梯度PCR退火温度的设计

温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到最优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器 内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),最后看看哪个温度的效果最好。总之是用来进行退火温度优化的。......阅读全文

梯度PCR退火温度的设计

温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到最优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器 内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),最后看看哪个温度的效果最好。总之是用来进行退火温度优化的。

pcr退火温度是根据什么原则设计?

在模板变性后温度快速冷却至40℃~60℃(某个退火温度 )的时候,可使引物和模板发生结合。由于模板DNA 比引物复杂得多,引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞,这就使PCR后期的过程成为可能。退火温度与时间,取决于引物的长度、碱基组成及其浓度,还有靶基序列的长度。对于20个核苷酸

PCR的退火温度怎么设定

PCR中退火的那步是引物与模板结合,一般来说,退火温度比Tm值要低上5度左右。另外,也可以根据你设计引物的软件比如primer5.0或Olige 6 推荐的温度。但这些都不是绝对的。你要是在他的推荐温度下没有目的条带,你可以试试做一个温度梯度,摸索一下退火温度。

PCR的退火温度对反应的影响

引物退火温度是影响PCR的主要因素之一,一般来说每个引物都对应着各自的退火温度。影响:以文献作参考,在一定的温度范围内,退火温度越高,扩增的特异性也就越高。退火温度越低,扩增产物的特异性也就降低。如果退火温度过高,引物与模板结合差,电泳条带差,甚至没有扩增。如果温度过低,扩增特异性差,杂带较多,背景

PCR的退火温度对反应的影响

引物退火温度是影响PCR的主要因素之一,一般来说每个引物都对应着各自的退火温度。影响:以文献作参考,在一定的温度范围内,退火温度越高,扩增的特异性也就越高。退火温度越低,扩增产物的特异性也就降低。如果退火温度过高,引物与模板结合差,电泳条带差,甚至没有扩增。如果温度过低,扩增特异性差,杂带较多,背景

pcr退火温度太高有什么缺点

说影响得看情况,退火温度太高肯定会影响引物的结合效率的。但是,实际上,好的引物一般是上下游引物的退火温度比较接近。有时候,我们可能会通过牺牲特异性的手段(当GC含量过高时,减少引物长度)来平衡两条引物的退火温度。高的退火温度是不利于复性的,所以不会因为使模板复性而降低扩增效率,倒是可能因为影响引物结

pcr退火温度一般为多少

唉,这种题就是中国特色,完全理论脱离实际。PCR退火温度是一个范围,一般是50度到65度,或者到70度做两步法PCR。其中,模板的GC含量、模板的组成(单一模板还是cDNA还是全基因组DNA还是别的什么)等等条件都会影响tm值。没有一个确定的说是多少比较好,都是具体情况具体分析。有的时候引物设计回来

退火温度低会对PCR产生什么影响

通常来说,退火温度是由引物的GC%含量决定的,但是反应体系的条件改变也会影响引物的退火温度(如Mg,Na等离子浓度)。建议你去http://www.idtdna.com/analyzer/Applications/OligoAnalyzer/分析一下你的PCR体系中的引物退火温度,而不是仅仅由公式计

关于温度梯度PCR和降落PCR

关于温度梯度PCR和降落PCR的区别: 温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到zui优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),zui后看看哪个温度的效果z

关于温度梯度PCR和降落PCR

关于温度梯度PCR和降落PCR的区别:  温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到最优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),最后看看哪个温度的效果最好。总

变性、退火温度对PCR热循环的影响

PCR退火温度应如何设置? 在PCR自动热循环中,最关键的因素是变性与退火的温度。如操作范例所示,其变性、退火、延伸的条件是:94℃60s, 37℃60s, 72℃120s,共25~30个循环,扩增片段500bp。在这里,每一步的时间应从反应混合液达到所要求的温度后开始计算。在自动热循环仪

变性、退火温度对PCR热循环的影响

PCR退火温度应如何设置?在PCR自动热循环中,最关键的因素是变性与退火的温度。如操作范例所示,其变性、退火、延伸的条件是:94℃60s, 37℃60s, 72℃120s,共25~30个循环,扩增片段500bp。在这里,每一步的时间应从反应混合液达到所要求的温度后开始计算。在自动热循环仪内由混合液原

PCR-温度梯度怎么设

一般是设退火温度,在你做的PCR的温度上下加减2度,

谈关于温度梯度PCR和降落PCR

  关于温度梯度PCR和降落PCR的区别:  温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),最后看看哪个温度的效果好。总

根据引物合成单如何设定PCR退火温度?

问题:引物单上数据如下上游TTACAAGATGGAGCCTCACC(GC含量50%)Tm(1M Na+):68.2Tm(50mM Na+):46.6下游CAAAGAATAACCCAGGACGA(GC含量45%)Tm(1M Na+):66.2Tm(50mM Na+):44.6顺便问下大家,Tm(1M

根据引物合成单如何设定PCR退火温度?

PCR退火温度应如何设置? 问题:引物单上数据如下 上游TTACAAGATGGAGCCTCACC(GC含量50%) Tm(1M Na+):68.2 Tm(50mM Na+):46.6 下游CAAAGAATAACCCAGGACGA(GC含量45%) Tm(1M Na+):

温度梯度pcr怎么做

温度梯度pcr一般主要是指退火温度梯度。如果PCR仪支持的话,一次可以做好几个温度梯度,象AIB的可以做六个,而有些公司的是模仿梯度,比如一边高一边低,这样梯度温度可能误差大一点。如果仪器不支持,可能就麻烦了,想做六个温度就得做六次PCR了。每一次设成不同的温度。

梯度PCR仪怎么设置温度循环

PCR原理很简单,就是三个步骤的循环么,首先你要在纸上打一个草稿,设计好每个步骤什么温度,运行多久,然后几个循环。然后设置程序的时候,其实就是把你设计的步骤输进去就好了。循环的概念也很简单,就是告诉系统,我想让这三个步骤运行多少遍的意思,SEDI里面内置的是GOTO函数,也就是说,当系统从左到右一步

引物退火温度

一般低4、5度就好了。如果你用软件设计的引物,比如oligo6什么的,它会在tm之外给你一个operate t,就是操作温度,用这个就好了。

温度梯度PCR仪和降落PCR区别大吗

梯度pcr仪就是可以允许用户在退火步骤时选择同时进行不同的退火温度以筛选最佳退火温度.以wealtec的SEDI G为例,96孔控温模块按照8x12排布,解链步骤设置完后,设置退火步骤时,可以选择“梯度步骤”,此时程序会允许你设置梯度温控范围,让12个纵列孔位在此步骤时以不同温度运行.之所以pcr仪

温度梯度PCR仪和降落PCR区别大吗

  温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到zui优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),zui后看看哪个温度的效果zui好。总之是用来进行退火温度优化的

温度梯度PCR仪和降落PCR区别大吗

  温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到zui优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),zui后看看哪个温度的效果zui好。总之是用来进行退火温度优化的

引物的熔解温度与退火温度

primer的一个重要参数是熔解温度(Tm)。这是当50%的primer和互补序列表现为双链DNA分子时的温度.Tm对于设定PCR退火温度 是必需的。在理想状态下,退火温度足够低,以保证primer同目的序列有效退火, 同时还要足够高,以减少非特异性结合。合理的退火温度从55℃到70℃。退火温度一般

PCR反应退火温度的高低与什么因素有关

退火温度是影响PCR反应特异性的重要因素。引物与模板复性所需要的退火温度取决于引物的长度、碱基组成及其浓度。引物长度越短,引物中G+C的含量越低,所需的退火温度越低。虽然降低退火温度可能增加扩增产量,但引物与模板间的错配现象也会增多,导致非特异性扩增上升。相反,提高退火温度虽然可以提高反应的特异性,

什么是PCR退火?

 退火:高温变性后,降低温度至55-60℃,实现模板单链与引物配对结合。

上海旦鼎谈关于温度梯度PCR和降落PCR

  关于温度梯度PCR和降落PCR的区别:    温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),后看看哪个温度的效果好

触摸屏梯度PCR仪设计程序介绍

 触摸屏梯度PCR仪设计程序    1、常规PCR反应:    出现主菜单后,按standard或new方式编制要运行的PCR程序,在输入预变性的温度及时间、变性的温度及时间、退火的温度及时间、延伸的温度及时间、Sock的温度后,按start/stop键开始启动运行当前程序。    如果设计程序时选

荧光定量pcr三步法退火温度比普通pcr要高吗

实时荧光定量pcr两步法与三步法的异同是什么?如何选择使用?比如引物退火是54...更加准确,半定量做不了绝对定量,一般来说荧光定量的退火温度更高一些,

梯度PCR设置梯度问题

梯度PCR只是方便你寻找最佳PCR退火温度,可能减少你做PCR的次数和时间。使用时和楼上的兄弟说的一样,但有一点需要说明一下,就是你所设的温度梯度并不能象楼上的兄弟所说的那么简单,设温度梯度时,第一行的温度是需要一个简单计算的。比如一个12X8的96孔板,如果一共可设12个温度梯度,也就是说每8个孔

tm值与退火温度

我用primer 5设计出来的Tm值从来都是直接当退火温度用。用引物primer-blast的话我都是直接贴序列上去。有其他菌的匹配很正常,有些进化亲缘性很近的,只要在同一物种中没有匹配上的问题应该不大!