脉冲场凝胶电泳制备DNA(哺乳动物细胞和组织DNA的分离)
实验方法原理 本方案叙述了从培养细胞和组织制备 DNA 样品的方法。病人或动物来源的白细胞也能用作 PFGE 的高分子质量 DNA 样品。如果确有必要,DNA 也可以从哺乳动物细胞分离出的胞核制备。经验表明:从胞核制备 DNA 没有优点,因为从完整细胞制备的 DNA 同样易于酶切。实验材料 细胞或组织样品试剂、试剂盒 EDTAL 缓冲液磷酸缓冲盐液红细胞裂解缓冲液TE仪器、耗材 低熔点琼脂糖Sorvall SS-34 或相当的转头纱布玻璃匀浆器细胞计数板LeucoPrep 细胞分离管研钵和研杵水浴实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液EDTA ( 0.5 mol/L, pH 8.0)L 缓冲液(0.1 mol/L EDTA (pH 8.0),0.01 mol/L Tris-Cl(pH 7.6),0.02 mol/L NaCl,4℃ 贮存)含蛋白酶 K 和十二烷基肌氨酸钠(Sarkosyl) 的 L缓冲液磷酸缓冲盐液(PBS......阅读全文
动物细胞基因组DNA的制备
实验概要本实验介绍了动物细胞基因组DNA的制备原理及操作流程。本方法一般可从5×107培养的非整倍体细胞(如HeLa细胞)中获得大约200μg DNA。DNA的长度可达到100~150kb。20ml正常血的DNA产量约为250μg。实验原理真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组
脉冲场凝胶电泳的应用
脉冲场凝胶电泳在生物基因分型、分子流行病学研究、细胞凋亡、追踪传染源、兽医流行病诊断辅助、食品和公共健康及染色体DNA分离等研究中有广泛应用。追踪传染源脉冲场凝胶电泳用于评估同一事件中不同来源菌株可能存在的关系,是溯源的有用技术之一。当疫情爆发时, 为了采取有针对性的措施,对该疫情进行合理有效地防控
将大片段插入-DNA-导入哺乳动物细胞和胚胎实验
基本方案1 通过质体融合将完整的 YAC 导入哺乳动物细胞 基本方案2 将细菌人工染色体(BAC或PAC)引入到哺乳动物细胞和小鼠胚胎中
横向交变场的脉冲场凝胶电泳
实验方法原理 Gardiner 等(1986; Gardiner and Patterson 1989) 使用置于垂直凝胶两侧的两组铂线电极的凝胶电泳装置以分离大的 DNA 片段。在这种横向交变场电泳(transverse alterna
向交变场的脉冲场凝胶电泳
Gardiner 等(1986; Gardiner and Patterson 1989) 使用置于垂直凝胶两侧的两组铂线电极的凝胶电泳装置以分离大的 DNA 片段。在这种横向交变场电泳(transverse alternating field electrophoresis, TAFE) 中 ,当
横向交变场的脉冲场凝胶电泳
实验方法原理 Gardiner 等(1986; Gardiner and Patterson 1989) 使用置于垂直凝胶两侧的两组铂线电极的凝胶电泳装置以分离大的 DNA 片段。在这种横向交变场电泳(transverse alternating field electrophoresis,
用蛋白酶K和苯酚从哺乳动物细胞中分离高分子质量DNA
这一程序改自最先由 Daryl Stafford 及其同事描述的方法(Blin and Stanfford 1976)。 当需要大量哺乳动物 DNA,如用于 Somhern 杂交或者用噬菌体 λ 载体构建基因组文库时,应选用这一方法。从 5X107 培养的非整倍体细胞 ( 如 HeLa 细胞)中可获
用蛋白酶K和苯酚从哺乳动物细胞中分离高分子质量DNA
实验方法原理 这一程序改自最先由 Daryl Stafford 及其同事描述的方法(Blin and Stanfford 1976)。 当需要大量哺乳动物 DNA,如用于 Somhern 杂交或者用噬菌体 λ 载体构建基因组文库时,应选用这一方法。从 5X107 培养的非整倍体细胞 ( 如
用蛋白酶K和苯酚从哺乳动物细胞中分离高分子质量DNA
实验方法原理 这一程序改自最先由 Daryl Stafford 及其同事描述的方法(Blin and Stanfford 1976)。 当需要大量哺乳动物 DNA,如用于 Somhern 杂交或者用噬菌体 λ 载体构建基因组文库时,应选用这一
脉冲场凝胶电泳(PFGE)概述
脉冲场凝胶电泳(PFGE)的原理大致为:细菌包埋于琼脂块中,用适当的内切酶在原位对整个细菌染色体进行酶切,酶切片段在特定的电泳系统中通过电场方向不断交替变换及合适的脉冲时间等条件下而得到良好的分离。PFGE中内切酶的选用至关重要,所采用的内切酶常为寡切点酶(lowfrequencycleavager
脉冲场凝胶电泳(PFGE)概述
脉冲场凝胶电泳(PFGE)的原理大致为:细菌包埋于琼脂块中,用适当的内切酶在原位对整个细菌染色体进行酶切,酶切片段在特定的电泳系统中通过电场方向不断交替变换及合适的脉冲时间等条件下而得到良好的分离。PFGE中内切酶的选用至关重要,所采用的内切酶常为寡切点酶(low frequency cle
脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验
实验概要本实验利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分离了大分子DNA。实验原理大分子DNA(一般长度超过20kb,在某些情况下,超过40kb)在电场作用下通过孔径小于分子大小的凝胶时,将会改变无规卷曲的构象,沿电场方向伸直,与电场平行从而才能通过凝胶。此时,大分子通过凝胶的方式相同,迁移率无差别(也称“极
将大片段插入-DNA-导入哺乳动物细胞和胚胎实验2
基本方案2 将细菌人工染色体(BAC或PAC)引入到哺乳动物细胞和小鼠胚胎中实验材料纯化的 BAC DNA试剂、试剂盒RNase A原核的注射缓冲液透析缓冲液I乙醇小鼠胚胎哺乳动物细胞灭菌素仪器、耗材含有合适的抗生素的LB培养基Qiagen Midi-prep 试剂盒培养箱高速离心机高速离心管玻璃离
将大片段插入-DNA-导入哺乳动物细胞和胚胎实验1
基本方案1 通过质体融合将完整的 YAC 导入哺乳动物细胞实验材料靶细胞:培养的贴壁生长的哺乳动物细胞带有以neo(G418-resistance)为筛选标记的 YAC 的酵母菌株试剂、试剂盒山梨糖醇SCE 溶液ST 溶液EDTA小鼠 Cot-1 DNA仪器、耗材SD dropout 培养基和培养板
脉冲场凝胶电泳实验——倒转电场
脉冲场凝胶电泳是在两个不同方向的电场周期性交替进行的,可分离长至5Mb的DNA分子,其工作原理是DNA分子在交替变换方向的电场中作出反应所需的时间取决于它的大小。较小的分子重新定向较快,因而在凝胶中移动也较快,于是不同大小的分子被成功分离。实验材料DNA试剂、试剂盒GTBETBE琼脂糖仪器、耗材电泳
哺乳动物中制备基因组DNA实验
制备DNA 实验材料 动物组织
哺乳动物中制备基因组DNA实验
实验材料 动物组织试剂、试剂盒 PBS乙酸铵乙醇酚氯仿异戊醇TE仪器、耗材 离心机摇床研钵实验步骤 1. 切下组织并立即剪成小块,置于液氮中冻结。 2. 将200 mg~1 g 的组织用预冷的研钵和研杵研碎,或用锤子将其捣为细粉末,每100 mg 组织用1. 2 ml 消化缓冲液悬浮。 3.
脉冲场凝胶电泳的应用领域
脉冲场凝胶电泳在生物基因分型、分子流行病学研究、细胞凋亡、追踪传染源、兽医流行病诊断辅助、食品和公共健康及染色体DNA分离等研究中有广泛应用。追踪传染源脉冲场凝胶电泳用于评估同一事件中不同来源菌株可能存在的关系,是溯源的有用技术之一。当疫情爆发时, 为了采取有针对性的措施,对该疫情进行合理有效地防控
哺乳动物细胞总RNA的分离
实验概要本实验介绍了从培养的单层哺乳动物细胞中分离RNA的实验程序,该程序同样适用于从悬浮培养的哺乳动物细胞中或从易于分散成单个细胞的哺乳动物组织中分离RNA。但不适用于从固体组织中提取RNA,因为用这种裂解细胞的方法(在SDS存在的条件下用蛋白酶K消化)去消化组织速度很慢,导致内源性RNA酶在被蛋
哺乳动物细胞总RNA的分离
哺乳动物细胞总RNA的分离细胞的裂解提取步骤注意事项 这一从培养的单层哺乳动物细胞中分离RNA的实验程序系为Favaloro 等(1980)所介绍程序的改良。该程序同样适用于从悬浮培养的哺乳动物细胞中或从易于分散成单个细胞的哺乳动物组织中分离RNA。但不适用于从固体组织中提取RNA,因为用这种裂解
植物组织制备基因组DNA实验
氯化铯法 CTAB法 实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则
植物组织制备基因组DNA实验
实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。实验材料 植物组织试剂、试剂盒 抽提缓冲液十二烷基肌氨酸钠TE异丙醇溴化乙锭氯化铯仪器、耗材 离心机实验步骤 收取1
质粒DNA的制备和纯化
实验概要质粒(plasmid)是一种染色体外的稳定遗传因子,大小从1~200kb不等,为双链、闭环的DNA分子,并以超螺旋状态存在于宿主细胞中。质粒主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中,它具有自主复制和转录能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。质粒在细胞内的复制一般有两种类型:
脉冲场凝胶电泳的分子质量标准
实验方法原理 PFGE 用于分离很大的 DNA 分子,因而需要很高分子质量的标准。这种标准可以按照 Lauer 等(1977 ) 介绍的方法从噬菌体,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取
脉冲场凝胶电泳的分子质量标准
PFGE 用于分离很大的 DNA 分子,因而需要很高分子质量的标准。这种标准可以按照 Lauer 等(1977 ) 介绍的方法从噬菌体,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取获得。但是一个更好的覆盖范围更广的系列标准是 λ 噬菌体 DNA 的系列串联体。后面介绍的具
箝位匀强电场的脉冲场凝胶电泳
实验方法原理 箝位匀强电场(contour-clamped homogeneous electric field, CHEF) 凝胶电泳中, 电场是由多个电极产生的。这些电极围绕水平凝胶呈四边形或六边形,其电位被箝制在顶先设定的水平(Ch
箝位匀强电场的脉冲场凝胶电泳
实验方法原理 箝位匀强电场(contour-clamped homogeneous electric field, CHEF) 凝胶电泳中, 电场是由多个电极产生的。这些电极围绕水平凝胶呈四边形或六边形,其电位被箝制在顶先设定的水平(Chuetal. 1986; Vollrath and
脉冲场凝胶电泳的分子质量标准
实验方法原理 PFGE 用于分离很大的 DNA 分子,因而需要很高分子质量的标准。这种标准可以按照 Lauer 等(1977 ) 介绍的方法从噬菌体,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取获得。但是一个更好的覆盖范围更广的系列标准是 λ 噬菌体 DNA
箝位匀强电场的脉冲场凝胶电泳
箝位匀强电场(contour-clamped homogeneous electric field, CHEF) 凝胶电泳中, 电场是由多个电极产生的。这些电极围绕水平凝胶呈四边形或六边形,其电位被箝制在顶先设定的水平(Chuetal. 1986; Vollrath and Davis 1987;
哺乳动物细胞总RNA快速分离
试剂、试剂盒 尤钙镁离子磷酸缓冲盐溶液 EDTASDS 乙酸钠水平衡的苯酚 乙醇 Tris-Cl NaCL 实验步骤 一 材料与设备 1)尤钙镁离子磷酸缓冲盐溶液 (PBS) 2)10 mmol/L EDTA (pH8.0 ) 3)0.5% SDS