λ噬菌体臂与外源基因组DNA片段的连接实验
当 λ 噬菌体臂与外源基因组 DNA 片段相连时,必须考虑到两个参数:噬菌体臂与潜在插入片段的摩尔比,以及在反应混合物中各类 DNA 的浓度。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理当 λ 噬菌体臂与外源基因组 DNA 片段相连时,必须考虑到两个参数:噬菌体臂与潜在插入片段的摩尔比,以及在反应混合物中各类 DNA 的浓度。实验材料噬菌体 T4 DNA 连接酶基因组 DNAλ 噬菌体包装混合物λ 噬菌体臂 DNA试剂、试剂盒ATPSM 和 SM+ 明胶仪器、耗材琼脂糖凝胶LB 或 NZCYM 琼脂平板水浴实验步骤一、材料1. 缓冲液和溶液ATP ( 10 mmol/L)SM 和 SM+ 明胶2. 酶和缓冲液噬菌体 T4 DNA 连接酶3. 凝胶琼脂糖凝胶(0.7%), 用 0.5X TBE, 含 0.5 μg/ml 溴化乙锭4. 核酸和寡核苷酸适当大小的基因组 DNA,用于载体克隆5. 培养基LB 或 NZCY......阅读全文
研究实现大片段DNA染色体整合
近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心开发了创新的、基于可重复利用靶点的大片段DNA染色体整合策略,构建了首株能够脱离质粒、稳定合成红霉素A的大肠杆菌菌株,并提升了产量。红霉素是临床重要的广谱大环内酯类抗生素。传统研究多采用多质粒系统进行表达,但质粒的不稳定性、抗生素的使用及细胞代谢负担过重,限制
新型DNA测序算法让“重复片段”不再神秘
美国华盛顿大学的一个研究小组称,他们使用了一种被称为“mrFAST”的新型DNA测序算法,可对基因的重复片段进行精确统计并对其作用作出初步判断。相关研究发表在8月30日出版的《自然·遗传学》杂志上。 据了解,截至2003年底,绝大部分的人类基因组已获得测定。但基因组中仍有许多的区域未获得测
脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收
低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠胚胎干细胞(Choi et al. 1993) 时是非常有效的。本实验来源「
分子克隆化DNA片段与载体连接介绍
DNA分子与载体分子连接是克隆过程中的重要环节之一,方法有: ①粘性末端连接,DNA片段两端的互补碱基顺序称之为粘性末端,用同一种限制性内切酶消化DNA可产生相同的粘性末端。在连接酶的作用下可恢复原样,有些限制性内切酶虽然识别不同顺序,却能产生相同末端。 ②平头末端连接,用物理方法制备的DN
DNA片段的亚克隆实验——基本方案
所谓亚克隆就是对已经获得的目的DNA片段进行重新克隆,其目的在于对目的DNA进行进一步分析,或者进行重组改造等。亚克隆的基本过程包括:(1)目的DNA片段和载体的制备;(2)目的DNA片段和载体的连接;(3)连接产物的转化;(4)重组子筛选。实验材料DNA试剂、试剂盒CIPdNTPDNA聚合酶T4聚
“垃圾DNA”片段是如何开启或关闭基因?
普林斯顿大学的研究人员近日捕捉到一段视频,显示曾被认为是“垃圾DNA”的片段如何开启或关闭基因。这段视频和成果于周一发表在《Nature Genetics》上。 在人类基因组中,未编码基因的DNA片段占90%以上。过去,它们被认为是“垃圾DNA”,但是后续的研究证实,这些片段包含了开启或关闭基
脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠
DNA片段的回收实验——液氮冻融法
实验材料DNA片段试剂、试剂盒纯化试剂盒异丙醇仪器、耗材离心机电泳仪电泳槽取液器微量真空装置抽滤装置实验步骤1. 紫外灯下从胶上切下目的片段,放入一Epphendof管中。2. 离心1 min,加入500 ul TE,200 ul 酚/氯仿混匀。3. 离心管放入液氮中10~15 min,再室温
DNA核苷酸序列冈崎片段的介绍
冈崎片段是相对较短的DNA核苷酸序列(真核生物中大约有150到200个碱基对长),它们的合成是不连续的,并随后通过DNA连接酶连接在一起,形成DNA复制过程中的滞后链。冈崎片段是20世纪60年代两位日本分子生物学家、名古屋大学的一对校友夫妇冈崎令治和冈崎恒子共同发现的。
DNA片段纯化与回收常见问题分析
Q:利用凝胶回收试剂盒DNA回收效率较低或者未回收到目的片段?A:可能有以下几个原因: 1. 胶块未完全溶解,可适当延长水浴时间,并增加上下颠倒次数辅助溶解; 2. 胶块体积太大,应先将其切为小块,分多次回收; 3. 电泳缓冲液pH太高,硅基质膜在高盐低pH结合DNA,如pH太高,应作适
DNA片段探针的应用实验——甲酰胺法
所谓探针,一般是指用来检测某一特定核苷酸序列或基因序列的DNA片段或RNA片段。但要使探针DNA片段能实际应用,必须使DNA或RNA分子带上可识别的信号标志,以便跟踪观察探针与其同源的核苷酸序列发生杂交反应的位置,被探测DNA或RNA片段上的大小、杂交信号的强弱等。目前应用最多的是核素标记方法或非核
脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠胚胎干细胞(Choi et al. 1993) 时是非
研究实现大片段DNA染色体整合
近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心开发了创新的、基于可重复利用靶点的大片段DNA染色体整合策略,构建了首株能够脱离质粒、稳定合成红霉素A的大肠杆菌菌株,并提升了产量。红霉素是临床重要的广谱大环内酯类抗生素。传统研究多采用多质粒系统进行表达,但质粒的不稳定性、抗生素的使用及细胞代谢负担过重,限制
凋亡细胞核DNA片段检测方法进展
细胞凋亡(apoptosis)又称细胞凋谢或称程序性细胞死亡(Programmed cell death,PCD),是有别于细胞坏死而受基因控制的一种主动性细胞自杀过程。对细胞凋亡的研究已成为当今生物学领域的热点之一。开展对细胞凋亡的研究,首先要解决的是方法学问题。根据凋亡细胞的生化特征检测组织或培
DNA片段能预知寿命:端粒长度决定生物寿命
西班牙、英国研究人员最近发现,提取血液中的细胞,测试细胞中端粒的长度,可推断一个人的寿命有多长。这种检测方法将于2011年年底在英国上市,由此引来争议与关注 端粒长度 决定生物寿命 西班牙马德里国立癌症研究中心的玛莉亚・比拉斯科博士是这项商业端粒检测方法的发明者,她说这是一种非常简单、快捷
凋亡细胞核DNA片段检测方法进展(二)
2.3 凋亡细胞的TUNEL和ISNT鉴定的流式细胞仪分析[16]对于培养的细胞,可以将TUNEL或ISNT鉴定同流式细胞仪结合起来分析其发生凋亡的情况。待检细胞与含有TdT或DNA聚合酶I或Klenow片段及生物素标记的dUTP反应液共孵育一段时间后,加入荧光素(常用FITC)标记的链霉抗生物
分子克隆实验DNA片段与载体连接方法介绍
DNA分子与载体分子连接是克隆过程中的重要环节之一,方法有:①粘性末端连接,DNA片段两端的互补碱基顺序称之为粘性末端,用同一种限制性内切酶消化DNA可产生相同的粘性末端。在连接酶的作用下可恢复原样,有些限制性内切酶虽然识别不同顺序,却能产生相同末端。②平头末端连接,用物理方法制备的DNA往往是平头
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。实验材料 DNA 大小标准基因组 DNA试剂、试剂盒 溴化乙锭酚:氯仿仪器、耗材 水浴实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液溴化
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ-Klenow片段实验
标记DNA的3‘末端 修复突出的3’或5‘末端 随即寡核苷酸引物介导 实验方法原理 选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量
DNA片段探针的应用实验——水溶液中杂交
实验材料DNA试剂、试剂盒杂交液洗膜液仪器、耗材培养箱实验步骤1. 除了于65℃在杂交液Ⅰ中温育的条件外,预杂交按甲酰胺法进行。 2. 按甲酰胺法制备探针并用2 ml 杂交液Ⅰ稀释。3. 滤膜在65℃杂交过夜,然后移去杂交液,用低严紧性洗膜液Ⅰ洗膜2次。4. 用高严紧性洗膜液Ⅰ在65℃迅速洗
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ-Klenow片段实验
实验方法原理 选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量标志物。放射自显影带的强度与片段长度无关,标记DNA可稳定数月之久。 实验材料 DNA试剂、试剂盒 dNTP仪器、耗材 水浴锅实验步骤 1. 在20 μl 反应体积中,用可产生5’突出端的限制性内切酶消化0.1~0.4 μg DNA
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。 实验材料
凋亡细胞核DNA片段检测方法进展(一)
摘 要:当今生物学领域的研究一个热点之一是细胞凋亡。开展对细胞凋亡的研究,首先要解决是方法学问题。作者从凋亡细胞的特征性核DNA片段检测着手,阐述了多种凋亡细胞核DNA片段检测方法以及近年来的一些新进展。细胞凋亡(apoptosis)又称细胞凋谢或称程序性细胞死亡(Programmed cell
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 D
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ-Klenow片段实验——标记DNA的3‘末端
实验方法原理选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量标志物。放射自显影带的强度与片段长度无关,标记DNA可稳定数月之久。 实验材料DNA试剂、试剂盒dNTP仪器、耗材水浴锅实验步骤1. 在20 μl 反应体积中,用可产生5’突出端的限制性内切酶消化0.1~0.4 μg DNA。 2.
从琼脂糖凝胶(Agaros-gel)中回收DNA片段
实验原理限制性内切酶切割后的DNA片断经过电泳后,按分子量大小被分开,排列在琼脂糖凝胶中,可以将特定的某条DNA带所在的凝胶切下来,加热或用特殊的试剂熔解凝胶,使DNA溶回到溶液中,再经过乙醇沉淀或过柱即可获得目的 DNA酶切片段。实验试剂1. 电泳缓冲液2. 荧光染料3. 电泳级琼脂糖粉4. 10
破解人脑独特性的关键DNA片段发现
究竟是什么让人脑与众不同?美国加州大学圣迭戈分校研究团队发现了一个名为HAR123的小型DNA片段,这将是解开人类大脑独特性之谜的关键。相关研究成果发表于新一期《科学进展》杂志。 最新研究表明,HAR123并非普通基因,而是一个精妙的“大脑发育调控器”。它就像一位经验丰富的指挥家,精确指导脑细
关于目的基因组DNA片段的制备的介绍
按照常规方法从作为供体的生物细胞中分离纯化其染色体DNA,在一般条件下,由于分离纯化操作中的物理剪切作用,制备出的染色体DNA片段平均大小在10~-200kb左右。然后将染色体DNA用下列方法切成片段,以便与载体分子进行体外重组 [1]。 (1)机械切割。供体染色体DNA可用机械方法(如超声波
变性梯度凝胶电泳不同的双链DNA-片段
不同的双链DNA 片段因为其序列组成不一样,所以其解链区域及各解链区域的解链浓度也是不一样的。当它们进行DGGE时,一开始变性剂浓度比较小,不能使双链DNA 片段最低的解链区域解链,此时DNA 片段的迁移行为和在一般的聚丙烯酰胺凝胶中一样。然而,一旦变性剂浓度达到DNA 片段最高的解链区域温度时
从琼脂糖凝胶(Agaros-gel)中回收DNA片段
目的学会从琼脂糖凝胶中回收DNA片段的基本技术。2.原理限制性内切酶切割后的DNA片断经过电泳后,按分子量大小被分开,排列在琼脂糖凝胶中,可以将特定的某条DNA带所在的凝胶切下来,加热或用特殊的试剂熔解凝胶,使DNA溶回到溶液中,再经过乙醇沉淀或过柱即可获得目的 DNA酶切片段。3.器材旋涡混合器,