什么是PCR熔解曲线法

PCR熔解曲线分析法是做realtime-pcr时分析,用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物的分析方法。原理是在扩增反应完成后,通过逐渐增加温度的同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低,用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图,在扩增产物的溶解温度上有一特征峰(Tm,DNA双链解链50%的温度),因为它们在不同的温度溶解,所以用这个特征峰就可以将特异产物与其它产物如引物二聚体区分开。......阅读全文

什么是PCR熔解曲线法

PCR熔解曲线分析法是做realtime-pcr时分析,用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物的分析方法。原理是在扩增反应完成后,通过逐渐增加温度的同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低,用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图,在

什么是PCR熔解曲线法

PCR熔解曲线分析法是做realtime-pcr时分析,用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物的分析方法。原理是在扩增反应完成后,通过逐渐增加温度的同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低,用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图,在

什么是PCR熔解曲线法

PCR熔解曲线分析法是做realtime-pcr时分析,用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物的分析方法。原理是在扩增反应完成后,通过逐渐增加温度的同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低,用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图,在

定量PCR熔解曲线为何不止一个主峰

1.引物设计不够优化。应避免引物二聚体和发夹结构的出现。2.引物浓度不佳。适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。3.镁离子浓度过高。适当降低镁离子浓度,或选择更合适的mix试剂盒。4.模板有基因组的污染。RNA提取过程中避免DNA的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。

定量PCR熔解曲线为何不止一个主峰

最主要的原因:1.有非特异性产物2. 有引物2聚体。建议你重新设计引物。而且目前SYBR GREEN的方法已经逐渐被淘汰了,最好改用probe-primer 的方法来做。

高分辨熔解曲线突变检测

高分辨熔解曲线(High Resolution Melting)技术是近年来兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨熔解,即可完成对样品的分析。该方法与其他遗传分型技术相比具有灵敏度高、特异性好、成本低廉

荧光定量PCR熔解曲线出现多峰是什么原因?怎么解决?

较为理想的熔解曲线是单峰曲线,如出现多峰有以下原因:    1)非特异性扩增:主要原因为引物特异性不好、Tm值较低或模板质量不高,可以根据设计原则设计新引物或者通过梯度 PCR 对引物退火温度(Tm值)进行优化,上调Tm值,选购质量较好的离心柱法核酸提取试剂,提高核酸提取质量,等等。    2)引物

高分辨率熔解曲线(HRM)分析预混Mix(PCR),能基因筛查吗?

  高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)是一种基于单核苷酸熔解温度不同而形成不同形态熔解曲线的基因分析新技术,具有极高的敏感性,可以检测出单个碱基的差异。 作为一种高效稳健的"post-PCR"技术,它不受突变碱基位置与类型的限制,无需序列特异性探针,在PCR结

高分辨熔解曲线法HRM实现基因分型

HRM实现基因分型基因分型在动物、植物、微生物的物种、菌种筛查、筛选、缺陷、突变基因的检测,根据个体基因类型实现对诸如癌症治疗、监测等的精准用药,以及消费类基因检测如酒精代谢能力基因检测等等领域有很多应用。通常,基因分型SNP采用荧光探针终点法,检测一个位点需要两个荧光探针,如一个探针的荧光报告基团

农业领域中的应用高分辨熔解曲线分析技术

高分辨熔解曲线分析技术(High Resolution Melting Curves Analysis)是近年来发展起来的一种检测基因突变和刷选SNP的新方法。这种方法也可以与标记和非标记探针结合对已知位点的突变和SNP进行检测以及用于SSR(STR)等短串联重复分子标记分析。该技术已经被大

甲基化的高分辨率熔解曲线法

  在非CpG岛位置设计一对针对亚硫酸氢盐修饰后的DNA双链的引物,这对引物中间的片段包含感兴趣的CpG岛。若这些CpG岛发生了甲基化,用亚硫酸氢盐处理后,未甲基化的胞嘧啶经PCR扩增后转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,样品中的GC含量发生改变,从而导致熔解温度的变化。

高分辨熔解曲线方法检测不同的DNA杂合体(一)

高分辨率熔解曲线方法检测不同的DNA杂合体文章来源:Clinical Chemistry 51, No. 7, 2005Distinguishing Different DNA Heterozygotes by High-Resolution Melting, Robert Graham,1 Mic

高分辨熔解曲线方法检测不同的DNA杂合体(二)

高分辨熔解技术对于区分相同扩增子内的不同的杂合体是必要的。与高分辨率的HR-1分析方法相比,LightCycler产生的熔解曲线并不能保证分离出杂合子。如图1所示,根据各自的4 对Tm值, 每个杂合子描绘出一条独特的熔解曲线。这些独特的熔解曲线的形状通过标准化的温度移位数据,以不同的图形形式表现出来

pcr原始曲线和扩增曲线区别

扩增曲线可以粗略地判断扩增效率。SYBR Green的双delta Ct法要求目的基因和内参的扩增效率基本一致。如果不一致,需要对公式进行修正,部分qPCR仪的配套软件可以做到,直接输入每对引物的扩增效率。但无论如何,保证高扩增效率是实验成功的关键。如果扩增效率一致,不同Ct的曲线显示出来就基本是平

PCR异常曲线解析

在PCR实验过程中,我们经常会遇到各种奇特的扩增曲线,如何正确解读这些曲线并且做出恰当的解决方案是我们一线实验者需要练就的基本功。今儿,小编将多年累积的功力编成“武功秘籍”奉上,助你PK掉那些令人犯晕的异常曲线。异常曲线1:PCR扩增抑制原因分析:H07存在扩增抑制解决方案:将样本稀释后进行扩增(抑

高分辨率熔解曲线的dna浓度影响结果么

用Syber Green方法做完PCR后,用来判断产物是否相对专一。反应结束后,逐渐加温。和Syber Green分子结合的PCR产物随温度升高逐渐变为单链,就不能在和Syber Green结合。一般每加温一度,读一次信号。当温度到达PCR产物的Tm时,产物解离一下增多。曲线的横坐标是温度,而纵坐标

高分辨率熔解曲线分析甲基化研究应用

高分辨率熔解曲线分析甲基化研究应用—表观遗传学中检测CpG位点的一种新技术甲基化敏感性高分辨率熔解曲线分析(MS-Hi-Res Melting®)是一种不需要PCR产物后续操作的,简单且灵敏的检测基因甲基化水平的方法。该方法主要通过比较曲线的熔解温度和峰形得以实现。该方法可以在一系列的CpG位点

高分辨率熔解曲线法检测DNA的甲基化

在非CpG岛位置设计一对针对亚硫酸氢盐修饰后的DNA双链的引物,这对引物中间的片段包含感兴趣的CpG岛。若这些CpG岛发生了甲基化,用亚硫酸氢盐处理后,未甲基化的胞嘧啶经PCR扩增后转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,样品中的GC含量发生改变,从而导致熔解温度的变化。

通过温度内标提高高分辨熔解曲线中纯合子检测...(二)

表1  比较每个目的基因使用温度内标前后四个重复的Tm。在所有情况下,校准后差异降低。可以看出,校准后标准差和非感兴趣区域差异都降低。                                                    表1.校准对Tm值影响的统计表1. 每个重复盘包含了相同设

通过温度内标提高高分辨熔解曲线中纯合子检测...(一)

通过温度内标提高高分辨熔解曲线中纯合子检测的灵敏度摘要应用高分辨率熔解曲线技术进行基因分型不仅简单而且有效。基于熔解曲线的分析方法中,探针法是进行基因分型的金标准,能够全面的检测匹配的目的等位基因。小片段扩增法是一种不需要设计探针进行基因分型的方法。由于异源双链的存在,杂合子很容易检测,而这很大程度

高分辨率熔解曲线法检测甲基化的相关介绍

  在非CpG岛位置设计一对针对亚硫酸氢盐修饰后的DNA双链的引物,这对引物中间的片段包含感兴趣的CpG岛。若这些CpG岛发生了甲基化,用亚硫酸氢盐处理后,未甲基化的胞嘧啶经PCR扩增后转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,样品中的GC含量发生改变,从而导致熔解温度的变化。

pcr溶解曲线的峰值太低

横坐标是温度,每个温度点一个.一般从60到98度纵坐标是荧光强度的变化值(不是强度本身).一开始加热的时候,虽然荧光强度比较强,但是由于双链没有解离,所以荧光强度保持不变.当加热接近于PCR产物Tm时,双链开始解离,荧光强度变小,机器会比较前后2个温度点的荧光强度,然后把2者的差值标在图上.Tm到达

pcr扩增曲线呈波浪线

是real-time PCR吗?在复制循环刚开始的时候,荧光还很低,有波浪线很正常。在扩增曲线呈指数上升的时候,一般曲线就会很平滑了。在取阈值的时候,将阈值线取在指数上升的时期,就好了。如果整条线都是波浪形的话,那就是PCR失败了,原因需要你一一排查。

PCR溶解曲线要跑多久

一次pcr的时间不是固定的,要根据循环数决定。一般一次pcr需要70-90分钟,如果加上前面加样时间,一般两个小时左右。一般染料法定量pcr在进行完pcr后都要运行熔解曲线,一般设定先94度几分钟,然后骤冷到65度(假定65度为退伙温度).在65度时,pcr产物是以双链的形式存在的。因为染料是插到双

实时荧光曲线PCR曲线起峰较缓的原因

实时荧光曲线PCR曲线起峰较缓的原因。1,非特异性扩增:主要原因为引物特异性不好、Tm值较低或模板质量不高,可以根据设计原则设计新引物或者通过梯度PCR对引物退火温度(Tm值)进行优化,上调Tm值,选购质量较好的离心柱法核酸提取试剂,提高核酸提取质量,等等。2,引物二聚体可通过琼脂糖凝胶电泳确认引物

多个序列突变的筛查HRMA(一)

摘要:双链DNA分子转化为两个单链分子,DNA分子变性或熔解用于研究DNA结构和组成已经有多年。最近,新技术的进步提高了这种技术的潜力,尤其是用于DNA序列突变的检测。通过饱和DNA染料的发展和设备的改善,熔解的灵敏度和特异性有了很大的提高(改良的温度精确地结合每个时间单位温度的精确测量)。熔解分析

多色探针熔解技术有何潜力?

多色探针熔解曲线分析技术荧光PCR是应用最广的核酸检测平台。荧光PCR操作简单、闭管反应,可有效降低扩增产物污染,但一大缺点在于它所能检测的靶标数目有限。这也是荧光PCR在临床应用受到制约的重要因素,但随着多色探针熔解曲线分析技术的出现,却很好的解决了这个问题,即能够在保留荧光PCR优点的同时也能突

实时定量pcr扩增曲线怎么分析

Green的双deltaCt法要求目的基因和内参的扩增效率基本一致。如果不一致,需要对公式进行修正,部分qPCR仪的配套软件可以做到,直接输入每对引物的扩增效率。但无论如何,保证高扩增效率是实验成功的关键。如果扩增效率一致,不同Ct的曲线显示出来就基本是平行的位移,其倾斜程度基本一致。而如下图一样,

什么是realtimePCR溶解曲线

如图所示,这就是一个标准的real time-qPCR溶解曲线。下面从几个方面来解读:1、随着温度的升高,DNA双链断裂;接着温度降低,到达退火温度的时候,DNA双链复性,荧光分子绑定在DNA双链上,所以荧光信号值到达最高点。上面的是反映在扩增曲线上面的。2、接着DNA双链分子由退火温度约60度,继

pcr外部质控有几条扩增曲线

pcr扩增曲线四个阶段。_cr扩增曲线四个阶段为:基线期,指数增长期,线性增长期,平台期。聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加。