细胞RTPCR的经验(偏向RNA提取)

做RT也做了几次,有成功也有失败,在园子中受益良多,把我自已的一个流程放上来,供大家参考.细胞RT-PCR操作流程实验流程一 、取RNA:1、 处理细胞:(1) 贴壁细胞:先用无菌DEPC水配制的PBS洗细胞两次,弃尽PBS后,直接向培养瓶中加入1ml Trizol,通过溶解细胞,通过移液管分次移出细胞裂解物。当Trizol量不足,可导致RNA中有DNA污染。(2) 悬浮细胞:先用无菌DEPC水配制的PBS洗细胞,通过离心沉淀细胞,在Trizol中移液管反复吹打来裂解细胞,每107细胞加入1ml Trizol。2、 冰浴5分钟,充分分解核蛋白体,加入0.2ml氯仿,剧烈颠倒混匀15秒。3、冰浴10分钟,4℃ 12000rpm,15分钟。4、仔细取上层水样层(体积大约为所加Trizol的60%)转入新EP管,万勿吸到蛋白。5、加入0.5ml异丙醇,颠倒混匀后,25℃放置10分钟.6、4℃,12000rpm,10分钟(或可见胶状片状......阅读全文

细胞RTPCR的经验(偏向RNA提取)

做RT也做了几次,有成功也有失败,在园子中受益良多,把我自已的一个流程放上来,供大家参考.细胞RT-PCR操作流程实验流程一 、取RNA:1、 处理细胞:(1) 贴壁细胞:先用无菌DEPC水配制的PBS洗细胞两次,弃尽PBS后,直接向培养瓶中加入1ml Trizol,通过溶解细胞,通过移液管分次移出

RNA提取和RTPCR

在做Northern等杂交实验、构建cDNA文库、获取能够编码真核生物蛋白的基因、获得RNA病毒基因时,会用到RNA提取和RT-PCR技术。真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是

RNA提取和RTPCR

真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是被这些内元隔开的,这些编码区叫做外元(exon)。真核生物的DNA转录成为RNA之后,经过剪切和拼接,去掉这些非编码区,才形成成熟的mRNA

RNA提取与RTPCR

 1.RNA的提取  RNA的提取其实原理很简单:通过变性剂破碎细胞或者组织,然后经过氯仿等有机溶剂抽提RNA,再经过沉淀,洗涤,晾干,zui后溶解。但是由于RNA酶无处不在,随时可能将RNA降解,所以实验中有很多地方需要注意,稍有疏忽就会前功尽弃。  1.1分离高质量RNA  成功的cDNA合成来

RNA提取与RTPCR(4)

2.8 小量RNA检测方法的提高 当仅有小量RNA时,RT-PCR尤其具有挑战性。在RNA分离过程中加入的作为载体的糖元有助于增加小量样品的产量。可以在加入Trizol的同时加入无RNase的糖元。糖元是水溶性的,可以同RNA保持在水相中以辅助随后的沉淀。对于小于50mg的组织或106个培养细胞

RNA提取与RTPCR(2)

融解RNA一般使用TE。 保存RNA应该尽量低温。为了防止痕量RNase的污染,从富含RNase的样品(如胰脏、肝脏)中分离到的 RNA需要贮存在甲醛中以保存高质量的RNA,对于长期贮存更是如此。从大鼠肝脏中提取的RNA,在水中贮存一个星期就基本降解了,而从大鼠脾脏中提取的 RNA,在水

RNA提取与RTPCR(1)

在做Northern等杂交实验、构建cDNA文库、获取能够编码真核生物蛋白的基因、获得RNA病毒基因时,会用到RNA提取和RT-PCR技术。 真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋

RNA提取与RTPCR(3)

2.3 RT-PCR的引物设计 RT-PCR引物设计和一般PCR引物设计可以遵循同样的原则。细心地进行引物设计是PCR中最重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。设计糟糕的引物可能会同扩增其他的非目的序列。设计理想的引物都有以下共同的特点,而设计失败的引物则各有各的缺

RNA提取心得(组织RNA提取和培养细胞的RNA提取)

一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织,这样RNA提取的效果比较好,这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的(最好在半年之内,-80℃或者液氮中冻存的)组织,注意不要反复冻融,从冰冻状态拿到0-4℃,注意不要拿到常温,待组织解冻后,用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织,称重后,放到预冷的匀浆器中,然后

RNA-提取策略及RT-PCR技术

第一部分RNA 提取策略1、RNA降解的原因内源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因为人体细胞自身就是几十分钟(20min?)mRNA被降解一轮,所以不管是组织还是细胞还是液体状样本在离开其中细胞的最佳生活状态后都应该尽快的被妥善的方法保存起来。外源性RNA酶也是一个需要注意的因素,最常见

RT-PCR技术及RNA提取策略2

一般的琼脂糖凝胶电泳,注意不要用甲醛变性电泳(又不是做northern,实在没有必要)。电泳槽注意一定不要用DEPC处理,一定要保证电泳体系中有少量的RNAase存在。分别在加样孔中加入1,2,3μlRNA抽提溶液。在旁边加入DNA marker。1%琼脂糖凝胶,10V/cm的电压,电泳10

RT-PCR技术及RNA提取策略3

成功的RT PCR的要素1、高质量RNA 成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到 cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)选择性分离poly(A)+RNA。不管起始模

RT-PCR技术及RNA提取策略1

第一部分 RNA 提取策略1、RNA降解的原因内源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因为人体细胞自身就是几十分钟(20min?)mRNA被降解一轮,所以不管是组织还是细胞还是液体状样本在离开其中细胞的最佳生活状态后都应该尽快的被妥善的方法保存起来。外源性RNA酶也是一个需要注意的因素,最常

RTPCR经验浅谈

RT-PCR成败的关键首先在于RNA模板的制备以问者的口气应该是做RNA病毒基因的RT-PCR本人三年前做过一个正链RNA病毒全基因组分段扩增设计方案是将全基因组分成7个片段,0.6kb-3.3kb不等分别进行RT-PCR扩增刚开始的三个月我们课题组三个人辛辛苦苦什么招都想过了结果连一个片段都没有拿

RTPCR经验浅谈

做RNA病毒基因的RT-PCR成败的关键首先在于RNA模板的制备。本人三年前做过一个正链RNA病毒全基因组分段扩增,设计方案是将全基因组分成7个片段,0.6kb-3.3kb不等,分别进行RT-PCR扩增,刚开始的三个月,我们课题组三个人辛辛苦苦,什么招都想过了,结果连一个片段都没有拿到。后来有一个周

提取悬浮细胞RNA

提取RNA器械:离心管2支,吸管4个,酒精灯,打火机,记号笔,200ul,1000UL枪,DEPC泡过的枪头EP管,紫外照过的手套。滤纸,DEPC纯水(750ml无水乙醇+150mlDEPC水,剧烈振荡,使劲的摇晃,直至混匀),氯仿,75%酒精,异丙醇,Trizol,预冷的离心机(两种),EP管架(

肝脏细胞RNA的提取

一.原理RNA提取技术不仅是分子生物学技术的重要组成部分,也是功能基因组 学科研技术的重要基础。从RNA水平研究生物体内基因的调控机制,已成为分子生物学研究的一个重要手段。对某一生物或组织进行性状研究,首先要获得该性状基因,从组织细胞中分离完整的RNA对于分子克隆 和基因表达分析等实验是至关重要的,

细胞RNA的提取方法

(一)细胞总RNA的提取1、6孔板细胞汇合度为90-100%时,取出无菌室,去其上清,用PBS洗两次后,每孔加TRIZOL试剂 1 ml,摇匀,无菌罩内消化3-5 min。2、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一DEPC处理过的1.5 ml EP管中,加新开的氯仿0.2 ml,轻摇15 s。3、室温静置

细胞总RNA的提取

提取细胞RNA的步骤:1)  六孔板每孔细胞中加入1ml Trizol,冰上放置5min,枪头吹打。2)  将各孔裂解液吸到1.5 ml EP管中,加入氯仿0.2ml/管,用力振摇15s。15-30℃下孵育2-3min,离心(4℃,12,000g,15min)。3)  离心后液体分为三层(上层-无色

线虫总RNA提取及RTPCR实验方法

C. elegans RNA Isolation and RT-PCRReagents Needed:M9 (common stock)Trizol (stored at 4ºC)chloroform2-propanol70% EtOHRNase-free H2OiScript cDNA Synth

从RNA的提取到PCR——Realtime-PCR经验

一 引物的设计引物的设计对于这个实验至关重要,因为real time pcr的检测灵敏度比较高,所以相应的对引物设计的要求就很高。普通的要求规则大家都知道,还有几点必须注意:1,引物的错配率(引物错配形成引物二聚体,但是SYBR照样能嵌入进去,结果导致实验结果的误差很大,重复性也不好)。2,引物的特

RtPCR经验总结

Rt-PCR实验步骤一、实验器具与材料:1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl2、吸头:1ml、200μl、20μl3、匀浆管:5ml4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl6、试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,

总细胞RNA的提取方法

实验概要总细胞RNA的提取在建库过程中,由于cDNA合成这一步将使用通用引物oligo dT,因此在总RNA提取这一步中,提取纯化mRNA不是非常必要的。提取高纯度的总细胞RNA足可以被用作cDNA合成的模板,目前提取RNA的方法很多,也有不少商业化的试剂盒。实验步骤1. TRIZOL法   1)

组织/细胞RNA快速提取

 操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)提示: 第一次使用前请先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入指定量无水乙醇! 操作前在裂解液RLT中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 ml RLT 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RLT 4℃可放置一个月。1. 组织培养细胞a. 收

脂肪细胞RNA提取原理

氯仿是分子量比较大的有机溶剂,在提取RNA时,氯仿可以有效的使有机相和无机相迅速分离。DNA提取过程 有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和DNA脱离,DNA进入水相。但是在RNA的提取过程就要避免蛋白和DNA脱离,否则DNA会释放到水相。不管有酚也好,没有酚也好,氯仿本身也对蛋白有变性作用,剧

RTPCR的操做经验分享

在所有RNA实验中,最关键的因素是分离得到全长的RNA。而实验失败的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。由于RNA酶广泛存在而稳定,一般反应不需要辅助因子。因而RNA制剂中只要存在少量的RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解,而所制备的RNA的纯度和完整性又可直接影响RNA分析的结果,所

RTPCR-经验之我谈

看到论坛上有很多朋友询问RT-PCR的重复性问题,说明这里面还是有很多问题的,于是 想跟大家分享一下自己做PCR的经验:1. 总RNA的提取: 材料来源一般为细胞和组织,细胞相对比较单一,蛋白污染较小,TRIZOL法提取结果 A260/A280 结果一般都在1.8-2.1之间;组织的成分较复杂,污染

培养细胞的RNA提取方法介绍

1. 贴壁细胞,需要先用胰酶消化后,然后收集到离心管中,离心,去上清,然后用PBS多洗2-3次,以去除多余的胰酶。悬浮细胞,直接用吸管或者加样枪吹打评壁,以使细胞基本可以被吹下来。然后离心去上清,不需要用PBS洗。2. 然后将少量细胞悬液转移到预冷的DEPC泡过的1.5毫升EP管中,然后加入一定量的

细胞总RNA的提取操作步骤

一、准备1、 物品:Trizol、氯仿(三氯甲烷)、异丙醇、75%灭酶异醇、冷PBS、1.5ml灭酶EP管、灭酶枪头、一次性手套、EP管架、吸管 2、 打开冷冻离心机4℃预冷 二、操作步骤: 将Trizol、氯仿、冷PBS、EP管、灭酶枪头、一次性手套、EP管架、吸管等物品带入细胞室。

真核细胞总RNA的分离提取

RNA是基因表达产物,由以下几类分子组成,rRNA(占细胞总RNA的80%~85%)、tRNA和核内小分子RNA(占10~15%)、mRNA(占1~5%)。其中mRNA是分子生物学的主要研究对象,分离制备mRNA是克隆基因,分析基因表达以及建立cDNA文库的首要步骤。真核细胞总RNA分离提取的目的是