高分辨熔解曲线突变检测

高分辨熔解曲线(High Resolution Melting)技术是近年来兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨熔解,即可完成对样品的分析。该方法与其他遗传分型技术相比具有灵敏度高、特异性好、成本低廉、高通量检测的优点,是进行突变检测的迅速、廉价而有效的方法。HRM原理HRM是在PCR基础上通过测定DNA双链熔解曲线变化来检测突变的方法,溶解曲线的变化取决于DNA序列、长度、GC含量,因此,可以通过饱和燃料监控熔解曲线的变化来反映核酸性质的差异,从而对样品进行分析。在双链体的溶解曲线检测时需要添加合适的染料,饱和染料例如SYBR Green在双链解链过程中会发生重排,无法真实反映DNA熔解情况。不适用于需低温解链的样品而且不能检测异源双链体。因此不能用于熔解曲线的检测。而LC Green是一种与DNA有更强的结合位点,对P......阅读全文

高分辨熔解曲线突变检测

高分辨熔解曲线(High Resolution Melting)技术是近年来兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨熔解,即可完成对样品的分析。该方法与其他遗传分型技术相比具有灵敏度高、特异性好、成本低廉

高分辨熔解曲线法HRM实现基因分型

HRM实现基因分型基因分型在动物、植物、微生物的物种、菌种筛查、筛选、缺陷、突变基因的检测,根据个体基因类型实现对诸如癌症治疗、监测等的精准用药,以及消费类基因检测如酒精代谢能力基因检测等等领域有很多应用。通常,基因分型SNP采用荧光探针终点法,检测一个位点需要两个荧光探针,如一个探针的荧光报告基团

农业领域中的应用高分辨熔解曲线分析技术

高分辨熔解曲线分析技术(High Resolution Melting Curves Analysis)是近年来发展起来的一种检测基因突变和刷选SNP的新方法。这种方法也可以与标记和非标记探针结合对已知位点的突变和SNP进行检测以及用于SSR(STR)等短串联重复分子标记分析。该技术已经被大

甲基化的高分辨率熔解曲线法

  在非CpG岛位置设计一对针对亚硫酸氢盐修饰后的DNA双链的引物,这对引物中间的片段包含感兴趣的CpG岛。若这些CpG岛发生了甲基化,用亚硫酸氢盐处理后,未甲基化的胞嘧啶经PCR扩增后转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,样品中的GC含量发生改变,从而导致熔解温度的变化。

高分辨熔解曲线方法检测不同的DNA杂合体(一)

高分辨率熔解曲线方法检测不同的DNA杂合体文章来源:Clinical Chemistry 51, No. 7, 2005Distinguishing Different DNA Heterozygotes by High-Resolution Melting, Robert Graham,1 Mic

高分辨熔解曲线方法检测不同的DNA杂合体(二)

高分辨熔解技术对于区分相同扩增子内的不同的杂合体是必要的。与高分辨率的HR-1分析方法相比,LightCycler产生的熔解曲线并不能保证分离出杂合子。如图1所示,根据各自的4 对Tm值, 每个杂合子描绘出一条独特的熔解曲线。这些独特的熔解曲线的形状通过标准化的温度移位数据,以不同的图形形式表现出来

高分辨率熔解曲线的dna浓度影响结果么

用Syber Green方法做完PCR后,用来判断产物是否相对专一。反应结束后,逐渐加温。和Syber Green分子结合的PCR产物随温度升高逐渐变为单链,就不能在和Syber Green结合。一般每加温一度,读一次信号。当温度到达PCR产物的Tm时,产物解离一下增多。曲线的横坐标是温度,而纵坐标

高分辨率熔解曲线分析甲基化研究应用

高分辨率熔解曲线分析甲基化研究应用—表观遗传学中检测CpG位点的一种新技术甲基化敏感性高分辨率熔解曲线分析(MS-Hi-Res Melting®)是一种不需要PCR产物后续操作的,简单且灵敏的检测基因甲基化水平的方法。该方法主要通过比较曲线的熔解温度和峰形得以实现。该方法可以在一系列的CpG位点

什么是PCR熔解曲线法

PCR熔解曲线分析法是做realtime-pcr时分析,用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物的分析方法。原理是在扩增反应完成后,通过逐渐增加温度的同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低,用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图,在

什么是PCR熔解曲线法

PCR熔解曲线分析法是做realtime-pcr时分析,用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物的分析方法。原理是在扩增反应完成后,通过逐渐增加温度的同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低,用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图,在

什么是PCR熔解曲线法

PCR熔解曲线分析法是做realtime-pcr时分析,用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物的分析方法。原理是在扩增反应完成后,通过逐渐增加温度的同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低,用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图,在

高分辨率熔解曲线法检测DNA的甲基化

在非CpG岛位置设计一对针对亚硫酸氢盐修饰后的DNA双链的引物,这对引物中间的片段包含感兴趣的CpG岛。若这些CpG岛发生了甲基化,用亚硫酸氢盐处理后,未甲基化的胞嘧啶经PCR扩增后转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,样品中的GC含量发生改变,从而导致熔解温度的变化。

通过温度内标提高高分辨熔解曲线中纯合子检测...(一)

通过温度内标提高高分辨熔解曲线中纯合子检测的灵敏度摘要应用高分辨率熔解曲线技术进行基因分型不仅简单而且有效。基于熔解曲线的分析方法中,探针法是进行基因分型的金标准,能够全面的检测匹配的目的等位基因。小片段扩增法是一种不需要设计探针进行基因分型的方法。由于异源双链的存在,杂合子很容易检测,而这很大程度

通过温度内标提高高分辨熔解曲线中纯合子检测...(二)

表1  比较每个目的基因使用温度内标前后四个重复的Tm。在所有情况下,校准后差异降低。可以看出,校准后标准差和非感兴趣区域差异都降低。                                                    表1.校准对Tm值影响的统计表1. 每个重复盘包含了相同设

高分辨率熔解曲线法检测甲基化的相关介绍

  在非CpG岛位置设计一对针对亚硫酸氢盐修饰后的DNA双链的引物,这对引物中间的片段包含感兴趣的CpG岛。若这些CpG岛发生了甲基化,用亚硫酸氢盐处理后,未甲基化的胞嘧啶经PCR扩增后转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,样品中的GC含量发生改变,从而导致熔解温度的变化。

高分辨率熔解曲线(HRM)分析预混Mix(PCR),能基因筛查吗?

  高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)是一种基于单核苷酸熔解温度不同而形成不同形态熔解曲线的基因分析新技术,具有极高的敏感性,可以检测出单个碱基的差异。 作为一种高效稳健的"post-PCR"技术,它不受突变碱基位置与类型的限制,无需序列特异性探针,在PCR结

定量PCR熔解曲线为何不止一个主峰

最主要的原因:1.有非特异性产物2. 有引物2聚体。建议你重新设计引物。而且目前SYBR GREEN的方法已经逐渐被淘汰了,最好改用probe-primer 的方法来做。

定量PCR熔解曲线为何不止一个主峰

1.引物设计不够优化。应避免引物二聚体和发夹结构的出现。2.引物浓度不佳。适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。3.镁离子浓度过高。适当降低镁离子浓度,或选择更合适的mix试剂盒。4.模板有基因组的污染。RNA提取过程中避免DNA的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。

荧光定量PCR熔解曲线出现多峰是什么原因?怎么解决?

较为理想的熔解曲线是单峰曲线,如出现多峰有以下原因:    1)非特异性扩增:主要原因为引物特异性不好、Tm值较低或模板质量不高,可以根据设计原则设计新引物或者通过梯度 PCR 对引物退火温度(Tm值)进行优化,上调Tm值,选购质量较好的离心柱法核酸提取试剂,提高核酸提取质量,等等。    2)引物

甲基化敏感性高分辨率熔解(MSHRM)

DNA 甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3‘双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲基

甲基化敏感性高分辨率熔解(MSHRM)

DNA 甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3‘双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲基胞嘧

甲基化敏感性高分辨率熔解(MSHRM)

DNA 甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3‘双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲基胞嘧

多个序列突变的筛查HRMA(二)

突变检测    高分辨熔解曲线分析已用于DNA序列突变的检测,是第一个用于基因分型中的技术[Wittwer等,2003]。简便、廉价、容易使用、高灵敏性和高特异性是它的突出特点,使它成为一种用于基因分型和诊断应用实验室中有吸引力的新工具。在萨普,表S1给出了我们所能找到的基于人类基因的实验。高分辨熔

多个序列突变的筛查HRMA(一)

摘要:双链DNA分子转化为两个单链分子,DNA分子变性或熔解用于研究DNA结构和组成已经有多年。最近,新技术的进步提高了这种技术的潜力,尤其是用于DNA序列突变的检测。通过饱和DNA染料的发展和设备的改善,熔解的灵敏度和特异性有了很大的提高(改良的温度精确地结合每个时间单位温度的精确测量)。熔解分析

高分辨质谱到底“高”在哪里?

  高分辨质谱  用低分辨质谱测定时,分子的质量数都是整数表示,如CO、N2、C2H4和CH2N的质量都是28。如果用高分辨质谱测定就能得到如C2H4=28.031299,CH2N=28.018723,因此,根据高分辨质谱所测得的精密质量就可以对结构加以剖析和区别  小分子化合物确定结构式有多种方法

甲基化检测——MSHRM技术

DNA甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3'双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲

甲基化检测——MSHRM技术

  HRM技术服务之甲基化检测(MS-HRM技术)    DNA甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3'双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状

应用非标记探针法进行基因分型(一)

RET原癌基因单个碱基的突变可以引发多发性内分泌腺瘤2型。RET突变传统的基因分型方法是外显子测序。一种闭管操作的基因分型方法已经成熟,此方法用的是一种饱和DNA染料,非标记探针及高分辨率熔解扩增子分析。此方法需要两个连续的聚合酶链式反应阶段,主要的和第二次实验。主要的实验共用7个反应和8个非标记探

LightCycler应用:甲基化分析

主要应用:应用实时荧光PCR技术进行快速准确的DNA甲基化分析DNA甲基化是表观遗传学的重要研究内容之一,它可以在转录水平抑制基因的表达。具体的过程是在胞嘧啶-鸟嘧啶(CpG二核苷酸)的5位碳原子上添加了一个额外的甲基团,形成5-甲基胞嘧啶。CpG二核苷酸密度较高的区域在人体基因组中呈非随机分布于,

引物的熔解温度与退火温度

primer的一个重要参数是熔解温度(Tm)。这是当50%的primer和互补序列表现为双链DNA分子时的温度.Tm对于设定PCR退火温度 是必需的。在理想状态下,退火温度足够低,以保证primer同目的序列有效退火, 同时还要足够高,以减少非特异性结合。合理的退火温度从55℃到70℃。退火温度一般