BioTechniques:从外周血中分离cfDNA的高通量方法

传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从全血中分离出血浆,这一步妨碍了自动化的实施。为此,加拿大迈克•史密斯基因组科学中心的研究人员开发出一种方法,能够高通量地分离ctDNA。 在液体活检中,人们通常需要对游离的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行分析。传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从全血中分离出血浆,这一步妨碍了自动化的实施。为此,加拿大迈克•史密斯基因组科学中心的研究人员开发出一种方法,能够高通量地分离ctDNA。这项成果发表在《BioTechniques》二月刊上。 液体活检,这种新兴技术有望改变癌症检测和疾病监控。ctDNA是片段化的DNA,由癌细胞在凋亡或坏死过程中释放到血浆。通过检测ctDNA,医生有望发现癌症复发或转移的线索。目前,基于ctDNA的新一代测序检测已引入科研和临床实验室。 对于这些检测而言,第一步当然是纯化ctDNA。传统的方法需要先通过离心从全血中分离出血浆。不过,离心不仅是耗时费......阅读全文

高通量测序

  高通量测序技术又称“下一代”测序技术,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序包括:大规模平行签名测序、聚合酶克隆、454焦磷酸测序、离子半导体测序和DNA 纳米球测序等技术。  高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DN

cfDNA甲基化检测能够早期检测和定位多种癌症

如果说,Illumina看见了美国泛癌早筛圣杯(GRAIL)之光,不必羡慕。因为,我们也见证了中国泛癌早筛燃石(Burning Rock)之光。两种光,虽不一样,但均照亮了泛癌早筛之路!癌症早筛,是指在看似健康的目标人群中发现未被识别的(临床前)癌症或癌前病变(在人未出现任何症状之前发现癌症),然后

独特高通量方法改进新蛋白结构设计

根据发表在《美国国家科学院院刊》上的一项研究,美国西北大学医学研究人员使用独特的高通量方法,解决了具有挑战性的蛋白质设计难题。这种方法可促进新疗法和生物技术工具的开发。 研究的资深作者、西北大学药理学助理教授加布里尔·罗克林博士称,设计ɑββɑ蛋白质的经验教训对于任何计算蛋白

几种快速识别高通量组织研磨仪故障的方法

   高通量组织研磨仪的维护保养一直是维持它稳定性能和减少故障率的重要因素,但对于那些已经存在故障的仪器我们又该如何找出问题所在呢?今天就要来教大家几种快速识别高通量组织研磨仪故障的方法。   一、观察法   通过视觉、嗅觉和触觉。某些时候,损坏了的元件会变色、起泡或出现烧焦的斑点;烧坏的器件会产

高通量组织研磨仪的使用方法步骤介绍

  高通量组织研磨仪是振动球磨仪的一种,其依靠摇臂的高频次振动来赋予研磨球动能,从而实现样品的高效精细研磨,在生物、农牧业、食品等行业实验有着广泛的应用。那么高通量组织研磨仪该如何操作使用呢?下面东方天净就来给大家详细介绍一下。   高通量组织研磨仪的使用方法   1、将仪器放置在干燥通风的环境

高通量研究脊椎动物多维表型的方法(一)

Nature Communications 4, February 12, 2013, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475 Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimo

我所发展人乳寡糖高通量定量检测方法

 近日,我所病毒侵染机制研究组(2806组)闫竞宇副研究员团队与中国疾病预防控制中心营养所赖建强研究员团队合作,在人乳寡糖高通量绝对定量方法研究方面取得新进展。   母乳作为新生儿唯一的天然营养来源,在为婴幼儿提供必需营养物质的同时,也在完善其免疫系统、促进生长发育等方面发挥重要作用。人乳寡糖是一类

高通量研究脊椎动物多维表型的方法(二)

  3.颅面畸形三维重建与评估:每条斑马鱼幼体,记录高达320帧的图像,通过三维重构技术,形象化展示了斑马鱼幼体软骨复杂表型。图像显示的层析效果图充分显示了三种不同药物处理后的5dpf斑马鱼幼体的颅面骨骼变化。三种药物是:retinoic acid(视黄酸)、cyclopamine(环巴胺)和flu

《Cell》:新型肿瘤细胞富集系统,让循环肿瘤细胞无处可逃

   在血流中对循环肿瘤细胞(CTC)进行计数可以预测癌症患者的预后和存活率。 然而,CTC的稀有性和异质性使它们在作为生物标志物使用时产生巨大的困难。 最近的研究报道了癌症患者中存在的新型循环非癌性肿瘤衍生细胞, 包括癌症相关巨噬细胞,肿瘤  -内皮簇(TEC)和癌相关成纤维细胞(CAF)。目前的

研究为妊娠期糖尿病早期诊断和治疗带来新思路

7月25日,中国科学院大学生命科学学院、深圳华大生命科学研究院、武汉华大生命科学研究院和天津市妇女儿童保健中心等机构联合开展研究,通过对孕妇血浆中的游离DNA(cfDNA)进行高通量测序,发现了妊娠期糖尿病的特定分子标记物和调控通路变化特征,并构建了疾病早期预测模型,为妊娠期糖尿病的早期诊断和治疗提

早期诊断实体器官移植排斥反应:无创性检测指标或成

    在临床工作中,移植排斥反应是影响实体器官移植预后的主要因素。早期发现和诊断排斥反应,对于及时采取防治措施具有重要指导意义。排斥反应的临床判断主要依靠症状和体征、移植物功能状态及实验室检测等综合指标。因此,在实体移植排斥反应的早期能发现一些预警分子可能对实体器官移植的发展起着非常重要的作用。 

高通量测序技术

没有测序的癌症诊断是不完整的,完整的癌症诊断应该包括一系列基于细胞遗传学技术、荧光原位杂交技术、标准分子技术以及NGS的预后与预测性分析。对于早期癌症患者来说,NGS序列分析在多种癌症的筛查技术中具有不容忽视的代表性;而对于晚期癌症患者,大量的侵入性测试往往只能筛查出少数几个药物靶点。 随

高通量测序原理

高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量

高通量测序原理

高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量

高通量测序原理

高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量

高通量测序技术-中的“高通量”-是什么意思

高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。不过到2005年以后,高通

Nature-Medicine:-液体活检新技术让肿瘤耐药性基因显形!

   肿瘤异质性是恶性肿瘤的特征之一,可使肿瘤的生长速度、侵袭与转移、药物敏感性等多方面产生差异。之前的研究表明,液体活检(特别是cfDNA (无细胞DNA))可以很好地检测获得性耐药的肿瘤异质性。但该方法尚缺少大规模队列验证。近日,由包括麻省总医院、麻省理工学院布罗德研究所、哈佛大学及IBM Re

实验室仪器高通量组织研磨仪的保养方法

1.研磨机连续工作时间过长时,抛光辊摩擦生热温度高,易烫伤革面,需降温后再操作2.工作前后,应清洁抛光辊表面,并打蜡保持辊面光滑无尘3.使用中,控制供料辊压力适当,以免阻力太大,电器发热易烧坏。做好传动链各转动部位的润滑,保持传动准确可靠。

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法

 简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达zui灵敏,zui可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法

简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内

QM100高通量组织研磨仪研磨玉米叶方法

QM100组织研磨仪研磨玉米叶方法目的:批量研磨玉米叶片,为后续提取核酸,进行遗传或生理生化指标分析研究提供方便。为种子和农产品质量管理部门、种子公司等单位利用分子方法检测样品纯度、检测纯度真实性等实验所必需的样品前处理工作提供参考。地点:某种业育种和栽培实验室材料:新鲜玉米幼苗叶片仪器:主机,QM

上海有机所发现新的高通量有机合成方法

  中国科学院上海有机化学研究所有机氟化学重点实验室研究员董佳家课题组在寻找新的SuFEx反应砌块的过程中,意外发现一种安全、高效合成罕见的硫(VI)氟类无机化合物FSO2N3(氟磺酰基叠氮)的方法,他们同时发现该化合物对于一级胺类化合物有极高的重氮转移反应活性和选择性。该成果近日发表于《自然》(n

基于血液的cfDNA甲基化检测能够早期检测和鉴别肺癌

肺癌早筛丨基于血液的cfDNA甲基化检测能够早期检测和鉴别肺癌在全球范围内,肺癌是导至癌症死亡的主要原因,作为全球主要的公共卫生问题已成为研究的重点。尽管手术,化疗,靶向及免疫治疗的综合应用显著提高了肺癌的生存率,但是与其他癌症相比,肺癌患者的预后仍然相对较差。一个主要因素就是,大部分肺癌是在晚期被

4大基因测序技术在无创性产前检测中的应用

  近年来,通过高通量测序技术检测孕妇外周血中游离胎儿DNA(cfDNA)筛查胎儿染色体多倍体异常的无创性产前检测( noninvasive prenatal testing, NIPT)技术正越来越多地用于临床,其具有安全性、高效性及准确率高的特点,正在给产前诊断技术带来革命性的变化。NIPT技术

金域医学:通过国家临检中心mNGS室间质评

  金域医学官微11月16日消息,11月15日,国家卫生健康委临床检验中心公布了2023年全国血液微生物cfDNA宏基因组高通量测序室间质量评价预研活动结果。金域医学连续两年通过该室间质评,证明公司在病原微生物宏基因组湿实验、生信分析及结果解读等方面的综合能力受权威认可。目前,金域医学已经在广州、长

PNAS:科学家开发出能改善液液体活检的新型工具

血浆中无细胞DNA(cfDNA)是机体所有器官细胞死亡的非侵入性生物标志物,解析cfDNA的组织来源或能帮助揭示因疾病所致的异常细胞死亡,这在疾病检测和监测上或许有着巨大的临床潜力;尽管前景广阔,但由于组织甲基化的特征有限以及对无监督方法的依赖,在对组织来源的cfDNA进行敏感和准确的量化的现有方法

高通量组织研磨机低温以及高通量研磨工艺

 高通量组织研磨机是一种特殊的、快速的、率的、多试管的一致系统。在水平方向上进行振动的,研磨球的惯性带动它们以高能量撞击位于弧形内表面的样品材料,从而达到粉碎研磨的效果。它能将任何来源(包括土壤、植物和动物的组织/器官、细菌、酵母、真菌、孢子、古生物标本等)的原始DNA、RNA和蛋白质进行提取和纯化

女版乔布斯被定罪,“滴血验癌”——液体活检真的靠谱吗

  1月4日,曾估值90亿美元的美国体外检测公司Theranos创始人伊丽莎白·霍尔姆斯(Elizabeth Holmes)被陪审团认定4项欺诈罪名成立,其可能面临长达20年的监禁。霍尔姆斯因其过人魅力和与苹果创始人乔布斯类似的套头衫打扮而被成为“女版乔布斯”。  其实,虽然“滴血验癌”神话早已破灭

EMBO-Molecular-Medicine:通过尿液或血液竟然能够检测胶质瘤

  神经胶质瘤简称胶质瘤,也称为胶质细胞瘤,是最常见的原发性中枢神经系统肿瘤,约占所有颅内原发肿瘤的一半,其预后差生存期短,且缺乏有效的治疗方法。胶质瘤诊断一直依赖于神经影像学检查,但最近,英国剑桥癌症研究所的研究人员证实,通过尿液或血液检测就能够准确鉴别不同类型的脑肿瘤,包括胶质瘤。  用于检测不

药物高通量筛选技术

药物高通量筛选技术简单介绍一下关于药物高通量筛选技术的知识。一.概念高通量筛选(High throughputscreening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机对实验数