根据引物合成单如何设定PCR退火温度？
问题：引物单上数据如下上游TTACAAGATGGAGCCTCACC(GC含量50%)Tm(1M Na+)：68.2Tm(50mM Na+)：46.6下游CAAAGAATAACCCAGGACGA(GC含量45%)Tm(1M Na+)：66.2Tm(50mM Na+)：44.6顺便问下大家，Tm(1M Na+)和Tm(50mM Na+)有什么区别啊?回答：TM值是在一定buffer盐浓度情况下计算出来的。你需要查一下你的PCR体系里buffer盐的浓度，然后找相应的TM值。不过TM值也是一个估算值，举个例子，以你的正向引物而说，TTACAAGATGGAGCCTCACC。在primer5计算得到TM是54.0， DNASTAR是49.1.所以这个数值仅供参考，最稳妥的做法是用梯度PCR仪 从55-65做一个梯度PCR。PCR能不能做出来最关键的因素有两个，第一，模板质量如何，第二，引物3'是否有错配，gc含量如何。如......阅读全文
根据引物合成单如何设定PCR退火温度？
问题：引物单上数据如下上游TTACAAGATGGAGCCTCACC(GC含量50%)Tm(1M Na+)：68.2Tm(50mM Na+)：46.6下游CAAAGAATAACCCAGGACGA(GC含量45%)Tm(1M Na+)：66.2Tm(50mM Na+)：44.6顺便问下大家，Tm(1M
根据引物合成单如何设定PCR退火温度？
PCR退火温度应如何设置？ 问题：引物单上数据如下 上游TTACAAGATGGAGCCTCACC(GC含量50%) Tm(1M Na+)：68.2 Tm(50mM Na+)：46.6 下游CAAAGAATAACCCAGGACGA(GC含量45%) Tm(1M Na+)：
PCR的退火温度怎么设定
PCR中退火的那步是引物与模板结合，一般来说，退火温度比Tm值要低上5度左右。另外，也可以根据你设计引物的软件比如primer5.0或Olige 6 推荐的温度。但这些都不是绝对的。你要是在他的推荐温度下没有目的条带，你可以试试做一个温度梯度，摸索一下退火温度。
引物退火温度
一般低4、5度就好了。如果你用软件设计的引物，比如oligo6什么的，它会在tm之外给你一个operate t，就是操作温度，用这个就好了。
pcr退火温度是根据什么原则设计？
在模板变性后温度快速冷却至40℃～60℃(某个退火温度 )的时候，可使引物和模板发生结合。由于模板DNA 比引物复杂得多，引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞，这就使PCR后期的过程成为可能。退火温度与时间，取决于引物的长度、碱基组成及其浓度，还有靶基序列的长度。对于20个核苷酸
PCR引物浓度是如何设定的
>>> 一般都稀释成应用液，常用浓度是10uM/L也就是10pM/L.这样的话，20ul体系加1ul，50ul体系加2ul，方便使用！至于引物会不会降解的问题，估计高浓度比低浓度保存时间长说法是对的。但是，通常引物在20度放半年都没有问题，如果不是经常用，可以先取出一部分来用，其余都放-80度保存，
如何设定PCR引物的保护碱基？
如果您想直接对PCR产物酶切，同时想获得理想的酶切效果，一般情况下需要在酶切位点序列5’端方向增加额外的保护碱基。保护碱基的数目随酶的种类不同而不同，根据文献资料汇总，一般保护碱基有3-4个就可以了。不提倡提供过多的保护碱基，因为太多的额外碱基会增加PCR扩增的难度，同时增加合成费用。
为什么引物中GC含量越高，需要设定更高的退火温度？
GC碱基互补配对时形成三个氢键，非特异性配对后需要较高的温度才能打开氢键，从而促进特异性配对。
引物的熔解温度与退火温度
primer的一个重要参数是熔解温度(Tm)。这是当50%的primer和互补序列表现为双链DNA分子时的温度.Tm对于设定PCR退火温度 是必需的。在理想状态下，退火温度足够低，以保证primer同目的序列有效退火， 同时还要足够高，以减少非特异性结合。合理的退火温度从55℃到70℃。退火温度一般
定量PCR仪引物长度设定
① 引物长度 一般引物长度为18~30碱基。总的说来，决定引物退火温度（Tm值）最重要的因素就是引物的长度。有以下公式可以用于粗略计算引物的退火温度。 在引物长度小于20bp时：[4(G+C)+2(A+T)]-5℃ 在引物长度大于20bp时：62.3℃+0.41℃(%G-C)-