方案2蛋白质还原和S羧甲基化：大规模方法
实验方法原理蛋白质链间或链内完整的二硫键，会给酶解或化学裂解带来麻烦。如：1.二硫键连接的肽段洗脱物，在基于RP-HPLC的肽段作图中会产生单个的峰，从而使这些肽段图很难解释；2.最理想的方法是在序列测定之前，分离由S—S键连接的肽段，否则会使序列数据的解释变得复杂；3.没有断裂二硫键的蛋白质不便于蛋白质的片段化。用于断裂二硫键的最普通方法，是将胱氨酸还原成半胱氨酸残基。可是，半胱氨酸残基具有很高的反应性，导致序列测定变得复杂（比如，形成随机二硫键，以及在去掉还原剂后很容易被氧化）。基于这个原因，通常要使它们变成稳定的衍生物（如通过烷化作用）。在本方案中，完整的蛋白质（>lmg) 首先被还原，然后被碘乙酸（或碘乙酰胺）S-羧甲基化，得到半胱氨酸衍生物 S-羧甲基胱氨酸（或 S-羧甲基半胱氨酸），利用化学测序方法很容易检测。另一种常用的烷基化试剂是 4-乙烯基吡啶，产生 4-乙烯基吡啶半胱氨酸（RafteryandCole,......阅读全文
方案2－蛋白质还原和S羧甲基化：大规模方法
实验方法原理蛋白质链间或链内完整的二硫键，会给酶解或化学裂解带来麻烦。如：1.二硫键连接的肽段洗脱物，在基于RP-HPLC的肽段作图中会产生单个的峰，从而使这些肽段图很难解释；2.最理想的方法是在序列测定之前，分离由S—S键连接的肽段，否则会使序列数据的解释变得复杂；3.没有断裂二硫键的蛋白质不便于
方案3－蛋白质还原和S羧甲基化：微量方法
实验材料纯化的蛋白质样品试剂、试剂盒乙腈碘乙酸正丙醇还原缓冲液储存液仪器、耗材台式离心机HPLC 系统冷冻干燥离心机聚丙烯小管水浴或温箱实验步骤一、样品还原1.利用冷冻干燥离心机蒸发纯化的蛋白质样品溶液（含 0.01%~0.02% Tween-20)，直到少于 10ul。2.加入 150ul 储存液
电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验
方案1 蛋白质的过甲酸氧化实验 方案2 蛋白质还原和S-羧甲基化：大规模方法 方案3 蛋白质还原和S-羧甲基化：微量方法 方案4 用Ellman 试剂测定自由巯基和二硫键实验 方案5 蛋白质的胰酶消化实验 方案6 用溴化氰切割 M
方案12－胶内蛋白质的S吡啶乙基化实验
实验材料通过电泳分离的凝胶内蛋白质试剂、试剂盒β-巯基乙醇还原缓冲液仪器、耗材冷冻干燥离心机去离子水温箱冷冻干燥机小离心管移液管塑料皿实验步骤方法 1: 整块凝胶的还原和 S-吡啶乙基化1.保证整块凝胶的正确染色和脱色（见方案 9)。2.在 400~500 ml 水中清洗凝胶 3 次，约 1.5 h
基本方案2－直接－Southern－杂交检测异常扩增和甲基化实验
实验材料基因组DNA试剂、试剂盒5 X 限制性缓冲液10 X Ficoll载样缓冲液1 X TAE 缓冲液变性缓冲液转性缓冲液中性缓冲液杂交缓冲液仪器、耗材Whatman 3MM 滤纸Nytran SuPercharge Turboblotter Rapid Downward Transfer 系统
重组蛋白质的大规模生产实验——基本方案
蛋白质（protein）是生命的物质基础，没有蛋白质就没有生命。因此，它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。实验材料重组蛋白质仪器、耗材培养瓶过滤器实验步骤1. 在悬浮培养液中培养Sf9细胞，并使之适应无血清培养液。 2. 准备旋转培养瓶，用于按比例扩增Sf9细胞，将合适大小的两
蛋白质组实验全套流程方案2
聚丙烯酰胺凝胶的配制表1 配制Tris-甘氨酸SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳分离胶所用溶液溶液成分不同体积（ml）凝胶液中各成分所需体积（ml）5101520253040506% 水2.65.37.910.613.215.921.226.5 30%丙烯酰胺溶液123456810 1.
酵母遗传学方法实验指南——技术和方案2
技术和方案2 快速粗放的酵母菌落质粒转化法实验步骤展
基本方案2－确定甲基化特异性－PCR－产物中－CpG－位点的甲基化
实验材料甲基化特异性PCR (MSP) 产物试剂、试剂盒适合的限制性内切核酸酶和缓冲液牛血清白蛋白糖苷配糖基1 X 甲酰胺上样缓冲液乙醇实验步骤1.在 1.5 ml 管中加入 10ul MSP 产物。加入 15ul 10 X 限制性内切核酸酶和缓冲液，需要的话加 BSA，加水至 150ul。加入 1
大规模蛋白质相互作用研究方法进展（二）
这一经典的蛋白相互作用研究方法接近于体内环境，那些瞬时、不稳定的两两相互作用也可以被检测到，并且与内源蛋白的表达无关[6]。鉴于这些优点并结合简便高效的Gateway表达载体构建方法[7]，在大规模的蛋白质－蛋白质相互作用研究中酵母双杂交系统得到了最为广泛的应用。Rain 等[8]用该法绘制了人类胃
大规模蛋白质相互作用研究方法进展（四）
表1 蛋白质相互作用分析相关数据库及网站 网站 资源类型 网址 DIP 蛋白质相互作用http: //dip.doe-mbi.uda.edu INTERACT 蛋白质相互作用http: //bioinf.man.ac.uk/interactpr.htm ProNet 蛋白质相互作用ht
大规模蛋白质相互作用研究方法进展（三）
图1 TAP亲和层析纯化原理[14] 注：A:标签中的ProteinA 与固化的IgG 结合缓冲液淋洗去除不能结合的杂蛋白，TEV 酶切分离ProteinA 和靶蛋白；B:利用CBP(Calmodulin binding peptide)-Calmodulin 的相互
大规模蛋白质相互作用研究方法进展（一）
来源：生命科学 关 薇, 王 建, 贺福初*（军事医学科学院放射与辐射医学研究所，北京 100850） 摘 要：随着2000 年酵母大规模蛋白质相互作用网络图谱的成功描绘，蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用研究成为生命科学领域的又一个研究热点。酵母、果蝇、线虫以及人类蛋白的大规模相
大连化物所蛋白质组学研究取得进展
蛋白质甲基化是一种非常重要的翻译后修饰现象，其甲基供体为S-腺苷甲硫氨酸（SAM）。由于甲基化可发生在氨基酸残基的N-,O-和S-中心，并且N-中心甲基化还存在不同状态，同时甲基化对分离行为影响非常细微，限制了对蛋白质甲基化组的解析。常规基于抗体的研究策略仅捕获了部分N-中心甲基化的信息。中国科
核酸和蛋白质序列分析2
（2）输出：除了以文本形式外，还可以通过JalView显示和编辑结果。此外，还可以另外使用GeneDoc（常见于文献）及DNAStar软件等显示结果。多序列比对的结果还用于进一步绘制进化树。3、ORF(Open Reading Frame)分析从核酸序列翻译得到蛋白质序列，需要进行ORF分析，每个生
关于同型半胱氨酸代谢通路的介绍
（5-甲基四氢叶酸进入同型半胱氨酸代谢通路，亦称甲基传递通路） （1）5-甲基四氢叶酸在甲硫氨酸合成酶及其辅酶维生素B12的催化下提供一个甲基给同型半胱氨酸使之转化成为甲硫氨酸，而自身转换为四氢叶酸，甲硫氨酸则在ATP供能的情况下转化为S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。 （2）S-腺苷甲硫氨酸(S
蛋白质DNA相互作用的甲基化和尿嘧啶干扰分析法—甲基化
实验方法原理在甲基化干扰实验中，探针通过将鸟嘌呤N-7及腺嘌呤N-3位用硫酸二甲酯 (DMS)进行甲基化而产生。这些甲基化的碱基可被哌啶特异性切割。实验材料含有蛋白质结合位点的DNA片段试剂、试剂盒TE 缓冲液 pH 7.5 〜8.0硫酸二甲酯（DMS)DMS反应缓冲液DMS终止缓冲液10 mg m
Nature－Genetics－|－迄今最大规模DNA甲基化QTL图谱
分子生物学领域内的一个重要课题是个体基因组特征，如单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP），与基因调控各层级之间的因果关联以及这种关联对表现型的影响机制。换句话说即是对表观修饰和基因表达等分子特征的遗传基础的解析。在这一研究方向上，最具代表性的范式无疑
生物转化的主要类型
葡萄糖醛酸化肝细胞微粒体中含有非常活跃的葡糖醛酸基转移酶，它以尿苷二磷酸葡糖醛酸（UDP-葡糖醛酸）为供体，催化葡糖醛酸基转移到多种含有极性基团的化合物（包括药物、毒药和激素）上，如酚、醇、胺和羧酸等，生成β-葡糖醛酸苷。生物转化硫酸化硫酸化反应是人体化学防御系统的一部分，同时在芳香胺、多环芳烃等许
基本方案2－RNA－抽提和标记
试剂、试剂盒TRIzol 试剂PBS氣仿乙醇乙酸钠引物Superscript Ⅱ RNase H反转录酶10 X low-T dNTP 混合物EDTATE 缓冲液仪器、耗材RNeasy Maxi 试剂盒组织匀浆机圆底离心管圆锥底离心管水平离心机薄壁 PCR 管热循环仪荧光扫描仪实验步骤展
大规模的问题及对策2
用基因工程方法将bcl-2基因这种细胞凋亡抑制基因导入细胞，成为众多研究者的选择。bcl-2基因的过量表达能抑制Gln或氧缺乏引起的细胞凋亡，减少细胞特定营养成分的消耗，提高细胞密度和目的蛋白产量,这对于细胞大规模培养具有重大意义。对细胞的这种保护作用依赖于bcl-2等抑制基因的高水平表达。因此，需
方案1－蛋白质和多肽－MALDIMS－分析的一般方法
实验材料冷冻干燥样品试剂、试剂盒校准标准品基质溶液甲醇仪器、耗材MALDI 质谱仪MALDI 板实验步骤1.吸取 0.5ul 的基质溶液，加到 MALDI-MS 分析所用的金属样品板上的样品孔中（为了准确起见，请使用2ul 的移液器）。2.在基质干燥之前，迅速加入 0.5ul 的标准品或样品到基质中
蛋白质与多肽提取分离方法2
1.1.7 灌注层析（Perfusion Chromatography，PC）PC是一种基于分子筛原理与高速流动的流动相的层析分离方法，固定相孔径大小及流动相速度直接影响分离效果。试验证明其在生产、制备过程中具有低投入、高产出的特性。目前市场上可供应的PC固定相种类较多，适合于不同分子量的多肽分离
生物转化的分类
生物转化中的结合反应由于结合物种类的不同可分为下列几种类型，各种类型结合反应举例如下：葡萄糖醛酸化肝细胞微粒体中含有非常活跃的葡糖醛酸基转移酶，它以尿苷二磷酸葡糖醛酸（UDP-葡糖醛酸）为供体，催化葡糖醛酸基转移到多种含有极性基团的化合物（包括药物、毒药和激素）上，如酚、醇、胺和羧酸等，生成β-葡糖
羧苄西林钠的检查方法
酸碱度取本品,加水制成每1ml中含20mg的溶液,依法测定(通则0631),pH值应为6.0~7.5。溶液的澄清度与颜色取本品5份,各0.60g,分别加水10ml使溶解,溶液应澄清无色;如显浑浊,与1号浊度标准液(通则0902第一法)比较,均不得更浓;如显色,与黄色或黄绿色3号标准比色液(通则090
羧苄西林钠的检查方法
检查酸碱度取本品,加水制成每1ml中含20mg的溶液,依法测定(通则0631),pH值应为6.0~7.5。溶液的澄清度与颜色取本品5份,各0.60g,分别加水10ml使溶解,溶液应澄清无色;如显浑浊,与1号浊度标准液(通则0902第一法)比较,均不得更浓;如显色,与黄色或黄绿色3号标准比色液(通则0
羧甲司坦的检查方法
检查酸度取本品,加水制成1%的混悬液,依法测定(通则0631),pH值应为2.8~3.0溶液的透光率取本品0.50g,加1mol/L氢氧化钠溶液10ml溶解后,照紫外-可见分光光度法(通则0401),在430nm的波长处测定,透光率不得少于95.0%氯化物取本品0.20g,加稀硝酸10ml使溶解,用
蛋白质的表达、分离、纯化和鉴定（2）
二、氯霉素酰基转移酶重组蛋白的分离，纯化 1. NTA层析柱的准备：在层析柱中加入1mL NTA介质，并分别用8mL 去离子水，8mL上样缓冲液洗涤。 2. 重组蛋白的变性裂解：在冰浴中冻融菌体沉淀，加入5mL上样缓冲液, 用吸管抽吸重悬，超声波破裂菌体，用振荡器等轻
什么是甲基化
甲基化是指从活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上将甲基催化转移到其他化合物的过程。可形成各种甲基化合物，或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内，甲基化是经酶催化的，这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工
什么是甲基化？
甲基化是指从活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上将甲基催化转移到其他化合物的过程。可形成各种甲基化合物，或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内，甲基化是经酶催化的，这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工。