CRRSPR/Cas9基因敲除系统之sgRNA设计

sgRNA设计网站介绍sgRNA的在线设计网站有:1、http://crispr.mit.edu/ ;2、http://www.e-crisp.org/E-CRISP/;等网站。这些网站虽然一定程度上满足了部分研究 者的需要,但仍然存在很多不足和缺陷。例如:1、数据分析周期长;2、无具体的脱靶数据;3、可供选择物 种十分有限。极大的影响了科研工作者的工作效率。鉴于此Biomics及时推出了本地化运行sgRNA软件设计服务,2个工作日内可给出sgRNA设计结果,包括详细的off‐target数据,且不限物种,提高科研工作效率!设计要点一、设计选项1、基因信息或基因ID;2、种属信息;3、Cas9/sgRNA类型,比如spCas9 nickase需要设计一对sgRNA;4、CRISPR类型,例如敲入、敲除、抑制、激活;5、PAM类型,NGG或者NAG等。二、基因敲除设计思路1、根据相应基因及种属信息,在NCBI或ENSEM......阅读全文

刘小乐教授连发多项研究成果

  华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐(X Shirley Liu)教授,也是教育部“长江学者”讲座教授、中组部“千人计划”入选者,是国际生物信息学界的领军人物。其带领的课题组长期致力于生物大数据的收集和信息挖掘、筛选治疗癌症药物的有效靶点,以及开发个性化癌症诊

华人先锋《Nature-Methods》利用CRISPRi绘制遗传互作图谱

  斯坦福大学亓磊(Lei Stanley Qi)教授早年毕业于清华大学,现任斯坦福大学生物工程学、化学和系统生物学系的助理教授,近年来他在CRISPR研究领域取得了一系列突破性进展,比如第一次采用CRISPR-Cas9系统的变种技术,改变了读取诱导多能干细胞(iPSCs)基因组的方式(由此入选了生

Cell子刊综述:多能干细胞的基因组编辑

  具有敲除或突变等位基因的人类多能干细胞(hPSCs),可以通过定制设计的核酸酶产生。转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)和成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)-Cas9核酸酶,是编辑hPSC基因组最常用的技术。 1月6日,Cell子刊《Cell Stem Cell》在线发表了来自哈佛

crispr/cas9的技术优缺点

CRISPR (Clustered Regularly Interspersed Short Palindromic Repeats)是细菌用来抵御病毒侵袭/躲避哺乳动物免疫反应的基因系统。科学家们利用RNA引导Cas9核酸酶可在多种细胞(包括iPS)的特定的基因组位点上进行切割,修饰。 Rudol

crispr/cas9的技术优缺点

CRISPR (Clustered Regularly Interspersed Short Palindromic Repeats)是细菌用来抵御病毒侵袭/躲避哺乳动物免疫反应的基因系统。科学家们利用RNA引导Cas9核酸酶可在多种细胞(包括iPS)的特定的基因组位点上进行切割,修饰。 Rudol

crispr/cas9的技术优缺点

CRISPR (Clustered Regularly Interspersed Short Palindromic Repeats)是细菌用来抵御病毒侵袭/躲避哺乳动物免疫反应的基因系统。科学家们利用RNA引导Cas9核酸酶可在多种细胞(包括iPS)的特定的基因组位点上进行切割,修饰。 Rudol

纳米马达让CRISPRCas9钻进癌细胞心窝进行基因编辑

  在癌症研究领域,“Cas-9–sgRNA”复合物是一种有效的基因编辑工具,但是其穿过细胞膜接触肿瘤细胞基因组的能力非常低。来自美国和丹麦的科学家们现在开发了一种可以运动的纳米马达,可以有效输送并释放这种基因魔剪系统。在这篇发表于《Angewandte Chemie》的文章中,研究人员详细描述了他

上海生科院完整染色体敲除研究获进展

  11月25日,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组与北京大学胡家志实验室合作完成的研究论文,以《CRISPR/Cas9介导的基因编辑技术敲除目标染色体》为题,发表在《基因组生物学》上。该研究介绍了CRISPR/Cas9技术的新型应用,即在细胞、胚胎或

敲除一整条染色体!上海生科院获最新进展

  11月25日,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组与北京大学胡家志实验室合作完成的研究论文,以《CRISPR/Cas9介导的基因编辑技术敲除目标染色体》为题,发表在《基因组生物学》上。该研究介绍了CRISPR/Cas9技术的新型应用,即在细胞、胚胎或

科学家在植物中实现超长基因片段高效精准无赘敲入

  5月17日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为CRISPR/Cas9-mediated gene targeting in Arabidopsis using sequential transfo

国家纳米中心:新型非病毒纳米载体将有效抑制肿瘤生长

  近日,中国科学院国家纳米科学中心研究员蒋兴宇、郑文富带领的课题组发表了非病毒纳米载体递送的研究成果。他们开发了一系列非病毒的纳米载体,这些非病毒纳米载体可以高效递送CRISPR/Cas9系统到体内,为拓展这一强大基因编辑技术在生命科学和临床应用领域的应用提供了新途径。相关研究成果Thermo-t

国家纳米中心在CRISPR纳米递送研究中取得进展

  近日,中国科学院国家纳米科学中心研究员蒋兴宇、郑文富带领的课题组发表了非病毒纳米载体递送的研究成果。他们开发了一系列非病毒的纳米载体,这些非病毒纳米载体可以高效递送CRISPR/Cas9系统到体内,为拓展这一强大基因编辑技术在生命科学和临床应用领域的应用提供了新途径。相关研究成果Thermo-t

crispr/cas9到底是什么东西

最近几年基因编辑技术异常火爆,CRISPR/Cas9技术面世以后,弥补了传统基因编辑技术的诸多不足,使得基因的“任意编辑”变得越来越容易。也因此,CRISPR/Cas9技术当仁不让的成为基因编辑技术的“王牌”,大有一副取而代之的势头。所以这里就给大家简单介绍一下CRISPR/Cas9的技术原理!一、

CRISPR大范围“脱靶”?可能还需要进一步验证

来源:Pixbay编者按:CRISPR基因编辑会导致数以百计意想不到的突变?5月30日,《自然-方法》刊登的一篇通信文章显示,来自美国哥伦比亚大学等研究机构的科学家确认通过CRISPR基因编辑技术成功修复了导致两只小鼠失明的基因后,经全基因组测序发现小鼠体内有超过1500个单核苷酸发生突变,并有百个

CRISPR导致突变-从而大范围“脱靶”?

CRISPR基因编辑会导致数以百计意想不到的突变?5月30日,《自然-方法》刊登的一篇通信文章显示,来自美国哥伦比亚大学等研究机构的科学家确认通过CRISPR基因编辑技术成功修复了导致两只小鼠失明的基因后,经全基因组测序发现小鼠体内有超过1500个单核苷酸发生突变,并有百个以上的位点发生发生了大片段

强大的基因组编辑工具Crisp/cas9(二)

三、 产品推荐 针对sgRNA和cas9,我们有如下产品可供选择哦: 1.sgRNA系列。 (1)sgRNA载体类型  货号 载体 启动子 sgRNA 是否含有Cas9核酸酶基因 筛选标记/报告基因 SG001

利用CRISPR/Cas9技术构建基因敲除大鼠及小鼠模型

  国际著名生物学期刊《Nature Biotechnology》(2012年影响因子为32.44)于8月8日在线正式发表了上海市调控生物学重点实验室、华东师范大学生科院生命医学研究所刘明耀教授和李大力副教授课题组的最新研究成果。这是继今年6月该课题组在《Nucleic Acids Rese

CRISPR/Cas9完全性基因敲除鼠的鉴定方法

基因工程小鼠基因型PCR鉴定的基本原则是利用基因工程小鼠基因组与野生型小鼠基因组的序列差异,以小鼠基因组DNA为模板进行PCR,并以凝胶电泳比对比不同基因型特异产物的大小,根据条带大小来区分小鼠的不同基因型。上期我们讲述了PCR胶浓度、电泳电压及时间的选择,今天我们就开始学习CRISPR/Cas9完

德国应用化学:蒋兴宇组用非病毒纳米载体传送CRISPR

  导读:近日,中国科学院国家纳米科学中心研究员蒋兴宇、郑文富带领的课题组发表了非病毒纳米载体递送的研究成果。他们开发了一系列非病毒的纳米载体,这些非病毒纳米载体可以高效递送CRISPR/Cas9系统到体内,为拓展这一强大基因编辑技术在生命科学和临床应用领域的应用提供了新途径。  近日,中国科学院国

CRISPRCas9基因编辑的两种不同编辑实验流程的应用(一)

IDT Alt-R® CRISPR-Cas9基因编辑系统 IDT(Integrated DNA Technologies)作为核酸定制合成领域的知名企业,依托30年来的技术研发,推出了Alt-R®系列CRISPR-Cas9基因编辑产品,通过对gRNA序列、Cas9核酸酶优化,对RNP转染效率、同

科学家整合多种遗传操作技术构建新型家蚕性别调控体系

  8月13日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所谭安江研究组等在《美国国家科学院院刊》上发表了题为Silkworm genetic sexing through W chromosome-linked, targeted gene integration的研究论文,报道了整合多

科学家开发新CRISPR系统——可调、可逆的一步式基因表达控制

  生物通报道:控制基因表达水平的能力,是生物学中的一个主要任务。一种广泛使用的方法是删除一个感兴趣的非必须基因(Knockout),或者多步重组让一个感兴趣的基因表达减少(Knockdown)。然而,这些遗传学方法是费时费力的,并且对于定量研究来说是有限的。12月20日,在Nature子刊《Sci

广州生物院利用CRISPR/Cas9技术建立基因敲除克隆猪

  中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员、吉林大学教授赖良学博士的研究团队利用最新的CRISPR/Cas9技术成功地培育出两种基因敲除克隆小型猪,即酪氨酸酶基因敲除猪和PARK2和PINK1双基因敲除猪,建立了人类白化病和帕金森综合征两种猪模型,该研究成果于10月2日在线发表在Cellular

CRISPR/Cas9条件性基因敲除鼠的鉴定手法

基因工程小鼠基因型PCR鉴定的基本原则是利用基因工程小鼠基因组与野生型小鼠基因组的序列差异,以小鼠基因组DNA为模板进行PCR,并以凝胶电泳比对比不同基因型特异产物的大小,根据条带大小来区分小鼠的不同基因型。上期我们讲述了CRISPR/Cas9完全性基因敲除鼠的鉴定,今天我们就开始学习CRISPR/

昆明植物所在小立碗藓多基因敲除体系研究中取得进展

  小立碗藓是第一批登陆的高等绿色植物,是植物分子生物学研究中的一种重要模式植物。目前,小立碗藓的基因敲除主要依赖于同源重组的方法,但这种方法获得突变体的效率相对较低且不利于多基因家族基因功能的研究。由于小立碗藓的杂交极其困难,使得构建多突变体的过程费时费力。尽管小立碗藓中也建立了CRISPR/Ca

刘小乐教授:CRISPR高通量筛选的新算法

  高通量的CRISPR筛选,已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日,华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授,在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualiz

陈玉林教授团队新技术流程用于创制基因编辑绵羊模型

  近年来,以基因编辑技术为代表的家畜分⼦设计育种技术迅速发展。CRISPR/Cas9基因编辑技术是具有简单、高效、精确等优点的新型基因编辑⼯具,将其应用于家畜育种,有望对多个基因实现同步的精准编辑,提高家畜选育的精准度,缩短育种周期,加快育种进程。绵羊是重要的经济动物,更是基因编辑的模式动物,研究

我科学家用CRISPR获得转基因山羊

  CRISPR/Cas9系统的最新研究进展,提供了一种精确而灵活的方法,可在不同物种中进行基因组编辑。然而,这种方法在大型动物模型(如山羊)中的适用性和效率,还没有得以广泛的研究。最近,来自西北农林科技大学、榆林学院、南京大学和上海科技大学等处的研究人员,在Nature子刊《ScientificR

基因编辑鼠的构建-Guide-RNA设计和筛选

众所周知,CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”,它可以高效地实现靶基因的编辑,自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成,Cas9核酸酶会在向导RNA(Guide RNA, gRNA)的指引下,在完整基因组上的特定位点完成切割反应,同

CRISPR/Cas9:基因编辑的历史与发展

CRISPR/Cas系统是细菌和古菌特有的一种天然防御系统,用于抵抗病毒或外源性质粒的侵害。当外源基因入侵时,该防御系统的 CRISPR 序列会表达与入侵基因组序列相识别的 RNA,然后 CRISPR 相关酶(Cas)在序列识别处切割外源基因组DNA,从而达到防御目的。根据Cas蛋白的特点,可将CR