生物物理所等在组蛋白甲基化修饰识别方面取得新进展
10月17日，《美国国家科学院院刊》（Proceedings of the National Academy of Sciences）在线发表了生物大分子国家重点实验室许瑞明、饶子和课题组和北京生命科学研究所（NIBS）朱冰课题组合作的最新研究成果Distinct mode of methylated lysine-4 of histone H3 recognition by tandem tudor-like domains of Spindlin1。 组蛋白甲基化是表观遗传学的核心内容之一，其中关于甲基化的识别是近年来研究的热点。甲基化识别蛋白是表观遗传信号的执行者，它们特异地识别不同位点、不同形式的甲基化修饰，把信号传递给下游与其相互作用的分子，行使表观遗传的生物学功能。许瑞明课题组基于前期基础研究（Genes & Dev. 2003；Science 2006；Genes & Dev.......阅读全文
中国科学院生物物理研究所朱冰研究团队等获国家自然科学奖二等奖
奖 日前，2023年度国家科学技术奖在京揭晓。中国科学院生物物理研究所研究员朱冰作为第一完成人的项目“细胞命运稳定性与可塑性的表观遗传调控机制”被授予2023年度国家自然科学奖二等奖。“每一个人的基因组都来自于父亲和母亲，但爸爸妈妈给我们的基因组效果一样吗？”朱冰告诉《中国科学报》，这个看上去简单的
免疫系统和表观遗传学调控：一个新的前沿领域
表观遗传学（epigenetics）研究转录前基因在染色质水平的结构修饰对基因功能的影响，这种修饰可通过细胞分裂和增值周期进行传递。表观遗传学已成为生命科学中普遍关注的前沿，在功能基因组时代尤其如此。免疫系统被认为是一个解析表观遗传学调控机制的良好模型，而且免疫细胞伯分化及功能表达和表观遗
朱冰：表观遗传学过去，现在，未来
由北京生命科学研究所朱冰研究组领衔完成的Science研究论文，揭示出染色质的紧密程度能调节组蛋白H3K27甲基化酶复合体PRC2的催化活性，从而影响基因转录，这有助于解析基因转录调控以及基因沉默的重要机制。为了更深入追踪这项研究的具体内容，生物通特联系了朱冰研究员，就几个方面请教了他。
Nature－表观遗传学进展将遗传学、环境与疾病联系了起来！
21世纪，表观遗传学的研究得到了快速发展，同时其产生了让研究人员感兴趣和憧憬的东西，当然了，这其中也存在一些大肆宣传的成分，本文中，我们回顾了表观遗传学在过去几十年里是如何演变的，同时分析了近年来改变科学家们对生物学理解的一些研究进展；我们讨论了表观遗传学和DNA序列改变之间的相互作用，以及表观
表观遗传研究指南（二）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
什么是表观遗传调节？
中文名称表观遗传调节英文名称epigenetic regulation定 义与DNA排列顺序的变化无关的,调节基因表达的频率、速度或者表达度的过程。如DNA甲基化、组蛋白修饰等。这种调节不能通过种系或生殖细胞传递,但可通过细胞分裂传给子代,在静止细胞的细胞质中也能稳定地自我繁殖。这种调节的失误或减
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节，这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映，这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
甲基化与lncRNA：表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。研究背景肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，由于环境的污染，肺癌
甲基化与lncRNA：表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，
表观遗传学分子生物学软件——DNA甲基化分析工具
第一类：基于引物设计功能的软件。此类软件主要是针对重亚硫酸盐序列进行甲基化特异性PCR（methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP）和重亚硫酸盐测序（bisulfite sequencing, BS）引物的设计。由于重亚酸盐修饰的特殊性，使常规的分子生物学
蛋白质磷酸化调控基因表达的机制
组蛋白的磷酸化一般导致对应区域基因表达的上调。表观遗传调控包括DNA甲基化，组蛋白修饰（磷酸化，乙酰化，甲基化等）和小RNA调节，是在DNA序列的基础上对基因表达的调节，是细胞分化的本质。如果除去表观遗传调控，人体各个细胞应该是一样的，但是组蛋白修饰在DNA复制过程中不但可以被复制，也可以在相应蛋白
遗传发育所发现植物组蛋白去甲基化酶招募的新机制
核小体作为真核生物染色质的基本单位，由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白N端存在多种共价修饰，这些翻译后修饰通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰（H3K27me3）通过维持基因的沉默状态，在动植物细胞命运决定以及发育中起着重要的调控作用。实验室前期研究
组蛋白甲基化修饰研究再获突破
日前，复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展，相关成果发布在《分子细胞》上，该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。 组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰，参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是
朱健康小组植物DNA去甲基化调控研究获进展
6月15日，《科学》杂志在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心、中科院上海生命科学研究院植物生理生态所朱健康课题组的最新成果，他们研究揭示了编码一个组蛋白的乙酰化酶IDM1在植物去甲基化作用机制中的重要作用。这被认为是近年来表观遗传领域的一项重大突破。 DNA甲基化修饰是一种重要的表
新的基因编辑领域突破口——表观遗传调控（一）
几十年来，DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质，但是近些年不断的研究表明，生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的，比如科学家们发现，可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰，这种改变不仅影响个体的发育，而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起，且与DNA和组蛋白修饰
上海生科院揭示拟南芥DNA主动去甲基化调控新机制
12月9日，《细胞研究》（Cell Research）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase c
金鹏教授Nature子刊解析iPSC与表观遗传
来自埃默里大学的研究人员在新研究中绘制出了体细胞重编程过程中，5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine，5-hmC)在细胞中的动态变化，揭示出在iPS细胞的亚端粒区域存在大量5-hmC介导的异常表观遗传修饰热点。这一研究成果发表在5月19日的《自然细胞生物学》(Natur
NSMB：表观遗传修饰家族又添新成员
最近，来自剑桥大学的研究人员发现了一种新的表观遗传学修饰，进一步壮大了表观遗传修饰的"队伍"。这项发表在国际学术期刊Nature Structural and Molecular Biology上的最新研究表明在人类，小鼠以及其他脊椎动物中存在的DNA修饰种类可能比我们想象的更多。 表观遗传学
清华大学3月连续发文－破译“组蛋白密码”识别新机制
清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组日前在国际权威学术期刊《自然》(Nature, 2014年3月2日)和《基因与发育》(Genes & Dev，2014年3月3日)在线发表两篇论文，从结构生物学角度解析组蛋白甲基化修饰识别新机制，进一步揭开错综复杂的表观遗传
关于组蛋白修饰—DNA甲基的基本内容介绍
在引起基因沉默的过程中，沉默信号（DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配）是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白甲基化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白— 2
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中，沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，目前仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白—
科学家破译“组蛋白密码”识别新机制
记者日前从中科院上海应用物理研究所获悉，清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组利用上海光源生物大分子晶体学线站，从结构生物学角度解析组蛋白甲基化修饰识别新机制，进一步揭开了错综复杂的表观遗传调控的神秘面纱。相关成果近期分别在线发表于《自然》和《基因与发育》杂志。 据了解，真核
2016上半年表观遗传学最受关注的成果
即将进入2016年盛夏，今年也将过去一半，在这几个月里，表观遗传学研究取得了许多成果，让我们来一起回顾下： Neil DNA glycosylases promote substrate turnover by Tdg during DNA demethylation “表观遗传标记如何被从
microRNA的肿瘤抑制因子角色
美国南加州大学的研究人员报道说，一种新的方法通过活化癌细胞基因组中保护性的microRNA的表达，从而使致癌基因的表达水平显著降低。这篇发表在6月的Cancer Cell杂志上的文章证明已知能调节基因表达的制剂还能够影响调节性的RNA。这种调节性的RNA即为microRNA，它能充当正常细胞中的肿瘤
程晓东《自然》文章揭示表观遗传学研究的新线索
来自美国Emory大学华裔教授程晓东（Xiaodong Cheng）领导的研究组发现了小鼠基因组中DNA序列的一种特殊模式，该模式在DNA分子调节基因表达的方式中起到基础性作用。该研究组与来自德国Jacobs大学的同事在8月22日的的《自然》杂志网络版上公布了这些发现。 自从科学家破解了构成人类
ChIPChip技术的介绍与应用
人类基因组计划的完成开启了一个新的纪元——功能基因组时代来临，与基因信息相比较，人们更关注于基因的功能、调控网络与信号通路等信息。表观遗传学研究与核内蛋白因子的功能分析成为基因表达调控研究的重要组成部分。结合了染色质免疫共沉淀与基因芯片技术的ChIP-chip技术的浮现使得全基因组范围内DNA与蛋白
上海植物逆境研究中心在植物DNA去甲基化调控研究进展
6月15日，国际权威学术期刊Science在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心、中科院上海生命科学研究院植物生理生态所朱健康课题组的研究论文A Histone Acetyltransferase Regulates Active DNA Demethylation in
甲基化的甲基化的功能
甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰，调节基因的表达和关闭，与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关，是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。DNA甲基化能关闭某些基因的活性，去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、D
Nature遗传学综述：何川教授详解RNA甲基化
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可调控基因的表达，并由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现， mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用，它
Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰，介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白，但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章，揭示了m6A在Sxl