高分辨熔解曲线突变检测

高分辨熔解曲线(High Resolution Melting)技术是近年来兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨熔解,即可完成对样品的分析。该方法与其他遗传分型技术相比具有灵敏度高、特异性好、成本低廉、高通量检测的优点,是进行突变检测的迅速、廉价而有效的方法。HRM原理HRM是在PCR基础上通过测定DNA双链熔解曲线变化来检测突变的方法,溶解曲线的变化取决于DNA序列、长度、GC含量,因此,可以通过饱和燃料监控熔解曲线的变化来反映核酸性质的差异,从而对样品进行分析。在双链体的溶解曲线检测时需要添加合适的染料,饱和染料例如SYBR Green在双链解链过程中会发生重排,无法真实反映DNA熔解情况。不适用于需低温解链的样品而且不能检测异源双链体。因此不能用于熔解曲线的检测。而LC Green是一种与DNA有更强的结合位点,对P......阅读全文

小片段法进行基因分型(一)

摘要:      背景:用于基因分型的高分辨率熔解曲线技术既简单又有效。在以熔解为基础的方法中,探针法是基因分型的黄金标准,可以将等位基因与目标的匹配完全区分开。小片段基因分型法是代替探针的基因分型法。异源双链核酸分子的存在使得检测纯合子变得容易,其熔解峰的形状有明显的改变。纯合子G/C或A/T的基

高灵敏、高时间分辨率实时在线测量大气OH自由基

  近期,中国科学院合肥物质科学研究院安徽光学精密机械研究所研究员谢品华课题组在大气OH自由基外场高灵敏测量研究方面取得新进展,相关研究工作以《基于激光诱导荧光技术的对流层大气OH自由基外场探测系统》(Development of a field system for measurement of

应用非标记探针法进行基因分型(三)

高分辨率熔解 在高分辨率熔解仪器HR-1(爱荷华科技,盐湖城,犹他州)上进行分析,将LightCycle毛细管加入HR-1中,0.3℃/s加热。主要的实验中,RET外显子的扩增及非标记探针熔解数据从60℃到95℃采集。主要实验分析了每个外显子的扩增子及探针数据,除了外显子14。因为所有报道的外显子1

多色探针熔解技术有何潜力?

多色探针熔解曲线分析技术荧光PCR是应用最广的核酸检测平台。荧光PCR操作简单、闭管反应,可有效降低扩增产物污染,但一大缺点在于它所能检测的靶标数目有限。这也是荧光PCR在临床应用受到制约的重要因素,但随着多色探针熔解曲线分析技术的出现,却很好的解决了这个问题,即能够在保留荧光PCR优点的同时也能突

我国首个高时空分辨率碳同化反演系统发布

  记者从中国科学院地理科学与资源研究所获悉,我国首个高时空分辨率碳同化反演系统——中科院碳追踪同化系统(CarbonTracker-China,CAS)于日前发布。依据该软件系统,可以通过大气二氧化碳浓度的观测数据来估算陆地生态系统碳源碳汇的分布信息。  2007年,美国国家海洋与大气局正式发布了

“化学脱笼”:实现蛋白质高时间分辨的原位激活

  在活细胞等生理环境下开展蛋白质功能的原位研究具有重要的科学意义。北京大学化学与分子工程学院陈鹏课题组长期致力于发展蛋白质的原位激活技术,希望为活细胞内的每一个蛋白质安装“调控开关”。  近日这一研究组与王初课题组合作发表了题为“Time-resolved protein activation b

一种快速有效的基因分型斑马鱼的方法(一)

 为了促进斑马鱼的高通量的基因分型,我们开发了一种新的技术——用高通量熔解分析(HRMA)区分野生、杂合、纯合突变。这种耗时一个小时的技术不需要进行限制性内切酶酶切和琼脂糖凝胶电泳的操作。此技术生成的熔解图的敏感性高,可以检测不明确的PCR产物。我们可以对斑马鱼的三种类型的突变进行可靠的基因分型,包

HRM甲基化位点检测的灵敏性(二)

两个不同的病人的CpG位点见下表图4:miR-195 CpG岛的150bp扩增区 图5:从4个CLL患者中克隆miR-195可能调控区,使用Qiagen EpiTect Kit进行重亚硫酸盐处理,之后PCR扩增,Lightscanner检测,测序。不同的患者采取不同的甲基化模式扩增(0-8

泰克Tektronix-370A高分辨率曲线示踪器

泰克Tektronix 370A高分辨率曲线示踪器    何S:15889300166深圳佳捷伦电子仪器有限公司何S::15889300166/13510500080 V同电话:0755-89518111特点和规格包括:半导体器件的高精度测量“,高达2000伏或10安培源高达220瓦1纳安培测量分辨

泰克Tektronix-370A高分辨率曲线示踪器

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应用非标记探针法进行基因分型(四)

外显子10和11:多重突变热点MEN2A和FMTC的主要突变位于外显子10(密码子609、611、618和620)和11(密码子630和634),且野生型半胱氨酸的密码子DNA序列“TGC”发生单核苷酸改变。外显子10和11报道的序列变化>40(表1)。RET10外显子的主要实验包括两个单独的实验和

高通量、低成本SNP、突变或甲基化检测方法—HRM-技术应用

HRM 介绍HRM 技术是high-resolution melting analysis 即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的PCR 技术,HRM 不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR 结束后直接运行高分辨熔解,即

HRM甲基化位点检测的灵敏性(一)

引言DNA甲基化是一种重要的表观遗传CpG二核苷酸修饰形式,异常的DNA甲基化模式发生在许多基因启动子的CpG岛,这会增加患癌症的风险。CpG岛高甲基化常导致基因沉默,与癌症、老化、基因印记、X-染色体失活密切相关,此外,全基因组CpG高甲基化中也证实了发生在肿瘤形成的早期。传统的检测甲基化位点的方

高分辨率熔点分析技术进行冻存组织样本甲基化的检测

1 前言      启动子高度甲基化是恶性肿瘤基因转录中的一种很常见的现象,被视为细胞恶性转化的标志之一。DNA甲基化分析是一种基因检测工具,用于早期癌症检测、风险评估与治疗疗效评估,具有非常诱人的前景。        DNA甲基化检测最常用的方法主要依赖于亚硫酸氢钠对基因组 DNA 的处理,将胞嘧

多个序列突变的筛查HRMA(三)

前序列筛查    使用HRMA进行前序列筛查,特别是对于大基因可以节省很大的成本;Provaznikova 等[2008]报道对于MYH9基因可以避免85%的测序。在例中的DMD基因,第79个外显子需要分析(Al-Momani 等),假定每个外显子测序需要10欧元,筛查一个患者总共需要8

长时间序列高时空分辨率城市景观动态遥感监测实现

  占全球约3%的城市地表供养了55%的人类生活,复杂高强度的人类活动使城市景观剧烈变化,但当前学术界缺少长时间连续序列-高时空分辨率城市景观动态数据,导致城市景观演变的驱动机制及其产生的生态效应尚不明确,这制约了城市居民福祉提升和城市可持续发展。  中国科学院东北地理与农业生态研究所城市森林与湿地

首台高重频高通量高次谐波超快角分辨光电子能谱仪应用

  角分辨光电子能谱仪(ARPES)因其具有能量和动量分辨能力,是探测材料能带结构的重要手段。随着超快激光技术的不断发展,结合泵浦-探测技术的超快角分辨光电子能谱仪(TR-ARPES)由于兼具时间分辨能力,可以用来探测非平衡态的电子能带信息,因此近年来备受人们的重视。特别是基于高次谐波产生(HHG)

小片段法进行基因分型(二)

结果:        图1显示的是校正之前的完整的熔解峰显示。 从低温和高温内标及扩增子熔解的中部区分熔解信号。图1:派生熔解曲线显示校准和扩增子的熔解峰。左边和右边的峰是校准内标的峰。94的熔解剖面图,接近76℃,从独立的PCR反应中生成。校准分子没有对其,纯合子的扩增峰没有清楚的分开。中部最窄且

定量PCR的新技术

1992年,Sano等人将免疫测定技术与PCR结合,创建了一种全新的极其敏感的抗原分子检测技术,即免疫-PCR(Immuno-PCR),随着这种技术的不断发展,2000年,Sim等使用荧光定量PCR代替普通PCR,发展了免疫定量PCR技术(real-timeimmuno-PCR)。该技术把抗原抗体反

采用快速循环荧光定量PCR仪和LightScanner32上的非标记探...

采用快速循环荧光定量PCR仪和LightScanner32上的非标记探针进行MAAB简介高分辨率熔解曲线可以通过扫描PCR的扩增片断来检测杂合体中基因序列的变化。配合使用高分辨的饱和荧光染料,在检测小于400bp的PCR片断的SNP、插入或缺失时的灵敏度可达98%以上。该方法自开发以来,被不断的应用

溶解曲线双峰可以用吗

如果不是很明显的话,是可以用的,但是很明显,就要重新设计实验一般的主峰前面出峰的话,是引物二聚体,而如果主峰后面出峰的话,一般的是非特异性的大片段的扩增。如果主峰相对强于次峰,可以通过改变引物浓度,退火温度和镁离子浓度来解决,但如果次峰强于主峰,就是说杂带的特异性高于目的条带,一般的只能换引物了。扩

标准曲线相关系数高或者低的原因是什么

标准曲线相关系数高或者低的原因有:1、仪器校验好。2、移取液体体积要精确,保证迅速准确,尽可能用一根移液管。为减小人为误差,同一种液体要一个人操作。3、保证标准品的纯度,所用标准品最好是新打开的,纯度较高的固体或溶液,防止污染。4、容器要保证洁净。5、根据标准品理化性质注意加样的先后顺序。6、如果要

技术进步:高信噪比和高分辨率的活体生物成像

    荧光成像由于具有非侵入性、高灵敏度、高时空分辨率等优点,被广泛用于生命科学和临床医学等领域。相对于可见光窗口(400-650 nm)和近红外第一窗口(650-900 nm)而言,生物组织在近红外第二窗口(1000-1700 nm)对于激发光和发射光的吸收与散射作用较小。因此,近红外第二窗口区

我国首个高时空分辨率碳同化反演系统于日前发布

  记者从中国科学院地理科学与资源研究所获悉,我国首个高时空分辨率碳同化反演系统——中科院碳追踪同化系统(CarbonTracker-China,CAS)于日前发布。依据该软件系统,可以通过大气二氧化碳浓度的观测数据来估算陆地生态系统碳源碳汇的分布信息。  2007年,美国国家海洋与大气局正式发布了

高通量、低成本-SNP、突变和甲基化检测方法-——HRM技术应用

  HRM介绍    HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高分

高通量、低成本-SNP、突变和甲基化检测方法-——HRM技术应用

HRM介绍     HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高

荧光定量PCR实验过程中什么样的试剂盒性能较好?

性能较好的试剂盒熔解曲线出现单一峰,扩增特异性高,扩增“S”型曲线典型,CT值较早出现。目前Roche、ABI、Biog等的试剂盒性能都不错,反应特异性高,有效避免非特异扩增,提高实验效率。

引物篇:普通PCR-和-QPCR-引物异同点

Q问题: 普通PCR 和 QPCR 引物 是否一样? A 回答:     二者的设计原则有相同也有不同;相同处:•         序列的查找是一致的;•         序列选取应在基因的保守区段;•         选取合适的扩增片段大小•         避免引物自身或与引物之间形成4个或4个

我国分辨率最高商业遥感卫星高景一号成功发射

12月28日,记者从中国航天科技集团获悉,高景一号(SuperView-1)于11点23分在太原卫星发射场顺利升空。该卫星由2颗分辨率为0.5米的光学小卫星组成,也是当前我国分辨率最高的商业遥感卫星。星座将以纯商业模式运营,为全球多行业用户提供遥感数据及应用服务。 此次发射采用一箭双星(0

无人机成斩污利器:监测范围大-航拍分辨率高

航拍结束后,伞包打开,无人机缓缓降落。  河北省唐山市金岭钢铁厂属于国家明令淘汰的小钢铁企业,但是靠近山区、远离城镇,长期脱离监管视线,一直没有被发现。在环保部组织开展的一次无人机执法检查行动中,航拍发现了其违规生产、污染环境的事实,如今这个小钢铁企业已经被当地政府取缔。  从去年11月起,环保部门