非编码序列,包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图,构成了超过

曹雪涛院士Science揭示重要非编码RNA

  来自第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院的研究人员,发现一种名为lnc-DC的长链非编码RNA控制了人类树突状细胞的分化。   领导这一研究的是我国著名的免疫学家曹雪涛(Xuetao Cao)院士。其现任职第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院,主要从事肿瘤免疫治疗和分子免疫

eLife:首次发现促癌非编码RNA因子—LAST

  中国科学技术大学吴缅教授研究组发现一条受c-Myc转录激活的长非编码RNA。  中国科学技术大学吴缅教授研究组发表了题为“LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA

长链非编码RNA:-从科研到临床(二)

脂类代谢和脂肪生成最新的研究表明,lncRNA控制肝脏中的脂类代谢,调控脂肪生成,从而维持机体的脂质稳态[9]。APOA1编码蛋白是高密度脂蛋白的重要组分。其反义转录本APOA1-AS可以在体内和体外抑制APOA1的表达。LncRNA NEAT1在脂肪生成过程中调节PPARγ2的可变剪接,它还介

水生所非编码RNA分子机制研究取得进展

  非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)是指不能编码产生蛋白质的RNA分子,种类众多。具有调控作用的非编码RNA包括微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)以及环状RNA(circRNA)等。越来越多的研究表明,非编码RNA具有重要且复杂的生物学功能。中国科学

Science子刊专题:癌症中的非编码RNA

  非编码RNA(尤其是microRNA)是众多细胞过程的关键调控子,与发育和癌症进程密切相关。本期Science Signaling杂志通过专题“Noncoding RNAs in cancer”,介绍了这类分子的生理和病理学功能。  发现哺乳动物基因组中的非编码RNA,不仅揭示了一类新的生物学调

【盘点】长链非编码RNA的研究进展

   非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他均为非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)等调控

Nature里程碑研究:新型非编码反义RNA

  在研究帕金森氏病的过程中,一个国际研究小组获得了一个可以提高工业蛋白质合成用于治疗用途的新发现。他们设法了解了非蛋白质编码RNA的一个新功能:借助这类称作“反义”的非编码RNA的活性可以提高编码基因的蛋白质合成活性。相关成果发表在10月14日的《自然》(Nature)杂志上。   为了合成蛋白

非编码RNA-Nfi调控水稻固氮酶活性

   近日,生物所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性,为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。该成果发表在最新一期的经典微生物学杂志《应用环境微生物学(Applied and Environmental Micro

长链非编码RNA:-从科研到临床(三)

肾脏疾病与糖尿病 糖尿病经常伴随着肾病的发生[5]. 比如基因间lncRNA PVT1与二类疾病都紧密关联。研究人员在II型糖尿病人的晚期肾病进程中发现了PVT1的基因变异。高糖处理可以诱导人的肾间质细胞中PVT1和纤连蛋白1、IV型胶原蛋白、TGFβ1、PAI1等因子的高表达。相反,敲除P

遗传编码荧光RNA探针研究获新进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503155.shtm

Cell:长期被误解-非编码RNA存在“认知黑洞”

   在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码RNA,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存?  《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫

武汉大学邓长生小组发现胃癌易感基因

“随机找一人提取基因,就能知道他以后是否可能患上胃癌。”武汉大学中南医院消化内科博士生导师邓长生教授团队历经10年研究,在国内率先筛查出6个与胃癌有关的易感基因。 日前,在湖北省科技厅主持的鉴定会上,来自北京、上海等地的消化界权威专家认为该研究达“国际先进水平”,该研究的相关论文被世界著名的科技文献

北京基因组所揭示胃癌耐药分子机制

  多药耐药基因MDR1过表达是造成肿瘤化疗耐受和肿瘤病人生存和预后较差的主要原因之一,但MDR1过表达的调控机制还不清楚。中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室赵永良课题组利用胃癌为模型,在研究耐药性分子机制方面获得新进展,发现人类解旋酶RecQL4通过促进转录因子YB1的磷酸化而调控

进化分析揭示编码区和非编码区RNA编辑的功能调控效应

  2017年3月,国际知名学术期刊PLOS Genetics在线发表了斯坦福大学Jin Billy Li课题组和中山大学生命科学学院张锐课题组共同研究的题为“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c

长链非编码RNA编码多肽的系统挖掘和鉴定研究新进展

  6月13日,Molecular & Cellular Proteomics在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队和中科院院士陈润生团队,关于长链非编码RNA(lncRNA)编码多肽的系统挖掘和鉴定的研究论文Deeply Mining a Universe of Peptides En

云序客户8.0分成果揭秘:还愁lncRNA功能机制如何研究吗?

  文章导读   LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱