PCAWG联盟6篇Nature、15篇Nature子刊揭示癌症的复杂性

一项大规模的国际努力对来自38个人体组织的2600多个肿瘤基因组进行了多方面研究,从而对癌症的遗传基础产生了丰富的见解。 早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。在发表在最新一期Nature期刊的6篇论文中,全基因组泛癌分析(Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes, PCAWG)联盟进行了迄今为止最全面、最雄心勃勃的癌症基因组荟萃分析。与以前的研究工作主要集中于癌症基因组的蛋白编码区域不同,PCAWG联盟分析了整个基因组。在这6篇Nature论文中,每篇论文都仔细研究了癌症遗传学的一个重要方面---总之,他们的发现对于理解癌症的完整遗传复杂性至关重要。 在讨论这些分析的影响之前,至关重要的是要强调支持PCAWG联盟努力的大量数据和复杂的组织框架。该项目涉及一个来自4大洲......阅读全文

PCAWG联盟6篇Nature、15篇Nature子刊揭示癌症的复杂性

  一项大规模的国际努力对来自38个人体组织的2600多个肿瘤基因组进行了多方面研究,从而对癌症的遗传基础产生了丰富的见解。  早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。在发表在最新

6篇Nature齐发!癌症基因组计划成果成井喷之势

  除了Nature一次性发表6篇论文外,Nature Genetics杂志发表了3篇,Nature Communications发表9篇,Nature Biotechnology一篇,详细报道BioArt后续会陆续发布。文章合集网址:https://www.nature.com/collectio

癌症基因组——癌症研究和云计算的里程碑

图片来源:https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w  2001年,人类基因组计划完成,整个计划花费约30亿美元,1985年提出,1990年正式启动,历经十余年。肿瘤是最热门的研究领域之一,该领域的研究者们一直希望可以借助测序手段去表征肿瘤的

Nature癌症综述:复制应激与癌症

  基因组的稳定性直接关联到细胞是否发生癌变,而在这其中,DNA复制是最容易发生变化的过程,也是最容易致癌的过程。任何导致DNA损伤高水平发生的条件也都会引发复制应激(replication stress),这是基因组不稳定的来源之一,也是癌变前细胞和癌变细胞的一大标志。  来自西班牙塞维利亚大学的

科学家绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱

  体细胞突变是肿瘤发生的标志,可用于癌症的无创诊断。美国约翰·霍普金斯大学医学院绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱,用于癌症无创检测。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上,题为:Single-molecule genome-wide mutation profile

Nature:癌症代谢,过犹不及

  一种受到严密调控的酶在癌细胞中平衡了能量生成和来自葡萄糖的大分子合成。通过促进这种酶的活性来打乱这种平衡能够抑制小鼠体内肿瘤的生长。   癌症的形成与支持肿瘤细胞增殖活力和生物合成需求的一套代谢改变相关。其中许多的改变是由驱动肿瘤形成的相同遗传突变所激发,这表明通过药理学方法使这些肿瘤细胞代谢

Nature-Genetics:癌症“大爆炸”

  南加州大学USC的科学家们首次追溯了结直肠癌(Colorectal cancer)的起源,并从中发现了癌细胞生长的重要线索,提出了癌症发生时的“大爆炸”理论。这项研究发表在二月九日的Nature Genetics杂志上。  “大爆炸”原本是一个经典的宇宙起源理论,该理论认为宇宙是在一次奇点大爆炸

Nature癌症综述:如何用CRISPR进行癌症研究

   CRISPR/Cas9系统可以很容易地改写多种生物的基因组,这一技术很快如风暴一般席卷了整个基因组工程领域。可想而知,以CRISPR/Cas9为基础的各种应用也将为癌症遗传学领域带来一场变革。麻省理工霍华德・休斯医学研究所的Tyler Jacks就是这方面的先行者,他去年连发两篇Nature文

Nature癌症综述:癌症中的黏连蛋白

  大量的癌症基因组测序项目,每天都在发现可能与肿瘤形成有关的新基因。黏连蛋白(cohesin)就是一个很好的例子,cohesin是一种围绕DNA的环状蛋白复合体,控制着细胞的分裂。就在几个月前,人们通过测序数以千计的肿瘤样本发现,STAG2是一些癌症中(例如膀胱癌和黑色素瘤)突变最为频繁的基因之一

Nature:阻遏癌症恶病质

  来自Dana-Farber癌症研究所的一项新研究,让更有效地治疗恶病质(cachexia)变得前景光明。  恶病质是一种严重的机体代谢紊乱,它发生于近一半的癌症患者中,表现为肌肉和脂肪严重丧失并伴有体重减轻、疲劳和虚弱,这使得患者无法耐受可拯救生命的潜在治疗方法,提升了癌症患者的死亡风险。尽管人

Nature解析癌症与“垃圾”DNA

  癌症是由多次遗传改变(或突变)而引起的一类疾病。我们从父母那里继承了或强或弱的形成某些癌症类型的遗传易感性;此外,在我们的一生中我们的细胞内也会不断地累积新的突变。尽管已开展了很长一段时间的癌症遗传起源研究,直到现在研究人员仍无法估量基因组一些非编码区域的作用。  来自日内瓦大学(UNIGE)的

Nature:向着癌症相关mRNA开炮

  大多数癌症药物都被设计来阻止细胞生长,这是癌症的一个标志,控制细胞生成成千上万种蛋白质的信号通路是一个受欢迎的靶标。  来自加州大学伯克利分校的研究人员现在发现了这一信号通路中一个有前景的新药物靶标,其之所以具有吸引力,部分原因在于它似乎控制了机体一小部分蛋白质的生成,而这些蛋白对于调控生长和细

Nature:癌症让免疫细胞叛变

  免疫系统是机体对抗疾病、感染甚至癌症的武装部队,但这个队伍中也会出现叛徒。荷兰癌症研究所的科学家们发现,特定免疫细胞会被乳腺肿瘤“策反”,促进癌细胞的扩散。这项研究发表在三月三十日的Nature杂志上。  在西方国家,大约每八个女性中就有一个患上乳腺癌。而乳腺癌死亡90%是因为癌症扩散到了机体其

Nature:扼住癌症生长的咽喉

  当称作为Ral的蛋白活化之时,它会在胰腺癌、前列腺癌、肺癌、结肠癌和膀胱癌等几种人类癌症中驱动肿瘤生长和转移。不幸的是,当前还没有可以阻断Ral活性的药物。发表在9月14日《自然》(Nature)杂志上的一项研究,报告称采用了一种新方法来阻断这些Ral蛋白的激活。  “如果你想阻止鳄鱼咬你,你可

Nature:向着癌症相关mRNA开炮

  大多数癌症药物都被设计来阻止细胞生长,这是癌症的一个标志,控制细胞生成成千上万种蛋白质的信号通路是一个受欢迎的靶标。  来自加州大学伯克利分校的研究人员现在发现了这一信号通路中一个有前景的新药物靶标,其之所以具有吸引力,部分原因在于它似乎控制了机体一小部分蛋白质的生成,而这些蛋白对于调控生长和细

Nature揭示新型癌症蛋白家族

  来自英国癌症研究院的科学家们在发表于12月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究论文中,描述了一个似乎在癌症中发挥重要作用的新型蛋白质家族——谷氨酸膜内蛋白酶(glutamate intramembrane proteases),并着手解析了这一新家族的结构,该家族的基础成员在将健康

Nature揭示新型癌症致病基因

  来自英国癌症研究中心(Cancer Research UK)的科学家们在小鼠中发现了一个防止卵巢癌的新基因,如果其发生缺陷就可以提高形成这一疾病的机会。这项研究发表在9月4日的《自然》(Nature)杂志上。   这一称作为HELQ的基因,可帮助修复细胞增殖时DNA复制过程中所发生的所有的

Nature:追踪癌症从血液入手

  通过追踪患者血液中的改变,来自剑桥大学的科学家们建立了一种新方法,可以实时观测肿瘤演变及耐药形成。这一研究发表在5月2日的《自然》(Nature)杂志纸质版上。   剑桥大学英国剑桥癌症研究所的科学家们,通过追踪癌症患者血液中的循环肿瘤DNA(circulating tumour DNA,

Nature:新型靶向性癌症疫苗

  星形细胞瘤和少突神经胶质瘤是神经胶质瘤的两种亚型。这些无法治愈的脑肿瘤都是起源于中枢神经系统的一类支持细胞——胶质细胞。低级别的神经胶质瘤生长相对缓慢,以一种弥漫的方式扩散至整个大脑,很难通过手术完全清除。在许多情况下,化疗和放疗的疗效非常有限。神经胶质瘤可发展为极具侵袭性的胶质母细胞瘤。  低

首创全基因组大数据的高精度计算技术揭示癌症复杂性

  2月6日出版的《自然》集中发表了国际癌症基因组联盟(ICGC)泛癌全基因组分析协作组(PCAWG)完成的6篇论文,分别聚焦泛癌全基因组数据画像、肿瘤体细胞突变的路径图谱、非编码区的驱动突变特征、基因组结构突变的特征模式、复现肿瘤的演化历程和多组学荟萃的RNA变化规律六个方面。同日,PCAWG还在

Nature发现22种癌症的奥秘:癌症进程性发展

  这一发现由德国四大殿堂级研究机构Max Delbrück分子医学中心,伦敦大学学院等处完成,揭示了22种肿瘤类型,包括乳腺癌,结肠直肠癌和肺癌等的奥秘。  德国Max Delbrück分子医学中心领导的一组最新研究表明,癌症患者的某些细胞中会出现获得或丢失大部分染色体,但其它细胞中却没有,这个过

最全癌症基因图谱公布-有望提前数十年识别出肿瘤突变

  癌症是一种基因病,由体细胞癌基因突变引起。早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。  2月5日,Nature杂志及其子刊同期发表了20余篇关于癌症研究的文章,由来自37个国家、

Nature首次发现骨癌症干细胞

  来自美国Rhode Island医院的研究人员,发现小鼠体内一些特殊软骨细胞缺失Shp-2酶,可导致多发性良性软骨肿瘤形成。这一小鼠模型重演了人类一种罕见的肿瘤综合征:混合性软骨瘤病(metachondromatosis)。研究结果发布在7月17日的《自然》(Nature)杂志上。   S

Nature子刊:癌症新扩散方式

 新的研究发现了癌细胞如何被吸引到特定的机械“甜点”环境。科学家们发现,癌细胞可以被吸引到特定的机械“甜点”环境中,这为癌症如何入侵人体提供了新的见解。这些发现可以帮助科学家和工程师更好地了解癌症是如何扩散的。这一发现还可能导致未来治疗方法的改进。这项研究于2022年7月11日发表在同行评议的多学科

Nature:癌症中增强的劫持现象

   髓母细胞瘤是最常见的一种儿童脑瘤。近日德国的研究人员在针对髓母细胞瘤的研究中取得了突破性发现。两篇论文发表在《自然》(Nature)杂志上。  PedBrain肿瘤网络协调员、德国癌症研究中心的Peter Lichter教授说:“根据疾病的侵袭性,髓母细胞瘤可以分为差异极大的4种不同亚型。其中

Nature重要论文:癌症追根溯源

  研究人员提供了第一个有关驱动肿瘤形成的突变过程的综合纲要。这些突变过程解释了30种最常见癌症类型的大部分突变。这一关于癌症形成的新认识可能有助于治疗和预防广泛的癌症。相关研究论文发表在8月14日的《自然》(Nature)杂志上。   每个突变过程都在它导致的癌症基因组上留下了一种特定的突变模式

《Nature》癌症和肥胖或可传染

  住在同一屋檐下的人们共享的不仅仅是屋子。无论是家人还是室友,室友体内的微生物往往是相同的,同居的时间越长,这些微生物群落就越相似。  这一结论基于1月18日发表在《Nature》杂志上的一项关于世界各地数千人肠道和口腔微生物群的研究,提出了一种可能性,即与微生物群功能紊乱有关的疾病,包括癌症、糖

Nature子刊:细胞定位与癌症

  曼彻斯特大学的科学家揭示了细胞定位的机制,因为在癌症早期细胞的组织形式会遭到破坏,所以细胞定位机制的发现将有助于人们对抗癌症。这项研究发表在Nature Cell Biology杂志上。   正确的细胞组织形式对于维持器官正常功能和机体健康至关重要,这包括细胞在组织中的位置和朝向,因为细胞

Nature揭示“癌症之王”的抑制开关

  发表在12月4日《自然》(Nature)杂志上的一项新研究证实,p53蛋白的状态决定了抑制细胞自噬信号通路是促进或是抑制小鼠体内的胰腺癌。这一研究发现为临床自噬抑制剂试验提供了一个警示故事。   自噬是细胞吞噬自身,降解和回收细胞质蛋白及细胞器的一个基本过程。这一信号通路在响应各种形式压力促进

Nature解析癌症与非编码RNA

  人类基因组可生成1万多种长链非编码RNA(lncRNA) 分子,但人们至今却只知道其中几十种转录物的功能。在发表在8月14日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究中,来自加州大学的杨柳青(Liuqing Yang,音译)等研究人员揭示,两种lncRNAs结合并控制了雄激素受体的功能。