TheScientist热议:出人意料的甲基化
DNA甲基化是基因组中重要的表观遗传学标志,在大多数生物的生命周期中基因组的甲基化模式都相对稳定。然而近期发表在Genome Biology杂志上的两篇文章显示,有的生物在一生中不断累积着甲基化,有的生物则可能通过甲基化去除大量DNA。 吉林大学刘明远教授所领导的研究团队首次在线虫中发现了基因组甲基化现象,他们还发现旋毛形线虫Trichinella spiralis会随着时间推移累积甲基化标签。刘明远教授在接受The Scientist采访时表示,“我非常惊讶,在我们分析的是一种线虫中,T. spiralis是唯一拥有DNA甲基化的,而且它的甲基化模式如此独特。” T. spiralis会感染包括人类在内的多种哺乳动物。一旦这种寄生虫到达小肠,幼虫就会成熟并交配。新生线虫进入血流,在肌肉组织安家,并被包裹在囊包内休眠,至到它们再次进入新宿主肠道而苏醒 刘明远教授的研究团队与华大基因合作,筛查......阅读全文
表观遗传学关于DNA甲基化
表观遗传学是研究表观遗传变异的遗传学分支学科从目前的研究来看,X 染色体剂量补偿、DNA 甲基化、组蛋白密码、基因组印记、表观基因组学和人类表观基因组计划等问题都是表观遗传学研究的内容。其中甲基化是基因组DNA 的一种主要表观遗传修饰形式,是调节基因组功能的重要手段。在脊椎动物中,CpG二核
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。 CpG岛的异常甲基化是导致基
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。CpG岛的异常甲基化是导致基因沉默和过度表
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
什么是表观遗传学
是研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传修饰,即探索从基因演绎为表型的过程和机制的一门新兴学科。遗传学是指基于基因序列改变所 致基因表达水平变化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等。而表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲基化和染色质构象变化等;表观基因组
甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,
甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。研究背景肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,由于环境的污染,肺癌
表观遗传学分子生物学软件——DNA甲基化分析工具
第一类:基于引物设计功能的软件。此类软件主要是针对重亚硫酸盐序列进行甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP)和重亚硫酸盐测序(bisulfite sequencing, BS)引物的设计。由于重亚酸盐修饰的特殊性,使常规的分子生物学
程晓东《自然》文章揭示表观遗传学研究的新线索
来自美国Emory大学华裔教授程晓东(Xiaodong Cheng)领导的研究组发现了小鼠基因组中DNA序列的一种特殊模式,该模式在DNA分子调节基因表达的方式中起到基础性作用。该研究组与来自德国Jacobs大学的同事在8月22日的的《自然》杂志网络版上公布了这些发现。 自从科学家破解了构成人类
孙方霖:表观遗传学-后基因组时代的领舞者
DNA双螺旋的解码者、诺贝尔奖获得者Watson说:“你可以继承DNA序列之外的一些东西。这正是现在遗传学中让我们激动的地方。” 不久前,美国国立卫生研究院利用由“路标计划”管理的新基金,启动了表观基因组学研究计划,一批表观遗传学项目和研究人员将获得数百万到上千万美元的经费支持。几乎在同时,国家自然
Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A在Sxl
Nature发表表观遗传学重要发现-决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。 伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月,中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组,与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究,发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
著名遗传学家表观遗传学新成果
可卡因成瘾性的一个主要挑战在于,在戒断期之后的高复发率。但新的研究表明,在药物戒断过程中,我们DNA的变化可能为更有效的成瘾疗法开发,提供了有希望的方法。 加拿大麦吉尔大学和以色列巴尔依兰大学的研究人员,将这项研究结果发表在最近的《Journal of Neuroscience》。他们指出,戒
《科学》推出“表观遗传学”专题
10月29日出版的《科学》杂志刊登专题——《表观遗传学》(Epigenetics)。专题导言文章《什么是表观遗传学》(What Is Epigenetics?)说,多细胞有机体的细胞名义上拥有同样的DNA序列(因而拥有同样的遗传指令系统),但是它们却维持着不同的显型。这种记录了发育和环
表观遗传学和人类疾病
上个世纪50年代初,Watson和Crick建立了DNA分子结构模型,极大程度地促进了生命科学的发展。自此遗传学便成为现代医学研究领域中一个重要的分支。人类已经认识到基因突变可以导致疾病的发生,如慢性进行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纤维化等。近年来
表观遗传学名词解释
表观遗传学(英语:epigenetics)又译为表征遗传学、拟遗传学、表遗传学、外遗传学以及后遗传学,在生物学和特定的遗传学领域,其研究的是在不改变DNA序列的前提下,通过某些机制引起可遗传的基因表达或细胞表现型的变化。表征遗传学是1980年代逐渐兴起的一门学科,是在研究与经典的孟德尔遗传学遗传法则
续写十大科学突破-Science公布重要甲基化图谱
来自耶路撒冷希伯来大学的科学家们在一项最新研究中,重构了尼安德特人与丹尼索瓦人的DNA甲基化图谱,并将其进行了比对,这对于深入探索表观遗传学调控机制,以及表观遗传差异造成的形态学差异具有重要意义。 2010年,2012年Science十大科学突破接连聚焦于古人类的DNA基因组序列测定结果,
精准医疗:再吸金€6.7亿,4篇Nature奠定临床新技术
近年来,随着基因组学技术在医疗领域的广泛应用,全球范围内对疾病的诊疗能力有了很大的提高,各国政府也纷纷制定了相关的医疗计划,并投入大量的资金。近日法国首次宣布启动《法国基因组医疗2025》计划,精准医疗再度吸来重金。疾病诊疗技术是精准医疗得以实现的关键,6月27日,Nature平台连发四篇文章证
生活环境和生活方式会影响你的表观基因组
法国巴斯德研究所和CNRS领导的一项基因组研究,首次证实生活环境和生活方式能够影响我们的表观基因组。表观基因组控制着我们基因的表达,但不影响基因的序列。 研究人员发现,从森林迁移到城市对人类免疫应答的表观遗传学模式有深远的影响。而生活方式(定居耕种或游牧狩猎)主要影响较为持久的机能,比如发育相
PNAS发布人类胎盘甲基化组
甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体
PNAS发布人类胎盘甲基化组
甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体
PNAS首次评估表观遗传学突变率
Groningen大学的科学家们在重要模式生物拟南芥中,精确评估了表观遗传学标志出现或消失的频率,有助于深入理解表观遗传学改变在植物进化中的重要性。这项研究发表在五月十一日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下影响基因的活性。大多数动物(包括人类)的
Nature-表观遗传学进展将遗传学、环境与疾病联系了起来!
21世纪,表观遗传学的研究得到了快速发展,同时其产生了让研究人员感兴趣和憧憬的东西,当然了,这其中也存在一些大肆宣传的成分,本文中,我们回顾了表观遗传学在过去几十年里是如何演变的,同时分析了近年来改变科学家们对生物学理解的一些研究进展;我们讨论了表观遗传学和DNA序列改变之间的相互作用,以及表观
GenomeResearch:双生子表观基因组研究
基因决定了人生命中的方方面面,不过环境也能对基因产生强烈的影响,这种影响在人出生前就已产生,而且其造成的影响将会伴随人的一生。日前,研究人员首次展示了子宫内环境对新生儿表观遗传学图谱的影响,即我们出生时就带有的DNA化学修饰,这项研究将为人们提供宝贵的疾病风险信息。文章发表在7月16日的Geno
表观遗传之DNA甲基化(一)
俗话说,龙生龙,凤生凤,老鼠的儿子会打洞。 这句话什么意思呢?想必很多人有不同的看法~~ 从传统的社会认知角度看,就是“出生决定论”,一个人的出生是什么样的,以后就会有什么样的作为和成就,家庭决定着个人的前途和发展方向。龙凤阶层的人自出生以来便是龙凤,若是草根阶层,也很难上升到龙凤圈层,即使有这样的
表观遗传之DNA甲基化(二)
二 DNA甲基化 DNA甲基化:DNA甲基化是通过DNA甲基转移酶在胞嘧啶环的第5个碳原子上共价加成甲基而产生的,从而产生5-甲基胞嘧啶(5-mC),在体细胞中,几乎仅在二核苷酸CpG的对称甲基化配对中发现了5-mC,而在胚胎干(ES)细胞中,在非CpG中也观察到了大量的5-mC。5-mC作为表型和
家蚕高分辨率甲基化图谱成功构建
作为表观遗传学的一种重要标记,DNA甲基化在基因组防御、基因调控等方面都发挥着重要作用。相对于动植物,昆虫甲基化水平很低,其功能也一直存在争议。近年来,随着越来越多昆虫甲基化基因和甲基化酶的报道,昆虫甲基化的功能和生物学意义引起了广泛的兴趣。 近期,中国科学院昆明动
两篇Nature论文挑战流行表观遗传学观点
Friedrich Miescher生物医学研究所(FMI)的Dirk Schübeler和他的研究团队,确定了沿着基因组设置表观遗传学标记的决定因素。这项发表在《自然》(Nature)杂志上的新研究表明,基因活性和DNA序列在对表观遗传标记的调控中发挥了比以往认为更大的作用。这对流行的观点:外
中科院Cell发表表观遗传突破性发现
来自中科院北京基因研究所的研究人员在斑马鱼实验中证实,早期胚胎过程中维持了精子而非卵母细胞的DNA甲基化组(Methylome)。这一突破性的研究发现以封面文章形式发表在5月9日的《细胞》(Cell)杂志上。 来自中科院北京基因研究所的刘江(Jiang Liu)博士和慈维敏(Weimin