青岛农大等完成海湾扇贝两个亚种基因组测序

日前,青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展,海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析,相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。 此前,王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装,紫扇贝和海湾扇贝两个亚种基因组的成功测序,为从分子水平解析海湾扇贝属扇贝及其杂交后代的生长、抗逆性、育性和寿命等重要性状的决定机制及分子育种,打下了基础。 海湾扇贝属是原产于美洲的雌雄同体型扇贝,大部分种类分布在北大西洋沿岸,其中海湾扇贝北部亚种和海湾扇贝南部亚种已由张福绥院士分别于1982年和1991年由美国引进我国,成为我国北方和南方海域主要扇贝养殖品种。紫扇贝是唯一分布于南太平洋沿岸的海湾扇贝属种类,2007年由王春德课题组首次从秘鲁引进我国。 近年来,课题组通过将紫扇贝与海湾扇贝两个亚种分别进行杂交,成功培育出一系列生长优势极其显着的杂交扇贝......阅读全文

青岛农大等完成海湾扇贝两个亚种基因组测序

  日前,青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展,海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析,相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。  此前,王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装,紫扇贝和海湾扇贝两个

青岛农大等团队完成海湾扇贝两个亚种基因组测序和组装

  日前,青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展,海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析,相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。  此前,王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装,紫扇贝和海湾扇贝两个

青岛农业大学完成紫扇贝基因组测序

  近日,青岛农业大学海洋科学与工程学院科研团队日前完成了紫扇贝基因组的测序和分析,这是继虾夷扇贝和栉孔扇贝之后人类完成的第三个扇贝基因组测序。图片来源于网络  青岛农业大学海洋科学与工程学院教授王春德带领的科研团队结合第二代和第三代基因测序方法,对紫扇贝进行了全基因组测序分析,共获得463.19G

西农大发表世界首个-大规模小麦全基因组重测序结果

  西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室在基因组学领域国际知名期刊Ge-nomeBiology上发表论文,揭示了六倍体小麦遗传多样性来源于频繁的与野生小麦的种内杂交及与更远缘野草的种间杂交,为了解小麦起源、进化和驯化历史,克服小麦遗传资源同质化,促进小麦遗传改良提供了重要的数据资源。  

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

南京农大,中国农业科学院发表全基因组重测序新发现

  来自南京农业大学,中国农业科学院棉花研究所,浙江大学等处的研究人员发表了题为“Genomic analyses in cotton identify signatures of selection and loci associated with fiber quality and yield

中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制

  小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼

青岛农大与企业共建食品药品安全检测中心

  日前,青岛农业大学、润德(山东)检测技术有限公司、青岛海都集团有限公司签署合作协议,三方合作在青岛农大建立国内首家符合美国FDA和欧盟EFSA标准的食品药品安全检测中心,负责出口到欧美国家的中国食品的安全检测。  该中心的设立将填补我国在国际食品药品检测高端服务业方面的空白,提高我国政

青岛农大成立中国农村发展研究院

  4月7日,由青岛农业大学和科技部农村技术开发中心共同设立的开放性实体研究机构“青岛农业大学中国农村发展研究院”揭牌成立。这一汇集高等学校、政府智囊、科研机构、龙头企业共同参与的农村发展研究机构,旨在打造我国具有重要影响力的农村发展战略研究平台、“三农”专家学者交流平台和“三农”研究成果发布平台,

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

关于全基因组测序的测序指标介绍

  一、全基因组测序的测序指标— 深度  测序深度(Sequencing depth)是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体,如果采用的是双末端或Ma

青岛农大发表改善婴幼儿配方奶新成果

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454994.shtm 近日,青岛农业大学食品科学与工程学院教授孙庆杰团队在《食品科学与技术趋势》发表最新综述论文。论文聚焦百姓关心的热点婴幼儿配方奶粉,为改善婴儿配方乳脂结构及复合脂质产品开发提供理论

青岛农大与两企业共建食品药品检测中心

  2月28日,青岛农业大学、润德(山东)检测技术有限公司、青岛海都集团有限公司签署合作协议,三方合作在青岛农大建立国内首家符合美国FDA和欧盟 EFSA标准的食品药品安全检测机构,负责出口到欧美国家的中国食品的安全检测,确保出口食品达到美国FDA或欧盟EFSA的安全要求。  该项目预计2

中国农大玉米基因组组装取得重大突破

  玉米是一种重要的作物,具有高水平的基因组多样性和杂种优势。先前发布了典型雌性系B73的基因组序列。7月30日,中国农业大学教授赖锦盛研究组在Nature Genetics在线发表研究论文,报告了相应的雄性代表系Mo17的从头基因组装配。图片源自网络  B73/Mo17是许多遗传和分子研究中最常见

454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

  一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当

青岛农大主持制定全国首个鹅肥肝生产行业标准

  近日,由国家水禽产业技术体系岗位科学家、青岛农业大学食品科学与工程学院教授王宝维主持制定的《鹅肥肝生产技术规范》,顺利通过国家审定。这是自1981年我国首次试验成功鹅肥肝以来,全国首个属于鹅肥肝自己的行业标准。  据悉,鹅肥肝被誉为世界三大美食之一,但我国鹅肥肝产业化起步晚,在饲养管理、产品质量

青岛农大获批2个农业农村部重点实验室

  近日,农业农村部办公厅公布了80个农业农村部重点实验室(部省共建)名单,由青岛农业大学牵头申报的“农业农村部盐碱地智能农机装备重点实验室”和“农业农村部特种食品加工重点实验室”顺利通过遴选,获批为农业农村部重点实验室(部省共建)。  “农业农村部盐碱地智能农机装备重点实验室”围绕我国可开发利用盐

我国完成小麦A基因组测序

本报讯(记者丁佳)5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和

我国完成小麦A基因组测序

   5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和表达特征,对深入和

什么是基因组测序技术

自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来,人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开,分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中,他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为"霰弹法",人类基因组工程则采用了"克隆法"。所谓"霰弹法",其实是一种

盘点最新基因组测序成果

  the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者:  种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae)  基因组:~2.86 billion bp  人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年

基因组测序的具体过程

讲起来很复杂哈,简单来说,就是边合成边测序,把所要测序的序列通过各种手段来建库,然后加上5‘和3’都加上接头,放在一个小玻璃片一样的芯片上,上面一般是8个lane,把样品加入到lane上之后和上面长好的接头序列相结合(之前的建库时加的接头与之反向互补),然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇,然

简化基因组测序好做吗

简化基因组方法是一种利用酶切技术、序列捕获芯片技术或其他实验手段降低物种基因组复杂程度,进而研究基因组各类遗传结构性变异的技术手段。目前常见的简化基因组技术包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。这些技

白肉灵芝完成基因组测序

 在韶关产业园种植的白肉灵芝。吴清平团队 供图 近日,中国工程院院士、广东省科学院微生物研究所名誉所长吴清平团队完成了第一个白肉灵芝全基因组测序。据悉,这是世界上首次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。相关研究发表于《G3:基因,基因组,遗传学》(G3-Genes Genomes Genet

人类全基因组测序计划

  全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基

中国莲基因组测序完成

  继中国科学家成功完成水稻、玉米基因组测序工作后,近日,中国科学院武汉植物园研究人员与国外多家科研机构合作,顺利完成中国莲的基因组测序,构建了首张中国莲全基因组图谱,相关论文在线发表于《基因组生物学》杂志。   “该项目为将来的莲分子育种提供了坚实的基础,也标志着我国相关研究将对生物进

让基因组测序绕过PCR

 在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-