探针合成实验
实验材料基因试剂、试剂盒转录缓冲液DTTRNA酶抑制剂CTPATPGTPS-UTP乙酸铵乙酸铵乙醇仪器、耗材水浴锅离心机培养箱烘箱实验步骤1. 在一个含SP6、T3或T7启动子的载体中,插入目的基因。在编码序列下游酶切使质粒呈线性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以无菌水重溶沉淀至1 μg/μl。 2. 室温配罝如下反应混合液(总体积20 μl):(1)4.0 μl 5×转录缓冲液(2)0.2 μl 1 mol/l DTT(3)60 U RNA酶抑制剂(4)1.0 μl 三种10 mmol/l NTP中的每一种(5)1.0 μl 1 μg/μl 酶切DNA(6)10.0 μl [35S]UTP(7)16 U SP6或T7 RNA聚合酶(8)37℃温育30 min,再加16 U聚合酶并于37 ℃温育40 min。 3. 在反应混合液中加入:60 U RNA......阅读全文
探针合成实验
实验材料 基因试剂、试剂盒 转录缓冲液DTTRNA酶抑制剂CTPATPGTPS-UTP乙酸铵乙酸铵乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机培养箱烘箱实验步骤 1. 在一个含SP6、T3或T7启动子的载体中,插入目的基因。在编码序列下游酶切使质粒呈线性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以无菌
探针合成实验
实验材料基因试剂、试剂盒转录缓冲液DTTRNA酶抑制剂CTPATPGTPS-UTP乙酸铵乙酸铵乙醇仪器、耗材水浴锅离心机培养箱烘箱实验步骤1. 在一个含SP6、T3或T7启动子的载体中,插入目的基因。在编码序列下游酶切使质粒呈线性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以无菌水重溶沉
探针合成实验
基本方案 实验材料 基因 试剂、试剂盒
使用合成核苷酸作探针实验
实验材料 核苷酸 试剂、试剂盒 SSC 焦磷酸钠 SDS
使用合成核苷酸作探针实验
实验材料 核苷酸试剂、试剂盒 SSC焦磷酸钠SDS仪器、耗材 培养箱水浴锅实验步骤 1. 制备双份的转印细菌菌落或噬斑的硝酸纤维素滤膜(处理和干烤过)。2. 在室温下用3× SDS / 0.1%SDS溶液500 ml 洗膜3~5次。3. 然后在65℃洗膜至少1.5 h 以上直至过夜。 4.
探针合成的注意事项
①合成探针的长短,一般在20~50个核苷酸之间。合成过长成本高,且易出现聚合酶合成错误,杂交时间长,合成太短则特异性下降。②碱基组成G-C应含40%~60%,一种碱基连续重复不超过4个,以免非特异性杂交产生。③探针自身序列内应无互补区域,以免产生“发夹”结构,影响杂交。总之,一个好的探针最终要在实践
基因探针合成的注意事项
①合成探针的长短,一般在20~50个核苷酸之间。合成过长成本高,且易出现聚合酶合成错误,杂交时间长,合成太短则特异性下降。 ②碱基组成G-C应含40%~60%,一种碱基连续重复不超过4个,以免非特异性杂交产生。 ③探针自身序列内应无互补区域,以免产生“发夹”结构,影响杂交。总之,一个好的探针
基因探针合成的注意事项
①合成探针的长短,一般在20~50个核苷酸之间。合成过长成本高,且易出现聚合酶合成错误,杂交时间长,合成太短则特异性下降。 ②碱基组成G-C应含40%~60%,一种碱基连续重复不超过4个,以免非特异性杂交产生。 ③探针自身序列内应无互补区域,以免产生“发夹”结构,影响杂交。总之,一个好的探针
RNA探针的合成方法和合成效率检测
在RNA的杂交检测实验中,应用标记的RNA 探针将获得高灵敏度的杂交检测结果,与DNA 探针相比,检测灵敏度提高10-100倍。因为对于不同的杂交体类型来说,RNA-RNA杂交体的结合强度高于RNA-DNA和DNA-DNA杂交体。对于通过Northern blots检测低浓度mRNA,以及原
RNA探针合成方法和合成效率检测方法介绍
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体外转录合成单链RNA探针
实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 1977)。虽然 DNA 探针仍普遍地应用于 Norther
双链DNA探针随机引物合成法
随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切
体外转录合成单链RNA探针
实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 197
合成寡核苷酸探针的技术步骤
首先使支持物羟基化,并用光敏保护基团将其保护起来。每次选取择适当的蔽光膜(mask)使需要聚合的部位透光,其它部们不透光。这样,光通过蔽光膜照射到支持物上,受光部位的羟基解保护。因为合成所用的单体分子一端按传统固相合成方法活化,另一端受光敏保护基的保护,所以发生偶联的部位反应后仍旧带有光敏保护基团。
合成的寡核苷酸探针的优点
合成的寡核苷酸探针具有一些独特的优点:一.由于链短,其序列复杂度低,分子量小,所以和等量靶位点完全杂交的时间比克隆探针短,如20nt的寡核苷酸探针在浓度为100ng/ml,靶序列为1~100pg、1kb片段或3×10-18~3×10-16mol/L时,达到最大程度的杂交只需10min,而用2kb的克
合成的寡核苷酸探针的优点
合成的寡核苷酸探针具有一些独特的优点:一.由于链短,其序列复杂度低,分子量小,所以和等量靶位点完全杂交的时间比克隆探针短,如20nt的寡核苷酸探针在浓度为100ng/ml,靶序列为1~100pg、1kb片段或3×10-18~3×10-16mol/L时,达到最大程度的杂交只需10min,而用2kb的克
合成的寡核苷酸探针的优点
合成的寡核苷酸探针具有一些独特的优点:一.由于链短,其序列复杂度低,分子量小,所以和等量靶位点完全杂交的时间比克隆探针短,如20nt的寡核苷酸探针在浓度为100ng/ml,靶序列为1~100pg、1kb片段或3×10-18~3×10-16mol/L时,达到最大程度的杂交只需10min,而用2kb的克
生物素酰化探针的制备实验——随即寡核苷酸引物合成法
实验材料DNA试剂、试剂盒dNTP生物素klenow酶TEEDTALiCl乙醇仪器、耗材离心机培养箱实验步骤1. 在1. 5 ml 离心管中加入500 ng~2 μg 模板DNA,加水至总体积为34 μl。 2. 在沸水中变性DNA 5 min 置于冰浴5 min,稍加旋离。3. 按顺序加入下
杂交探针的检测实验
实验步骤 1. 暗室中,以42~45℃水浴,温育盛有4盎司(113.3 g)Kodak NTB-2放射自显影胶乳瓶30 min。同时,在500 ml 三角瓶中预热等体积的水至相同温度。 2. 胶乳熔化后,缓慢沿三角瓶壁(以一角度)倒入瓶中
杂交探针的检测实验
1. 将载玻片以胶带固定于硬纸板或废胶片上。2. 将Du Pont Cronex 成像胶片(MRF 34 Clear) 轻压在玻片上4℃曝光。3. 当用这种胶片时,应注意以胶片的胶乳面正对样品。
使用合成核苷酸作探针实验——在绿化四甲胺中(TMAC)杂交
实验材料寡核苷酸试剂、试剂盒LBSDSEDTATMAC仪器、耗材水浴锅离心机培养箱尼龙膜实验步骤1. 按“在氯化钠/柠檬酸钠中杂交”介绍的方法处理已影印细菌菌落的滤膜。2. 按下列方法制备带扩增噬斑的滤膜(1)从文库中以渐减密度〔15 000~8 000噬斑 / 150 mm 平板)的方式将噬菌
随机引物合成法双链DNA探针标记法
随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切酶活
cDNA-合成实验
试剂、试剂盒 二硫苏糖醇dNTP随机引物来自方案 4 的 RNA 样品 RNasin反转录缓冲液仪器、耗材 PCR 管子 热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂0.1mol/L 二硫苏糖醇dNTP(每种 2.5 mmol/L)随机引物(20~40U/ml)(1034731,RocheAp
cDNA-合成实验
试剂、试剂盒 二硫苏糖醇 dNTP 随机引物 来自方案 4 的 RNA 样品 RNasin 反转录缓冲液
基因合成实验
基因合成可应用于:(1)代谢通路合成;(2)基因网络构建;(3)疫苗设计。实验方法原理基因合成是指在体外人工合成双链DNA分子的技术,与寡核苷酸合成有所不同:寡核苷酸是单链的,所能合成的最长片段仅为100nt左右,而基因合成则为双链DNA分子合成,所能合成的长度范围50bp-12 kb。基因合成是用
cDNA-合成实验
试剂、试剂盒二硫苏糖醇dNTP随机引物来自方案 4 的 RNA 样品RNasin反转录缓冲液仪器、耗材PCR 管子热循环仪实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂0.1mol/L 二硫苏糖醇dNTP(每种 2.5 mmol/L)随机引物(20~40U/ml)(1034731,RocheApplied
基因合成实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 dNTPDAN聚合酶乙醇TE限制性内切核酸酶缓冲液仪器、耗材 水浴锅培养箱实验步骤 1. 将两种寡核苷酸各1 μg加入微量离心管中,加水至17 μl,再加2 μl 的10×测序酶缓冲液。70℃加热5 min,然后在合适的退火温度下保温5 min,取2 μl 留待以后
基因合成实验
基因合成可应用于:(1)代谢通路合成;(2)基因网络构建;(3)疫苗设计。难度系数 2.0共2人点评打分点评实验,有机会获丁当奖励 +收藏 8人收藏基因合成实验标签: 基因 合成基因合成可应用于:(1)代谢通路合成;(2)基因网络构建;(3)疫苗设计。基因合成实验实验方法原理基因合成是指在体外人工
基因合成实验
实验方法原理 基因合成是指在体外人工合成双链DNA分子的技术,与寡核苷酸合成有所不同:寡核苷酸是单链的,所能合成的最长片段仅为100nt左右,而基因合成则为双链DNA分子合成,所能合成的长度范围50bp-12 kb。基因合成是用人工方法合
DNA片段探针的应用实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 杂交液洗膜液仪器、耗材 注射器超声仪水浴锅实验步骤 1. 用5~20 ml 杂交液Ⅰ依次浸泡10~20张硝酸纤维素滤膜。滤膜装入杂交袋中,加入足够的杂交液,密封后42℃预杂交1 h。 2. 往带螺盖的试管中,加入放射性探针和2 mg 超声波处理的鲱鱼精DNA,煮沸1