中心体“RNA基因组”的重大发现
基因组是有编码蛋白质的DNA组成，但是细胞核的一个关键部分还有一种特有的基因组，它由RNA构成，而RNA通常是从基因到蛋白质的中介物——这意味着这种奇怪的实体可能是RNA世界的一个分子遗迹，它先于DNA的进化并使人们更加相信生命最初依赖于RNA的假说。 RNA存在于中心体（centrosome）。对细胞分裂至关重要的中心体会在细胞分裂成两半之前向细胞的两极运动。它们锚定在附着在被复制染色体上的蛋白质链上，并帮助将姐妹染色体拉开，从而使每个新细胞只有每条染色体的一个拷贝。在参与这项工作时，一个中心体本身会进行自我复制。数十年来，研究人员一直争论这些锚是否有它们自己的“基因组”，如果是这样，那么它的核酸序列是DNA还是RNA? 路易斯安那州立大学的Alliegro和他的妻子Mary Anne以及Rensselear Polyt......阅读全文
Nature惊人发现：RNA，修复损伤的模板
能够准确地修复自发的错误、氧化或诱变剂导致的DNA损伤对于细胞生存至关重要。这种修复通常是利用完全相同或同源的完整DNA序列来实现。但科学家们现在证实，在一种常见芽殖酵母细胞内RNA可充当模板用来修复破坏性最大的DNA损伤——DNA双链断裂。 尽管较早的研究表明了将RNA寡核苷酸导入到细胞中可
Nature重要发现：独特的非编码RNA
我们的皮肤表皮是由许多不同细胞类型构成的混合体，每种细胞类型都有非常明确的职责。这样复杂的组织，其生成或分化在细胞水平上需要进行大量的协调，这一过程发生故障可以导致灾难性的后果。现在，来自斯坦福大学医学院的研究人员确定了这一分化过程的一个主要调控因子。研究成果发表在12月2日的《自然》(Natu
小RNA（tsRNA）的发现与临床价值
转移 RNA (tRNA) 衍生的小RNA (tsRNA) 是一种新型的非编码小 RNA，可通过酶从 tRNA 上切割下来，在转录和翻译水平调节基因表达。tRNA的化学修饰可以直接影响 tsRNA 的产生和生物学功能。tsRNA参与多种疾病的发病机制，包括免疫紊乱、代谢紊乱和恶性肿瘤的发展，并且是各
关于信使RNA的发现时间介绍
储存在DNA分子中的这种遗传信息能在复制中产生更多的拷贝，并翻译成蛋白质。DNA的功能构成了信息的流动，遗传信息如何转变成蛋白质呢？转录就是其中的重要的一环。基因表达时以DNA的一条链为模板合成RNA，这一过程就是转录（transcription）。催化合成RNA的酶叫做RNA聚合酶（RNA p
概述RNA噬菌体的基因组结构和功能
研究最清楚的大肠杆菌RNA噬菌体是MS2，R17，f2和Qβ。它们的基因组小，只有3600到4200个核苷酸，包含四个基因。MS2.R17和f2具有几乎一样的基因组结构。在四个基因中有两个基因编码噬菌体的结构蛋白：一个是A蛋白的基因，长1178个核苷酸。A蛋白（称为成熟蛋白）的功能是使噬菌体能识
PNAS：基因组测序的惊人发现
科学家们发现，水母（平凡的海洋生物）经过漫长的进化变成了生活在其它动物体内的奇特寄生虫。这项研究发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 Myxozoa是感染无脊椎动物和脊椎动物宿主的微小寄生虫，由少数几个细胞组成。美国堪萨斯大学的研究人员对这种生物进行了基因组测序，发现它们实际上是高度
从总－RNA－中除去基因组－DNA－实验
试剂、试剂盒 变性（甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇 甲醛MOPS 缓冲液乙二胺四乙酸MOPS乙酸钠酚 氯仿（3:1) 溶液氯仿液体酚Tris-HCl电泳缓冲液仪器、耗材 离心机和转头离心管配胶板微波炉实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂变性（甲醛)琼脂糖凝胶（配制过程见第 18步）
从总－RNA－中除去基因组－DNA－实验
为了进行 FDD 基因表达的分析，以及使用任何其他基于 RNA 的基因表达技术，在反转录合成单链 cDNA 和后续的 PCR 操作之前，必须除掉污染的基因组 DNA。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒变性（甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇甲醛MOPS
从总－RNA－中除去基因组－DNA－实验
从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验 试剂、试剂盒 变性（甲醛)琼脂糖凝胶 琼脂糖 蒸馏
《PNAS》:RNA“质检员”被发现
在8月14日的《PNAS》网络版上，来自日本京都大学的研究人员发表的最新研究成果发现，脊椎动物细胞内有一套严格的"质量管理"机制来确保只有正确的信息从细胞核传递到细胞质，以防止不可靠信息在蛋白质合成过程中发挥作用。 DNA复制过程是以DNA双链中的一条链为模板合成的RNA，而由于合成蛋白组的核糖体在
Cell重要发现：RNA命运由谁定？
由DNA转录过来后，RNA可继续走向多种命运。虽然最为人熟悉的道路是直接促成了蛋白质的生成，RNA分子自身也能够改变基因的表达。新研究帮助解释了实现RNA序列命运的机制。 在发表于8月27日《细胞》（Cell）杂志上的一项研究中，洛克菲勒大学的科学家与哥伦比亚大学的同事证实一种蛋白质识别了附着
RNA测序发现杂交蝉遗传证据
据英国《通讯·生物学》杂志近日发表的一项动物学研究，日本科学家通过RNA测序，出乎意料地发现了13年蝉与近亲17年蝉杂交的遗传证据，而这两种蝉至少221年才相遇一次。研究显示，杂交蝉在极其漫长时间里都维持了各自不同的生命周期，目前科学家无法就这种平行趋异演化给出遗传学解释。长期以来，周期蝉的生命
GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组
多伦多大学的科学家们发现，作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白（C2H2-ZF）实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究，有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员，是规模最大的一种人类蛋白。然而，人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-
提取的基因组DNA有RNA－污染如何解决？
得到的基因组在进行常规下游实验如，PCR、酶切、分子杂交等生物学实验时如不能顺利进行，主要因为DNA 样品不纯，含有蛋白、有机溶剂和盐类等杂质影响内切酶或DNA 聚合酶的活性。 1)实验过程中没有有效使用RNase A，应严格按照实验要求进行。 2)RNase A失活： RNase A应
单细胞RNA测序发现新的免疫细胞
最近在《Nature Immunology》发表的一项新研究，详细检测了一组新发现的免疫细胞（被称为ILC）。通过对单个扁桃体细胞的基因表达进行分析，瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们，发现了三个以前未知的ILC子群，并揭示了关于“这些细胞在人体中如何发挥功能”的更多信息。 先天淋巴细胞（ILC）是
科学家发现新的RNA降解机制
在任何时候，一个生物体中的全部RNA分子，都是一段微妙的舞蹈所产生的产物。基因必须是“打开”或表达的，以便于把DNA转化为RNA，然后RNA被转化成蛋白质，才能完成一个生物体的生理需求。但是，同样重要的是，那些RNA转录本一旦不再需要就必须被清除。 最近，宾夕法尼亚大学的研究人员对于后面这个过
首批月球样品重大发现！
“嫦娥五号”采集的首批月球样品，能为我们揭示月球的哪些奥秘？这一问题近期有了部分答案。12月13日，中国科学院紫金山天文台发布消息称，该台徐伟彪研究员及其行星化学科研团队联合南京地质古生物研究所合作完成的一项关于嫦娥五号首批月球样品的研究成果，近期在线发表于我国综合类学术期刊《科学通报》（《Sc
首批月球样品重大发现！
“嫦娥五号”采集的首批月球样品，能为我们揭示月球的哪些奥秘？这一问题近期有了部分答案。12月13日，中国科学院紫金山天文台发布消息称，该台徐伟彪研究员及其行星化学科研团队联合南京地质古生物研究所合作完成的一项关于嫦娥五号首批月球样品的研究成果，近期在线发表于我国综合类学术期刊《科学通报》（《Sc
Science|人类细胞中心体多样性为神经系统疾病提供新线索
德国慕尼黑大学神经生物学者Magdalena Götz正在寻求重要的线索，以阐明神经系统疾病的原因。在一项新的研究中，Götz及其团队对人类中心体（centrosome）有了新的认识，而中心体的功能障碍与许多神经发育障碍有关。相关研究结果发表在2022年6月17日的Science期刊上，论文标题
重大发现：精准基因编辑的机制
CRISPR相关蛋白（Cas）和其他靶向核酸酶彻底改变了我们操作基因组的能力，但是在靶向双链断裂时外源DNA的精确敲入（KI）仍然很困难。成功的KI既需要通过靶向核酸内切酶进行有效切割，又需要募集内源性DNA修复因子，以将所需编辑整合到宿主基因组中。然而，尽管在基因组上有针对性地断裂的能力已经获
Nature发布大型全基因组RNA分析研究
由来自宾夕法尼亚州立大学的化学家和植物生物学家领导的一个研究小组开发出了一种分子技术，将有助于科学团体以从前不可能达到的规模，来分析在基因表达调控中起重要作用的分子。 科学家们开发出了一种方法，能够更精确预测在活细胞内核糖核酸分子(RNAs)的折叠情况，由此阐明植物以及其他的活体生物对环境
植物基因组DNA及总RNA提取技术1
幼嫩组织的细胞处于旺盛的分裂阶段，核较大而胞质较少，核酸浓度高，且内含物少、次生代谢产物少，蛋白质及多糖类物质相对较少，在SDS或 CTAB物质存在时，经机械研磨，使细胞破裂并释放出内含物，提取的DNA、RNA的产量高，纯度好。 提取DNA所用的提取液、吸头、离心管等需要高压灭菌以灭活DNase。R
植物基因组DNA及总RNA提取技术2
（二）植物总RNA提取 （1）65°C水浴中预热15 mL CTAB提取液。 （2）液氮中研磨2～3 g新鲜或-70°C冷冻的材料。 （3）转移样品至有CTAB提取液的离心管中，立即激烈涡旋30s，短时放回 65°C水浴中（4～5 min）。 （4）加入等体积的氯仿/异戊醇并涡旋混合，10000 r
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止？
近日，南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化（polyadenylation）的转录本在
非编码RNA调控作用机制重大研究计划项目申报
关于发布“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2014年度项目指南的通告 国科金发计〔2014〕59号 国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2014年度项目指南，请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事
潘滔教授Nature－Methods发布RNA测序重大突破
来自芝加哥大学、德克萨斯大学奥斯汀分校的研究人员报告称，他们开发出了一种新方法实现高效定量高通量tRNA测序。这种叫做DM-tRNA-seq的技术适用于在所有生物体中开展tRNA研究。这一重要的研究成果发布在7月27日的《自然方法》（Nature Methods）杂志上。 芝加哥大学生物化学和
PNAS颠覆性发现：RNA自行打包
利兹大学的研究人员解析了简单RNA病毒生命周期中的关键阶段，开辟了抵御病毒疾病的新战线。 研究人员首次在单分子水平上观察到了单链RNA病毒的核心遗传物质(基因组)将自己打包进入蛋白衣壳的全过程。利兹大学Peter Stockley教授介绍说，这项结果颠覆了人们对病毒包装过程的普遍认知，
学者首次发现植物环状RNA编码蛋白
华南农业大学植物保护学院周国辉教授/杨新副研究员团队在国家自然科学基金等项目的资助下，首次发现植物环状RNA编码多肽的功能，并揭示该多肽赋予水稻对多种病原物的广谱抗性。2月25日，相关成果发表于《新植物学家》（New Phytologist）。水稻条纹花叶病毒的感染促进水稻植株中circ-WRKY9
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
怎么样在RNA提取时避免基因组的污染
260/280的比值可以判断比较严重的基因组污染。也可以通过跑琼脂糖胶看加样孔里亮不亮作为一个参考依据。其实一般很难保证RNA没有基因组污染的，特别是加入氯仿后的剧烈震荡会促进dna溶解到水相里，后面就很难分离了。有些许的基因组污染的样品也能够满足大部分的实验要求。所以在rt-pcr等试验中才要求设