蛋白质与核酸的紫外交联实验
用溴脱氧尿苷(BrdU)取代的探针进行紫外交联 实验方法原理 含有胸苷卤代物如溴脱氧尿苷(BrdU)的DNA比非取代的DNA对紫外线诱导的 交联更为敏感。本方案中的紫外交联效率是0.1%〜10%,而且在单一复合物中出现1 次以上交联事件的情况十分罕见。 实验材料 含有所研究结合位点的M13单链载体 试剂、试剂盒 17 bp 的 M13 通用引物 1×和10×限制性内切核酸酶缓冲液 (分别含500μmol L和50......阅读全文
抗原准备-交联方法
化学合成的多肽抗原是小分子, 本身很难具有好的抗原性,只能诱导动物产生很弱的免疫反应,因而与载体蛋白交联是很重要的。载体蛋白含有很多抗原决定基,能够刺激T-帮助细胞,进而诱导 B-细胞反应。用于与多肽交联的载体蛋白有多种,其中*常用的是keyhole limpet hemacyanin (K
DNA交联的概念
中文名称DNA交联英文名称DNA crosslink定 义DNA分子的两条链或同一DNA链的不同区段的侧链间形成的共价相互作用。通过交联能增加DNA分子的刚性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
化学交联原理
化学交联是通过形成共价键将两种或多种分子连接在一起的一种化学方法。其中,共价键的形成主要依赖于使用特定的交联试剂,通常情况下,交联试剂分子都含有可与蛋白质或其他分子发生化学反应的活性基团,如氨基,巯基等。目前,交联试剂已经应用于蛋白质-蛋白质相互作用,蛋白质三维结构,及细胞膜分子结合等方面的研究
蛋白质(抗体)和酶(过氧化物酶)的交联实验
基本方案 实验方法原理 实验材料 半胱胺
蛋白质(抗体)和酶(过氧化物酶)的交联实验
实验材料半胱胺试剂、试剂盒过氧化物酶SMCC-溶液仪器、耗材交联葡聚糖 G-25 色谱柱分光光度计实验步骤实验所需「试剂」具体见「其他」将 10 mg 过氧化物酶溶解到 1 ml 0.1 mol/L pH 7.0 放入磷酸二氢钾中,加热至 30℃,并加入 60 ul SMCC 溶液(终浓度 15 m
蛋白质(抗体)和酶(过氧化物酶)的交联实验
实验方法原理 实验材料 半胱胺试剂、试剂盒 过氧化物酶SMCC-溶液仪器、耗材 交联葡聚糖 G-25 色谱柱分光光度计实验步骤 实验所需「试剂」具体见「其他」将 10 mg 过氧化物酶溶解到 1 ml 0.1 mol/L pH 7.0 放入磷酸二氢钾中,加热至 30℃,并加入 60 ul SMC
蛋白质化学交联结合质谱鉴定技术取得新进展
3月8日,国际著名期刊《eLife》在线发表了北京协和医学院、北京生命科学研究所(NIBS)、北京大学和清华大学等处的一项最新成果,题为 “Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks an
核酸亲和层析法纯化蛋白质实验
步骤一 偶联寡核苷酸到溴化氰活化的 Sepharose 4B 步骤二 核酸亲和层析 实验方法原理 DNA 偶联至溴化氰活化的 Sepharcse 4
核酸亲和层析法纯化蛋白质实验
实验方法原理 DNA 偶联至溴化氰活化的 Sepharcse 4B 是通过它们本身的碱基实现的。从理论上讲,该方法也许干扰最佳结合序列的接近路径,但是这样一个简单的方法一直被广泛地成功应用。偶联效率的定量检测可经 A260 值测定评估,或者更精确地从偶联介质上水解核酸和进行磷酸盐测定。实
年轻蛋白质让核糖核酸展现活力
据美国物理学家组织网10月14日(北京时间)报道,耶鲁大学和韦恩州立大学的科学研究显示,一种复杂的RNA(核糖核酸)与蛋白质共同作用,在蛋白质的帮助下能经过整形,重新塑造成合适的形状。这些存在已久的古老RNA通过不断进化,在年轻的蛋白质中寻找合适的搭档,辅助自己完成功能使命。这项研
补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间作用实验
基于补骨脂素光化学反应的 RNA-蛋白分子复合物分析法,能够在数据相对缺乏的情况下分析生理条件下的 RNA-蛋白复合物的拓扑构象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验材料蛋白酶K试剂、试剂盒变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙
补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用
实验材料 蛋白酶K 试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液 非变性胶电泳缓冲液 结合缓冲液
体内甲醛交联及染色质免疫沉淀研究DNA和蛋白质作用
染色质由真核基因组包装而成,它参与了转录、复制、重组、修复等许多以DNA一蛋白质相互作用为基础的生化过程。研究者感兴趣的是这些过程涉及到哪些特异的基因或DNA序列,有哪些蛋白质参与。尽管有许多人对染色质进行分类,就像Holde将其分为转录活性或非活性位点,但染色质构本身是动态的,并且DNA与非组蛋白
细胞化学词汇DNA交联
中文名称:DNA损伤定 义:复制过程中发生的DNA核苷酸序列永久性改变,并导致遗传特征改变的现象
细胞化学词汇DNA交联
中文名称:DNA交联英文名称:DNA crosslink定 义:DNA分子的两条链或同一DNA链的不同区段的侧链间形成的共价相互作用。通过交联能增加DNA分子的刚性。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
什么是交联聚乙烯?
聚乙烯(PE)交联技术是提高其材料性能的重要手段之一。经过交联改性的PE可使其性能得到大幅度的改善,不仅显著提高了PE的力学性能、耐环境应力开裂性能、耐化学药品腐蚀性能、抗蠕变性和电性能等综合性能,而且非常明显地提高了耐温等级,可使PE的耐热温度从70℃提高到100℃以上,从而大大拓宽了PE的应
核酸亲和层析法纯化蛋白质实验2
核酸亲和层析实验材料样品蛋白质试剂、试剂盒平衡缓冲液(Tris-HClKClEDTA)非特异 DNA实验步骤在上样品液到核酸亲和柱之前,建议首先采用其他的纯化方法,如硫酸铵沉淀、离子交换或凝胶过滤层析等富集目的蛋白。这样可以除去绝大多数的污染物,并减少非特异结合。亲和层析柱一般来讲是短而粗的,例如长
《自然》:年轻蛋白质让核糖核酸展现活力
据美国物理学家组织网10月14日(北京时间)报道,耶鲁大学和韦恩州立大学的科学研究显示,一种复杂的RNA(核糖核酸)与蛋白质共同作用,在蛋白质的帮助下能经过整形,重新塑造成合适的形状。这些存在已久的古老RNA通过不断进化,在年轻的蛋白质中寻找合适的搭档,辅助自己完成功能使命。这项
脱氧核糖核酸与蛋白质作用
所有DNA功能都取决于其与特定蛋白质的相互作用。这些相互作用可以是非特异性的,也可以是极其特异性的。还有许多可以结合DNA的酶,其中,在DNA转录和复制中复制DNA序列的聚合酶特别重要。DNA与组织蛋白(图1中白色部分)的交互作用,这种蛋白质中的碱性氨基酸(左下蓝色),可与DNA上的酸性磷酸基团结合
核酸亲和层析法纯化蛋白质实验1
核酸亲和柱的应用极大地促进了核酸结合调节蛋白特性的研究,这些蛋白质涉及基因表达、染色体修复和复制、基因重组等的调控。核酸结合蛋白可以结合单链 DNA、双链 DNA 或 RNA。DNA 结合蛋白结合 DNA 可以是序列特异的,也可以是非特异的。此外,含有特异寡核苷酸的亲和树脂能用于某些酶的分离,这些酶
脱氧核糖核酸与蛋白质作用
所有DNA功能都取决于其与特定蛋白质的相互作用。这些相互作用可以是非特异性的,也可以是极其特异性的。还有许多可以结合DNA的酶,其中,在DNA转录和复制中复制DNA序列的聚合酶特别重要。DNA与组织蛋白(图1中白色部分)的交互作用,这种蛋白质中的碱性氨基酸(左下蓝色),可与DNA上的酸性磷酸基团结合
磷酸交联AFFIGEL-10-亲和介质实验——磷酸酪氨酸交联
实验方法原理磷酸酪氨酸在肽交联时所用的无水条件下是不溶的,因此交联必须在水相条件下进行。按此节的步骤最终能产生 10 ml 柱床体积的亲和树脂;与肽类似,每毫升 Affi-Gel 10上能交联 3 μmol 磷酸酪氨酸。实验材料磷酸酪氨酸Affi-Gel 10试剂、试剂盒NaOH (可选)碳酸氢钠乙
补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作...
补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用实验实验材料 蛋白酶K试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙二胺过硫酸铵AMV 反转录酶及反应缓冲液磷酸钠8-羟基补骨脂素13-二碘丙烷碳酸钾丙酮石油醚乙酸乙酯硫酸钠硅胶三氟乙
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互...
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用实验实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。实验材料 RNA试剂、试
方案5-交联法和质谱法对蛋白质复合体进行拓扑学分析
实验材料纯化的蛋白质复合体试剂、试剂盒缓冲液交联试剂二甲基亚砜(DMSO)4 X SDS 上样缓冲液终止溶液仪器、耗材Bio-Spin 柱可鉴定蛋白质的质谱仪可根据蛋白质序列计算肽链的软件包超滤装置实验步骤一、交联反应条件的优化不同方法得到的同种蛋白质复合体的质量与纯度不同,因此建议进行各种实验来摸
我所提出聚集态蛋白质相互作用组的交联解析新方法
近日,我所蛋白质折叠化学生物学创新特区研究组(02T5组)刘宇研究员团队、生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员团队,以及西湖大学张鑫教授团队等合作,通过系统性调控绿色荧光蛋白发色团的骨架结构,实现分子的三重态化学活性,并用于活细胞内聚集态蛋白质的靶向交联,获得了聚集态蛋白质的相互作
速冻样品研磨提取核酸、蛋白质和代谢物
低温研磨,又称冷冻研磨、低温粉磨、冷冻粉磨和低温球磨,是在温度受控的环境下将深冻样品变成粉末的行为。低温研磨是从生物样品中提取DNA、RNA、蛋白质和代谢物的最有效方法之一。不适当的机械研磨方案可能导致核酸剪切或蛋白质降解。蛋白质和RNA是温度敏感的分子,在机械研磨过程中产生的热量会降解它们。为了应
核酸适配体可以特异性识别蛋白质吗
适配体,顾名思义,就是比较适合配合配对配种---的东西,而我们通常所说的适配体是核酸适配体的简称,但是核酸只是一个限定性词语,核有两种含义,一种是核心,一种是微观,核酸是核糖核酸的简称,也就是DNA和RNA,这两种东西就是螺旋链。一般认为,一种核酸适配体可以有多种目标分子,但一种分子只应该有一种核酸
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA相互作用
实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。
亚甲基蓝介导光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用
亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反