BioTechniques:从外周血中分离cfDNA的高通量方法

传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从全血中分离出血浆,这一步妨碍了自动化的实施。为此,加拿大迈克•史密斯基因组科学中心的研究人员开发出一种方法,能够高通量地分离ctDNA。 在液体活检中,人们通常需要对游离的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行分析。传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从全血中分离出血浆,这一步妨碍了自动化的实施。为此,加拿大迈克•史密斯基因组科学中心的研究人员开发出一种方法,能够高通量地分离ctDNA。这项成果发表在《BioTechniques》二月刊上。 液体活检,这种新兴技术有望改变癌症检测和疾病监控。ctDNA是片段化的DNA,由癌细胞在凋亡或坏死过程中释放到血浆。通过检测ctDNA,医生有望发现癌症复发或转移的线索。目前,基于ctDNA的新一代测序检测已引入科研和临床实验室。 对于这些检测而言,第一步当然是纯化ctDNA。传统的方法需要先通过离心从全血中分离出血浆。不过,离心不仅是耗时费......阅读全文

cfDNA检测能有效对双胎妊娠进行唐氏综合征筛查

近日,一项刊登在国际杂志Ultrasound in Obstetrics & Gynecology上题为“Screening for trisomies by cfDNA testing of maternal blood in twin pregnancy: update of The Fetal

高通量组织研磨器

高通量组织研磨器可以在3分钟内最多对2×96个样本同时进行快速、有效的研磨。可以干磨、湿磨和混合以及均质化处理。样本的种类包括:植物组织、动物组织、细胞、细菌和酵母等等。对于提取大通量样本中的核酸,大大提高研磨效率和质量。

高通量基因点样仪

  高通量基因点样仪是一种用于基础医学领域的医学科研仪器,于2016年11月17日启用。  技术指标  1.X 轴移动速度:50-250mm/s;Y 轴移动速度:100mm/s;Z 轴移动速度:100mm/s;X,Y,Z轴移动精度:± 0.2mm;划线头定位精度:± 0.2mm。2.划头最小间距:

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

高通量测序的步骤

当然,首先地提取出您想要测序的东西,比如RNA、DNA 。再就是建库-测序-分析。建库需要将序列片段化、加接头、PCR。不同的业务有细微的差别,比如RNA要先反转录成cDNA等等。然后就是上机测序了!最后就是数据分析了。数据分析分为流程分析(基本分析)和个性分析(根据老师课题分析)。这些以后呢,就是

转录组高通量测序

(第二代高通量测序技术-454)  转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代

高通量测序技术包括

高通量测序技术及原理介绍如下:高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(“Next-generation” sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。测序技术推进科学研

高通量细胞迁移筛选

细胞迁移是一个活的生物生长和维持生命过程中不可缺少的的关键过程。为了完成相应的功能,体内的细胞经常会以特定的方向迁移到特定的位置。迁移是一个循环的过程,细胞向前端伸出突触,缩回其尾端。动物组织中的细胞发生迁移主要是为了响应特定的外部信号。细胞迁移对于胚胎发育、伤口愈合、分化以及免疫应答等都是非常重要

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

高通量测序的意义

  高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降, 以人类基因组测序为例, 上世纪末进行的人类基因组计划花费 30 亿美元解码了人类生命密码, 而第二代测序使得人类基因组测序已进入万(美)元基因组时代。如此低廉的单碱

高通量平行合成仪

  产品描述:这是专为精细化工等行业研发设计的组合化学和多产品合成设备。该产品按反应板温度区域数量不同分为单区反应和多区反应;按多区反应板功能不同可分为加热型、加热/冷却型、回流型;按试管容量不同及试管的装载数量不同又可分成多个品种规格。   产品特点:   ●模块化设计理念   1、一个反应

药物高通量筛选技术

药物高通量筛选技术简单介绍一下关于药物高通量筛选技术的知识。一.概念高通量筛选(High throughputscreening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机对实验数

高通量平行合成仪

  仪器产品描述:这是专为精细化工等行业研发设计的组合化学和多产品合成设备。该产品按反应板温度区域数量不同分为单区反应和多区反应;按多区反应板功能不同可分为加热型、加热/冷却型、回流型;按试管容量不同及试管的装载数量不同又可分成多个品种规格。   产品特点:   ●模块化设计理念   1、一个

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

什么是高通量测序

高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要

Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测

  加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。  研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN

Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测

  加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。  研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN

厉害了!cfDNA又添新用途,或将成为新型衰老生物标志物

  在我们年轻的时候,DNA会规矩的待在细胞核中,但随着年龄的增长,DNA开始不再那么听话。在血液中,细胞因应激或降解释放的cfDNA仍保留了部分的组装状态,可为生物标志物研究提供信息。  近年来,表观遗传学成为研究热点。由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位——核小体也是表观基因组的重要组成。在

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(一)

简介:什么是PCR芯片? 实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(一)

摘  要:制备大量生物样品的模板DNA用于PCR检测是费时费人工的工作。本文介绍一种高通量的植物基因组DNA(gDNA)快速制备及其用于PCR基因型检测的操作方法。将一小段单子叶植物苗叶片(长度约30 mm或40 mm,与96方孔板的孔深大致相同) 或一小块(约2~4 mg)双子叶植物叶片放入9

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(五)

重复性 实时定量PCR的定量特性使得PCR芯片的重复性强。为检测重复性,2位研究者采用了同样的总RNA样品,分别进行了4次重复试验。两个人使用同种PCR芯片,但批号不同,并且每个人都分两天进行试验。比较两位研究者分别做的4张芯片的原始Ct值。图5显示了比较结果的图示和相关系数。每一组比较结果均获得理

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(三)

将纯化定量的水稻品种(93-11)基因组DNA标准样品(0.5~8 ng)与1.0 µL本方法制备的水稻品种(02428)基因组DNA混合作为模板,用InDel 标记引物(表1)进行PCR扩增和PAGE检测。箭头指某反应(或2个反应之间)其02428与93-11条带的信号值大致相等(即DNA

一种新型整合酶抑制剂高通量筛选方法

  随着HIV-1病毒耐药性的不断升级,抗艾滋病药物的研发远远滞后,抗HIV-1药物新靶点的发现和创新药物的研发已成为燃眉之急。HIV-1整合酶催化病毒cDNA与宿主细胞基因组的整合,是HIV病毒复制周期中必需的关键酶。人体内无整合酶功能类似物。因此,整合酶是抗艾滋病药物研发的理想靶点。  近年来,

张锋团队开发出高通量的单细胞RNA测序方法

  去年,Broad研究所的研究人员在《Science》上发表了一种称为sNuc-Seq的单核RNA测序方法。这种方法让人们能够研究那些难以分离的单细胞中的基因表达谱。如今,Broad研究所领导的团队克服了sNuc-Seq应用的一大障碍:规模。  8月28日,研究人员在《Nature Methods

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(四)

2.3  高通量的分子标记检测 本方法制备的DNA浓度虽然低,用96针复制器加入0.5~1 µL模板进行33~35个PCR循环就可获得足够浓度的产物,并不需要加入特别多的Taq酶(甚至使用量为每45~50 µL PCR反应液1 U也能扩增分子标记)。该方法已对数万份水稻样品进行了分子标记(S

基于共价连接适合高通量应用的新型高精度CLIP方法

  1月31日,国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚实验室的研究成果:SpyCLIP: an easy-to-use and high-throughput compatible CLIP platform fo

蜂蜜中外源污染物高通量筛查研究方法建立

  近日,从中国农业科学院蜜蜂研究所获悉,农业部蜂产品质量安全风险评估实验室(北京)在蜂产品产地、生产、采收、贮藏和运输过程中外源性污染物的高通量筛查技术研究方面取得新进展。相关研究成果于1月正式发表在国际权威分析化学期刊《色谱A(JournalofChromatographyA)》杂志上,标志着蜜

高通量组织研磨仪针对中药药材DNA提取的研磨方法

实验目的       通过提取药材的DNA,进行DNA条形码分子对照,进而鉴定中药。 实验原理       通过对照药材自身独有的DNA条形码记录,可以准确鉴定出中药材品种。用DNA条形码分子法鉴定中药是药典中一项重要的鉴定方法。 实验材料和器具样品:甘草,陈皮,阿胶饮片仪器:高通量组织研磨仪(上海

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(二)

PCR芯片的设计和所包含的基因 96孔模式的每种RT2Profiler PCR芯片,含有基因特异性引物,可用于研究84个与某种信号通路或者疾病相关的基因。此外,芯片中还有设置了3个检测实验质量的对照。图2为PCR芯片模式图。由于每种芯片都是根据特别的信号通路或者特定的应用范围设计的,研究者可以用它来

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(四)

RT2ProfilerTM PCR芯片特点灵敏度 研究者总是希望能检测到表达量相当低的基因,有时候,研究者得到的起始总RNA量也很少,但仍希望能进行实时定量PCR检测。为了满足研究者的这些需要,Superarray严格检测了PCR芯片系统的灵敏度。例如,Superarray使用PCR芯片检测了一系列