李劲松／陈子江／汤富酬实现核移植扩增人源精子的新方法
哺乳动物单倍体胚胎干细胞（haESCs）由于仅存在一组遗传物质，因此是进行遗传分析的理想工具。重要的是，当与CRISPR-Cas9技术结合使用时，雄激素性haESC（AG-haESCs）可以用作精子的替代品，并在生物水平上用于破译基因功能。然而，迄今为止，只能在啮齿动物中获得AG-haESCs 。 2019年12月18日，中国科学院上海生化细胞所李劲松，山东大学陈子江及北京大学汤富酬共同通讯在Cell Research 在线发表题为“In vitro expansion of human sperm through nuclear transfer”的研究论文，该研究发现在低氧浓度的培养条件下，可以通过精子核转移产生人类单倍体ESC。 包含精子基因组的hAG-haESCs在体外ESC衍生和增殖过程中稳定维持典型的印迹DMR。 令人惊讶的是，hAG-haESCs可以“受精”卵母细胞并支持早期胚胎发育，从而导致胚泡和二倍体ES......阅读全文
李劲松/陈子江/汤富酬实现核移植扩增人源精子的新方法
哺乳动物单倍体胚胎干细胞（haESCs）由于仅存在一组遗传物质，因此是进行遗传分析的理想工具。重要的是，当与CRISPR-Cas9技术结合使用时，雄激素性haESC（AG-haESCs）可以用作精子的替代品，并在生物水平上用于破译基因功能。然而，迄今为止，只能在啮齿动物中获得AG-haESCs
上海生科院合作揭示受精卵DNA去甲基化重要机制
9月11日，国际学术期刊《细胞—干细胞》（Cell Stem Cell）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所徐国良研究组、李劲松研究组和北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组的最新研究成果Active and Passive Demethylation
汤富酬最新综述：单细胞测序与干细胞
干细胞能够分化成为机体内任何类型的细胞，既是研究人体早期发育的理想工具，也是细胞治疗的宝贵资源。细胞间差异和异质性是干细胞群体固有的基本特性。如果我们对一群细胞进行组学分析，这些关键的信息就会被掩盖。 单细胞测序技术是近几年备受关注的强大工具，可以在同种干细胞中全面剖析细胞异质性，鉴定不同表型
陈子江团队－人源分裂期胚胎介导高效的单碱基编辑！
基础编辑器能够在不引起双链断裂的情况下实现单核苷酸转换，目前已成功应用于小鼠和人类胚胎的基础校正。与小鼠相比，人类胚胎中的碱基编辑效率通常较低（低于30％），这常常导致镶嵌现象，而且还限制了当前基础编辑方法在人类胚胎中进行基因功能研究的应用。2019年5月2日，杨辉、陈子江团队等人在Genome
北大汤富酬等人揭示人类胚胎发育机制
基因表达图 近日，北京大学研究团队采用先进的单细胞 RNA-Seq 转录组测序技术绘制出了完整的人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组图谱，这一重要的研究成果发表在9月的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。 由
北大汤富酬发表表观基因组新成果
表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性。基因表达在时间和空间上的表观遗传学调控，对于人类发育是至关重要的。近年来，表观基因组已经成为了生物医学领域的一大研究热点。 北京大学的研究团队对早期人类胚胎进行深入研究，获得了胎儿大脑、心脏和肝脏的表观基因组景观。这一成果发表在十二月
北大汤富酬Cell－Stem－Cell点评重编程研究成果
将体细胞重编程为诱导多能干细胞的iPS技术有着广阔的应用前景。但目前人们对iPS体细胞重编程的分子机制还知之甚少。这主要是因为目前iPS重编程的效率比较低，得到的细胞存在很大的异质性。 北京大学生物动态光学成像中心BIOPIC的研究员汤富酬和助理研究员文路在Cell Stem Cell杂志上
北大乔杰、汤富酬、黄岩谊发表环状RNA新成果
早在几十年前，生物学家们就发现了环状RNA。与线性RNA相比，环状RNA受到的关注比较少，一直被认为是剪切过程中发生的错误。随着二代测序的发展，近几年人们意识到环状RNA其实是非常普遍的。这些分子广泛存在于多种生物的细胞中（从古生菌、酵母、小鼠到人类），能够通过不同途径影响基因表达，很可能在细胞
2018单细胞测序盘点：北大汤富酬教授连发11篇论文
单细胞RNA测序技术随着近几年的迅速发展，已在多个领域，从早期胚胎发育到组织和器官发育、以及免疫学和肿瘤学开花结果。 2018年，这一领域国内外成果不断，比如北京大学的汤富酬课题组就接连发表了11篇文章，获得了单细胞测序领域的接连重要成果。 3月，这一研究组与中国科学院生物物理研究所王晓群课
汤富酬－乔杰再发文：绘制人类心脏高精度发育细胞图谱
人类胚胎发育是一个极其复杂的过程，从一个单细胞的受精卵开始，首先经过着床前胚胎发育产生胚内和胚外组织，再到着床后原肠胚阶段三个胚层的特化，进而到器官发生、分化、成熟，及至新生命的诞生。整个两百八十天的胚胎发育过程从一个单细胞受精卵增殖发育形成含有上万亿个细胞的婴儿，期间基因表达受到严密、精准的调
北大汤富酬、乔杰团队Cell－Res表观遗传学新成果
生物通报道：2016年11月8日，国际著名期刊《Cell Research》在线发表了北京大学汤富酬、乔杰团队题为“DNA methylation and chromatin accessibility profiling of mouse and human fetal germ cells”
汤富酬Nature－Cell－Biology发文－揭示人类消化道发育细胞图谱
人类胚胎发育过程中食道、胃、小肠、大肠的细胞类型图谱及其关键生物学特征。 消化系统是人体中最重要的器官系统之一，而消化道作为消化系统最重要的组成部分，其在食物消化、营养吸收、废物排泄、抵抗微生物入侵等多个方面起着极其重要的作用。消化道主要由食道、胃、小肠、大肠组成。揭示这四种器官在人类胚胎发育
北大汤富酬、乔杰、付卫Science发表结直肠癌新成果
结直肠癌是胃肠道中常见的恶性肿瘤。基因组不稳定性、表观遗传异常以及基因表达失调是结直肠癌的典型分子特征。以往的单细胞研究只能分别检测基因组、甲基化组或转录组，而不能以单细胞分辨率同时开展多组学研究。 为了更好地了解结直肠癌的发展，北京大学的研究团队开发出一种单细胞测序方法，不仅能够分析单细胞的
《自然—方法学》年度方法：单细胞测序
2014年1月《自然—方法学》(Nature Methods)上发表年度特别报道，将“单细胞测序”(Singled out for sequencing)的应用列为2013年度最重要的方法学进展。 近几年来，基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展，其成果有望为一些重
Nature2015最佳评论文章：汤富酬、文路、马晓娅入选
Nature杂志近日展开了一年一度的年终大盘点，评出了2015年的最佳评论文章。本次盘点选入了三名中国学者的两篇文章，他们分别是北京大学的研究员汤富酬和研究员文路，以及云南大学的研究员马晓娅。 汤富酬和文路在这篇文章中重点介绍了Grün等人开发的RaceID的算法，该算法能够在复杂的细胞混合物
Nature－Methods－：北大汤富酬团队揭示单个细胞内高阶染色质结构
调控基因组元件的高阶三维(3D)组织为基因调控提供了拓扑基础，但尚不清楚哺乳动物基因组中的多个调控元件如何在单个细胞内相互作用。 2023年8月28日，北京大学汤富酬团队在Nature Methods （IF=48）在线发表题为“scNanoHi-C: a single-cell long-r
Cell－Research解析小鼠原肠期胚胎胚层形成的表观遗传规律
细胞命运决定过程的调控机制是哺乳动物胚胎发育研究领域关注的重点。在哺乳动物胚胎发育过程中，具有全能性的合子会依次经过桑椹胚期、囊胚期、原肠胚期等，最终形成能够发挥完整生物学功能的个体。其中，外、中、内三个胚层形成的原肠运动时期对后续胚胎发育蓝图的构建起着至关重要的作用。 表观遗传调控在哺乳早期
2022年度上海市科学技术奖复评专家名单出炉
2022年度上海市科学技术奖复评已结束，现公布参加复评的专家名单（按姓氏拼音排序）。 艾连中、白景峰、毕燕龙、蔡传兵、曹家麟、曹俊诚、曹先常、柴洪峰、陈芬儿、陈刚、陈光辉、陈红洁、陈红专、陈建民、陈杰、陈俊平、陈凯、陈凯先、陈立东、陈立侨、陈平、陈启军、CHENQUN、陈韶红、陈寿面、陈恕行、
Biology－of－Reproduction发表关于“人造精子细胞”的综述
5月11日，中国科学院生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究组受邀在生殖领域老牌杂志Biology of Reproduction在线发表了题为“Artificial spermatid”-mediated genome editing的综述论文，系统地介绍了“人造精子细胞”的产生、优化和应用，
北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术新成果
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
北京大学汤富酬等团队发布单细胞测序技术最新研究成果
基于第三代测序（TGS）平台的单细胞RNA-seq技术的进步加速了生物学研究。自2016年以来，已经开发了几种基于TGS平台的单细胞RNA-seq方法。由于受到低准确度和灵敏度的限制，它们要么结合基于NGS平台的方法降低错误率，要么通过牺牲通量来提高检测率。 2023年1月11日，北京大学汤富
陈子江/刘洪彬团队揭示SSH2参与精子顶体形成的新机制
目前，世界范围内育龄期夫妇不孕不育的比例约为8-12%，其中男性因素所致约占50%， 而精子生成异常是导致男性不育症的主要遗传因素之一【1】。精子生成是未成熟精子细胞经历顶体形成等一系列细胞形态重塑事件，最终分化为具备运动能力和受精潜能成熟精子的过程【2】。位于精子头部前段的顶体是精子特化的囊泡
北大汤富酬团队首次在单细胞水平上从头组装人类基因组
基因组组装受益于具有更高准确性和更高连续性的长读长测序技术。然而，大多数人类基因组组装需要来自同质细胞系的大量 DNA，而不会保持细胞异质性，因为细胞异质性会严重影响单倍型组装结果。 2022年7月12日，北京大学汤富酬团队在Nucleic Acids Research （IF=19）在线发表
人的单倍体胚胎干细胞的建立方法
5月17日，国际著名学术期刊Cell Research在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究组和上海交大仁济医院陈子江研究组的合作研究论文，该研究建立了来自人孤雌囊胚的单倍体胚胎干细胞系。 哺乳动物，包括小鼠、大鼠和猴，其单倍体胚胎干细胞的建立为遗传筛选研究以及制
科研人员在生殖细胞中治愈小鼠遗传疾病
12月5日，《细胞研究》期刊在线发表了中科院上海生科院生化与细胞所李劲松研究组和吴立刚研究组以及北京大学汤富酬研究组的一项合作研究成果，研究人员利用CRISPR-Cas9技术，在小鼠的精原干细胞中修复了遗传缺陷，产生了完全健康的后代。专家认为，这项研究为人类基因治疗提供了一个新的思路。 据悉，
上海生科院等建立人的单倍体胚胎干细胞
5月17日，国际学术期刊Cell Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究组和上海交通大学仁济医院陈子江研究组的合作研究论文，该研究建立了来自人孤雌囊胚的单倍体胚胎干细胞系。 哺乳动物，包括小鼠、大鼠和猴，其单倍体胚胎干细胞的建立为遗传筛选研
上海生化细胞所发现受精卵DNA去甲基化重要机制
近日，中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现，小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段，均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化，DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生，而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊
研究揭示受精卵DNA去甲基化重要机制
近日，中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现，小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段，均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化，DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生，而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊《细胞—干细胞》。 该研究由中科院上海生
我科学家完成单个卵细胞的高精度全基因组测序
近日，由北京大学第三医院教授乔杰、北京大学生物动态光学成像中心教授汤富酬和谢晓亮所领导的3个研究小组，共同完成了对单个卵细胞的高精度全基因组测序。成果发表在国际著名学术期刊《细胞》上。 2012年，谢晓亮课题组实现了对单个细胞全基因组的高精度测序，随后该技术被应用到多项研究中。数据显示，我国每
1100人！上海市2021年度扬帆计划项目通讯评审专家名单
上海市2021年度“科技创新行动计划”扬帆计划项目通讯评审专家名单公布 上海市2021年度“科技创新行动计划”扬帆计划项目通讯评审已结束，现公布参加通讯评审的专家名单。 安红梅、安平、安晓霞、安仲勋、包玉倩、鲍嫣、毕庆贞、卞振锋、卜军、步扬、蔡亮、蔡孟浩、蔡清萍、蔡新波、曹广文、曹丽英、