单细胞和空间组学技术在肝脏领域的应用
近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞技术及空间组学技术,论述了这些技术在肝脏研究的前沿进展,总结归纳了相关计算生物学策略,并对未来的发展方向提出了新思考。 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing)与空间组学(spatially resolved techniques)作为新兴技术,被越来越多地运用于肝脏研究,推动了肝脏领域的发展。随着肝脏单细胞及空间数据的积累,计算生物学分析策略和工具不断丰富和完善,并展现出多元特征。多样化的实验及分析方案加快了肝脏研究的进程,但为设计目的导向型的单细胞或空间组学实验及策略提出了新挑战。 该文章介绍了......阅读全文
单细胞和空间组学技术在肝脏领域应用
近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞
单细胞和空间组学技术在肝脏领域的应用
近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞
肝脏生物学中单细胞和空间组学技术的成果与挑战
近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞
空间转录组和单细胞转录组测序联合应用的典型案例
单细胞转录组测序技术的如火如荼,伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展,可以看到,在现有的高通量检测技术领域,这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展,到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展,相信在接
单细胞分析技术在肿瘤学中的应用
肿瘤异质性研究:通过分析肿瘤组织中的单个癌细胞,揭示不同癌细胞之间的基因表达、突变和蛋白水平的差异,为理解肿瘤的发生、发展和耐药机制提供关键信息。例如,在乳腺癌中,发现某些肿瘤细胞具有特定的基因突变,导致对特定治疗药物产生抗性。肿瘤微环境分析:了解肿瘤细胞与免疫细胞、基质细胞等微环境成分之间的相互作
单细胞在医药领域的应用
单细胞在医药领域的应用非常广泛,以下为您详细介绍:疾病机制研究神经退行性疾病:如阿尔茨海默病、帕金森病等。通过单细胞分析,可以了解不同类型神经细胞的基因表达变化、蛋白质组学特征以及细胞间通讯的异常,从而揭示疾病的发病机制。心血管疾病:研究心肌细胞、内皮细胞、平滑肌细胞等在疾病状态下的基因表达和功能改
单细胞在医学领域的应用
单细胞在医学领域有着广泛而重要的应用,包括但不限于以下几个方面: 1. 疾病诊断 - 肿瘤诊断:通过分析肿瘤组织中的单细胞,可以更精确地了解肿瘤细胞的异质性,区分不同亚型的肿瘤细胞,有助于肿瘤的早期诊断、分型和预后评估。例如,在乳腺癌中,单细胞分析可以识别出具有不同转移潜能的肿瘤细胞。
布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略
摘要 * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征; * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像; * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict
单细胞分析技术在免疫学中的应用
免疫细胞分型和功能研究:精确区分不同类型的免疫细胞,如 T 细胞、B 细胞、巨噬细胞等,并了解它们在免疫应答中的功能变化。这对于自身免疫性疾病、感染性疾病和免疫缺陷病的诊断和治疗具有重要意义。比如,在类风湿关节炎患者中,分析滑膜组织中的免疫细胞,揭示异常的免疫激活状态。免疫治疗监测:评估免疫治疗(如
时空分辨单细胞测序技术在医疗领域的应用前景
时空分辨单细胞测序技术在医疗领域的应用前景十分广阔,包括但不限于以下几个方面:癌症诊断与治疗早期诊断:更精确地识别癌前病变细胞,在肿瘤形成的早期阶段进行检测。肿瘤分型:确定肿瘤的分子亚型,为个性化治疗提供依据。监测治疗反应:实时跟踪肿瘤细胞在治疗过程中的变化,评估治疗效果。发现转移灶:明确肿瘤细胞的
2018年新技术:空间转录组学技术
——也许不久的将来,定位组织中的基因表达就会成为一种常规技术了。 对于基因表达研究来说,空间一直都是具有挑战性的前沿研究领域。但是随着越来越多的研究人员获得了技术进展,这已经不再是令人望而生畏的领域了。这些方法的多样性和创造性使其成为一个值得关注的技术方向。 空间基因表达对于理解组织中细胞的
空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用
空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。空间转录组测序运用方向(Trends Biotechn
空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用
空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。 空间转录组测序运用方向(Trends Bi
单细胞分析技术的应用领域
肿瘤研究:有助于鉴别癌前侵袭、分析原发性肿瘤的克隆进化、研究肿瘤内异质性、解析肿瘤微环境的重编程、探索肿瘤转移机制和治疗抵抗(耐药性)等。与常规的 RNA 测序分析相比,其优势在于更容易找出在治疗和预后条件下有差异表达基因的细胞,同时可以重建分化谱系和差异表达亚型,推断描述克隆亚结构、克隆谱系、重建
糖组学的概念、研究技术和应用
概念:醣体学(Glycomics)是生物学的一个学门,专门研究寡醣类(oligosaccharide)构造与功能。Glycomics一词是从表示糖或甜味的「glyco-」与基因体学(genomics)和蛋白质体学(proteomics)之命名规律而来。此规律也导致了醣体(glycome)一字的出现,
Namocell单细胞分离仪在单细胞测序领域的应用
9月26至27日2019年细胞产业大会暨2019第四届(上海)细胞与肿瘤医疗高峰论坛在上海新南雅酒店举行。本届会议,邀请了全国30位专家学者、人物演讲、40家企业参展,400余人报名参会,逾500人参加了会议,就细胞储存、细胞治疗、细胞培养、细胞工程、细胞银行、细胞能量与代谢、细胞免疫学、细胞生理学
当代谢组学技术遇到单细胞测序技术
代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映,因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年,组学研究飞速发展,处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进
布鲁克和景杰生物:单细胞和空间蛋白质组技术推动精准医疗
2023年9月24-27日,为促进蛋白质组学的研究和学科发展,增进国际间合作交流,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)主办的第十二届中国蛋白质组学大会在四川成都隆重召开。本次大会的主题是“人体蛋白质组的导航者(π-HuB项目):通往智慧医学之路”。大会聚焦蛋白质组学的最新
空间组学新技术破解肿瘤细胞早期空间侵袭模式
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516182.shtm近日,上海交通大学医学院分子医学研究院杨朝勇团队和附属仁济医院泌尿科郑军华团队开发了一种空间转录组学测序新技术Decoder-seq,并运用该技术探究了早期肾细胞癌(RCC)两种亚型肿
大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会
2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。 目前,基于单细胞技
大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会
2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。 目前,基于单细胞技
代谢组学技术在临床医学中的应用
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新发展起来的一门学科,它通过对人体内小分子代谢物(50~1,500 Da)进行精准定性定量,分析代谢物与人体生理病理变化的关系,研究疾病发生发展、寻找疾病生物标记物、预测疾病预后等。代谢组学在临床诊断上将有广阔的发展前景,主要应用方向有四个方面:在临床诊断(B
第二届单细胞技术及组学应用发展大会
议程揭晓,亮点荟萃 | 第二届单细胞技术及组学应用发展大会聚势来袭!(文末领取限量免费入场券)2023年5月 19-20日,第二届单细胞技术及组学应用发展大会将在上海虹桥绿地铂瑞酒店盛大召开,大会以“聚焦技术前沿,加速科研转化”为主题,邀请众多单细胞及组学领域的科学家、代表性企业展示单细胞及多组学技
第二届单细胞技术及组学应用发展大会
专场早知道!单细胞分析迈入多组学时代,掀起单细胞多组学研究新革命! 大量的多组学分析,如基因组、转录组和蛋白质基因组学分析,已被证明有利于加强对细胞事件的全面了解。这一优势促进了单细胞多组学分析的发展。近年来出现了一些前沿的单细胞多组学技术,并掀起了一场新的研究革命! 今天,
单细胞分离技术应用于众多领域的单细胞分析
单细胞分离目前主要有三种选择:手动分离、荧光激活细胞分选和微流体技术。当然,除了成熟的方法,巧妙的新方法也在不断涌现,能以更高的准确性和特异性来分离单细胞。 将细胞分散到悬液中,会失去它们在组织里的位置信息。如果想了解单细胞所处的环境,就需要用到激光捕获显微切割技术,这种技术通过扫描组织切片来
单细胞脂质组学技术的机制及意义
5月17日,清华大学精密仪器系质谱研究团队发文报道基于质谱的单细胞脂质组精细结构表征技术,实现了哺乳动物单细胞内脂质的大规模精细结构分析,解决了单细胞质谱领域长期面临的关键技术挑战。基于单细胞内多种类型脂质异构体的鉴定与相对定量,该团队实现了野生型非小细胞肺癌(HCC827)细胞群体中耐药细胞的
Nature发布单细胞基因组学新技术
胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。 一开始是一团相同的细胞,随着增殖不断地改变形状和功能,最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。
单细胞分析技术在临床诊断和治疗中的应用案例
单细胞分析技术在临床诊断和治疗中有以下一些成功的应用案例:癌症诊断和治疗:通过单细胞测序可以分析癌细胞的基因突变、转录组特征和免疫细胞组成,为癌症的诊断、分型和治疗提供重要信息。例如,研究人员利用单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)技术,首次在颅底脊索瘤恶性细胞中发现了的一簇干细胞样细胞簇,并
单细胞技术在药物筛选中的应用
单细胞的异质性会被组织等高通量细胞样本的均质化生信数据覆盖以致难以凸显,尤其是在临床诊断中。所以开发应用单细胞技术在发现甚至筛选药物靶点成为了有力的手段之一。苏州系统医学研究所李贵登课题组、加州理工学院的David Baltimore课题组和西雅图系统医学研究院的James Heath课题组在综合性
单细胞测序技术在医学领域的发展趋势
单细胞测序技术在医学领域的发展呈现出以下几个明显的趋势: 1. 更高的分辨率和准确性 - 随着技术的不断进步,单细胞测序将能够更精确地检测基因表达水平、突变和表观遗传修饰等,提供更细致和准确的细胞信息。 2. 多组学整合 - 未来将不仅仅局限于对单个细胞的基因组或转录组进行测