5.6引物延伸法RNA分析
引物延伸法可用于 RNA 的作图和 RNA5'端的定暈。在此方法中,将过量的 5'端标记的单链 RNA 引物与待测的 RNA 杂交,随后用反转录酶延伸该引物,生成句 RNA 模板互补的 cDNA。再在变性条件下通过聚丙烯酰胺凝胶电泳测定 cDNA 的长度,即可确定 RNA 端的位置,并且 cDNA 的量将反映出 RNA 的水平。实验材料T4 多核苷酸激酶AMV 反转录酶酵母 tRNA试剂、试剂盒10X 激酶缓冲液5X 杂交缓冲溶液Tris-HClMgCl2DTT放线菌酮 DdNTPRNasin甲酰胺上样染液SephadexG-25NaAc乙醇[r-32P]ATP仪器、耗材水浴杂交炉电泳设备实验步骤一、材料与设备1) 水浴2) 杂交炉3) 电泳设备4)T4 多核苷酸激酶,AMV 反转录酶5)10X 激酶缓冲液:5mol/LTris-HCl(pH7.6),0.lmol/LMgCL2,50 mmol/LDTT,lmmol/L 亚精胺.......阅读全文
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀,每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚,充分混匀,于 60
引物延伸法-RNA-分析
实验材料 T4 多核苷酸激酶 AMV 反转录酶 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 10X 激酶缓冲液
环状-RNA-测序案例分析
案例:以结肠癌,卵巢癌,特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是构成生物体 RNA 网络的一部分,而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的
RNA分离与分析实验
暂未评分点评实验,有机会获丁当奖励 +收藏 1人收藏RNA分离与分析实验标签: RNA
RNA分离与分析实验
实验材料 标记细胞试剂、试剂盒 乙酸缓冲液仪器、耗材 漩涡器实验步骤 1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀,每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚,充分混匀,
引物延伸法-RNA-分析
实验材料 T4 多核苷酸激酶AMV 反转录酶酵母 tRNA试剂、试剂盒 10X 激酶缓冲液 5X 杂交缓冲溶液 Tris-HCl MgCl2 DTT 放线菌酮 D dNTP RNasin 甲酰胺上样染液 SephadexG-25 NaAc 乙醇 [r-32P]ATP仪器、耗材 水浴 杂交炉 电泳设备
5.6-引物延伸法-RNA-分析
引物延伸法可用于 RNA 的作图和 RNA5'端的定暈。在此方法中,将过量的 5'端标记的单链 RNA 引物与待测的 RNA 杂交,随后用反转录酶延伸该引物,生成句 RNA 模板互补的 cDNA。再在变性条件下通过聚丙烯酰胺凝胶电泳测定 cDNA 的长度,即可确定 RNA 端的位置,并且 cDNA
环形RNA与线性RNA定量比较分析新系统CLEAR发布
1月15日,国际学术期刊Genomics,Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCexplorer3: A CLEAR Pipeline for Direct Comparison o
RNA分离与分析实验_用丙烯酰胺尿素凝胶纯化RNA
实验材料RNA试剂、试剂盒TBE 缓冲液丙烯酰铵溶液过硫酸铵水溶液RNA 染色液仪器、耗材玻璃板实验步骤1. 准备下列溶液:TBE 缓冲液:Tris 碱 54 g,硼酸 27.5 g,0.5 mol/L EDTA ( pH 8.0) 20 ml,溶解并加水至 1000 ml。当发现贮存液有白色沉淀
RNA-光谱分析与定量
试剂、试剂盒 DEPC 无核酸酶的水 仪器、耗材 紫外分光光度计 石英比色杯
RNA足迹和修饰干扰分析实验
实验方法原理 RNA 足迹和修饰干扰分析(RNA footprinting and modification interference analysis)是用来研究 RNA 与蛋白质相互作用的技术。RNA 测序及其结构分析的原理是 RNA
RNA-光谱分析与定量
试剂、试剂盒 DEPC 无核酸酶的水仪器、耗材 紫外分光光度计 石英比色杯实验步骤 一、材料与设备1)紫外分光光度计。2) 石英比色杯。3)DEPC4) 无核酸酶的水。二、操作方法(一)准备分光光度计用 0.1%DEPC 水浸泡比色皿至少 15 min。2) 用水或无 UV 吸收的缓冲掖设置基线。
RNA足迹和修饰干扰分析实验
RNA 足迹和修饰干扰分析(RNA footprinting and modification interference analysis)是用来研究 RNA 与蛋白质相互作用的技术。RNA 测序及其结构分析的原理是 RNA 足迹试验的理论基础,它们都是建立在变性、半变性或自然条件下采用碱基特异性
RNA足迹和修饰干扰分析实验
实验方法原理 RNA 足迹和修饰干扰分析(RNA footprinting and modification interference analysis)是用来研究 RNA 与蛋白质相互作用的技术。RNA 测序及其结构分析的原理是 RNA 足迹试验的理论基础,它们都是建立在变性、半变性或
RNA提取得率偏低原因分析
1 ) 组织或细胞中 RNA 含量偏低: 不同细胞或者组织中RNA的丰度不一样,RNA提取量也不一致。 2 ) 样品起始量太少或者太多: 样品起始量太少,则细胞组织中RNA含量较低,样品过多则超过裂解液的裂解能力,使得裂解不完全,从而RNA得率低。
总RNA提取常见问题分析
Q:RNA降解 A:1. 新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可
多功能植物小RNA分析工具|一站式小RNA分析及可视化
日,《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果,他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer,可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。 据介绍,植物小RNA是植物生长发育和营养繁殖过程的重要调控分子。目前已有的分析工具多数依赖于命令行环境,
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教
细胞RNA含量样品的制备及分析
实验材料单细胞悬液试剂、试剂盒PY 试剂醋酸缓冲液磷酸缓冲液DNA 酶消化液实验步骤一、试剂配制1. PY 试剂的配制:PY 1.0 g 以 100 ml 蒸馏水溶解,配成母液,置 4℃ 冰箱保存。PY 工作液:取 1 ml PY 母液,加入 1 mol/L pH 4.7 的醋酸缓冲液 100 ml
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教
5.1-RNA-光谱分析与定量
采用分光光度法对核酸进行精确定量,因为这种方法不破坏结构,并且还能回收样品.。RNA 有吸收紫外光的性质,吸收高峰在 260nm 波长处,这是单个核糖核甘酸在 256nm 和 281nm 之间吸收值的平均值。试剂、试剂盒DEPC无核酸酶的水仪器、耗材紫外分光光度计石英比色杯实验步骤一、材料与设备1)
“泛转录组”首次用于RNA测序分析
近日发表在《自然·方法》杂志上的一篇新论文中,美国加利福尼亚大学圣克鲁斯分校(UCSC)的研究人员介绍了有史以来第一种使用“泛转录组”分析全基因组RNA测序数据的方法。 分析一个人的基因表达需要将他的RNA图谱映射到一个标准参照物,以深入了解基因在多大程度上“开启”并在体内发挥功能。但当参照物
信使RNA的检测、分析及定量介绍
对mRNA的检测、分析及定量方法目标RNA的类型同时定量的目标RNA的数量用途缺点Northern杂交mRNA通常为一个,最多几个。主要用于估测不同组织、细胞中目标mRNA的分子质量,可用于mRNA的粗略定量。需要大量RNA;只可同时检测一个或最多几个mRNA;与PCR方法相比,灵敏度差、耗时。RN
细胞RNA含量样品的制备及分析
细胞RNA含量样品的制备及分析 实验材料 单细胞悬液 试剂、试剂
细胞RNA含量样品的制备及分析
实验材料 单细胞悬液 试剂、试剂盒 PY 试剂 醋酸缓冲液 磷酸缓冲液 DNA
用引物延伸法进行-RNA-的分析
实验方法原理 引物延伸法主要用于 mRNA5' 末端作图。poly (A) + RNA 先与过量 5' 末端标记的且与靶 RNA 互补的单链寡核苷酸引物杂交,然后用反转录酶延伸这个引物。产生的 cDNA 与 RNA 模板互补且长度与引物 5' 末端和 RNA 5'
“泛转录组”首次用于RNA测序分析
近日发表在《自然·方法》杂志上的一篇新论文中,美国加利福尼亚大学圣克鲁斯分校(UCSC)的研究人员介绍了有史以来第一种使用“泛转录组”分析全基因组RNA测序数据的方法。 分析一个人的基因表达需要将他的RNA图谱映射到一个标准参照物,以深入了解基因在多大程度上“开启”并在体内发挥功能。但当参照物不
细胞RNA-含量样品的制备及分析
实验材料 单细胞悬液试剂、试剂盒 PY 试剂醋酸缓冲液磷酸缓冲液DNA 酶消化液实验步骤 一、试剂配制1. PY 试剂的配制:PY 1.0 g 以 100 ml 蒸馏水溶解,配成母液,置 4℃ 冰箱保存。PY 工作液:取 1 ml PY 母液,加入 1 mol/L pH 4.7 的醋酸缓冲液 100
用引物延伸法进行-RNA-的分析
引物延伸法主要用于 mRNA5' 末端作图。poly (A) + RNA 先与过量 5' 末端标记的且与靶 RNA 互补的单链寡核苷酸引物杂交,然后用反转录酶延伸这个引物。产生的 cDNA 与 RNA 模板互补且长度与引物 5' 末端和 RNA 5' 末端之间的距离相
用引物延伸法进行-RNA-的分析
实验方法原理 引物延伸法主要用于 mRNA5' 末端作图。poly (A) + RNA 先与过量 5' 末端标记的且与靶 RNA 互补的单链寡核苷酸引物杂交,然后用反转录酶延伸这个引物。产生的 cDNA 与 RNA 模板互补且