新手总结PCR/RTPCR疑难杂症

这里,很多经常遇到的问题,比如引物设计,PCR体系和条件,电泳条带分析等,我没有一一详细列举,因为这些原因比较容易找到,我这里列举的可能多是些容易忽略的疑难杂症,希望对大家有帮助。(说了是疑难杂症了,可能有一些看法走极端了,但是为了做出实验,怀疑一切,狗急跳墙,没事找抽也是值得的)。1.引物设计引物的参数合理控制,像发卡结构,错配,二聚体等,只要别太过分,问题应该不大,当然没有最好,个人感觉上下游两条引物的退火温度这个参数比较重要,让两条引物的退火温度尽量接近,不然后果很严重。2.RNA提取试剂尽量用新的,用自己的,不知道情况的不要用,如果对RNA 不放心,特别是以前提的RNA,重新反转,用RNA电泳一下看看,我直接用DNA电泳的条件电泳RNA的,应该没问题,RNA酶是存在广泛,但还没强到这么短的时间就分解吧(个人感觉的,反正我能跑出RNA条带)。3.反转录如果RNA表达比较少不妨多加点RNA反转;oligodT只反转真核生物m......阅读全文

实时-RTPCR-实验

            试剂、试剂盒 RNA 模板 DNA 酶缓冲液 DNA 酶 I DEPC 处理的水 oligo(dT) MgCl2 dNT

PCR技术总结

PCR技术简史  PCR的最早设想 核酸研究已有100多年的历史,本世纪60年代末、70年代初人们致力于研究基因的体外分离技术,Korana于1971年最早提出核酸体外扩增的设想:“经过DNA变性,与合适的引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可克隆tRNA基因”。  PCR的实现 1

PCR新手指南:PCR仪的故障分析

PCR仪是一种在实验室使用频率及使用时间非常高的仪器,因此故障率也是比较高的。PCR仪的故障主要有以下几类:1、制冷半导体故障2、温度传感器故障3、控制板故障4、电源板故障5、热盖故障6、软件故障7、其他故障下面就这几类问题做简单分析。1、制冷半导体故障制冷半导体故障率与制冷半导体的质量、温度变化次

RNA提取和RTPCR

真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是被这些内元隔开的,这些编码区叫做外元(exon)。真核生物的DNA转录成为RNA之后,经过剪切和拼接,去掉这些非编码区,才形成成熟的mRNA

RNA提取和RTPCR

在做Northern等杂交实验、构建cDNA文库、获取能够编码真核生物蛋白的基因、获得RNA病毒基因时,会用到RNA提取和RT-PCR技术。真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是

RTPCR引物的选择

 对靶序列中潜在的引物位点进行分析, 这些位点应该不会形成同源多聚体结构,也没有明显的形成二级结构的趋势,不会自身互补,与基因组中的其他序列无显著的同源性。    (1)依据寡核苷酸引物与其靶序列形成杂合分子的熔解度的计算中提供的公式计算各引物的熔解温度。    (2)选择一对匹配完好的正向和反向引

RTPCR技术的简介

  RT -PCR首先经反转录酶的作用以RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平、细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RN

RTPCR引物的选择

随机引物 适用于长的或具有发卡结构的RNA。适用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反转录反应。主要用于单一模板的RT-PCR反应。 Oligo dT 适用于具有PolyA尾巴的RNA。(原核生物的RNA、真核生物的 Oligo dT rRNA和tRNA不具有PolyA尾巴。)由

RTPCR实验方法

RT-PCR定义:是指对组织或细胞的总RNA进行抽提,把RNA反转录为cDNA,然后设计目的基因引物进行PCR,琼脂糖电泳并数码拍照,分析电泳条带灰度值,判断目的基因mRNA转录水平的相对量的变化。 RT-PCR流程简介 一、抽提RNA: 1、防止RNA酶污染 180℃的高温下

基因表达-RTPCR之我见

 本文讨论的范围包括RNA酶保护分析,northernblot,原位杂交,半定量RT-PCR和定量RT-PCR。本文不谈具体protocol,是因为各种书籍和kit说明书上都有,主要说一些原则,而且大部分是失败和成功的经验,还有小组讨论结果以及各种书里七零八落看的内容,希望对大家有用。基因表达的定义

RNA提取与RTPCR

 1.RNA的提取  RNA的提取其实原理很简单:通过变性剂破碎细胞或者组织,然后经过氯仿等有机溶剂抽提RNA,再经过沉淀,洗涤,晾干,zui后溶解。但是由于RNA酶无处不在,随时可能将RNA降解,所以实验中有很多地方需要注意,稍有疏忽就会前功尽弃。  1.1分离高质量RNA  成功的cDNA合成来

RTPCR技术的定义

RT-PCR,反转录·聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)是将RNA的反转录(reverse transcription )和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。

RTPCR引物的选择

随机引物             适用于长的或具有发卡结构的RNA。适用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反转录反应。主要用于单一模板的RT-PCR反应。                                                   Oligo dT        

RTPCR技术的简介

RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用,从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。RT—PCR

RTPCR的反应体系

一:25UL 体系的量如下:无RNA酶水 ?5*buffer 5.0ULDNTP Mix 1.0ULEnzyme Mix 1.0ULprimer A ?(0.6M)Primer B ?(0.6M)RNA模板 ?(不大于1UL)Q (RNA酶抑制剂) 可加可不加二:虽说有几个试剂未知其量,但都是需要算

PCR(RTPCR)反转录-定性检测方法

  1、试剂  (1)10倍 RT 缓冲液:500mmol/L Tris·Cl(pH8.0),0.60 mmol/L MgCl2,400mmol/L KCl,10mmol/L DTT。  (2)10倍 PCR 缓冲液:100mmol/L Tris·Cl(pH8.3),500mmol/L kCl,15

PCR问题的总结

PCR产物的电泳检测时间一般为48h以内,有些zui好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。 假阴性,不出现扩增条带pcr反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有

RTPCR、QPCR、Realtime-PCR、realtime-RTPCR你真的区分的开吗?

多少同学能将 RT-PCR、Realtime-PCR、QPCR区分开?有多少同学还在犯晕?今儿这贴,师兄就带你区分区分,拨开那扇 PCR 迷雾。什么是 RT-PCR?RT-PCR就是逆转录 PCR(reverse transcription PCR)或者称反转录PCR(reverse transcr

PCR,RTPCR,实时荧光定量PCR的区别与联系

1、所说的PCR应该就是最常规的PCR,以DNA为模板,通过上下游引物,实现DNA的扩增。2、RT-PCR一般情况下是指反转录PCR(reverse transcription),尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也(realtime fluores-cence quantitative PCR)也

PCR,RTPCR,实时荧光定量PCR的区别与联系

1、所说的PCR应该就是最常规的PCR,以DNA为模板,通过上下游引物,实现DNA的扩增。2、RT-PCR一般情况下是指反转录PCR(reverse transcription),尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也(realtime fluores-cence quantitative PCR)也

原位PCR和原位RTPCR操作规程

原位PCR是Hasse等于1990年建立的技术,就是在组织细胞里进行PCR反应,它结合了具有细胞定位能力的原位杂交和高度特异敏感的PCR技术的优点,是细胞学科研与临床诊断领域里的一项有较大潜力的新技术。一、仪器设备英国Thermo Hybaid原位PCR仪。二、操作流程1、原位PCR步骤(1)预处理

Realtime-PCR与RTPCR的区别

实时荧光定量PCR原理所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。1.内标在传统定量中的作用由于传统定量方法都是终点检测,即PCR到达平台期后进行检测,而PCR经过对数期扩增到达平台期时,检测重

原位PCR和原位RTPCR操作规程

(一)、仪器设备 英国Thermo Hybaid原位PCR仪。 (二)、操作流程 1、原位PCR步骤 1)预处理: (1)切片常规脱蜡; (2)0.2mol/L HCl处理10min; (3)5μg/ml蛋白酶K消化组织37℃10m

PCR新手指南:快速PCR技术与快速PCR仪的区别

 在PCR仪上完成一个PCR反应所需要的时间决定于以下几个因素:1、模块升温和降温时间2、模块与PCR管内温度平衡时间3、延伸时间4、循环次数下面就以上几点做一点分析,以便大家了解快速PCR技术与快速PCR仪的区别。1、模块升温和降温度时间PCR仪一般会标明升温速度和降温速度,但标的大多是zui大变

PCR新手指南:快速PCR技术与快速PCR仪的区别

在PCR仪上完成一个PCR反应所需要的时间决定于以下几个因素:1、模块升温和降温时间2、模块与PCR管内温度平衡时间3、延伸时间4、循环次数下面就以上几点做一点分析,以便大家了解快速PCR技术与快速PCR仪的区别。1、模块升温和降温度时间PCR仪一般会标明升温速度和降温速度,但标的大多是最大变温速度

PCR新手指南:快速PCR技术与快速PCR仪的区别

在PCR仪上完成一个PCR反应所需要的时间决定于以下几个因素:1、模块升温和降温时间2、模块与PCR管内温度平衡时间3、延伸时间4、循环次数下面就以上几点做一点分析,以便大家了解快速PCR技术与快速PCR仪的区别。1、模块升温和降温度时间PCR仪一般会标明升温速度和降温速度,但标的大多是zui大变温

RTPCR的影响因素介绍

RT-PCR反应受多个因素影响,如硫酸镁的浓度, 引物退火的温度,扩增的循环数等。1、建议选择0.5-3.0 mM (相差0.5 mM)的硫酸镁作初步实验。2、对于具有较高Tm的引物,增加退火和延伸时的温度对反应有利。较高的温度有利于减少非特异的引物结合,因而提高特异产物的得率。3、大多数目标RNA

RTPCR技术的操作步骤

1、从RNA(或mRNA)反转录合成cDNA第一链:2、于95℃加热5~10min,灭活反转录酶,使RNA—cDNA杂交体变性,然后迅速冰浴冷却:3、PCR扩增:方法基本同PCR。cDNA第一链合成方法:20ul反应液中含10xPCR扩增缓冲液,2ul;四种dNTP(10 mmol/L)2ul;RN

RTPCR一些心得

从RNA到电泳鉴定一、RT-PCR原理:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA 作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA 为模板,用VI 型胶原蛋白的α1 链的编码序列的特异性引物进行PCR 扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR 使RNA

RTPCR成功的几个要素

1、高质量RNA成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)选择性分离 poly(A)+RNA。不管起始模板是总RNA还是poly(A)