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应用EADHRMS新技术开展环肽和PROTAC的代谢物鉴定

报告时间2023年6月10日下午报告地点中国药学会医药生物分析技术年会分会场5(深圳厅)项目背景液相色谱串联高分辨质谱仪(LC-HRMS)是目前开展药物代谢产物鉴定(MetID)最常用的分析仪器,LC-HRMS开展MetID的流程中一个关键的步骤是根据代谢物的离子谱图进行结构解析。常用的质谱解离方式-碰撞诱导解离(CID)对某些类型的代谢物往往不能产生信息丰富的碎片,导致无法推断代谢物的详细结构。近来SCIEX推出了一种新型的Q-TOF质谱仪(SCIEX ZenoTOF™ 7600系统),其特征之一是配备了电子活化解离(EAD)技术。本研究通过与SCIEX中国应用中心的合作系统地评估了EAD在鉴定PROTAC的氧化代谢物和葡萄糖醛酸结合物的效果,并与CID在此方向的应用进行比较。另外,我们根据EAD和CID离子质谱图对环肽药物的线型和环型代谢物的结构进行了解析,并比较了EAD和CID的优势。我们的研究结果发现,无论是针......阅读全文

应用EAD-HRMS新技术开展环肽和PROTAC的代谢物鉴定

报告时间2023年6月10日下午报告地点中国药学会医药生物分析技术年会分会场5(深圳厅)项目背景液相色谱串联高分辨质谱仪(LC-HRMS)是目前开展药物代谢产物鉴定(MetID)最常用的分析仪器,LC-HRMS开展MetID的流程中一个关键的步骤是根据代谢物的离子谱图进行结构解析。常用的质谱解离方式

AB Sciex视频讲座“QTRAP系统进行代谢物鉴定方法”

  3月24日,AB Sciex 公司在分析测试百科网成功举办了题为“在药物发现和开发阶段代谢物鉴定的高级解决方案”的网络视频讲座。AB Sciex 的资深应用专家张克荣老师简单介绍了代谢物鉴定的应用和仪器概述,随后重点讲解用QTRAP®系统进行代谢物鉴定的方法。   代谢物鉴定的应用和仪器概述

关于环肽的命名介绍

  环肽(cyclic peptides)的名称由肽的名称(放在括号内)加前缀“环(cyclo)”构成。由符号构成的肽的名称放在括号“( )”内,前面也加上前缀“环(cyclo)”。完全由氨基酸残基以正常肽键[真肽键(eupeptide linkage)]组成的肽对其中 D -型的氨基酸残基需要使用

复杂生物样本中大规模未知代谢物鉴定获得实现

中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员课题组在Nature Communications杂志在线发表了题为“Metabolite Annotation from Knowns to Unknowns through Knowledge-guided Multi-laye

关于鬼笔环肽的毒性介绍

  发现后不久,科学家将鬼笔环肽注射入小鼠体内,并通过IP注射发现其LD50为2 mg / kg。 当暴露于最小致死剂量时,这些小鼠死亡需要几天时间。 鬼笔环肽中毒的唯一明显副作用是极度饥饿。 这是因为鬼笔环肽仅通过胆汁盐膜转运蛋白被肝脏吸收。 一旦进入肝脏,鬼笔环肽会结合F-肌动蛋白,从而阻止其解

简述环肽的合成方法

  Jame P.Tam[88-90]等建立了分子内转移硫内酯化和Ag+离子辅助环合来制备非保护环肽的方法。对于N端为半胱氨酸,C端为硫酯的线性多肽,在pH=7的磷酸缓冲液中,巯基与硫酯基生成共价的硫内酯,这种硫内酯自发地经过S原子到N原子酰基迁移而形成环肽。  作者应用上述方法合成了一系列N端为半

关于鬼笔环肽的物质介绍

  鬼笔环肽是最早发现的环状肽之一。它是从Amanita phalloides中分离出来的,并于1937年由Feodor Lynen和Ulrich Wieland结晶。它的结构不同寻常,因为它包含一个半胱氨酸-色氨酸键,形成一个双环七肽。这种连接以前没有被表征过,这使得鬼笔环肽的结构阐明变得更加困难

关于鬼笔环肽的基本介绍

  鬼笔环肽(phalloidin),是从一种剧毒蘑菇(Amanita phalloides(Vaill ex Fr.)Secr.) (伞菌目,毒伞属的毒伞)中分离出来的一种多肽物质,属于毒伞肽类毒素,是一种强烈毒素。无色,细针状结晶。鬼笔环肽中毒的主要症状是由于肝细胞的破坏引起的急性饥饿。它通过结

简述鬼笔环肽的作用机理

  鬼笔环肽结合F-肌动蛋白,防止其解聚并中毒细胞。 鬼笔环肽特异性结合在F-肌动蛋白亚基之间的界面,将相邻的亚基锁定在一起。 鬼笔环肽(一种双环七肽)与肌动蛋白丝的结合比与肌动蛋白单体的结合更紧密,从而导致肌动蛋白亚基从丝端解离的速率常数减小,这通过防止丝解聚而基本稳定了肌动蛋白丝。此外,发现鬼笔

同时鉴定和定量水果和蔬菜中300种农药及其代谢物

  目前,世界上使用的农药已超过800种,其中很多化合物在饮用水和食品中法定允许量即最大残留 限要求得到控制。对于这种目标物分析,迫切需要能够进行同时多残留组分的分析方法,这样可以大大 降低工作量。但是,很多农药用GC-MS分析很困难或几乎不能分析,但是却可以用LC-MS/MS多残留组分 分析方法进

同时鉴定和定量水果和蔬菜中300种农药及其代谢物

目前,世界上使用的农药已超过800种,其中很多化合物在饮用水和食品中法定允许量即最大残留 限要求得到控制。对于这种目标物分析,迫切需要能够进行同时多残留组分的分析方法,这样可以大大 降低工作量。但是,很多农药用GC-MS分析很困难或几乎不能分析,但是却可以用LC-MS/MS多残留组分 分

SCIEX与IROA 合作推出新系统 将加速代谢物鉴定分析

   分析测试百科网讯 近日,SCIEX宣布已经与IROA Technologies合作,提供用于生物样品中代谢物鉴定和定量的系统。  根据协议条款,两家公司表示将共同推广一个结合同位素比值异常分析的IROA工作流程,该系统包括用质谱法标记生物化学代谢物的相对定量分析,然后进行算法分析——利用SCI

LED室内照明新技术成果通过鉴定

  “LED室内照明用低成本高效率改进型MCOB封装材料与技术集成”1月31日通过了专家鉴定。鉴定委员会专家组一致认为,该技术拥有完整的自主知识产权,且已实现大规模产业化,产品的技术指标都达到国际先进水平。   当日在福建莆田召开的中国科学院这项技术成果鉴定会上,以中科院武汉物理与数学研究所叶朝辉

我国建立世界“植物环肽”化学研究坐标系

经过15年的系统研究,以中国科学院昆明植物研究所周俊院士和谭宁华研究员为首的研究团组,共发现植物环肽79个,为世界植物环肽研究建立了一套完整的化学研究体系,树立了该领域的研究标杆和坐标系。 1991年,谭宁华在昆明植物研究所利用从江苏带回的中药太子参进行实验时,偶然获得了两个任何对照图谱上都没有记载

关于环肽的基本信息介绍

  通常生物学中所指的环肽是指以氨基酸肽键形成的化合物,在植物化学中这一概念被扩大成以酰胺键形成的一类化合物,因此范围被扩大至包括有机胺类和大环生物碱类,根据成环与否分为环肽和直链肽。 已报道的环肽类化合物具有多方面的生物活性,包括抗肿瘤、抗HIV、抗菌、抗疟、安眠、抑制血小板聚集、降压、抑制酪氨酸

关于鬼笔环肽的生物合成介绍

  鬼笔环肽是一种双环七肽,含有不寻常的半胱氨酸-色氨酸键。 编码鬼笔环肽合成的基因是死亡帽蘑菇中MSDIN家族的一部分,编码34个氨基酸的前肽。 脯氨酸残基位于七个残基区域的两侧,稍后将变成鬼笔环肽。 翻译后,必须对肽进行蛋白水解切除,环化,羟基化,使Trp-Cys交联形成色氨酸,并差向异构化以形

关于鬼笔环肽的配制内容介绍

  0.1mg鬼笔环肽溶于1ml无水甲醇(也可用DMSO或无水乙醇溶解)配成贮存液,可在-20度避光的条件下长期保存,工作液的浓度为5ug/ml,由贮存液加生理盐水PBS稀释20倍即可。  一、染色程序  1、生理盐水PBS清洗细胞2次,每次10分钟;  2、3.7%-4%的甲醛或多聚甲醛固定20分

Science:新方法鉴定肠道微生物组产生的代谢物分子

  肠道菌群产生数百种以高水平存在于血液循环中的分子,它们的水平在不同人之间差异很大。这些分子是研究肠道微生物组与宿主相互作用的一个有前景的起点;少数经过详细描述的分子具有强效的免疫或代谢调节活性,并且是G蛋白偶联受体或核激素受体的配体。但是,在大多数情况下,这些分子的产生尚未与特定的细菌菌株或代谢

对1μM维拉帕米进行快速灵敏的体外代谢物鉴定

目的 :使用ACQUITY UPLC®/Xevo™ G2 QTof质谱系统及MetaboLynx™ XS应用管理软件,鉴定通过人肝微粒体体外孵育而获取的1 μM维拉帕米的代谢物。 背景 近年来,随着越来越多的一线药品因存在安全性顾虑而退出市场,人们对药品研发过程中的药物代谢和毒性研究给

RGD环肽,AMC(香豆素)修饰多肽

1. RGD环肽简介在了解RGD肽之前,我们先简单介绍一下整合素,整合素即整联蛋白,是一类介导哺乳动物细胞黏附与信号转导的异二聚体跨膜糖蛋白受体,由α和β亚单位组成,参与包括细胞迁移、细胞侵袭、细胞和细胞间的信号传导、细胞黏附及血管新生过程等多种细胞活动的调节,其中对整合素αvβ3的研究最为广泛。整

关于鬼笔环肽的化学合成介绍

  由于鬼笔环肽因其结合和稳定肌动蛋白聚合物的能力而被开发利用,但细胞无法轻易吸收,因此科学家发现鬼笔环肽衍生物在研究中更有用。 本质上,它遵循典型的使用羟脯氨酸的小肽合成。 合成的主要困难是色氨酸的形成(半胱氨酸-色氨酸交联)。  以下是Anderson等人进行的一般合成机理。在2005年进行了a

上海有机所发表基于离子淌度质谱的多维代谢物鉴定技术

  中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组发展了基于离子淌度质谱的碰撞截面积数据库(AllCCS),并开发出基于离子淌度质谱的多维代谢物分析技术,用于生命体内已知和未知代谢物的化学结构鉴定。  离子淌度质谱(Ion Mobility-Mass Spectrometry)

代谢物结构鉴定新算法MetDNA,克服标准MS/MS谱图库依赖性

  近日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)杂志发表了由中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组的最新研究成果“Metabolic Reaction Network-based Recursive Metabolite Annotat

环肽合成酶的基本信息

中文名称环肽合成酶英文名称cyclic peptide synthetase定  义催化直链多肽N端的α氨基和C端的α羧基脱水反应形成环状多肽的酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

环肽合成酶的基本信息

中文名称环肽合成酶英文名称cyclic peptide synthetase定  义催化直链多肽N端的α氨基和C端的α羧基脱水反应形成环状多肽的酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

关于鬼笔环肽用作显影剂的介绍

  荧光鬼笔环肽(红色)标记内皮细胞中的肌动蛋白丝鬼笔环肽的特性使其成为研究F-肌动蛋白在细胞中分布的有用工具,方法是用荧光类似物标记鬼笔环肽并用它们对肌动蛋白丝染色以进行光学显微镜检查。鬼笔环肽的荧光衍生物在定位活细胞或固定细胞中的肌动蛋白丝以及体外观察单个肌动蛋白丝方面非常有用。开发了一种高分辨

固相合成法制备抗原肽环肽

1.1  仪器与试剂多肽合成仪(CS536,美国CSBio公司),半制备型高效液相色谱仪(Waters Delta Prep4000,美国Waters公司),分析型高效液相色谱仪(Agilent 1100,美国Agilent公司),冷冻干燥机(Christ Alpha,德国Christ公司)

香港研发出肉类成分快速鉴定新技术 时间缩短8成

  香港城市大学研发出崭新的肉类成分快速鉴定技术,可同时鉴定多种肉类混合制成的食品的成分,所需时间比现有鉴定法缩短八成,将有助于大大提高食品安全。   香港城大生物及化学系郑淑娴教授及其团队潜心研究两年,运用分子生物技术研发出一种快速鉴定方法,仅须使用特制的检测试纸,即可在短短8小时内完