南京农业大GenomeBiology构建世界首个植物重复基因数据库
以往的研究发现,有的植物有复制自己基因的功能,即通过不同类型复制方式产生一个与原基因序列相同的新基因。基因复制产生的两个同源基因称为重复基因或“姊妹基因”。近年来,随着测序技术的不断升级和测序成本的大幅度降低,越来越多的植物基因组被破译。 植物在千百年的进化中,怎样变得越来越多姿多彩?一个重要因素,就是植物会复制自己基因,丰富自己的基因库数量。多了自己的“同胞胎”兄弟姐妹,基因在生物体中就“声势壮大了”,团结起来力量大,不仅能抵御外界复杂多变的环境,还能增加进化变异的机会,实现物种分化和多样性。 以往的研究发现,有的植物有复制自己基因的功能,即通过不同类型复制方式产生一个与原基因序列相同的新基因。基因复制产生的两个同源基因称为重复基因或“姊妹基因”。近年来,随着测序技术的不断升级和测序成本的大幅度降低,越来越多的植物基因组被破译。 目前已经完成全基因组测序的植物超过200种,包括单细胞绿藻,苔藓类植物,蕨类植物,裸子植......阅读全文
南京农大构建世界首个植物重复基因数据库
图片说明:植物界不同类型重复基因含量分布及其随时间变化规律 2月21日,南京农业大学园艺学院教授张绍铃团队在国际著名学术期刊Genome Biology在线发表研究论文,系统鉴定了梨等141种植物基因组中不同类型重复基因,构建世界首个植物重复基因数据库,揭示重复基因进化的普遍规律。 植物在千百年
华北理工团队搭建大规模植物开花基因数据库平台
开花是被子植物从营养生长到过渡到生殖生长的重要生物学标志。然而,不同开花调控途径涉及的基因较多,使基因搜集耗时耗力,急需建立一个全面综合的植物开花基因数据共享及分析平台。对此,华北理工大学教授宋小明团队搜集了837个高质量植物基因组,并对其进行了开花基因的鉴定及深入分析,并搭建了“植物开花基因数据库
南京农业大Genome-Biology构建世界首个植物重复基因数据库
以往的研究发现,有的植物有复制自己基因的功能,即通过不同类型复制方式产生一个与原基因序列相同的新基因。基因复制产生的两个同源基因称为重复基因或“姊妹基因”。近年来,随着测序技术的不断升级和测序成本的大幅度降低,越来越多的植物基因组被破译。 植物在千百年的进化中,怎样变得越来越多姿多彩?一个重要
全球最大癌症基因数据库发布
美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库,为研究者们提供了迄今为止最全面的方式,搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。 周一NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库,将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更
众包个体基因数据库缓慢发展
Yaniv Erlich 计算遗传学家Yaniv Erlich因其建立了世界最大“家谱”而引人注目。而目前,他的DNA.land又引发新一轮个体基因数据库“众包热潮”。 早在2013 年,Erlich 团队就发表了一篇论文,介绍了如何利用公共资源,通过交叉比对的方法确定遗传学研究参与者的个人身
庞大基因数据库解开“墨西哥人”复杂历史
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510401.shtm
药企高校联手打造史上最大非洲血统基因数据库
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510572.shtm
解码“基因宝藏”:最全海洋微生物基因数据库出炉
9月4日晚,华大生命科学研究院(简称“华大”)联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构,在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源
基因检测解码“生命说明书”-全球竞跑基因数据库
随着华大基因上市临近,基因检测概念再度被关注。 华大基因CEO尹烨曾在公开场合介绍,给基因学家一滴血,能查到生育、肿瘤、感染,从三检合一到N检合一,液体活检可以做更多的事情。 相比于传统的影像学检测手段只能检测出已经发生且长成一定大小的异物,基因检测技术的优势在于,在更早的发病初始期,从分子
华北理工搭建首个蔬菜作物激素基因数据库平台
植物激素对蔬菜和多种作物的耐盐等逆境胁迫和生长发育具有非常重要的作用。激素主要有生长素、乙烯、细胞分裂素、脱落酸和赤霉素等十余类。然而,目前没有一个数据库能够全面展示这些激素在不同蔬菜中的作用及调控模式。这严重制约了激素相关基因的比较和功能组学研究。对此,华北理工大学教授宋小明团队对469种蔬菜及代
英、中等国科学家将建耐药结核杆菌基因数据库
英国牛津大学24日发布消息说,该校将与中国等国的研究人员合作,对来自世界多个地区的结核杆菌样本展开全基因组测序,建立耐药结核杆菌的基因数据库,以便提高对耐多药结核病的诊断和用药效率。 病菌的耐药性问题近年来日渐严峻,耐药结核病更呈迅猛上升趋势。据世界卫生组织介绍,耐多药结核病是耐药结
谷歌致力于基因数据市场,整合Tute-Genomics基因数据库
谷歌希望凭借人类基因组云端服务Google Genomics在基因组研究市场占有一席之地,如今,公司正忙于用最好的工具来填满这个工具箱。 Google Genomics是谷歌2013年推出的一项云端服务,帮助大学实验室和医院等机构将患者或科研对象的生物基因储存到云端上,推进人类基因组信息的存
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析,可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日,相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道,2021年,研究人员构建了一个目录,其中包含约3亿组陆地微生物和海洋微生物的基因。现在,沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516176.shtm迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析,可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日,相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道,
一个高度注释的与癌症铂耐药相关的基因数据库
10-20% 的癌症患者接受了铂类化疗,包括顺铂、卡铂和奥沙利铂。不幸的是,铂耐药在大量患者中产生,并成为临床结果的决定因素。铂耐药的机制可分为几个广泛的生物学过程,包括调节药物的进入、退出、积累、隔离和解毒,增强铂诱导的DNA损伤的修复和耐受性。 细胞存活途径的改变,多效过程和途径的改变,以
我国建立灵长类特异新基因数据库并系统预测新基因功能
灵长类特异乃至人特异新基因起源是推动人类表型演化的重要推动力,但只有少量新基因功能已知。近年来基因编辑技术和类器官技术的发展使得系统揭示新基因在人之所以为人这一演化过程中的贡献成为可能。然而,由于基因年龄推断方法的差别以及较低的新基因注释质量(很难区分新蛋白编码基因和假基因),文献中已经发表的灵
全球最大基因库在深圳开门迎客-专家解读该大库用意
深圳东南部大鹏半岛被政府规划为“生态岛、生物岛、生命岛”,也被称为深圳最后的“桃花源”。这里有一座状似哈尼梯田的建筑依山面海而建,这就是目前世界最大的基因库。9月22日,国家基因库开门迎客的当日,来自国内外政界、产业界以及媒体界的人士聚集于此。人们欣赏着别致建筑,也在探寻,如此大库究竟何用?
英国拟为癌症病人绘基因序列图以研发新药
据英国路透社12月10日报道,英国拟为近10万癌症或其它罕见疾病的患者绘制基因序列图,以研发新的药物。 英国首相卡梅伦10日表示,他希望英国能够成为第一个将基因排序引入健康服务的国家。 据报道,卡梅伦政府计划在未来3至5年内投入1亿英镑(约合人民币10亿元)用于基因排序项目。绘制病人
安徽大学教授开发完成国际上首个黑色素瘤基因数据库
黑色素瘤是皮肤以及其他器官中黑素细胞产生的恶性肿瘤,其发病风险与长时间紫外线照射有关。对于发生转移的晚期黑色素瘤患者来说,五年存活率不超过10%。作为严重威胁人类健康的恶性肿瘤,黑色素瘤的致病分子机制尚未完全弄清楚。先前研究表明在黑色素瘤病人中约有37~50%是BRAF基因突变,13~25%是N
关于植物固醇的植物来源介绍
植物油是植物固醇含量最高的一类食物。以常见的植物油为例,每100克大豆油中植物固醇含量约300毫克;花生油约250毫克;芝麻油和菜籽油为500毫克以上;玉米胚芽油中含量最高,可达到1000毫克以上。可以说,植物油是膳食中植物固醇的一个重要来源。 营养建议:每天植物油摄入量以25克为宜。植物油摄
植物细胞结构与植物徒手切片
[目的要求] 1.掌握植物徒手切片技术。 2.观察认识植物细胞的基本结构,质体的形态。 3.认识和鉴定植物细胞内常见的后含物。 [材料用品] 材料:洋葱鳞茎或番茄果实、葫芦藓叶、红辣椒、鸭跖草叶片、马铃薯块茎、蓖麻种子、花生种子。
欧盟采用分子生物学发展育种技术
对欧盟农户而言,最大的担忧之一来自日益严重的干旱极端环境,有时甚至直接威胁到一整年的农作物收成。2003年的欧洲干旱,造成欧盟农作物产量下降30%的,损失巨大。为此,欧盟第七研发框架计划(FP7)提供900万欧元的资助,总研发投入1170万欧元,由欧盟8个成员国英国(总协调)、法国、德国、意大利
植物表型成像系统植物表型和植物表型组学的概念
植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节,随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入,传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈,而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然植物表型组分析正在成为国内外研究的热点,相关概念仍然较为模糊,阻碍了这一新兴学
植物生长室为何可加速植物生长?
在植物生长室中,只需要根据植物的品种来设置不同的室内环境,那么植物就可以快速生长,这一点是行业研究人员的广泛共识,因此正是基于这一点,在农业研究中,植物生长室常用作科学育种,植物研究等,极大的提高了相关科研研究的效率,缩短了实验的周期。但是对于很多对农业不了解的人而言,可能就不知道植物生长
《分子植物》跨入植物科学顶级期刊之列
近日,美国汤姆森路透—科学信息研究所公布了2011年度《期刊引用报告》。中国学术期刊《分子植物》(Molecular Plant)的影响因子上升为5.546,位居国际植物科学领域研究类期刊第5名,跨入该领域190种核心期刊前5%(排名第9),并连续两年在亚洲同领域期刊中排名第一,已进入该
植物生长室是植物生长的暖房
植物生长室从外观上看就像是一个封闭的房间,只不过它不是为人类活动准备的,而是用于植物生长的。植物生长室可以说是专用于植物生长的暖房,植物在其中,可以不用受外界环境的影响,温度、湿度和光的调控都是根据植物生长的需要来配置,满足了植物完美的生长条件。 植物生长室既可以通过其可靠的控制功能控
植物组织培养和植物快速繁殖
组织培养是一种利用人工培养基(液)使细胞在体外发育和繁殖的技术。除了能够为许多实验提供大量的动植物细胞材料之外,它也是一项克隆植物细胞和个体的实用技术。实际上,在日常生活中必不可少的蔬菜、花卉及粮食作物中,许多种类都是克隆植物,例如,脱病毒马铃薯和红薯、百合和兰花、水稻等等。病毒是威胁园艺和蔬菜种植
植物徒手切片与植物细胞结构观察
[目的要求] 1.掌握植物 徒手切片技术。 2.观察认识植物细胞的基本结构,质体的形态。 3.认识和鉴定植物细胞内常见的后含物。 [材料用品] 材料:洋葱鳞茎或番茄果实、葫芦藓叶、红辣椒、鸭跖草叶片、马铃薯块茎、蓖麻种子、花生种子。 用品:I-KI溶液、苏丹溶液、显微镜
植物徒手切片与植物细胞结构观察
[目的要求] 1.掌握植物 徒手切片技术。 2.观察认识植物细胞的基本结构,质体的形态。 3.认识和鉴定植物细胞内常见的后含物。 [材料用品] 材料:洋葱鳞茎或番茄果实、葫芦藓叶、红辣椒、鸭跖草叶片、马铃薯块茎、蓖麻种子、花生种子。 用品:I-KI溶液、苏丹溶液、显微镜
植物所关于入侵植物与本地植物的共存机制研究获进展
达尔文在《物种起源》中提出了关于外来物种归化的两个相互矛盾的假说。预适应假说认为亲缘关系近的物种更易归化,而达尔文归化假说认为亲缘关系远的物种更具归化的优势。这一矛盾被称为达尔文归化谜团。尽管生态学家为解开这一谜团付出了努力,但未达成一致结论。由于生态系统的复杂性以及研究方法的多样性,解开该谜团面临