第五届全国生物信息学大会召开

第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会日前在哈尔滨召开,来自海内外的600余位生物信息学专家、学者出席会议。与会专家以“高通量时代的生物信息学与系统生物学”为主题,分别就利用基因组信息学分类细菌的新方法、细菌基因组组织形式、系统生物学在医学发展中的应用和研究策略以及基因组非编码区研究进展与方向等问题进行了深入探讨。 会议由中国细胞生物学学会、清华大学主办,哈尔滨医科大学承办。 中国科学院院士郝柏林、张春霆、陈润生,中国工程院院士刘德培、杨宝峰以及美国得克萨斯大学教授Michael Zhang、哈佛大学教授Shirley Liu等15位著名专家学者作了专题报告。 据与会专家介绍,生物信息学是一门交叉学科,主要是通过计算的方法进行生物医药问题的定量研究,其在基因组、蛋白质组、代谢组等高通量组学研究中居主导地位,在生物进化分析、表观遗传研究、生理和疾病机制探讨、新型药物研发等领域起着举足轻重的作用。 系统......阅读全文

中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得成果

  12月4日,中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果,以LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA stability in human cells为题,在线发表在e

中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得新成果

  12月4日,中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果,以LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA stability in human cells为题,在线发表在e

非编码RNA结合肌细胞增强因子2D调控肌肉发育

  近日,农科院特产研究所李光玉研究员带领的研究团队发现了一个新的在肌肉发育过程中发挥重要功能的长非编码RNA,该非编码RNA-Irm通过直接结合肌细胞增强因子2D来调节肌源性基因的转录,进而调节肌生成。该研究结果为动物肌肉生长发育研究提供了新的调节因子和表观调控机制,对深入解析肌肉生长发育的分子调

m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在

遗传编码荧光RNA探针研究获新进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503155.shtm

北京生科院发表环形非编码RNA识别新技术

   2月28日,国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因为目前在环形RNA识别方面存

JCI:促发儿童骨肿瘤的非编码RNA

  尤文氏肉瘤是骨或其周围软组织癌症,主要影响儿童和年轻成人。尤文氏肉瘤的特点是易位事件的发生,即RNA结合蛋白——EWS与转录因子如FLI1的融合。  以前的研究工作表明,该融合蛋白EWS-FLI1通过改变基因表达,促进癌症,但融合蛋白作用的靶基因是未知的。  发表在Journal of Clin

Nature:像海绵一样的非编码RNA

  一种称为RsmZ的小分子RNA具有特殊的功能:屏蔽细菌中抑制翻译的蛋白的作用,最新一项研究揭示了这种RNA如何能完成其功能的分子机制,指出RsmZ像海绵一样能吸收多种阻遏蛋白(repressor proteins)。  小 RNA(small RNAs 或 sRNAs)是一类长度为40-400个

Nature里程碑研究:新型非编码反义RNA

  在研究帕金森氏病的过程中,一个国际研究小组获得了一个可以提高工业蛋白质合成用于治疗用途的新发现。他们设法了解了非蛋白质编码RNA的一个新功能:借助这类称作“反义”的非编码RNA的活性可以提高编码基因的蛋白质合成活性。相关成果发表在10月14日的《自然》(Nature)杂志上。   为了合成蛋白

中科院Cell子刊解析非编码RNA

  来自中科院、福建农林大学等机构的研究人员在新研究中证实,一种叫做NRAV的长链非编码RNA(lncRNA)通过抑制干扰素刺激基因转录调控了抗病毒反应。这一研究发现发表在11月12日的《Cell, Host & Microbe》杂志上。  中科院微生物研究所的陈吉龙(Ji-Long Chen)研究

Science子刊专题:癌症中的非编码RNA

  非编码RNA(尤其是microRNA)是众多细胞过程的关键调控子,与发育和癌症进程密切相关。本期Science Signaling杂志通过专题“Noncoding RNAs in cancer”,介绍了这类分子的生理和病理学功能。  发现哺乳动物基因组中的非编码RNA,不仅揭示了一类新的生物学调

非编码RNA的调控作用研究计划项目指南

  基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制重大研究计划2016年度项目指南  非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究,有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络,从不同于蛋白质编码基因的角度注释和

曹雪涛院士Science揭示重要非编码RNA

  来自第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院的研究人员,发现一种名为lnc-DC的长链非编码RNA控制了人类树突状细胞的分化。   领导这一研究的是我国著名的免疫学家曹雪涛(Xuetao Cao)院士。其现任职第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院,主要从事肿瘤免疫治疗和分子免疫

水生所非编码RNA分子机制研究取得进展

  非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)是指不能编码产生蛋白质的RNA分子,种类众多。具有调控作用的非编码RNA包括微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)以及环状RNA(circRNA)等。越来越多的研究表明,非编码RNA具有重要且复杂的生物学功能。中国科学

eLife:首次发现促癌非编码RNA因子—LAST

  中国科学技术大学吴缅教授研究组发现一条受c-Myc转录激活的长非编码RNA。  中国科学技术大学吴缅教授研究组发表了题为“LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA

长链非编码RNA:-从科研到临床(一)

概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子;根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA;它具有多种作用机制,比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结

关键非编码RNA分子促进皮肤癌恶化

  在最近一项研究中,图尔库大学中心医院和西方癌症中心(FICAN West)的研究人员发现了一种新的RNA分子PRECSIT,它参与调节了皮肤鳞状细胞癌的生长和侵袭过程。将来,PRECSIT可能会成为检测快速进展或扩散的鳞状细胞癌的新标志物,以及有可能成为新疗法的靶标。  皮肤癌是世界上最常见的癌

Cell:长期被误解-非编码RNA存在“认知黑洞”

   在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码RNA,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存?  《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫

出人意料的新才能:非编码RNA

  在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到:人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质(dark matter)”的非编码序列,包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图,构成了超过

【盘点】长链非编码RNA的研究进展

   非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他均为非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)等调控

长链非编码RNA:-从科研到临床(三)

肾脏疾病与糖尿病 糖尿病经常伴随着肾病的发生[5]. 比如基因间lncRNA PVT1与二类疾病都紧密关联。研究人员在II型糖尿病人的晚期肾病进程中发现了PVT1的基因变异。高糖处理可以诱导人的肾间质细胞中PVT1和纤连蛋白1、IV型胶原蛋白、TGFβ1、PAI1等因子的高表达。相反,敲除P

非编码RNA-Nfi调控水稻固氮酶活性

   近日,生物所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性,为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。该成果发表在最新一期的经典微生物学杂志《应用环境微生物学(Applied and Environmental Micro

长链非编码RNA:-从科研到临床(二)

脂类代谢和脂肪生成最新的研究表明,lncRNA控制肝脏中的脂类代谢,调控脂肪生成,从而维持机体的脂质稳态[9]。APOA1编码蛋白是高密度脂蛋白的重要组分。其反义转录本APOA1-AS可以在体内和体外抑制APOA1的表达。LncRNA NEAT1在脂肪生成过程中调节PPARγ2的可变剪接,它还介

微生物所长链非编码RNA与免疫细胞癌变研究获进展

  Abelson鼠白血病病毒(A-MuLV)是一种可以诱导小鼠淋巴细胞癌变的逆转录病毒,v-Abl是A-MuLV的癌基因。Bcr-Abl癌基因是由位于人类9号染色体的c-Abl基因和22号染色体的Bcr基因断裂易位融合而成,编码的Bcr-Abl融合蛋白可以诱发人的慢性粒细胞白血病(CML)和急性淋

科学家发现哺乳动物细胞存在新型长非编码RNA

  中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究,揭示了一类全新内含子来源的长非编码RNA的产生机制,及其参与剪接调控的重要功能。今天,国际学术期刊《分子细胞》以封面故事发表了他们的相关研究论文。   据介绍,几乎所有哺乳动物细胞的基因都由外显子和内含子组成。一般认

Cell:发现长非编码RNA对细胞核仁功能的重要调控机制

  5月5日,国际学术期刊《细胞》(Cell)杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新研究成果:SLERT regulates DDX21-rings associated with Pol I transcription,该成果揭示了长非

上海生科院构建细胞核内长非编码RNA的新型表达载体

   11月5日,国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于研究细胞核内长非编码RNA的新型表达载体。该研究首次构建了一种可以将外源过表达的RNA滞留在细胞核内的载体(snoVector),而且过表达的RN

上海生科院发现长非编码RNA对细胞核仁功能重要调控机制

  5月5日,国际学术期刊《细胞》(Cell)杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新研究成果:SLERT regulates DDX21-rings associated with Pol I transcription,该成果揭示了长非

揭示特殊的非编码RNA或是联系干细胞和癌症的标志物

  近日,刊登在国际杂志Genome Biology上的一篇研究论文中,来自圣劳伦学院的研究者阐述了其在疾病系统生物学方面的研究成果。研究者在文中发现,一种名为vlincRNAs(较长基因间非编码RNAs,very long intergenic, non-coding RNAs)的人类

曹雪涛/侯晋揭示非编码RNA调控肝细胞癌的潜在机制

  肝细胞癌(HCC)是一种致命的恶性原发性肝癌,在与癌症相关的死亡中排名第四,在全球突发事件中排名第六,其5年生存率低。持续的肝损伤会引起慢性肝炎和反复代偿性肝细胞增生,最终导致肝癌的发生。肝癌发生的潜在调节机制已引起广泛关注,但仍很大程度上未知,需要进一步研究。调节肝细胞凋亡及其在肝癌发生中的作