定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)
摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋白质组学在相对定量和绝对定量分析方面的局限提供了有效途径。本文对定量蛋白质组学目前遇到的瓶颈问题进行了分析,总结了质谱定量采集技术的最新进展,并评述了这些新技术的特点以及在定量蛋白质组学应用中的优势。 关键词 定量蛋白质组学; 同步母离子选择; 平行反应监测; 数据非依赖性采集; 综述 1引言 当今蛋白质组学的关注焦点和研究趋势已经逐渐从定性分析转向定量分析。定量蛋白质组学是对细胞、组织乃至完整生物体的蛋白质表达进行定量分析,对生物过程机理的探索和临床诊断标志物的发现与验证具有重要意义[1,2] 。定......阅读全文
新型蛋白质结构分析手段氢氘交换质谱技术进展
氢氘交换质谱法是一种研究蛋白质空间构象的质谱技术。它在蛋白质结构及动态变化研究、蛋白质相互作用位点发现、蛋白表位及活性位点鉴定方面有着广泛的应用。随着氢氘交换质谱技术的不断发展,它正在成为结构生物学家及生物药物研发的重要手段。氢氘交换质谱(HDX MS,hydrogen deuterium exch
新型蛋白质结构分析手段氢氘交换质谱技术进展
氢氘交换质谱法是一种研究蛋白质空间构象的质谱技术。它在蛋白质结构及动态变化研究、蛋白质相互作用位点发现、蛋白表位及活性位点鉴定方面有着广泛的应用。随着氢氘交换质谱技术的不断发展,它正在成为结构生物学家及生物药物研发的重要手段。 氢氘交换质谱(HDX MS,hydrogen deuterium exc
布鲁克:以质谱技术破局蛋白质组学复杂性,引领精准医疗新方向
在生命科学研究中,蛋白质组学是连接基因信息与生命功能的关键桥梁。相较于静态的基因组,动态变化的蛋白质是细胞活性的核心执行者,也是精准医疗落地的 “核心密码”。随着质谱技术的迭代与AI的深度融合,蛋白质组学已从早期的定性鉴定,迈入单细胞解析、大规模生物标志物筛选、结构蛋白质组学的新阶段。作为全球生命科
高分辨质谱脂质轮廓谱表征用于食品组学研究中...(一)
1. 前言食品组学(Foodomics)是食品科学中的一门新兴学科,它通过运用或整合各种先进组学技术(-Omics)来研究食品与营养学中的相关科学问题,从而改善消费者的福祉与健康 [1]。按照研究目的与对象体系的不同,食品组学能从基因组学、蛋白组学与代谢组学等不同组学角度实施,可广泛应用于食品产地溯
品茗论谱-|-第一届杭州西子质谱沙龙——大数据背景下的质谱组学研究
2024年4月2日,SCIEX举办的“第一届杭州西子质谱沙龙——大数据背景下的质谱组学研究”在春意盎然的西湖畔顺利落幕。来自复旦大学的特聘教授唐惠儒教授和西湖大学郭天南教授、浙江大学的徐飞教授和王保红教授等浙江省内30余位质谱专家学者莅临沙龙;来自SCIEX全球和中国区的领导也参加沙龙交流。 沙龙伊
植物磷酸化蛋白质组学技术研发方面获进展
蛋白质磷酸化是在激酶催化下将磷酸基团转移到底物蛋白质上的可逆过程,是能够调控蛋白质结构与功能且参与细胞内信号转导的重要翻译后修饰,在植物的生长、发育、环境适应以及作物的产量和品质调控中发挥着重要作用。深度解析磷酸化蛋白质组,是探讨磷酸化如何参与这些生物学过程以及筛选与作物重要农艺性状相关的关键磷
岛津携手质谱专家,北京共话组学发展
——2023北京质谱专家沙龙-组学专题会议2023年8月17日,岛津企业管理(中国)有限公司举办的“2023质谱专家沙龙-组学专题会议”在北京成功召开。会议旨在促进质谱及组学行业专业人士交流、学习与合作。来自于国内各大高校及科研院所的四十余位专家学者参加了本次会议。分析测试百科网为您报道精彩内容
马来酸酐二次衍生技术的定量蛋白质组学方法研究
基于马来酸酐二次衍生技术的定量蛋白质组学方法研究田姗姗1,柏雪1,翟贵金1,张锴*,1,张玉奎2(1天津医学表观遗传学协同创新中心,天津医科大学基础医学院,天津 3000702中国科学院大连化学物理研究所,国家色谱研究分析中心,辽宁省大连市 116023)摘要:定量蛋白质组学在当前生物医学研究中发挥
ASMS-2023丨布鲁克质谱新品继续引领单细胞蛋白质组学
MS/MS扫描速度提升至300Hz的timsTOF Ultra,进一步推进空间蛋白质组学和单细胞多组学;新型离子源和微升流喷雾针、采集方法和软件带来更稳定、更灵敏、更快速的4D-蛋白质组学 01.timsTOF Ultra 质谱仪 timsTOF Ultra PASEF扫描速度提高至300
Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行
【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节,第一个是样品的处理阶段,这是最简单,也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分,使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分,这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的
大连化物所蛋白质组学研究取得进展
蛋白质甲基化是一种非常重要的翻译后修饰现象,其甲基供体为S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。由于甲基化可发生在氨基酸残基的N-,O-和S-中心,并且N-中心甲基化还存在不同状态,同时甲基化对分离行为影响非常细微,限制了对蛋白质甲基化组的解析。常规基于抗体的研究策略仅捕获了部分N-中心甲基化的信息。中国科
质谱+组学打出完美combo,张峰团队毒性评价取得新进展
近日,中国检科院张峰首席专家团队在毒性快速评价研究领域取得科研新进展,构建了一种基于脂质组学和离子淌度质谱的真菌毒素侵染细胞评价模型。 真菌毒素及其次级代谢产物种类繁多,分布广,毒性强,并可通过食物链累积和传递,严重威胁着人类健康。目前,真菌毒素的毒性评价主要采用体内模型和体外模型开展,体内模
第一届AI蛋白质组学技术研讨会暨易算生物第一代易肽蛋白质组学质谱前处理机器人发布研讨会
诚挚邀请尊敬的朋友们: 蛋白质组学作为与疾病表型直接关联的生物大分子,已经成为最常用的临床诊疗标志物之一,研究蛋白质组能够帮助我们理解疾病的发生机制、发展新的治疗方法和诊断工具。而质谱技术在特异性、灵敏度、多指标同时检测上所具备的显著优势使其特别适于复杂生物样本的分析检测,为疾病的发生机制、筛选生
蛋白质组学几种定量方法的案例解读(三)
经典案例题目:Proteome-wide Mapping of Cholesterol-Interacting Proteins in Mammalian Cells(采用甾醇探针结合SILAC定量技术在哺乳动物细胞中分析胆固醇-蛋白质相互作用)期刊:Nat Methods主要技术:SILAC定量文
定量蛋白质组学揭开巨噬细胞活化的秘密
巨噬细胞活化是许多疾病发展过程中的关键步骤,包括动脉疾病。最近,布莱根妇女医院和哈佛医学院的研究人员通过蛋白质组学及其他分析,强调了PARP9和PARP14在调节巨噬细胞活化中的作用。这项成果发表在《Nature Communications》上。布莱根妇女医院的Masanori Aikawa及其同
蛋白质组学几种定量方法的案例解读(二)
经典案例题目:A tumour suppressor network relying on the polyamine-hypusine axis(一种基于多胺Hypusine轴(Polyamine-hypusine axis)的新型肿瘤抑制网络)期刊:Nature主要技术:iTRAQ定量文章摘要:
探索蛋白质组学新境界——第一届AI蛋白质组学技术研讨会召开
2023年11月17日,上海易算生物科技有限公司与复旦大学生物医学研究院联合举办第一届AI蛋白质组学技术研讨会-暨易算生物第一代易肽蛋白质组学质谱前处理机器人发布研讨会。研讨会邀请了多位业内专家、学者,分享临床蛋白质组学大队列研究最新进展。易算生物同时为参会专家老师介绍第一代易肽蛋白质组学质谱前
聚焦药物和蛋白-质谱技术创新开发临床应用研讨会落幕
分析测试百科网讯 2018年7月6日,由上海市徐汇区中心医院/复旦大学附属中山医院徐汇医院,中国科学院上海临床研究中心,上海市徐汇区医学会共同主办,分析测试百科网承办的“质谱技术的创新开发及临床应用研讨会”在上海市徐汇区中心医院召开(相关链接:聚焦质谱技术创新开发与应用 拓展临床质谱方法学研究)
质谱在蛋白质组学中的应用实验
实验材料 冷冻干燥样品试剂、试剂盒 校准标准品基质溶液甲醇仪器、耗材 MALDI 质谱仪MALDI 板实验步骤 1.吸取 0.5ul 的基质溶液,加到 MALDI-MS 分析所用的金属样品板上的样品孔中(为了准确起见,请使用2ul 的移液器)。2.在基质干燥之前,迅速加入 0.5ul 的标准品或样品
质谱在蛋白质组学中的应用实验
方案1 蛋白质和多肽 MALDI-MS 分析的一般方法 方案2 反相微型层析柱的制备实验 方案3 固定化酶微型层析柱的制备 方案4 用于蛋白质组分析的微毛细管 HPLC 色谱及 ESI —体化装置的制备和使用 方案5 利用 Nano-LC
Nature年度技术:定向蛋白质组学
时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,此前出版的《Nature》杂志也对2012年进行了回顾,评点了2012年的科技进展,科技政策以及重要人物,中国科学家王俊入选了人物篇。同时《Nature Methods》也盘点了今年与明年的技术热点,选出了2012年度技术成果:定向蛋白质组学(targe
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大多数疾病并不是
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。 自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大
蛋白质组学新进展:关键技术和人工智能
蛋白质组学是关于蛋白质组的研究,这是一个不断发展的领域。它提供了对支撑细胞、组织和整个生物体内生物状态的分子过程的全面理解。科学研究的各个领域,包括人类、动物和植物生物学、个性化医学和法医学,都在快速发展的过程中,这主要归功于蛋白质组学技术、数据处理能力和数据共享方面的进步。在这篇文章中,我们将探讨
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(一)
在疫情逐步可控的情形下,一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示,新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,
1200万!南京农业大学采购单细胞蛋白质组学质谱
近日,南京农业大学发布2022年11月政府采购意向,计划以1200万元预算采购单细胞蛋白质组学质谱。详情如下:单细胞蛋白质组学质谱项目所在采购意向:南京农业大学2022年11月政府采购意向采购单位:南京农业大学采购项目名称:单细胞蛋白质组学质谱预算金额:1200.000000万元(人民币)采购品目:
质谱MRM技术定量分析与应用
质谱多反应监测(multiple reaction monitoring, MRM)技术作为一种质谱检测的分析方法,具有特异性强、灵敏度高、准确度高、重现性好、线性动态范围宽、自动化高通量的突出优点,这些特质能够满足今天很多研究领域的迫切需要。通过MRM技术进行实时的定量监测可以进行药代动
多维液相色谱质谱技术用于代谢组深度覆盖研究获进展
近日,中国科学院大连化学物理研究所高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)在利用多维液相色谱-质谱技术用于代谢组深度覆盖研究中取得新进展,相关研究结果被Analytical Chemistry杂志收录。 酰基辅酶A是一类重要的代谢物,在许多生物过程中发挥作用。由于其性质差异较大,很难用一种
医科院基础所选择TripTOF-5600开展蛋白质组学研究工作
中国医科院基础研究所是我国国内较早开展临床蛋白质组学研究的科研单位之一,从2002年起致力于蛋白质组学研究方法的开发和临床蛋白质组学研究工作,先后开发了质谱数据分析软件AMASS、快速微波辅助样品处理技术和细胞分泌蛋白分析技术,
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan s