COLDPCR和HRM结合应用于癌症基因低水平未知突变
研究背景:癌症中体细胞分子层面的突变,常常需要在大量野生型DNA中辨识低浓度的DNA突变。但是,突变检测方法的选择率和灵敏度常常限制了鉴定低浓度突变的可靠性。最近开发的COLD-PCR(低变性温度下的复合扩增,李等人。2008)解决了低含量基因突变检测的一些局限性,在PCR扩增过程中利用关键变性温度丰富含有突变的扩增子,不论突变位于序列的什么地方。COLD-PCR的一个主要属性是富集突变体以便于在PCR后的直接测序。然而碱基测序仍然是昂贵的选择,从而通过高通量扫描序列预检是有吸引力的办法。高分辨率融解(HRM)是一种可用于预筛查测序之前未知突变的技术,但不能确定具体的检测基因突变的身份。因此,为了富集、快速筛查和鉴定低浓度的未知突变,我们把HRM突变扫描和COLD-PCR相结合,随后进行已知突变的直接测序鉴定。方法:一系列稀释的HCC2157细胞系和SW480 (ATCC)细胞雄株基因组DNA准备用于评估方法的灵敏度。TP53基......阅读全文
COLDPCR和HRM结合应用于癌症基因低水平未知突变
研究背景:癌症中体细胞分子层面的突变,常常需要在大量野生型DNA中辨识低浓度的DNA突变。但是,突变检测方法的选择率和灵敏度常常限制了鉴定低浓度突变的可靠性。最近开发的COLD-PCR(低变性温度下的复合扩增,李等人。2008)解决了低含量基因突变检测的一些局限性,在PCR扩增过程中利用关键变性温度
Transgenomic获ICE-COLDPCR独家使用权
分析测试百科网讯 ICP(ICE COLD-PCR™)有可能成为精准医疗中癌症筛查和诊断的重要工具。 一个全球性的生物技术公司——Transgenomic公司,其优势在于利用先进的诊断测试盒和床研究服务来发展精准医疗,2015年12月23日宣布获得了一个由美国国立卫生研究院(NIH)资助的为
高通量、低成本SNP、突变或甲基化检测方法—HRM-技术应用
HRM 介绍HRM 技术是high-resolution melting analysis 即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的PCR 技术,HRM 不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR 结束后直接运行高分辨熔解,即
高通量、低成本-SNP、突变和甲基化检测方法-——HRM技术应用
HRM介绍 HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高分
高通量、低成本-SNP、突变和甲基化检测方法-——HRM技术应用
HRM介绍 HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高
-Science:利用RNAi揭示与癌症发展相关的未知基因
近日,发表在Science杂志上的一篇研究论文中,科学家们发现某些基因缺失与肿瘤生长之间的一种前所未知的联系。研究小组利用RNAi,发现以前未知的遗传基因缺失与癌变肿瘤的相关性。 在过去的几年里,科学家已经了解到,基因在癌症发展中产生了比人们以前认为的更大的作用。在这项新研究中,研究小组使
Science:RNAi活体研究揭示癌症发展的未知相关基因
由美国霍华德休斯医学研究所和西奈山伊坎医学院的研究人员组成的研究团队发现,在缺失基因和肿瘤生长之间存在一种以前未知的关系。在2014年1月17日的《Science》杂志上发表的这项研究中,研究团队描述了利用RNAi技术进行的研究,以及如何发现癌变肿瘤的一个以前未知的遗传关联。 在过去的几年
数字PCR,LunaProbesTM和MAAB相结合可以检测到低于0.01%的...
数字PCR,LunaProbesTM和MAAB相结合可以检测到低于0.01%的等位基因的突变数字PCR,LunaProbesTM和MAAB相结合可以检测到低于0.01%的等位基因的突变Matt Poulson, Jason McKinneyIdaho Technology, Inc. Salt La
高分辨率熔解曲线(HRM)分析预混Mix(PCR),能基因筛查吗?
高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)是一种基于单核苷酸熔解温度不同而形成不同形态熔解曲线的基因分析新技术,具有极高的敏感性,可以检测出单个碱基的差异。 作为一种高效稳健的"post-PCR"技术,它不受突变碱基位置与类型的限制,无需序列特异性探针,在PCR结
Science探索癌症的未知世界
由耶鲁大学领导的一个研究小组,通过对人类自然遗传变异和癌肿瘤变异进行海量数据分析,揭示了数十个乳腺癌和前列腺癌形成过程中的突变。研究结果发表在10月4日的《科学》(Science)杂志上。 新发现的这些突变均位于不编码蛋白质但却能影响其他基因活性的DNA区域。科学家们认为,这些区域代表了一
早期检测结肠癌的无创新方法
在这一期的《Cancer Prevention Research》杂志,一个德国团队介绍了一种高度灵敏的方法,能够检测引发结肠癌的遗传变异,从而有望实现无创的结肠癌筛查。 据文章的通讯作者,德国波茨坦大学的助理教授Bettina Scholtka博士介绍,携带遗传变异的癌前细胞会释
Nat-Commun:癌症——基因突变的起源
DNA的复制是细胞分裂的前提。但是,在存在某些破坏性成分的情况下,细胞将无法很好地执行相关操作,复制过程将变得更加缓慢且效率较低,这种现象称为“复制压力”。虽然已知“复制压力”与遗传突变的增加有关,但至今仍不清楚起作用的确切机制。 最近,日内瓦大学(UNIGE)的研究人员阐明了在“复制压力”下
基因突变检测指导癌症靶向治疗
肺癌和结直肠癌近年来已成为大多数国家癌症死亡的主要原因。由于个体遗传基因存在差异性,不同类型的癌症患者选择适合的靶向治疗药物或能取得预期的疗效,基因突变检测为医生提供了重要参考信息。中国国家食品药品监督管理局日前批准由瑞士罗氏诊断研发的cobas EGFR/KRAS基因突变检测技术用于临床基因突
《科学》重点文章:癌症与基因突变
生物通报道:来自霍德华休斯医学院,Ludwig癌症遗传与治疗中心(the Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics)以及约翰霍普金斯凯门综合癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Comprehensive Cancer Cen
最新研究可检测癌症组织中的基因融合和碱基突变
靶向治疗和免疫检查点抑制剂治疗目前已显著改善了肿瘤患者的生存率,而新型疗法的有效运用往往需要依赖于对基因变异的准确检测。当前的研究表明,诸如NTRK(神经营养因子受体酪氨酸激酶)等罕见的融合变异事件能有效地驱动肿瘤发生,并成为多种肿瘤中靶向治疗的靶标。基于DNA检测的大Panel可以覆盖几百个
SNP检测——HRM技术应用
HRM技术服务之SNP检测(snp检测的最佳方案) 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指单个核苷酸碱基的改变,包括置换、颠换、缺失和插入,导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一
美国首例!CRISPR基因编辑技术应用于癌症治疗
据美联社报道,美国宾夕法尼亚大学肿瘤学教授通过CRISPR基因编辑工具对三名晚期癌症的血细胞进行基因改造,医生从患者血液中提取出免疫系统细胞,对其进行基因改造以帮助患者对抗癌症。这是美国首次尝试使用CRISPR基因编辑治疗癌症。Edward Stadtmauer博士 这三名患者已经年过六旬,其
高分辨熔解曲线突变检测
高分辨熔解曲线(High Resolution Melting)技术是近年来兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨熔解,即可完成对样品的分析。该方法与其他遗传分型技术相比具有灵敏度高、特异性好、成本低廉
数字PCR和HRM在肿瘤样本中的应用
摘要:Vogelstein和Kinzler(美国国家科学院院刊,1999年)第一次描述了Digital PCR(dPCR)的概念,一种在微量细胞群中(如原发性肿瘤组织)鉴定突变的方法。通过稀释样品DNA到一个单个分子水平,它可以把PCR自然模拟指数转化为数字信号。当PCR成功的扩增出这些单个
通过纳米技术和基因工程的最佳结合来调节癌症干性
由于抗药性的出现,癌组织靶向性差和随后的转移,具有选择性抗癌活性的化学治疗剂的开发越来越缺乏吸引力。在肿瘤特征性细胞类型中,癌症干细胞越来越多地与癌症进展和转移相关,反映出自我更新及其进入循环的倾向。 日本高级科学技术研究院(JAIST)的科学家们通过将纳米技术和称为“光热遗传学”的基因工程相结合,
SNP检测——HRM技术应用
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指单个核苷酸碱基的改变,包括置换、颠换、缺失和插入,导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,这就是SNP。SNP在人类
基因突变让端粒失控 促发癌症
近日,来自威斯达研究所的研究人员揭示了保护端粒(我们染色体末端结构)的部分蛋白复合物的结构,相关研究成果发表在 Nature Communications 上,该研究解释了与这个蛋白复合物相关的一组基因突变如何促进一系列癌症。 端粒是染色体末端的保护性结构,对人体基因组的复制和保护至关重要。端
NCCN增加女性癌症新基因突变检测
据医脉通报道,第21届美国国家综合癌症网络(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)年会近日在好莱坞召开,会议增加了几个针对乳腺癌和卵巢癌遗传风险管理的新基因突变检测。 最近的研究发现PALB2基因突变与乳腺癌侵袭性相关,而RAD51C、RAD
甲基化检测——MSHRM技术
HRM技术服务之甲基化检测(MS-HRM技术) DNA甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3'双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状
基因重组和基因突变区别
1、基因突变是基因的从无到有,突变产生新基因。基因重组是原有基因的重新组合,产生的是新基因型。2、发生的时间:基因重组发生的时期是:减数分裂中四分体时期同源染色体的非姐妹染色单体之间的局部交换和减数diyi次分裂后期非同源染色体的而重新组合;基因突变发生的时间是在有丝分裂和减数分裂的间期。
454测序识别早期HIV耐药性突变低水平突变对临床结果重大
回顾性研究分析表明即使最低水平的耐药性突变也会导致早期治疗失败 2月17日《传染病杂志》(Journal of Infectious Disease)在线公布的一项研究称HIV病毒群体中少至1%的HIV耐药性突变会对临床结果产生显著影响。这篇论文由罗氏旗下454生命科学公司与耶鲁大学医
单一基因不仅和糖尿病有关,突变体还会诱发癌症!
最近,来自牛津大学和萨里大学的研究人员通过研究发现,单一基因的突变或许就能对人类机体的面部特征产生较大的影响,近年来科学家们进行了大量研究都发现单一基因在人类多种疾病的发生上扮演着关键角色,本文中,小编对相关研究进行了整理,分享给大家! 【1】Science:单一基因或可驱动前列腺分化 do
基因突变和修复的完美平衡可以帮助我们对抗癌症
谢菲尔德大学的研究人员已经发现了保持我们DNA损伤和修复的完美平衡的机制,这将有助于提高肿瘤化疗的成功率并对抗衰老相关的神经衰退。图片来源:CC0 Public Domain 我们的基因组每天面临着数千次破坏的风险。但是细胞会产生一组蛋白质负责寻找、检测并修复这些损伤,以维持基因组完整性,但是
罗氏NimbleGen综合性癌症基因捕获进行全面癌症突变检测
个人化癌症治疗是癌症治疗的发展方向与研究热点,相关的各种分子检测方案的发展迅猛。美国一个癌症中心开发了一个两步法方案用于指导药物选择、选择合适的患者参加药物临床实验。 这两步检测法包括:第一步,对少量癌症基因的突变热点进行测序,这些基因通常有较为明确的针对性治疗方案或者靶向药物,此作为快速的初步筛
-利用肿瘤细胞的基因突变制备癌症疫苗
个性化疫苗为治疗多对基因突变引发的癌症提供新的选择。 在一个小型临床试验中,利用在肿瘤细胞中的突变蛋白所制备的疫苗成功地引发了机体对癌细胞的免疫应答反应。 该结果是目前致力于研发个性化癌症治疗所得出的最新成果,并公布于4月2日的科学(Science)杂志中。在此次试验中,三位恶性黑色素瘤患者