定量蛋白质组表达谱分析技术——iTRAQ／TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签，通过特异性 标记多肽的氨基基团，然后进行串联质谱分析，可同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量。iTRAQ/TMT试剂由三部分组成：报告基团、平衡基团和反应基团。反应基团形成2-10种等质量同位素标签。iTRAQ/TMT试剂标记酶解后的肽段，可与氨基酸N端及侧链的伯胺基团发生反应。在一级谱图中，来自于不同样本的同一肽段，标记后表现为相同的质荷比。在二级谱图中，报告基团、平衡基团和反应基团之间的键断裂，带不同同位素标签的同一肽段产生质量不同的报告离子，根据报告离子的丰度可获得样本间相同肽段的定量信息，再经过软件处理得到蛋白质的定量信息。其基本原......阅读全文
质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人激动
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（四）
无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（二）
同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有
蛋白质组学质谱分析
Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la
蛋白质组学几种定量方法的案例解读（三）
经典案例题目：Proteome-wide Mapping of Cholesterol-Interacting Proteins in Mammalian Cells（采用甾醇探针结合SILAC定量技术在哺乳动物细胞中分析胆固醇-蛋白质相互作用）期刊：Nat Methods主要技术：SILAC定量文
iTRAQ技术研究植物胁迫
Comparativeproteomic analysis of the shoot apical meristem in maize between aZmCCT-associated near-isogenic line and its recurrent parent.文献来源：htt
蛋白质组学几种定量方法的案例解读
上期分享的蛋白组学内容，是不是有些小伙伴还绕在云里雾里呀？这次，小编用实例说话，帮您梳理清楚。 一、Label-free定量 Label-free定量，顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化
质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人
南师大王文组：从蛋白质组分析颤抖病螺原体与蟹的互作
中华绒螯蟹（Eriocheir sinensis ）在中国是一种重要的淡水养殖甲壳类水产。然而，细菌，病毒和寄生虫的大量存在已威胁到E. sinensis养殖的可持续发展，并严重影响其商业化生产。颤抖病（TD）是引起E. sinensis最严重的毁灭性疾病之一。颤抖病螺原体（Spiroplasm
定量蛋白质组学的诞生
在现代研究技术，如荧光显微镜，流式细胞仪和蛋白质芯片技术中，抗体仍然扮演着非常重要的角色。但依赖于抗体的蛋白质检测存在一些缺点，其中最大的限制就是，抗体的可用性和质量差别很大。一些大规模项目，比如人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas），Antibodypedia，以及美国NIH
定量蛋白质组学方法分类
1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律（特别是疾病防治和病理研究）已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究，识别功能模块和路径，监控疾病的生物标志物，这些研究都
赛默飞世尔科技“蛋白质组学解决方案”网络视频讲座
3月30日下午，赛默飞世尔科技蛋白质组学市场专员唐佳向大家作了题为《蛋白质组学研究方法和Thermo蛋白质组学解决方案》的报告
免疫方向研究思路
在“蛋白组学在临床科研中的应用”这一系列的文章中，我们分享了眼科、内分泌、心血管、神经等方面的研究思路。今天我们来介绍一个非常重要的，并且离不开蛋白质组学研究的一个学科——免疫方向的科研套路，哦不，是思路。话不多说，满满干货！ 第一篇， 强直性脊椎炎杂志：Cts-Clin Transl S
免疫方向研究思路精选！
在“蛋白组学在临床科研中的应用”这一系列的文章中，我们分享了眼科、内分泌、心血管、神经等方面的研究思路。今天我们来介绍一个非常重要的，并且离不开蛋白质组学研究的一个学科——免疫方向的科研套路，哦不，是思路。 话不多说，满满干货！ 第一篇， 强直性脊椎炎 杂志：Cts-Cli
定量蛋白质组学方法分类介绍
【蛋白研究系列专题】-4丨定量蛋白质组学方法，您值得拥有 1 背景和意义 从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律（特别是疾病防治和病理研究）已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下
Q－Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome－Di...（一）
Q Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome Discoverer2.1数据处理方法Xiaoyue Jiang1, Tabiwang Arrey2, Eugen Damoc2, Michaela Scigelova2, David Horn1, Rosa Viner1, an
免疫方向研究思路精选！
在“蛋白组学在临床科研中的应用”这一系列的文章中，我们分享了眼科、内分泌、心血管、神经等方面的研究思路。今天我们来介绍一个非常重要的，并且离不开蛋白质组学研究的一个学科——免疫方向的科研套路，哦不，是思路。 话不多说，满满干货！ 第一篇， 强直性脊椎炎 杂志：Cts-Cli
重组蛋白质的表达、纯化、复性和定量
重组蛋白质的表达、纯化、复性和定量按Qiagen公司的操作手册进行，具体步骤如下。一、重组蛋白质的诱导表达1.挑取转化有质粒的单菌落，接种于3ml 选择性LB液体培养基中，37 oC，250 rpm/min振摇培养过夜。2.次日将培养过夜的菌液500 μl再接种于10 ml（1:20）选择性LB液体
重组蛋白质的表达、纯化、复性和定量
一、重组蛋白质的诱导表达1.挑取转化有质粒的单菌落，接种于 3ml 选择性 LB 液体培养基中，37 oC，250rpm/min 振摇培养过夜。2. 次日将培养过夜的菌液 500 μl 再接种于 10 ml（1:::20）选择性 LB 液体培养基中，37 oC，250 rpm/min 振摇培养至光密
强强联合（脂质组+DIA），IF>10（一）
脂质组学技术 相比其他组学技术，脂质组学技术发展较晚，新颖性高，仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。DIA技术 新一代、革命性的蛋白质组技术DIA,相比传统的蛋白质组技术（shotgun，Label fr
环渤海色质谱学者精彩报告纷呈－贯彻“绿色化学”理念
分析测试百科网讯 2016年8月11日，由辽宁省分析测试协会，辽宁省分析科学研究院主办的“第四届环渤海色质谱学术报告会暨辽宁省第十届学术年会分会”在丹东召开（相关报道：第四届环渤海色谱质谱学术会在丹东开幕 首次发布徽标）。大会上，众位环渤海的
定量蛋白质组学的研究内容
1.蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。 2.翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化，糖基化，酶原激活等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，因此对蛋白质翻译后修饰的研究对
蛋白质组学几种定量方法的案例解读（一）
一、Label-free定量Label-free定量，顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化，通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free技术又可分为基于谱图数（Spectra Co
中科院：蜡样芽孢杆菌降解孔雀石绿？蛋白组学分析机制
导读 孔雀石绿（MG）作为一种染料的广泛应用引起了人们的广泛关注。蜡样芽孢杆菌能对抗MG的毒性作用，并能有效地对MG进行脱色。然而，基于蛋白质组学数据的关于其潜在适应和降解机制的详细信息却很少。本研究采用等压相对和绝对定量标记（iTRAQ）辅助定量方法，分析了蜡样芽孢杆菌降解MG的分子机制。在
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗力，不
李兰娟院士新成果：唾液乳杆菌LI01的胆汁应激反应
最近发现几种唾液乳杆菌菌株，表现出良好的益生菌性质，如抗菌活性，炎症调节，甚至是肿瘤性病变减少等。从健康人体内分离的唾液乳杆菌LI01已经在预防和治疗肝衰竭中表现出了益生菌性质。对胆汁的耐受对于乳杆菌在胃肠道中的存活和发挥其益处至关重要。 在这项研究中，浙江大学附属第一医院的李兰娟院士所在课题
张玉奎院士：蛋白质组定量新技术新方法研究
中国科学院大连化学物理研究所 张玉奎院士 2014年4月26日，首届全国质谱分析学术研讨会在北京西郊宾馆盛大开幕。来自中国科学院大连化学物理研究所的张玉奎院士为大家带来题为《蛋白质组定量新技术新方法研究》的报告。 通过对特定生物样本所有蛋白质在不同状态下