斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR，分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP，少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物，确认实际基因组序列与理论匹配情况，如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入，需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件，以备后用，如不能正常扩增需要重新设计，并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录，完成后需测定浓度（不得低于400 ng/μl） 和OD......阅读全文
科学家找到治疗眼癌新方法－抑制眼肿瘤细胞生长和扩散
美国科学家日前对患有眼癌的儿童进行了研究，通过比较儿童的基因序列，他们发现了新的证据，表明细胞中的多米诺骨牌效应是导致癌症扩散的原因。研究人员利用实验成功地在斑马鱼和人类细胞中找到事件链的阻断部分，从而让眼肿瘤细胞停止生长和扩散。 研究人员表示，这项新发现使治疗儿童最常见眼癌视网膜母细胞瘤变得
牙齿为何会敏感？原来是远古鱼“遗传”
你有过牙齿酸酸胀胀的体验吗？这会让我们真切地感受到牙齿有多敏感。其实，在咀嚼食物时，这种敏感性大有用处，它能提供关于温度、压力，还有疼痛方面的重要信息。但你可能不知道，坚硬的牙釉质内部那些敏感的部位，在演化之初竟然是帮助远古鱼类在危机四伏的海洋中存活下来的关键利器。 古代无颌脊椎动物鱼“Ast
RNA表观修饰在造血干细胞发育中的关键作用
血液是生命的源泉。不断流动的血细胞既可以运输营养物质，又是重要的免疫保护屏障。其中，所有的血细胞都来源于造血干细胞。这群干细胞不仅可以维持血液系统的长期稳定，也是骨髓移植治疗恶性血液疾病的核心组分。目前，造血干细胞来源仍是制约临床恶性血液疾病治疗的瓶颈。因此，造血干细胞的体内发育和体外诱导扩增已
病鱼鱼体的镜检方法
镜检是在目检不能确诊疾病的情况下，用显微镜或解剖镜对病原体作进一步的辨认。镜检的部位和顺序与目检基本相同。 1、玻片压展法：取被检鱼类器官或组织的一小部分，或一滴黏液、或一滴肠内容物等，置于载玻片上，滴少许清水或生理盐水，用另一载玻片压平，然后置于解剖镜或低倍显微镜下观察，辨认病原体。检
－谁控制着你的口腹之欲
肥胖是现代工业社会的一种流行病，随着人们饮食习惯和生活方式的改变，全球的肥胖发病率正在逐年攀升，已经成为了世界性的健康问题。 大脑深处的下丘脑中聚集着上万个POMC神经元，它们是饱足感和饥饿感的控制中心，能根据机体信号对食欲和进食行为进行调节。科学家们一直希望能够通过操纵这些神经元来解决肥胖问
模式生物高通量多维表型研究方法概述（一）
摘要：动物个体内，多数由基因突变与生物活性分子所引发的复杂生理应答机制，无法使用细胞培养模型进行预测，而动物水平研究却进展缓慢。本研究中，我们利用微米分辨率的高通量光学投影层析成像系统，结合高效的大颗粒流式分选系统（Union Biometrica），实现了脊椎动物的整体多维度扫描。系统以前
苏州大学特聘教授Nature子刊揭示蛋白降解新机制
来自康奈尔大学、苏州大学医学部等机构的研究人员证实，IRE1α是内质网相关蛋白降解(ERAD )的一个内源性底物。这一研究发现发布在11月9日的《自然细胞生物学》（Nature Cell Biology）杂志上。 苏州大学医学部特聘教授龙乔明（Qiaoming Long）及康奈尔大学营养科学系
在生命之初，胚胎中最早的转录因何触发
在一段生命旅程开始之初，精子细胞刺穿卵细胞，它们的遗传物质融合。然而，在之后的一段时间，所获得的DNA一直保持沉默：受精卵或早期胚胎中的基因不被转录。科学家也不清楚，是什么最终启动了这一过程。 最近发表在《Nature Genetics》上的三项研究深入探索了这一过程。研究人员报告了一个基因D
我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制
近日，由中国水产科学研究院首席科学家孙效文牵头，中国水产科学研究院联合黑龙江水产研究所、中科院基因组研究所、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作研究团队，完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制，在国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果于9月21日在国际生物学权威期刊《自然—
人耳和鱼鳃“共享软骨”－，科学家解开耳朵起源和构造谜团
狗用耳朵表达情绪、蝙蝠用耳朵捕食、大象用耳朵扇风……尽管脊椎动物的耳朵“花样繁多”，但研究发现，只有哺乳动物有突出的、复杂的外耳结构。近日两项独立但互补的研究，揭示了外耳的组成及其进化细节。其中，发表于《科学》的研究发现，哺乳动物的外耳和其他身体都有一种不寻常的软骨。这种软骨富含脂质，柔韧性更好。而
新研究为完善化妆品安全评价体系提供科学依据
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518154.shtm近日，南方医科大学公共卫生学院教授黄振烈团队发布了最新研究，强调了微塑料和外源性化合物联合作用的重要性。相关成果发表于《环境健康展望》（Environmental Health Per
动物所等关于造血干细胞发育调控机制的研究取得新成果
造血过程是产生各种成熟血细胞组分(包括红细胞、白细胞和淋巴细胞等)的过程，受到多个因子调控并且涉及多个造血组织。这些成熟的血细胞都来自于造血干细胞。造血干细胞是存在于造血组织中的一群多能造血细胞，是生命体维持正常生理功能不可或缺的。然而，目前关于造血干细胞发育的分子机制尚不完善。 中科院动
Nature关注遗传学新动向：人类基因敲除研究
数十年来，生物学家们一直在小鼠或其他动物模型中，通过失活目的基因来进行功能研究。现在这种基因敲除（knockout）研究有了更理想的模型，那就是人类。 当然，这并不是说像处理小鼠那样，对人类进行遗传学改造。事实上，研究者们是通过分析成百上千的人类基因组，在其中寻找失活某个基因的天然突变。他们希
利用I型CRISPRCas系统实现大片段基因敲除
CRISPR-Cas系统是细菌和古细菌中广泛存在的一种由RNA介导抵抗外援病毒或者核酸入侵的“获得性免疫系统”。CRISPR-Cas系统主要分为两大类：I类（Class I）利用多亚基效应复合物来实现对靶标序列的识别和切割过程；而II类（Class 2）则由单一蛋白来执行相关功能，作用机制相对简
广州生物院等建立世界首个基因敲除狗模型
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院和南京大学-南京生物医药研究院、广州医药研究总院等合作，利用CRISPR/Cas9技术成功培育两只肌肉生长抑制素（MSTN）基因敲除狗，在世界上首次建立了狗的基因打靶技术体系。该成果于10月12日在线发表于Journal of Molecular Cell
陈竺、陈赛娟院士Nature子刊发表新文章
来自上海交通大学医学院附属瑞金医院的研究人员对新白血病受累基因IQCG展开研究，揭示出IQCG蛋白的某些功能和分子特征是斑马鱼中造血作用的必要条件。相关研究结果发表在5月2日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 上海交通大学医学院附属瑞金医院的陈竺（Zhu Ch
水生所揭示氧影响宿主抗病毒能力机制
抗病毒先天免疫信号通路与低氧信号通路为细胞中两个经典且古老的信号通路，从高等脊椎动物到低等的无脊椎动物均高度保守。关于这两条通路之间的交互作用，尤其是氧气以及受氧气调控的关键因子在先天免疫信号通路中的作用和机制，是该领域关注的热点。近日，中国科学院水生生物研究所肖武汉团队发现，低氧信号通路核心转录因
Science十大科学突破之单细胞水平细胞谱系追踪
理解任何多细胞生命系统的前提是理解“细胞”，今天，单细胞研究已经不再只是纸上谈兵了，全球已经有许多实验室展开了单细胞研究。 生物通报道：12月21日Science杂志公布了2018年度十大科学突破。今年的Science十大科学突破之首是单细胞水平细胞谱系追踪技术，除此之外，今年的十大科学突破中
控制血糖的“第一反应”细胞发现
应用光遗传技术，研究人员观察到斑马鱼胰腺中的胰岛β细胞。图片来源：物理学家组织网科技日报讯（记者张佳欣）人体是怎么控制血糖平衡的？包括德国德累斯顿理工大学德累斯顿再生治疗中心在内的一个国际团队向破解该谜团又迈出了一步。他们在胰腺中找到了一组特殊的“第一反应”细胞，这些细胞对于触发血糖反应至关重要。相
肠炎造模：DSS在诱导非啮齿类动物肠炎模型的作用1
关于结肠炎动物模型，大家最熟悉的一定是大小鼠模型了。事实上，除了大小鼠，斑马鱼、兔子、豚鼠、猪等动物也可做结肠炎模型。葡聚糖硫酸钠盐（Dextran Sulfate Sodium Salt, DSS）是一种聚离子衍生物，常用于诱导建立动物结肠炎模型，是目前肠炎造模领域的金标准。往期的文章里，小编给大
海马基因组及环境适应进化机制获揭示
记者从中国科学院南海海洋研究所获悉，由该所研究员林强课题组主导，联合德国康斯坦茨大学、新加坡国家科技局和华大基因等共同揭示了海马在海洋近岸和岛礁栖息过程中的体型特化和繁殖适应性进化特征。相关研究12月15日以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 林强团队在国际上率先完成了海马的全基因组研究，揭
新研究发现一种与神经发育异常相关的新型遗传病
近日，发表在《Science Advances》上的一项最新研究中，来自费城儿童医院和普林斯顿大学的研究团队在21个独立家庭中发现了一种与神经发育异常相关的新型遗传疾病。 这种尚未命名的疾病是磷酸化丝裂原活化蛋白激酶（MAP4K4）基因一系列罕见变异的结果。在这项新研究中，研究团队研究了来自2
水生所研究揭示脊椎动物存在IV型干扰素
干扰素（interferon，IFN）是一类广泛存在于有颌脊椎动物体内并以alpha螺旋为结构特征的细胞因子，在机体炎症免疫应答特别是抗病毒免疫应答中发挥着重要的功能。目前，干扰素被分为三种类型，即I型、II型和III型，它们分别利用不同的受体复合物，IFN-αR1/IFN-αR2、IFN-γR1/
转基因技术的渔业应用
利用转基因技术可以改善鱼类养殖性能，增强其抗寒抗病能力，已有多种哺乳类和鸟类的基因被成功地整合到鱼类的基因组中，使转基因鱼的肌肉蛋白含量和饲料转换率明显提高，生长速度加快。此外还可以生产医药制品，譬如将人胰岛素基因导入斑马鱼卵子中，其受精孵化后可生成胰岛素产物。还可利用转基因技术培养观赏鱼等用途。
直读光谱仪是怎么做金属元素的检测的
直读光谱仪可以定性或者定量的分析金属基体中的非金属元素例如C,S,P，甚至N，也可以准确分析金属元素例如钛（Ti），钒（V），铬（Cr），锰（Mn），铁（Fe），钴（Co），镍（Ni），铜（Cu），锌（Zn），硒（Se），锆（Zr），铌（Nb），钼（Mo），钯（Pd），银（Ag）锡（Sn），锑（Sb
直读光谱仪是怎么做金属元素的检测的
直读光谱仪可以定性或者定量的分析金属基体中的非金属元素例如C,S,P，甚至N，也可以准确分析金属元素例如钛（Ti），钒（V），铬（Cr），锰（Mn），铁（Fe），钴（Co），镍（Ni），铜（Cu），锌（Zn），硒（Se），锆（Zr），铌（Nb），钼（Mo），钯（Pd），银（Ag）锡（Sn），锑（Sb
动物所阐明血液循环调控造血干细胞发育分化的分子机理
血液循环为生物有机体提供氧气、营养物质，维持生理稳态，是最重要的生命活动之一。由于血液循环相关基因的敲除小鼠模型早期致死，因此其在早期胚胎发育尤其是造血干细胞发生中的作用研究较少，分子机理尚不清楚。 中科院动物研究所刘峰研究员领导的血液和心血管发育研究组应用遗传学、发育生物学、分子生物学和
生物测试技术运用于消费品安全检测
“小鱼亲测”的首个检测项目为食用油。 你听说过用鱼胚胎来测试消费品安全的吗？5月23日，水中银(国际)生物科技有限公司(水中银)宣布应用全球独家“转基因青鳉鱼”及“斑马鱼”胚胎毒性测试技术于日常食用品及护肤品，并发布全球首个以生物测试技术T esting 2 .0作产品检测的消费品安全信息平台
Cell子刊：修补“破碎的心”的关键
最近，美国索尔克生物研究所的研究人员，通过再激活动物细胞中存在的长期休眠的分子机制，治愈了活体小鼠的受损心脏，这一发现可以帮助人类心脏疾病的新疗法铺平道路。 这一新的研究结果，发表在2014年11月6日的《Cell Stem Cell》杂志，该研究表明，尽管成年哺乳动物通常不能再生受损组织，但
Cell：肌萎缩症基因疗法获重要突破
最近，巴西圣保罗大学生物科学学院（IB-USP）和美国哈佛大学等处的研究人员发现，一个叫Jagged1（简称JAG1）的基因，可能是开发杜氏肌营养不良症（DMD）疗法的一个靶标，DMD是一种遗传性疾病，特征是渐进性肌肉退化。相关研究结果发表在十一月十二日的《Cell》杂志。 这项研究是在人类基