miRNA克隆实验
实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外，还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA（noncoding RNA，ncRNA），非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用，如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达，还有一部分则起着调控基因表达的作用。实验材料 寡核苷酸乙腈ImpAp17.91X DEPC糖原T4 RNA 连接酶反转录酶dNTPDTTEDTAT4 DNA 连接酶BanⅠ限制性内切核酸酶Taq 酶M13F 引物M13R 引物试剂、试剂盒 混合液沉淀液上样液乙醇T4 RNA 连接酶缓冲液重蒸水KOHTris-HCl T4 RNA 连接酶缓冲液NEB 缓冲液溶胶溶液仪器、耗材 TOPO TA 克隆试剂盒实验步骤 一、材料与设备1. 寡核苷酸。2. 乙腈。3. 混合液 A：0.5 mmol AMP（5' 磷酸化）溶解于 15 ml 二甲基甲酰胺。4. 混合液 B：1 mmol 三......阅读全文
转化克隆的筛选和鉴定实验
实验原理利用转化后宿主菌所获得的抗菌素抗性性状筛选出获得质粒的菌落克隆。再从这些菌落中鉴定出质粒上带有外源基因插入片段的克隆菌落。实验试剂1. LB培养基(加抗菌素)2. PCR用试剂3. 引物4. 质粒提取用试剂5. 酶切需要的限制性内切酶及其缓冲液，70%甘油(70%甘油，0.1mol/L Mg
单克隆抗体上清制备实验
与多克隆抗血清相比，采用单克隆抗体（MAb）的最主要的优势就是有可能得到大量的特异性单克隆抗体可供应用。MAb 制剂通常包括杂交瘤上清、由接种了杂交瘤的小鼠制备的腹水，以及纯化的 MAb。杂交瘤上清容易制备，特别是用于制备大量不同的 MAb , 但其中 MAb 的浓度则相对较低。为得到纯化的制剂，可
分子克隆蛋白表达实验指南（十四）
RbCl制备感受态细胞 需准备的灭菌器具和培养液： SOB，Buffer 1，Buffer 2，3×200ml广口瓶，1.5ml EP管，1×500ml离心瓶（按200ml摇菌量计算），2×50ml离心管，2×移液管（用于加Buffer 1），液氮，冰 离心管，EP管，移液管使用前均需要放
分子克隆蛋白表达实验指南（十五）
LB固体培养基 Tryptone 1g Yeast Extract 0.5g NaCl 1g Agar 1.5g 加蒸馏水至总体
分子克隆蛋白表达实验指南（十八）
15％胶 水1.11.872.33.43.854.65.76.99.211.5 30％聚丙烯酰胺混合液2.54.2557.58.751012.5152025 1.5M Tris(pH=8.8)1.32.212.53.84.5556.37.
贴壁细胞的克隆形成实验
实验方法原理用不同浓度的实验试剂将细胞处理24h 。经胰蛋白酶消化后，以低细胞密度接种，温育1～3 周，染色后（见彩图6a,e) 计集落数（图22.1)。实验步骤材料无菌生长液D-PBSA0.25%粗制胰蛋白酶待测化合物配制成最大使用浓度的10倍，溶于无血清生长液中；检査试验溶液的pH 和渗透压，若
分子克隆蛋白表达实验指南（十六）
Amp(50mg/ml) 溶解1g Amp于足量的水中，最后定容至20ml。分装成小份于-20℃贮存。常以20～50ug/ml的终浓度添加于生长培养基，1:1000比例稀释 Kan(50mg/ml) 溶解1g Kan于足量的水中，最后定容至20ml
分子克隆蛋白表达实验指南（三）
若有非特异性条带，可进行Touchdown PCR，提高引物的特异性。 PCR反应条件： 1 94C 5min 2 94C 45s 3 65C 45s 退火温度视
分子克隆蛋白表达实验指南（十一）
SDS-PAGE胶样品排列： MarkerUII 37CUI’I’ Marker：低分子量蛋白marker，上样10ul UI：未诱导菌液，上样10ul。任取37C和20C中一个 I：诱导后对照，上样10ul UI’, I’代表G
分子克隆蛋白表达实验指南（十）
13．连接产物转化DH5α（预开42C水浴） 与T载体转化相同，先转化DH5α，筛选及扩增目的重组质粒 转化DH5α后挑6～8个菌落验证，验证项目： 1． 目的基因引物PCR验证 2． 表达载体引物PCR验证 3． Step2中PCR产物胶回收后，以胶回收为模板、
分子克隆实验载体DNA的选择
①质粒：质粒是细菌染色体外遗传因子，DNA呈环状，大小为1-200千碱基对(kb)。在细胞中以游离超螺旋状存在，很容易制备。质粒DNA可通过转化引入寄主菌。在细胞中有两种状态，一是“紧密型”；二是“松弛型”。此外还应具有分子量小，易转化，有一至多个选择标记的特点。质粒型载体一般只能携带10kb以下的
分子克隆蛋白表达实验指南（十三）
7． 电泳结束后，按比例从胶上割下相应约1cm条带（当按比例的条带割下后可相应的向两边再割一点，但是电透析时中间和两边的胶必须分开透析），用镊子或尺子将胶碾碎成2mm见方的小块。 8． 将碎块小心加入电透析tube中，200V，120～150min。 9． 移出放电透析tube的架子，
单克隆抗体的纯化实验
实验材料蛋白质试剂、试剂盒Tris腹水液宁酸盐缓冲液甘氨酸乙酸盐缓冲液仪器、耗材超滤器滤膜实验步骤1. 将10 ml 经CNBr活化Sepharose 4B溶胀于1 mmol/l HCl中，然后转移至玻璃沙漏斗中，并用：①200~500 的1 mmol/l HCl和②200~500 ml 偶联缓冲
单克隆抗体腹水制备实验
实验方法原理 高滴度的单克隆抗体的制备可以通过在小鼠的腹腔内接种能产生 MAb 的杂交瘤细胞，从而产生腹水来获得。腹水可收集几次，经热灭活、滴定后储存。实验材料 裸鼠（6～8 周龄 无特定病原体／注射了鼠鼠杂交瘤细胞的同系宿主）目的杂交瘤试剂、试剂盒 完全DMEM-10培养液（含10mmol／L H
分子克隆蛋白表达实验指南（二）
取DEPC水时切记带上手套 Genequant使用方法： 开机－set-up－enter(只更改DNA/RNA，看光波是否为320nm)－set-ref(此时插入空白对照)－样品 1．使用前将比色皿中水吸出，用1ml蒸馏水重新洗涤再将比色皿中的水吸尽（先用1ml枪吸，后用100ul枪吸）
分子克隆蛋白表达实验指南（一）
目的基因克隆包括保存用全长基因(gene for saving, GS)和表达用全长基因(gene for expression, GE)两部分。 这两部分所克隆的基因都是全长片段，但克隆的策略及目的不同。直接用精确克隆(及引物从基因CDS两端开始)很难找到高效价的引物，且cDNA中目的基
分子克隆蛋白表达实验指南（五）
8. TA质粒转化菌落的验证 与表达载体的验证不同，转化TA质粒时不用双酶切验证。只需用目的基因引物和TA载体引物PCR验证即可。TA载体引物PCR片段比插入片段大约长150bp。 目的基因退火温度与之前胶回收时温度相同，TA退火温度60C即可，但可在55～70之间变动，不会影响结果。 挑取至
分子克隆蛋白表达实验指南（七）
目的基因表达 14．快速诱导表达 快速诱导目的是为检测该重组质粒在BL21中是否能被诱导表达重组蛋白，并确定在不同IPTG浓度蛋白诱导效率的差异。 5． 挑单克隆菌落于7ml含有相应抗生素LB培养液的50ml培养管中，37C振荡培养过夜（8-16h）。 6． 37C，1mM
分子克隆蛋白表达实验指南（八）
15. 小量蛋白诱导表达 该步骤的目的是检测蛋白是否在上清存在表达。低温时蛋白易于表达于上清，因此小量蛋白诱导表达以20或30C为培养温度。 1. 挑一单克隆的菌落于5ml含有相应的抗生素的LB培养液中，37℃振荡培养过夜（8-16h）。 2. 过夜培养液加入三瓶50ml含
分子克隆蛋白表达实验指南（十九）
Desired pH Volume of 1M K2HPO4 (mL)Volume of 1M KH2PO4 (mL) 5.8 8.591.5 6.0 13.286.8 6.2 19.280.8
分子克隆蛋白表达实验指南（九）
SDS-PAGE胶样品排列： MUIBS1S1P1BS2S2P2UIT1T2T3T4 M：marker；上样10ul UI：未诱导对照；10ul BS：超声前样品；10ul S：超声后上清； 10ul P：超声后沉淀； 10ul T：诱导后每隔1h样品，1
分子克隆蛋白表达实验指南（十七）
Buffers for His purification in denatured conditions: 配制时加终体积50％的水，之后定容至所需体积。先配pH 8.0的buffer(调pH需要较多NaOH)，再统一配bufferC，D，E，分别调pH Buffer B (200ml
分子克隆蛋白表达实验指南（四）
7. PCR产物与TA载体连接 pGEM-T vector is T-tailed at the insert site. To improve the ligation efficiency, it is recommended PCR product be A-tailed. +A s
分子克隆蛋白表达实验指南（六）
10. 测序 突变后氨基酸序列没有变化仍可用于表达。测序报告中blast时若有‘－’符号，则人工对照测序图谱。 测序验证后没有突变或者同义突变的重组质粒必须小抽，50ul，conc300ug/ml备份。测序文件应妥善保存，蛋白表达完成后一并提交存档。 获得GS后，即可构建含GE的重组T载体，用
Nature发布miRNA重要发现：脂肪细胞的miRNA信号
脂肪细胞并不简单，Joslin糖尿病中心的科学家发现这种细胞并不只是静静的待在我们身体中，而且能释放出激素和其它信号蛋白，影响多种组织，其中一种竟然是miRNA。利用脂肪细胞研发基因治疗方法，也许能用于治疗肝脏或其它器官的代谢疾病，还有癌症等。 这一研究成果公布在2月15日的Nature杂志上
粘粒和质粒克隆的纯化实验
基本方案 实验材料 质粒 试剂、试剂盒
大量细菌克隆的杂交方法筛选实验
这一方法由 Hanahan 和 Meselson (1980, 1983)报道，主要用来处理由质粒 cDNA 文库转化的细菌。将转化菌的混合物或者一份扩增的 cDNA 文库直接置于不含洗涤剂的硝酸纤维素膜或尼龙膜上，复制膜用膜-膜接触的方法制备。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方
YAC克隆的分析实验——基本方案
YAC带有天然染色体所有的功能元件，包括一个着丝粒，一个DNA复制起点，两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA，这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因，在染色体步移中每次允许更大的步移距离，同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。实验材料酵母菌试剂、试剂盒AHCYPD
大量细菌克隆的杂交方法筛选实验
实验方法原理 这一方法由 Hanahan 和 Meselson (1980, 1983)报道，主要用来处理由质粒 cDNA 文库转化的细菌。将转化菌的混合物或者一份扩增的 cDNA 文库直接置于不含洗涤剂的硝酸纤维素膜或尼龙膜上，复制膜用膜-膜接触的方法制备。采用这一方法，每块 150
单克隆抗体上清的制备实验
实验材料 杂交瘤试剂、试剂盒 完全培养基仪器、耗材 培养箱转子离心机实验步骤 1. 将杂文瘤置于一个盛有完全DMEM-10培养基的175 cm2组织培养瓶中，置37 ℃CO2培养箱中，直至生长旺盛适于分传。2. 按1：10的比例将细胞分传到一个新的175 cm2的培养瓶中，加入完全DMEM-10