使用合成核苷酸作探针实验
实验材料 核苷酸试剂、试剂盒 SSC焦磷酸钠SDS仪器、耗材 培养箱水浴锅实验步骤 1. 制备双份的转印细菌菌落或噬斑的硝酸纤维素滤膜(处理和干烤过)。2. 在室温下用3× SDS / 0.1%SDS溶液500 ml 洗膜3~5次。3. 然后在65℃洗膜至少1.5 h 以上直至过夜。 4. 在预杂交液中37℃预杂交1 h。 5. 在装有20 ml 以上的SSC杂交液的可封口的杂交袋中可移入多达20张的滤膜。6. 在毎 个杂交袋中每毫升杂交液加入0.125 ng 至1.0 ng 的每种32P标记的寡核苷酸。7. 在以下给定的温度条件下寡核苷酸杂交14~48 h。(1)14 碱基——室温(2)17 碱基——37℃(3)20 碱基——42℃(4)23 碱基——48℃ 8. 从杂交袋中取出滤胰,用6×SSC / ......阅读全文
使用合成核苷酸作探针实验
实验材料 核苷酸 试剂、试剂盒 SSC 焦磷酸钠 SDS
使用合成核苷酸作探针实验
实验材料 核苷酸试剂、试剂盒 SSC焦磷酸钠SDS仪器、耗材 培养箱水浴锅实验步骤 1. 制备双份的转印细菌菌落或噬斑的硝酸纤维素滤膜(处理和干烤过)。2. 在室温下用3× SDS / 0.1%SDS溶液500 ml 洗膜3~5次。3. 然后在65℃洗膜至少1.5 h 以上直至过夜。 4.
使用合成核苷酸作探针实验——在绿化四甲胺中(TMAC)杂交
实验材料寡核苷酸试剂、试剂盒LBSDSEDTATMAC仪器、耗材水浴锅离心机培养箱尼龙膜实验步骤1. 按“在氯化钠/柠檬酸钠中杂交”介绍的方法处理已影印细菌菌落的滤膜。2. 按下列方法制备带扩增噬斑的滤膜(1)从文库中以渐减密度〔15 000~8 000噬斑 / 150 mm 平板)的方式将噬菌
使用合成核苷酸作探针实验——在氯化钠/柠檬酸钠中杂交
基因探针(probe)又称“寡核苷酸探针”,简称“探针”,就是一段与目的基因或DNA互补的特异核苷酸序列,它可以包括整个基因,也可以仅仅是/基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之转录而来的RNA。实验材料核苷酸试剂、试剂盒SSC焦磷酸钠SDS仪器、耗材培养箱水浴锅实验步骤1. 制备双份的转印
探针合成实验
实验材料基因试剂、试剂盒转录缓冲液DTTRNA酶抑制剂CTPATPGTPS-UTP乙酸铵乙酸铵乙醇仪器、耗材水浴锅离心机培养箱烘箱实验步骤1. 在一个含SP6、T3或T7启动子的载体中,插入目的基因。在编码序列下游酶切使质粒呈线性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以无菌水重溶沉
探针合成实验
实验材料 基因试剂、试剂盒 转录缓冲液DTTRNA酶抑制剂CTPATPGTPS-UTP乙酸铵乙酸铵乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机培养箱烘箱实验步骤 1. 在一个含SP6、T3或T7启动子的载体中,插入目的基因。在编码序列下游酶切使质粒呈线性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以无菌
探针合成实验
基本方案 实验材料 基因 试剂、试剂盒
合成的寡核苷酸探针的优点
合成的寡核苷酸探针具有一些独特的优点:一.由于链短,其序列复杂度低,分子量小,所以和等量靶位点完全杂交的时间比克隆探针短,如20nt的寡核苷酸探针在浓度为100ng/ml,靶序列为1~100pg、1kb片段或3×10-18~3×10-16mol/L时,达到最大程度的杂交只需10min,而用2kb的克
合成寡核苷酸探针的技术步骤
首先使支持物羟基化,并用光敏保护基团将其保护起来。每次选取择适当的蔽光膜(mask)使需要聚合的部位透光,其它部们不透光。这样,光通过蔽光膜照射到支持物上,受光部位的羟基解保护。因为合成所用的单体分子一端按传统固相合成方法活化,另一端受光敏保护基的保护,所以发生偶联的部位反应后仍旧带有光敏保护基团。
合成的寡核苷酸探针的优点
合成的寡核苷酸探针具有一些独特的优点:一.由于链短,其序列复杂度低,分子量小,所以和等量靶位点完全杂交的时间比克隆探针短,如20nt的寡核苷酸探针在浓度为100ng/ml,靶序列为1~100pg、1kb片段或3×10-18~3×10-16mol/L时,达到最大程度的杂交只需10min,而用2kb的克
合成的寡核苷酸探针的优点
合成的寡核苷酸探针具有一些独特的优点:一.由于链短,其序列复杂度低,分子量小,所以和等量靶位点完全杂交的时间比克隆探针短,如20nt的寡核苷酸探针在浓度为100ng/ml,靶序列为1~100pg、1kb片段或3×10-18~3×10-16mol/L时,达到最大程度的杂交只需10min,而用2kb的克
生物素酰化探针的制备实验——随即寡核苷酸引物合成法
实验材料DNA试剂、试剂盒dNTP生物素klenow酶TEEDTALiCl乙醇仪器、耗材离心机培养箱实验步骤1. 在1. 5 ml 离心管中加入500 ng~2 μg 模板DNA,加水至总体积为34 μl。 2. 在沸水中变性DNA 5 min 置于冰浴5 min,稍加旋离。3. 按顺序加入下
用随机寡核苷酸引物从mRNA合成cDNA探针
实验方法原理 本方案以 poly(A) + RNA 作为模板,通过随机引物反应合成 cDNA 探针,这类探针可用于 cDNA 文库的差异筛选。实验材料 反转录酶反转录酶缓冲液随机脱氧核苷酸引物模板 mRNA试剂、试剂盒 乙酸铵DTTEDTA乙醇HClNaOH酚氯仿胰 RNA 酶抑制剂SDS Tris
用随机寡核苷酸引物从mRNA合成cDNA探针
本方案以 poly(A) + RNA 作为模板,通过随机引物反应合成 cDNA 探针,这类探针可用于 cDNA 文库的差异筛选。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理本方案以 poly(A) + RNA 作为模板,通过随机引物反应合成 cDNA 探针,这类探针可用于 cDNA
用随机寡核苷酸引物从mRNA合成cDNA探针
实验方法原理 本方案以 poly(A) + RNA 作为模板,通过随机引物反应合成 cDNA 探针,这类探针可用于 cDNA 文库的差异筛选。 实验材料
寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验
试剂、试剂盒 寡核苷酸杂交液 寡核苷酸预杂交液 SSC 或 SSPE TEAC1 洗涤液 TMAC1或 TEACl TMAC1 洗涤液
寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验
试剂、试剂盒 寡核苷酸杂交液寡核苷酸预杂交液SSC 或 SSPETEAC1 洗涤液TMAC1或 TEAClTMAC1 洗涤液核酸和寡核苷酸放射性标记的寡核苷酸探针仪器、耗材 杂交装置振荡培养器实验步骤 材料溶液和缓冲液稀释贮存液至适当浓度。寡核苷酸杂交液6XSSC(或 6XSSPE)0.05mol/
寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验
Jabobs等 ( 1988)介绍了在含季铵盐缓冲液中杂交的方法与原理。下述为该法的简单变通方案。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒寡核苷酸杂交液寡核苷酸预杂交液SSC 或 SSPETEAC1 洗涤液TMAC1或 TEAClTMAC1 洗涤液核酸和寡核苷酸放射性标
用寡聚(dT)作引物合成放射性标记的扣除cDNA探针
实验方法原理 本方案描述通过与 mRNA 驱动方杂交,继之以羟基磷灰石层析纯化单链放射性标记的 cDNA,制备扣除 cDNA 探针。实验材料 反转录酶反转录酶缓冲液驱动方 mRNA模板 mRNA试剂、试剂盒 乙酸铵DTTEDTA乙醇HCl异丁醇NaOH酚氯仿胎盘 RNA 酶抑制剂SDSSDS EDT
用寡聚(dT)作引物合成放射性标记的扣除cDNA探针
本方案描述通过与 mRNA 驱动方杂交,继之以羟基磷灰石层析纯化单链放射性标记的 cDNA,制备扣除 cDNA 探针。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理本方案描述通过与 mRNA 驱动方杂交,继之以羟基磷灰石层析纯化单链放射性标记的 cDNA,制备扣除 cDNA 探针。实验
寡核苷酸探针的简介
基因探针,即核酸探针,是一段带有检测标记,且顺序已知的,与目的基因互补的核酸序列(DNA或RNA)。基因探针通过分子杂交与目的基因结合,产生杂交信号,能从浩瀚的基因组中把目的基因显示出来。根据杂交原理,作为探针的核酸序列至少必须具备以下两个条件:①应是单链,若为双链,必须先行变性处理。②应带有容
寡核苷酸探针技术介绍
利用寡核苷酸探针可检测到靶基因上单个核苷酸的点突变。常用的寡核苷酸探针主要有两种:单一已知序列的寡核苷酸探针和许多简并性寡核苷酸探针组成的寡核苷酸探针库。单一已知序列寡核苷酸探针能与它们的目的序列准确配对,可以准确地设计杂交条件,以保证探针只与目的序列杂交而不与序列相近的非完全配对序列杂交,对于一些
核苷酸的合成
核苷酸是核糖核酸及脱氧核糖核酸的基本组成单位,是体内合成核酸的前身物。核苷酸随着核酸分布于生物体内各器官、组织、细胞核及细胞质中,并作为核酸的组成成分参与生物的遗传、发育、生长等基本生命活动。生物体内还有相当数量以游离形式存在的核苷酸。三磷酸腺苷在细胞能量代谢中起着主要的作用。体内的能量释放及吸收主
寡核苷酸探针的来源介绍
DNA探针根据其来源有3种:一种来自基因组中有关的基因本身,称为基因组探针(genomic probe);另一种是从相应的基因转录获得了mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNA探针(cDNA probe)。与基因组探针不同的是,cDNA探针不含有内含子序列。此外,还可在体外人工合成碱基数不
寡核苷酸探针的制备方法
寡核苷酸探针是人工合成的,与已知基因DNA互补的,长度可从十几到几十个核苷酸的片段。如仅知蛋白质的氨基酸顺序量,也可以按氨基酸的密码推导出核苷酸序列,并用化学方法合成。
寡核苷酸探针的用途介绍
寡核苷酸探针还有一个重要用途。在用于检测单个碱基差异时尚可采用一种称为寡核苷酸限制(oligonucleotiderestriction)的技术。该技术只有在突变点位于某一限制性内切酶识别位点时才有效。例如,镰刀状红细胞贫血是因β珠蛋白基因的第6个寡码子由GAG变成GTG,从而导致所编码氨基酸由酪氨
核苷酸的合成代谢
嘌呤核苷酸主要由一些简单的化合物合成而来,这些前身物有天门冬氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺、CO2及一碳单位(甲酰基及次甲基,由四氢叶酸携带)等。它们通过11步酶促反应先合成次黄嘌呤核苷酸(肌苷酸)。随后,肌苷酸又在不同部位氨基化而转变生成腺苷酸及鸟苷酸。合成途径的第一步是5-磷酸核糖在酶催化下,活化生成5
核苷酸的合成过程
核苷酸是核糖核酸及脱氧核糖核酸的基本组成单位,是体内合成核酸的前身物。核苷酸随着核酸分布于生物体内各器官、组织、细胞核及细胞质中,并作为核酸的组成成分参与生物的遗传、发育、生长等基本生命活动。生物体内还有相当数量以游离形式存在的核苷酸。三磷酸腺苷在细胞能量代谢中起着主要的作用。体内的能量释放及吸收主
核苷酸的合成途径
核苷酸是核糖核酸及脱氧核糖核酸的基本组成单位,是体内合成核酸的前身物。核苷酸随着核酸分布于生物体内各器官、组织、细胞核及细胞质中,并作为核酸的组成成分参与生物的遗传、发育、生长等基本生命活动。生物体内还有相当数量以游离形式存在的核苷酸。三磷酸腺苷在细胞能量代谢中起着主要的作用。体内的能量释放及吸收主
关于寡核苷酸探针的标记介绍
为了确定探针是否与相应的基因组DNA杂交,有必要对探针加以标记,以便在结合部位获得可识别的信号,通常采用放射性同位素32P标记探针的某种核苷酸α磷酸基。但近年来已发展了一些用非同位素如生物素-亲合素系统 、地高辛配体等作为标记物的方法。非同位素标记的优点是保存时间较长,而且避免了同位素的污染。