蛋白质结构解析的方法简介
到目前为止,蛋白质结构解析的方法主要是两种,x射线衍射和NMR。近年来还出现了一种新的方法,叫做Electron Microscopy。其中X射线的方法产生的更早,也更加的成熟,解析的数量也更多,我们知道,第一个解析的蛋白的结构,就是用x晶体衍射的方法解析的。而NMR方法则是在90年代才成熟并发展起来的。这两种方法各有优点和缺点。首先来说一下,这两种方法的一般的步骤和各自的优点和缺点。电子显微镜(electron microscopy)作为一种新型的技术,目前的应用还是非常少,并且比较狭窄,我可能等到最后在给它作些介绍,而且相信绝大多数人也没有听说过,也不会有很大的兴趣。首先是X晶体衍射。首先要得到蛋白质的晶体。通常,都是将表达蛋白的基因PCR之后克隆到一种表达载体中,然后在大肠杆菌中诱导表达,提纯之后摸索结晶条件,等拿到晶体之后,工作便完成的80%,将晶体进行x射线衍射,收集衍射图谱,通过一系列的计算,很快就能得到蛋白质的原子......阅读全文
关于蛋白质结构肽键的介绍
两个氨基酸可以通过缩合反应结合在一起,并在两个氨基酸之间形成肽键。而不断地重复这一反应就可以形成一条很长的残基链(即多肽链)。这一反应是由核糖体在翻译进程中所催化的。肽键虽然是单键,但具有部分的双键性质(由C=O双键中的π电子云与N原子上的未共用电子对发生共振导致),因此C-N键(即肽键)不能旋
我所提出聚集态蛋白质相互作用组的交联解析新方法
近日,我所蛋白质折叠化学生物学创新特区研究组(02T5组)刘宇研究员团队、生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员团队,以及西湖大学张鑫教授团队等合作,通过系统性调控绿色荧光蛋白发色团的骨架结构,实现分子的三重态化学活性,并用于活细胞内聚集态蛋白质的靶向交联,获得了聚集态蛋白质的相互作
解析振动筛的结构和工作原理
一、振动筛结构 振动筛结构简单、设计合理、便于操作,主要由振动器、筛箱、支承或悬挂装置、传动装置等部件组成。 1、振动器 单轴振动筛和双轴振动筛的振动器,按偏心重配置方式区分一般有两种型式。偏心重的配置方式以块偏心型式较好。 2、筛箱 筛箱由筛框、筛面及其压紧装置组成。筛框(新型制沙机
解析污水采样设备的结构组成与特点
污水采样设备是采用高可靠蠕动泵,混合式步进机驱动,满足各类环境条件下的水质采样;适用于各级环境监测站、污水处理厂、水利、水务及科研院所,对工业污水排放口、江、河、湖、海等水样的采集的仪器。 污水采样设备由喷雾器的气筒和气阀以及导管、多孔吸球组成。 气筒是用喷雾器的气筒改装而成。即把喷雾器的气
蛋白质二级结构预测-综合各种分析方法预测
综合各种分析方法预测在实际进行蛋白质二级结构预测时,往往会综合应用各种分析方法和相关数据。综合方法不仅包括各种预测方法的综合,而且也包括结构实验结果、序列对比结果、蛋白质结构分类预测结果等信息的综合。实际应用中最常见的综合方法是同时使用多个软件进行预测,通过分析各个软件的特点以及各个软件预测结果,最
ChouFasman预测方法预测蛋白质二级结构
Chou-Fasman方法是一种基于单个氨基酸残基统计的经验参数方法,由Chou和Fasman在20世纪70年代提出来。通过统计分析,获得的每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子,进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级结构。每种氨基酸残基出现在各种二级结构中倾向或者频率是不同的,例如Glu主要出
蛋白质二级结构预测-人工神经网络方法
人工神经网络是一种复杂的信息处理模型。随着神经网络研究的兴起,科学家们也将神经网络用于生物信息学,其中包括二级结构的预测、蛋白质结构的分类、折叠方式的预测以及基因序列的分析等等。将神经网络用于二级结构预测的最早是由Qian和Sejnowskit提出的,他们受到神经网络在文字语言处理方面应用的启发,将
我国科学家首创蛋白质动态结构AI建模方法
科技日报记者 刘园园 西湖大学12月8日公布,该校人工智能(AI)讲席教授李子青团队与厦门大学、德睿智药合作,首创研发了能够刻画蛋白质构象变化与亲和力预测的AI模型——ProtMD。 这是第一个尝试解析蛋白质动态构象的人工智能方法,可辅助药物化学专家更加精准地筛选出高活性小分子,从而加速临床前药物研
Science:全面解析大脑中所有蛋白质
由瑞典卡罗林斯卡研究所的研究人员领导的国际科学家团队全面概述了大脑中表达的所有蛋白质,这一开放式数据库为医学研究人员提供了前所未有的资源,加深了对神经生物学的理解,并有助于开发针对精神病和神经病的更有效的疗法和诊断方法。 这一发现刚公布在3月5日Science杂志上。 在结构和功能上,大脑是
简介涂层测厚仪的结构
涂层测厚仪可无损地测量磁性金属基体(如钢、铁、合金和硬磁性钢等)上非磁性涂层的厚度(如铝、铬、铜、珐琅、橡胶、油漆等), 以及非磁性金属基体(如铜、铝、锌、锡等)上非导电覆层的厚度(如:珐琅、橡胶、油漆、塑料等)。涂镀层测厚仪具有测量误差小、可靠性高、稳定性好、操作简便等特点,是控制和保证产品质量
球磨机的机械结构简介
球磨机由给料部、出料部、回转部、传动部(减速机,小传动齿轮,电机,电控)等主要部分组成。中空轴采用铸钢件,内衬可拆换,回转大齿轮采用铸件滚齿加工,筒体内镶有耐磨衬板,具有良好的耐磨性。本机运转平稳,工作可靠。 球磨机主机包括筒体,筒体内镶有用耐磨材料制成的衬,有承载筒体并维系其旋转的轴承,还要
微纤丝的结构简介
细胞壁的主要组成成分是纤维素,它形成细胞壁的框架,内含其他物质。在电子显微镜下看到,这种框架由一层层纤维素微丝,简称微纤丝组成的,每一层微纤丝基本上是平行排列,每添加一层,微纤丝排列的方位就不同,因此层与层之间微纤丝的排列交错成网。微纤丝之间的空间通常被其他物质填充,其常常是由果胶、半纤维素、细
自吸泵的结构类型简介
自吸泵的结构类型很多,其中熔盐泵、真空泵、液下泵、计量泵、齿轮泵、耐腐蚀泵、耐酸泵、消防泵向旋转方向流动。然后与右回水孔流来的水汇合,顺着蜗壳流动。由于液体在蜗壳内不断冲击叶栅,不断被叶轮击碎,就同空气强烈搅拌混合,生成气水混合物,并不断地流动致使气水不能分离。混合物在蜗壳出口被隔舌剥离,沿短管
关于结构基因的简介
结构基因是指决定某一种蛋白质分子结构的相应的一段DNA或染色体。在正常情况下,在需要某种或其有关的酶时,在调节基因和操纵基因的控制下等候在启动子(Promotor)位置上的RNA聚合酶开始转录,从而产生了与这些酶有关的结构基因的信使RNA,并由后者合成所需的酶。若其发生突变,便会产生失去活性的蛋
甘油糖脂的结构简介
甘油糖脂(glycosylacylglycerid),糖基酰甘油结构与磷脂相类似,主链是甘油,含有脂肪酸,但不含磷及胆碱等化合物。糖类残基是通过糖苷键连接在1,2-甘油二酯的C-3位上构成糖基甘油酯分子。已知这类糖脂可由各种不同的糖类构成它的极性头。不仅有二酰基油酯,也有1-酰基的同类物。 自
蛋白质的结构域与三级结构的分类α/β型结构
一、结构域是蛋白质三级结构的基本结构单位和功能单位 蛋白质三级结构的基本结构单位是结构域。一个蛋白质可以只包含一个结构域也可以由几个结构域组成,故结构域是能够独立折叠为稳定的三级结构的多肽链的一部分或全部。结构域也是功能单位,通常多结构域蛋白质中不同的结构域是与不同的功能相关联的。许多已知的例子表
关于蛋白质的结构的相关介绍
结构决定功能。大多数的蛋白质都自然折叠为一个特定的三维结构,这一特定结构被称为天然状态。虽然多数蛋白可以通过本身氨基酸序列的性质进行自我折叠,但还是有许多蛋白质需要分子伴侣的帮助来进行正确的折叠。在高温或极端pH等条件下,蛋白质会失去其天然结构和活性,这一现象就称为变性。生物化学家常常用以下四个
病毒的蛋白质的结构及功能
蛋白质是病毒的另一类主要成分,包括结构蛋白和非结构蛋白。非结构蛋白是指由病毒基因组编码的,在病毒复制或基因表达调控过程中具有一定功能,但不结合于病毒颗粒中的蛋白质。结构蛋白是指构成一个形态成熟的有感染性的病毒颗粒所必需的蛋白质医学|教育网搜集整理,包括壳体蛋白、包膜蛋白和毒粒酶等。壳体蛋白是构成病毒
不同层次的蛋白质结构的介绍
蛋白质结构,从一级结构到四级结构 蛋白质的分子结构可划分为四级,以描述其不同的方面: 一级结构:组成蛋白质多肽链的线性氨基酸序列。 二级结构:依靠不同氨基酸之间的C=O和N-H基团间的氢键形成的稳定结构,主要为α螺旋和β折叠。 三级结构:通过多个二级结构元素在三维空间的排列所形成的一个蛋
不同层次的蛋白质结构的介绍
蛋白质结构,从一级结构到四级结构 蛋白质的分子结构可划分为四级,以描述其不同的方面: 一级结构:组成蛋白质多肽链的线性氨基酸序列。 二级结构:依靠不同氨基酸之间的C=O和N-H基团间的氢键形成的稳定结构,主要为α螺旋和β折叠。 三级结构:通过多个二级结构元素在三维空间的排列所形成的一个蛋
蛋白质检测简介
蛋白样品提取是蛋白定量和分析的基础。天然蛋白质分子结构、化学性能各异,选择适当的细胞裂解液制备蛋白样品至关重要。选择细胞裂解液时,除了要考虑蛋白产量,还要考虑所选择的一抗的是否能识别线性的抗原表位。一些含有十二烷基硫酸钠(SDS)和强离子去污剂(如脱氧胆酸钠等)的蛋白质裂解液能够从组织或细胞中提
蛋白质芯片技术简介
由于利用了DNA与互补的DNA或RNA结合的典型性质, DNA 芯片在短时间内就取得了成功. 然而, 已经有关于mRNA 和蛋白质之间数量关系上的争论, 而且实际上在细胞中参与各种不同反应的都是蛋白质. 因此, 如果能制造出蛋白质芯片而不是DNA芯片, 而且如果蛋白质表达强度和键合物能被发现, 就有
陆豪杰:蛋白质糖基化的质谱解析
分析测试百科网讯 2020年9月14日,由中国质谱学会(中国物理学会质谱分会)主办,分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020 CMSS)正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年,按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素
生物活性物质蛋白质的简介
蛋白质是由许多α氨基酸按照一定的序列通过酰胺键 (或肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象并具有一定生物功能的生物大分子。蛋白质是生命的载体,任何有生命的机体都不可能离开蛋白质。蛋白质在生命活动和种族繁衍中有重要的生物学意义,承担着强大的功能。 ① 结构功能:蛋白质是生物组织和细胞的组成成分,并发
关于泛素载体蛋白质的简介
泛素载体蛋白是指一种在泛素参与的短半寿期蛋白质降解过程中,介导泛素与被降解蛋白质连接的蛋白质。蛋白质在胃液消化酶的作用下,初步水解,在小肠中完成整个消化吸收过程。氨基酸的吸收通过小肠黏膜细胞,是由主动运转系统进行,分别转运中性、酸性和碱性氨基酸。 除了遗传密码所编码的20种基本氨基酸,在蛋白质
关于结合蛋白质的分类简介
结合蛋白质主要分为以下种类。色蛋白:蛋白质和色素物质结合,如血红蛋白。卵磷蛋白:蛋白质与卵磷脂相结合,如血液中的纤维蛋白、卵黄磷蛋白。脂蛋白:溶于水,是脂肪与蛋白质结合,脂蛋白是人体在体内运输脂肪的工具。包括乳糜微粒、极低密度脂蛋白、低密度脂蛋白、高密度脂蛋白。金属蛋白:蛋白质与金属结合,如运铁
细胞周期蛋白质的简介
生活在自然界的各种生物,生命都将随着时间的流逝而日趋衰老,最后死亡。作为生物体基本单位的细胞也是如此。单个细胞都有一定的生命期限,活细胞到了一定阶段不是繁殖,就是死亡。细胞的繁殖是通过有丝分裂进行的,母细胞平均分裂成两个和自身相同的子细胞;子细胞逐渐成熟,又重复母细胞的生命过程,由此生命得以世代
多肽和蛋白质的区别简介
多肽和蛋白质的区别,一方面是多肽中氨基酸残基数较蛋白质少,一般少于50个,而蛋白质大多由100个以上氨基酸残基组成,但它们之间在数量上也没有严格的分界线,除分子量外,还认为多肽一般没有严密并相对稳定的空间结构,即其空间结构比较易变具有可塑性,而蛋白质分子则具有相对严密、比较稳定的空间结构,这也是
蛋白质按结构种类分类
纤维蛋白(fibrous protein):一类主要的不溶于水的蛋白质,通常都含有呈现相同二级结构的多肽链许多纤维蛋白结合紧密,并为单个细胞或整个生物体提供机械强度,起着保护或结构上的作用。球蛋白(globular protein):紧凑的,近似球形的,含有折叠紧密的多肽链的一类蛋白质,许多都溶于水
蛋白质沉淀方法重金属盐沉淀法简介
常用于抢救误服重金属盐中毒的病人 许多有机物质包括蛋白在内,在碱性溶液中带负电荷,能与金属离子形成沉淀。根据有机物与它们之间的作用机制,可分为羧酸、胺及杂环等含氮化合物类,如铜锌镉;亲羧酸疏含氮化合物类,如钙镁铅;亲硫氢基化合物类,如汞银铅。蛋白质-金属离子复合物的重要性质是它们的溶解度对溶液