DNA片段探针的应用实验——甲酰胺法

所谓探针,一般是指用来检测某一特定核苷酸序列或基因序列的DNA片段或RNA片段。但要使探针DNA片段能实际应用,必须使DNA或RNA分子带上可识别的信号标志,以便跟踪观察探针与其同源的核苷酸序列发生杂交反应的位置,被探测DNA或RNA片段上的大小、杂交信号的强弱等。目前应用最多的是核素标记方法或非核素标记方法。实验材料DNA试剂、试剂盒杂交液洗膜液仪器、耗材注射器超声仪水浴锅实验步骤1. 用5~20 ml 杂交液Ⅰ依次浸泡10~20张硝酸纤维素滤膜。滤膜装入杂交袋中,加入足够的杂交液,密封后42℃预杂交1 h。 2. 往带螺盖的试管中,加入放射性探针和2 mg 超声波处理的鲱鱼精DNA,煮沸10 min。3. 探针混合液移至冰浴,加入2 ml 杂交液Ⅰ 。4. 用带18-G针头的注射器将探针混合液加入到杂交袋中滤膜上,重新密封后于42℃温育过夜。5. 用约50......阅读全文

DNA片段探针的应用实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 杂交液洗膜液仪器、耗材 注射器超声仪水浴锅实验步骤 1.  用5~20 ml 杂交液Ⅰ依次浸泡10~20张硝酸纤维素滤膜。滤膜装入杂交袋中,加入足够的杂交液,密封后42℃预杂交1 h。 2.  往带螺盖的试管中,加入放射性探针和2 mg 超声波处理的鲱鱼精DNA,煮沸1

DNA片段探针的应用实验

甲酰胺法 水溶液中杂交             实验材料 DNA 试剂、试剂盒

DNA片段探针的应用实验——甲酰胺法

所谓探针,一般是指用来检测某一特定核苷酸序列或基因序列的DNA片段或RNA片段。但要使探针DNA片段能实际应用,必须使DNA或RNA分子带上可识别的信号标志,以便跟踪观察探针与其同源的核苷酸序列发生杂交反应的位置,被探测DNA或RNA片段上的大小、杂交信号的强弱等。目前应用最多的是核素标记方法或非核

DNA片段探针的应用实验——水溶液中杂交

实验材料DNA试剂、试剂盒杂交液洗膜液仪器、耗材培养箱实验步骤1.  除了于65℃在杂交液Ⅰ中温育的条件外,预杂交按甲酰胺法进行。 2.  按甲酰胺法制备探针并用2 ml 杂交液Ⅰ稀释。3.  滤膜在65℃杂交过夜,然后移去杂交液,用低严紧性洗膜液Ⅰ洗膜2次。4.  用高严紧性洗膜液Ⅰ在65℃迅速洗

DNA片段的回收实验

实验方法原理 本方法特别适合于PCR片段的回收,具有纯度高、操作简洁等特点,经此方法回收的片段可有效的用于重组载体构建。通过15分钟的纯化过程,PCR产物即能被有效地从含引物二聚体、非特异性扩增引物片断等混合物中分离出来,成为高度无盐的、不含其他大分子成分的纯化片断。在较宽的分子量范围内有较高的回收

DNA片段的连接技术

一、目的与原理DNA酶切片段的联接是两DNA片段相邻的5‘磷酸和3’羟基间可有连接酶催化形成磷酸二酯键,这个连接反应在体外一般都有大肠杆菌DNA连接酶和T4DNA连接酶催化,但是分子生物学试验中主要采用T4DNA连接酶,因该酶在正常条件下,即能完成连接反应。本实验拟通过T4DNA连接酶对酶切片断的连

DNA片段回收与纯化

    质粒、噬菌体等经酶切,电泳;PCR产物经电泳后,常常需要对一些DNA电泳片段进行回收和纯化,用于亚克隆、探针标记等。DNA回收和纯化常用方法有压碎法、低融点琼脂糖法、冻融法等,也有现成的试剂盒供应。一、冻融法1.  紫外灯下仔细切下含待回收DNA的胶条,将切下的胶条(小于0.6g)捣碎,置于

DNA片段的回收实验

树脂回收法 微量柱法 液氮冻融法 常规方法             实验方法原理 本方法特别适合于PCR片段的回收,具有纯度高、操作简洁等特点,经此方法

DNA片段的制备方法

常用以下方法获得DNA片段:①用限制性核酸内切酶将高分子量DNA切成一定大小的DNA片段;②用物理方法(如超声波)取得DNA随机片段;③在已知蛋白质的氨基酸顺序情况下,用人工方法合成对应的基因片段;④从mRNA反转录产生cDNA。

什么是“DNA探针”?

DNA探针(DNA probe)是最常用的核酸探针,为长度在几十到几百甚至上千碱基对的单链或双链DNA,用特殊示踪剂(如同位素、酶或有色基团)进行标记;在适当的pH值、温度和离子强度下,DNA探针利用分子的变性、复性以及碱基互补配对的高度精确性,能与待测样本中互补的非标记单链DNA或RNA以氢键结合

微量柱法纯化DNA片段

实验概要目的DNA片段的回收技术是重组DNA中的关键技术,回收是指从电泳介质中纯化出目的片断。目前待回收的片断主要有酶切片断和各种PCR片断;回收的介质主要有琼脂糖和PAGE;回收的方法主要有树脂回收、微量柱回收、玻璃奶回收、液氮冻冻融回收及透析袋大量回收等,下面分别介绍树脂、微量柱及液氮冻冻融回收

DNA片段的亚克隆实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 CIPdNTPDNA聚合酶T4聚合酶DTTATP仪器、耗材 水浴锅电泳仪培养箱实验步骤 1.  在20 μl 反应体积内用合适的酶完全消化DNA。75℃加热15 min,灭活酶。如若无需进一步的酶促处理,接歩骤6。2.  如果5’磷酸需要去除,加入2 μl 10×CIP

冻融法回收DNA片段

            实验方法原理 冻融法是指采用反复冷冻与融化时由于细胞中形成了冰晶及剩余液体中盐浓度的增高可以使细胞破裂。这种方法简单方便,但要注意那些对温度变化敏感的蛋白质不宜采用此法。  实验材料

冻融法回收DNA片段

冻融法回收DNA片段可用于:(1)获取纯化的DNA片段;(2)回收PCR产物。实验方法原理冻融法是指采用反复冷冻与融化时由于细胞中形成了冰晶及剩余液体中盐浓度的增高可以使细胞破裂。这种方法简单方便,但要注意那些对温度变化敏感的蛋白质不宜采用此法。 实验材料DNA胶条试剂、试剂盒Tris-HCl饱和酚

PCR扩增分离目的DNA片段

一、目的了解多聚合酶链反应DNA 扩增技术的基本原理和实验应用,掌握PCR反应基本技术。二、原理PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚合酶链式反应是1986 年由Kallis Mullis 发现。这项技术已广泛地应用于分子生物学各个领域,它不仅可用于基因分离克隆和核酸序列分

DNA片段的亚克隆实验

基本方案 凝胶块中DNA连接             实验材料 DNA 试剂、试剂盒

DNA小片段的纯化回收

DNA 电泳小于100bp的片断通常在电泳时就比较难观察分辨,需要用分辨率很高的琼脂糖或者丙烯酰胺凝胶。比如Cambrex的NuSieve 3:1或者GTG,或者是大名鼎鼎的MetaPhor琼脂糖。所以实际上对于小片断,可以分为两种情况:一个是真的要回收电泳中特别小的片断,这种情况我们前面有提到,比

DNA的酶切与连接——DNA片段连接

实验方法原理核酸片段可以通过连接酶的作用连接起来而获得重组分子。实验材料λDNA EcoT14I:由11条DNA片段组成试剂、试剂盒T4 DNA连接酶及其配套的10×连接缓冲液 0.5×TBE电泳缓冲液 6×Loading Buffer Goldview 琼脂糖仪器、耗材电泳仪 水浴锅 移液器 微波

DNA片段的回收实验——常规方法

实验材料NA片段试剂、试剂盒纯化试剂盒异丙醇仪器、耗材离心机电泳仪电泳槽取液器微量真空装置抽滤装置实验步骤1.  PAGE电泳,如EB染色的则在紫外灯下切下目的片断,如龈染或其他非放染色的则在关下切下目的片断。2.  用少量脱缓冲液I将目的片断胶条洗至一Eppendorf管中,用玻棒将凝胶捣碎,用1

大片段DNA测序(>50KB)

大片段DNA的测序: 通过鸟枪法 (Shot Gun Sequencing) 测序 鸟枪法测序的操作方法1. 用限制酶切下目的片段的大片段Insert DNA, 并用Agarose凝胶电泳进行回收。2. 对回收的大片段DNA用物理方法 (如超声波等) 进行切断处理,然后用T4 DNA Polymer

染色体DNA的片段化

实验概要琼脂糖(agarose)或聚丙烯酰胺(PAGE)电泳是分离、鉴定和纯化DNA的标准方法。琼脂糖凝胶的分辨率比聚丙烯酰胺电泳低,但分离范围广,可以分离200 bp一50 kb的DNA。细胞凋亡时染色体从核小体间断裂形成大小为180-200bp整数倍的片段,在琼脂糖凝胶中电泳后可呈现出规

长片段DNA如何设计测序引物

如果是测序引物的话,因为目前的测序技术一端只能到800bp左右,所以一对引物差不多能测1.5kb左右的片段,超出这个范围测出来的也不太可信了。所以如果你的目的片段在这个范围内,设计1对引物就行了,如果超出这个范围,比如说有6k左右,那就要设计四对引物,设计方法跟常规的一样,只是把握这个间隔就好了。1

“DNA探针”的性能优势

①DNA探针多克隆在质粒载体中,制备方法简便;②DNA探针相对RNA探针(RNA probe)而言不易降解,一般能有效抑制DNA酶活性;③DNA探针的标记方法较成熟,可用同位素或非同位素标记,有多种方法可供选择。

DNA探针的来源介绍

  DNA探针根据其来源有3种:一种来自基因组中有关的基因本身,称为基因组探针(genomic probe);另一种是从相应的基因转录获得了mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNA探针(cDNA probe)。与基因组探针不同的是,cDNA探针不含有内含子序列。此外,还可在体外人工合成碱基数不

“DNA探针”的性能优势

①DNA探针多克隆在质粒载体中,制备方法简便;②DNA探针相对RNA探针(RNA probe)而言不易降解,一般能有效抑制DNA酶活性;③DNA探针的标记方法较成熟,可用同位素或非同位素标记,有多种方法可供选择。

“DNA探针”的制备过程

基因组DNA探针的获得有赖于分子克隆技术的发展和应用。要得到一种特异性DNA探针,常常是比较烦琐的。以细菌为例,细菌的基因组大小约为5×106碱基,约含3000个基因。要获得某细菌特异的核酸探针,通常要采取建立细菌基因组DNA文库的办法,即将细菌DNA切成小片段后(如用限制性内切酶做不完全水解)分别

DNA探针原位杂交

  1、4—6微米切片,用防脱片胶(多聚赖氨酸)处理过的玻片贴附  2、56—60℃烤片2—16h  3、新鲜二甲苯脱蜡,10minX2(趁热脱蜡)  4、100%乙醇5minX2次,不用浸水,直接空气干燥  5、加入50μl蛋白酶K工作液(蛋白酶K用蒸馏水稀释,浓度为25μg/ml),37℃消化1

DNA探针的制备方法

基因组DNA探针的获得有赖于分子克隆技术的发展和应用。要得到一种特异性DNA探针,常常是比较烦琐的。以细菌为例,细菌的基因组大小约为5×106碱基,约含3000个基因。要获得某细菌特异的核酸探针,通常要采取建立细菌基因组DNA文库的办法,即将细菌DNA切成小片段后(如用限制性内切酶做不完全水解)分别

DNA探针的功能特性

  DNA探针是以病原微生物DNA或RNA的特异性片段为模板,人工合成的带有放射性或生物素标记的单链DNA片段,可用来快速检测病原体。DNA探针将一段已知序列的多聚核苷酸用同位素、生物素或荧光染料等标记后制成的探针。可与固定在硝酸纤维素膜的DNA或RNA进行互补结合,经放射自显影或其他检测手段就可以

“DNA探针”的技术依据

DNA探针根据其来源分为3种:一种来源于基因组中的基因本身,称为基因组探针(genomic probe),可以是基因的全序列,或者基因上的一段序列;另一种是从相应的基因经转录获得mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNA探针(cDNA probe);此外,还可在体外人工合成20~50个碱基的与基