基因芯片的主要类型
目前已有多种方法可以将寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上。这些方法总体上有两种,即原位合成( in situ synthesis )与合成点样两种。支持物有多种如玻璃片、硅片、聚丙烯膜、硝酸纤维素膜、尼龙膜等,但需经特殊处理。作原位合成的支持物在聚合反应前要先使其表面衍生出羟基或氨基(视所要固定的分子为核酸或寡肽而定)并与保护基建立共价连接;作点样用的支持物为使其表面带上正电荷以吸附带负电荷的探针分子,通常需包被以氨基硅烷或多聚赖氨酸等。 原位合成法主要为光引导聚合技术( Light-directed synthesis ),它不仅可用于寡聚核苷酸的合成,也可用于合成寡肽分子。光引导聚合技术是照相平板印刷技术( photolithography )与传统的核酸、多肽固相合成技术相结合的产物。半导体技术中曾使用照相平板技术法在半导体硅片上制作微型电子线路。固相合成技术是当前多肽、核酸人工合成中普遍使用的方法,技术成熟且已实现自......阅读全文
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究
基因芯片技术具有快速多样、微型化和自动化等特点在生物医学领域广泛的应用。但由于其基本原理是基于核酸杂交技术,有着内在的缺陷,实验的敏感性和重复性都存在一定问题。核酸杂交较适合于检测基因的表达,不易检测基因组DNA的基因的重排,突变和缺失。而大多数肿瘤性疾病和一些遗传变异和表型的改变与后者有关。为了解
基因芯片的应用药物筛选和新药开发
由于所有药物(或兽药)都是直接或间接地通过修饰、改变人类(或相关动物)基因的表达及表达产物的功能而生效,而芯片技术具有高通量、大规模、平行性地分析基因表达或蛋白质状况(蛋白质芯片)的能力,在药物筛选方面具有巨大的优势。用芯片作大规模的筛选研究可以省略大量的动物试验甚至临床,缩短药物筛选所用时间,提高
基因芯片数据处理流程与分析介绍
当人类基因体定序计划的重要里程碑完成之后,生命科学正式迈入了一个后基因体时代,基因芯片 (microarray) 的出现让研究人员得以宏观的视野来探讨分子机转。不过分析是相当复杂的学问,正因为基因芯片成千上万的信息使得分析数据量庞大,更需要应用到生物统计与生物信息相关软件的协助。要取得一完整的数据结
基因芯片,百姓受益的检测技术
复杂的医学诊断可以再快些、精准些、费用再低些吗?基因芯片的出现及广泛应用或将解决这个问题。 去年11月,昆明寰基生物芯片开发有限公司基因芯片医学检测中心在云南国家级经济技术开发区海归创业园落成。这是我省首个专业基因芯片医学检测中心,也是国内唯一以基因芯片技术为核心的第三方医学检验机构,设计检测
基因测序为何代替不了基因芯片以及PCR?
新一代基因测序技术在最近五年飞速发展,这吸引了不少人的目光,做为精准医疗的基础,之前市场上的报告都集中关注于基因测序。于是原本红火的基因芯片技术沉寂了不少。早些 年,有人甚至预言,芯片技术面临消亡。诚然,在某些方面,新一代测序让芯片失色,但就 很多应用而言,芯片仍然是不可取代的。 芯片和高通
基因芯片技术在疟疾研究中的应用
随着人类基因组( human genome p roject, HGP) 、多种模式生物(model organism)和部分病原体基因组测序的完成,基因序列数据以前所未有的速度不断增长。传统实验方法已无法系统地获得和诠释日益庞大的基因序列信息,研究者们迫切需要一种新的手段,以便大规模、高通
基因芯片技术的应用和发展趋势
随着基因芯片技术的日渐成熟, 在功能基因组、疾病基因组、系统生物学等领域中得到了广泛的应 用, 已经发表了上万篇研究论文, 每年发表的论文呈现增长的趋势. 芯片制备技术极大地推进了生物芯片的发展, 从实验室手工或机械点制芯片到工业化原位合成制备, 从几百个点的芯片到几百万点的高密度芯片, 生物芯片从
基因芯片技术及其研究现状和应用前景
摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国
基因芯片制作时的点样方法有哪些
点样方法: 点样分子可以是核酸也可以是寡核酸。一些研究者采用人工点样的方法将寡核苷酸分子点样于化学处理后的载玻片上,经一定的化学方法处理非干燥后,寡核苷酸分子即固定于载玻片上,制备好的DNA芯片可置于缓冲液中保存。
基因芯片与RNAseq的比较分析
基因芯片 vs RNA-seq哪个好 ?最近几年二代测序(又叫NGS)很火,而且价格越来越便宜,原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的,好像不少都换用RNA-seq了。那么,到底选择哪种更好呢?今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。常见误区一:测序的准确性高,获得的信息
基因芯片技术及其研究现状和应用前景
摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国
基因芯片的测序原理是杂交测序方法
基因芯片的测序原理是杂交测序方法 随着人类基因组(测序)计划( Human genome project )的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而 , 怎样去研究如此众多基因在生命过程中所
实验室检验检测工具基因芯片
基因芯片(genechip)(又称DNA芯片、生物芯片)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的
基因芯片制作时的点样方法有哪些
点样方法: 点样分子可以是核酸也可以是寡核酸。一些研究者采用人工点样的方法将寡核苷酸分子点样于化学处理后的载玻片上,经一定的化学方法处理非干燥后,寡核苷酸分子即固定于载玻片上,制备好的DNA芯片可置于缓冲液中保存。
基因芯片技术的应用医学疾病诊断
基因芯片作为一种先进的、大规模、高通量检测技术,应用于疾病的诊断,其优点有以下几个方面:一是高度的灵敏性和准确性;二是快速简便;三是可同时检测多种疾病。如应用于产前遗传性疾病检查,抽取少许羊水就可以检测出胎儿是否患有遗传性疾病,同时鉴别的疾病可以达到数十种甚至数百种,这是其他方法所无法替代的,非常有
用于基因芯片分析的血液样品的准备
用于基因芯片分析的血液样品的准备可用于:(1)基因表达分析;(2)分析血液中白细胞的基因表达情况。实验方法原理基因芯片(genechip)(又称DNA芯片、 生物芯片)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是 杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片
基因芯片合成后点样法的优缺点分析
主要优点是:保持探针长度均一,成本低用途广泛。缺点是:密度达不到原位合成法的水平,点之间重复性差。但经过改进,已可在6.5cm2 的范围内容纳100000个核酸位点已为从事基础研究的实验室广泛采用。
全球首张耳聋基因芯片应用获新成果
全球首张耳聋基因芯片应用取得新成果,北京等地众多被检测出携带耳聋基因的新生儿,将可避免“一针致聋”。由清华大学程京院士领衔的生物芯片研究团队研制的世界上第一款遗传性耳聋基因检测芯片,从待检测的人身上获取一点血液,就可以检测其是否携带耳聋基因突变位点。截至目前,北京市由政府提供专项资金,已为39万
基因芯片技术的应用生态环境保护
在环境保护上,基因芯片也广泛的用途,一方面可以快速检测污染微生物或有机化合物对环境、人体、动植物的污染和危害,同时也能够通过大规模的筛选寻找保护基因,制备防治危害的基因工程药品、或能够治理污染源的基因产品。
基因芯片发现帕金森症相关的新基因
最近,科学家利用来自18,000多名患者的数据,发现了20多个帕金森病相关的遗传风险因子,包括6个以前没有报道过的。相关研究结果发表在2014年7月27日的《Nature Genetics》,该研究部分由美国国立卫生研究院(NIH)资助,在NIH实验室内完成。 本文资深作者、NIH国家老龄化研
基因芯片技术及其研究现状和应用前景(二)
2.3 分子杂交 样品DNA与探针DNA互补杂交要根据探针的类型和长度以及芯片的应用来选择、优化杂交条件。如用于基因表达监测,杂交的严格性较低、低温、时间长、盐浓度高;若用于突变检测,则杂交条件相反(5)。芯片分子杂交的特点是探针固化,样品荧光标记,一次可以对大量生物样品进行检测分析,杂交过程
基因芯片技术的应用药物筛选和新药开发
由于所有药物(或兽药)都是直接或间接地通过修饰、改变人类(或相关动物)基因的表达及表达产物的功能而生效,而芯片技术具有高通量、大规模、平行性地分析基因表达或蛋白质状况(蛋白质芯片)的能力,在药物筛选方面具有巨大的优势。用芯片作大规模的筛选研究可以省略大量的动物试验甚至临床,缩短药物筛选所用时间,提高
染色体核型分析与基因芯片的区别
检测条件不同 核型分析需要新鲜的“活细胞”,需要细胞培养,若细胞培养失败,则检测失败,并且细胞生长周期比较长,因此核型分析的报告周期比较长。 基因芯片检测对象为DNA,不需要细胞培养,成功率高,报告周期短。 检测分辨率不同 芯片依赖其密布的探针,检测染色体上对应位点的信号,来判断同一染色
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究(五)
3.讨论 随着近年基因芯片技术的发展,研究者逐渐认识到基于核酸杂交原理的传统基因芯片缺陷与应用的局限性。随着PCR技术的进展,特别是荧光定量PCR技术的出现PCR技术已成为生物医学领域中应用最广泛的技术。如果一种基因芯片能直接进行PCR反应,而且能够同时扩增大批可能发生变异的基因显然会有广泛
基因芯片技术在疾病诊断领域的应用
基因芯片作为一种先进的、大规模、高通量检测技术,应用于疾病的诊断,其优点有以下几个方面:一是高度的灵敏性和准确性;二是快速简便;三是可同时检测多种疾病。如应用于产前遗传性疾病检查,抽取少许羊水就可以检测出胎儿是否患有遗传性疾病,同时鉴别的疾病可以达到数十种甚至数百种,这是其他方法所无法替代的,非常有
基因芯片杂交结果中的常见问题
基因芯片杂交结果中的常见问题问题可能原因解决方案杂交点模糊、毛边DNA浓度过高降低DNA探针浓度进行芯片的打印紫外交联时未能有效固化DNA检测紫外灯,将其能量值调试至合适值;将打印好的芯片置80℃烤2~4h。杂交时盖片移动杂交时将盖片放正,杂交过程中避免其移动;预先用水和普通载玻片练习放置盖玻片。没
基因芯片杂交结果中的常见问题
基因芯片杂交结果中的常见问题问题可能原因解决方案杂交点模糊、毛边DNA浓度过高降低DNA探针浓度进行芯片的打印紫外交联时未能有效固化DNA检测紫外灯,将其能量值调试至合适值;将打印好的芯片置80℃烤2~4h。杂交时盖片移动杂交时将盖片放正,杂交过程中避免其移动;预先用水和普通载玻片练习放置盖玻片。没
基因芯片技术在疟原虫研究中的应用
基因芯片技术的出现有力地促进了人们对疟原虫生物学的认识。早在2000年,恶性疟原虫的基因组测序尚未完成, Hayward等根据恶性疟原虫绿豆核酸酶基因文库, 制成“鸟枪”DNA ( shotgunDNA)芯片,分析了疟原虫滋养体和配子体之间的基因表达差异,为疟原虫发育阻断剂和疫苗研究提供了有益线
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究(一)
郝麟1) 朱平1)* 于晓梅2) 张大成2) 赵新生3) 欧阳贱华3 (1)北京大学第一医院 北京 100034; 2)北京大学微电子学研究所 北京100871; 3)北京大学化学与分子工程学院 北京100871) 目的: 我们设计一种含有大量微反应池的PCR基因芯片,能对基因的重
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究(二)
1.3.2 PCR-SSCP方法分析按照我室常规进行。 1.3.3 Taqman荧光探针 以发现的ALAS2基因第五外显子点突变为中心设计,序列如下: 5’ (荧光集团)FAM-CAAGATCATAGAGAAGAAAC- TAMRA(淬灭集团) 3’,设计Taqman荧光PCR反应的上下