手把手教你设计引物(图文并茂)

宽度:713 px高度:435 px维持原图长宽比:确认不知不觉几年下来自己也快毕业了,感谢丁香园这些年来的帮助。没有什么可回报的东西,就发个帖教教新人如何设计引物吧,尽量做到手把手的教,图文并茂。引物设计的帖子不少,以前很多战友会推荐Oligo、PrimerPremier、DNA man等等软件。这些软件设计完最后还是要去BLAST比对下,所以我教大家一种易懂实用的在线设计方法,觉得好的话请投个票。就以人的PTEN基因为例,首先你要找到他的基因序列,如果你要用的是cDNA,就找它的mRNA序列。如果你要做的是DNA,就找DNA的序列。以cDNA为例,普遍的一种方法是上PUBMED中GENE栏搜索找到cDNA那栏,但PUBMED导出序列不太方便,我介绍个网站 http://asia.ensembl.org/index.html1. 输入目的基因,进入2.在左侧栏选择TRANSCRIPT,选择后进入3. 选择PTEN-0......阅读全文

手把手教你设计引物(图文并茂)

宽度:713 px高度:435 px维持原图长宽比:确认不知不觉几年下来自己也快毕业了,感谢丁香园这些年来的帮助。没有什么可回报的东西,就发个帖教教新人如何设计引物吧,尽量做到手把手的教,图文并茂。引物设计的帖子不少,以前很多战友会推荐Oligo、PrimerPremier、DNA man等等软件。

手把手教你设计shRNA

  一、认识shRNA:   在研究基因功能中,RNAi由于可以特异性地使基因沉默或表达量降低而成为生物实验中的有力工具。其中,shRNA是可以克隆至表达载体并表达siRNA双链的DNA分子。今天给大家分享两种能快速设计shRNA的方法。   二、shRNA的设计:   1. Si

4-分钟教你学会多重-PCR-引物设计

设计策略 MPCR 要求所有的引物对在同一条件下扩增其各自的特异序列。大多数多元 PCR 反应 局限于扩增 5~10 个目的片段,原因之一是反应中,每另加入一对引物会导致一定程度的灵活性的丢失。引物数量的增加也使引物二聚体和非特异扩增出现的概率增加。因此,进行多元 PCR 要求周密计划

4-分钟教你学会多重-PCR-引物设计

多元 PCR (多重PCR,Multiplex PCR,MPCR) 是指在一个 PCR 反应中使用一个模板和几对引物同时扩增多个目的片段的 PCR 反应。这项技术非常有用,他不仅可以提高 PCR 的产率还能提高 DNA 样品的利用率。另一种形式的 MPCR 是组合 PCR, 组合 PCR 是在同一

引物设计的引物设计原则

1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般较Tm值低等于引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

手把手教你质粒转染

  胞转染是指将外源分子如DNA,RNA等导入真核细胞的技术。常规转染技术可分为瞬时转染和稳定转染(永久转染)两大类。本实验室主要是质粒转染、miRcroRNA转染、慢病毒转染、药物转染、多肽转染等。  一. 实验材料及试剂  六孔板、CO2培养箱、EP管、酒精灯等;无血清培养基、MEM-α或DME

第二章:4-分钟教你学会多重-PCR-引物设计

多元 PCR (多重PCR,Multiplex PCR,MPCR) 是指在一个 PCR 反应中使用一个模板和几对引物同时扩增多个目的片段的 PCR 反应。这项技术非常有用,他不仅可以提高 PCR 的产率还能提高 DNA 样品的利用率。另一种形式的 MPCR 是组合 PCR, 组合 PCR 是在同一

手把手教你看懂尿常规

体检时,尿常规是必检项目。结果一出,很多人看着手中的尿常规化验单,一脸迷惑,这上面写的究竟是啥意思?我到底有没有得病?   一般尿常规包括三列内容:检验项目,结果(带不同单位)和参考区间。其中:  ↑和↓分别代表高于或低于正常参考值;   +、-和+-则分别代表阳性、阴性和弱阳性;   +、++和+

手把手教你使用数字熔点仪

 数字熔点仪采用光电检测,数字温度显示等技术,具有初初熔、终熔自动显示等功能。温度系统应用了线性校正的铂电阻作检测元件,并用集成化的电子线路实现快速“起始温度”设定及八档可供选择的线性升温速率自动控制。初熔读数可自动贮存,具有无需人监视的功能。仪器采用药典规定的毛细管作为样品管。数字熔点仪操作使用1

RNA引物设计怎么设计

一般就是设计引物能够跨越至少一个exon-exon junction的,就是引物在两个exon的交界处,这样pcr的时候就不会有DNA污染现在NCBI可以直接有引物设计,还可以选择上述的设计方式或者可以通过找到cDNA序列然后自己在primer3上设计也可以

设计引物遵循原则、引物保存和各种PCR的引物设计

一 设计引物应遵循以下原则1 、引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。2 、引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。3 、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上

怎么设计引物

选择引物的一般规则设计和选择引物时有5个要素必需注意。1 引物的3′末端不互补 引物的3′末端一定不能有很大的互补性,因为它们的互补会形成引物二聚体,这就会带来很大的问题,例如合成出非专一的产物,极大地减少所期望产物的得量。有实验表明,3′末端双链的ΔG是0~-2 kcal/mol时,PCR产量几乎

怎样设计引物

一般是通过设计软件,例如oligo6,primer5等,你可以在网上搜一下引物设计软件下载和使用说明,是比较容易的。至于设计引物的一般原则如下:* 序列选取应在基因的保守区段* 避免引物自身或与引物之间形成4个或4个以上连续配对,避免引物自身形成环状发卡结构* 典型的引物18到24个核苷长。引物需要

如何利用LAMP引物设计平台设计IMSA引物?2

6. 更改ParameterCondition中默认的Normal至AT rich。默认显示Normal说明我们所上传VP1 gene的序列中GC含量位于40%-65%的正常范围内。高于65%属于GC rich;低于40%属于AT rich。7. 再次点击Generate时平台显示有1000或高于1

如何利用LAMP引物设计平台设计IMSA引物?3

(3)找到该文档,邮件选择打开方式为记事本,可得引物信息。再次点击文档,另存为Up-LF或Down-LB.txt文件。这里的第16套引物,我们需要它的下游环引物即LB,故名为Down-LB。这样命名的目的是为了防止混淆;      (4)同样打开LAMP引物设计平台(http://primerexp

如何利用LAMP引物设计平台设计IMSA引物?1

IMSA,全称为isothermal multiple-self-matching-initiated amplification,中文名为等温多自配引发扩增。该技术的详细介绍可见本公众号历史文章:“分子诊断万花筒” 开篇——等温多自配引发扩增技术简介。在这里隆地熊为大家介绍一种如何利用LAMP引物

手把手教你选择面料取样器

一.产品介绍     该款新式取样广泛应用于棉、毛、丝、麻、化纤等各种纺织、针织品的裁切取样,同时亦可裁切皮革、纸制品、铝箔等。尤其适合多层布一次裁切,极大的减少了工作量,提高了工作效率。     手压取样刀设计合理,使用简单便捷,轻松舒适、裁切圆整、取样面积,操作简单速度快。铸铝底座,稳固耐用,机

手把手教你如何清洗ICP炬管

  ICP炬管对传统的电感耦合等离子体发射光谱仪进行了改进,几乎可分析周期表中所有金属元素和部分非金属元素。该型仪器稳定性好,测量范围宽,检出下限低,分辨率高,灵敏度高。那么再好的设备在经过长时间的试用下对于ICP炬管都要进行定期的清洗工作来清楚长期使用后ICP炬管内部的污垢。下面就跟着小编来一起了

手把手教你选择“善其事”的移液器

手动移液器是实验室各种器材中用途广泛且持久耐用的工具。每天的使用时间可高达到数个小时,所以人体工学设计以及手柄舒适度等个人偏好都是非常重要的选择标准。为工作寻找合适的移液器时还需要考虑其他因素,比如适用性、实验室工作流程、所需的量程、样本的物理性质以及实验的灵敏度要求等。要选购符合实验要求的移液器有

【盘点】手把手教你“健康吃肉远离癌症”

图片来自:identidad.queretaro.itesm.mx  2016年10月17日--已有研究表明,长期使用加工肉类会增加患上食道癌结肠癌的风险。世界卫生组织下属的国际癌症研究所指出,每天食用超过50克的加工肉类食品,会导致肠道癌症风险增加18%。可见,加工肉类对癌症风险的贡献之大。但是,

PCR引物设计原则

PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列。因此,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。要设计引物首先要找到DNA序列的保守区。同时应预测将要扩增的片段单链是否形成二级结构。如这个区域单链能形成二级结构,就要避开它。如这一段不能形成二级结构,那就可以在

引物的设计原则

引物设计原则1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般是较低Tm值引物的Tm值减去5—10度。引物长度小

PCR引物设计技巧

自从1985年美国PE—Cetus公司的人类遗传研究室 Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链反应(PCP0 以来,PCR已经成为了分子生物学领域zui基本也是zui重要的技术手段之-[ I。然而能否找到一对合适的核苷酸片段作为引物,使其有效地扩增模板DNA序列,无疑决定着PCR的成败。现在动

Primer-引物设计原则

概念   引物,是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点,在核酸合成反应时,作为每个多核苷酸链进行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链,在引物的3′-OH上,核苷酸以二酯链形式进行合成,因此引物的3′-OH,必须是游离的。类型  存在有自然中生物的DNA复制引物(RNA引物)和聚合酶链式反应(

PCR引物设计原则

实验概要PCR是目前研究DNA、RNA等核酸的非常有效和最主要的方法之一。本Protocol对于PCR引物设计中的一些基本原则给予阐述,希望能对广大研究人员的研究工作带来方便。实验步骤首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物不能在模板的非目的位点引发DNA 聚合反应(即错配) ,再次引物与引物之间避

Primer-Premier-引物设计

Primer Premier4.0是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计,评估的软件,和Plasmid Premier2.02一起是该公司推出的最新的软件产品。其主要界面同样也是分为序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),

引物的设计原则

引物设计原则1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般是较低Tm值引物的Tm值减去5—10度。引物长度小