单细胞和空间组学技术在肝脏领域应用

近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞技术及空间组学技术,论述了这些技术在肝脏研究的前沿进展,总结归纳了相关计算生物学策略,并对未来的发展方向提出了新思考。 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing)与空间组学(spatially resolved techniques)作为新兴技术,被越来越多地运用于肝脏研究,推动了肝脏领域的发展。随着肝脏单细胞及空间数据的积累,计算生物学分析策略和工具不断丰富和完善,并展现出多元特征。多样化的实验及分析方案加快了肝脏研究的进程,但为设计目的导向型的单细胞或空间组学实验及策略提出了新挑战。 该文章介绍了......阅读全文

单细胞和空间组学技术在肝脏领域应用

  近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞

单细胞和空间组学技术在肝脏领域的应用

  近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞

肝脏生物学中单细胞和空间组学技术的成果与挑战

  近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞

布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略

  摘要  * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征;  * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像;  * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

空间转录组和单细胞转录组测序联合应用的典型案例

单细胞转录组测序技术的如火如荼,伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展,可以看到,在现有的高通量检测技术领域,这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展,到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展,相信在接

空间转录组学研究案例简析

01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]影响因子:11.878发表时间:2018.06发表期刊:Nat Commun肿瘤内异质性是当今癌症治疗中最大的挑战之一。在这里,研究人员使用空间转录组学(ST)技术研究整个多灶性前列腺癌的全组织基因表达异质性。利用一种新的去卷积方法,分析12个区域的近6

前沿:空间转录组学研究案例简析

  上一期,我们介绍了空间转录组测序产品,对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品,用起来到底好不好使呢?我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。   01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]   影响因子:11.878   发表时间:2018.06   发表期刊:Nat C

前沿:空间转录组学研究案例简析

  上一期,我们介绍了空间转录组测序产品,对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品,用起来到底好不好使呢?我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。   01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]   影响因子:11.878   发表时间:2018.06   发表期刊:Nat

2018年新技术:空间转录组学技术

  ——也许不久的将来,定位组织中的基因表达就会成为一种常规技术了。  对于基因表达研究来说,空间一直都是具有挑战性的前沿研究领域。但是随着越来越多的研究人员获得了技术进展,这已经不再是令人望而生畏的领域了。这些方法的多样性和创造性使其成为一个值得关注的技术方向。  空间基因表达对于理解组织中细胞的

AFADESI空间代谢组学高级研修班

  为做好AFADESI空间代谢组学技术服务工作,由中国科学院高能物理研究所测试中心和中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室共同承办的“AFADESI空间代谢组学高级研修班”将于2023年4月26日-4月27日在京召开。在这里,我们将竭诚为您提供丰富的前沿应用信息和与专家零距离交流的平台

当代谢组学技术遇到单细胞测序技术

代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映,因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年,组学研究飞速发展,处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进

单细胞测序推进了基因组的发展领域

单细胞测序能够帮助我们了解那些难以培养的微生物的基因组功能、了解遗传镶嵌功能在普通生物学功能或是疾病发生中的作用、肿瘤内在异质性对肿瘤发展以及耐药性的影响、重新定义细胞亚型等等。  单细胞测序可以揭示出每个细胞独特的微妙变化,甚至可以揭示全新的细胞类型,测序技术可谓是科技发展的一大创举,它推进了基因

单细胞表观组学:单细胞ChIPseq解码细胞命运决定机制

  在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项(批准号:2017YFA0103402)等资助下,北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈,开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术,可适应于不同课题研究需要,解析发育与疾

碧迪医疗与NanoString战略合作,推动单细胞空间多组学

2022年12月1日,上海——今日,全球领先的医疗技术公司碧迪医疗与全球空间生物学的先锋NanoString联合宣布,将在单细胞空间多组学领域开启战略合作,结合双方优势,为国内基础科研、临床研究和生物医药研发提供一站式的技术工具和服务。此次合作将把国际领先的单细胞多组学和空间组学技术相结合,着眼于面

利用单细胞空间转录组揭示猕猴大脑皮层的细胞类型

  阐明大脑皮层的细胞类型组成对于理解大脑结构和功能至关重要。中国科学院脑智卓越中心利用单细胞空间转录组揭示猕猴皮层的细胞类型。该研究成果于近日发表在《Cell》杂志上,题为:Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organizati

Nature发布单细胞基因组学新技术

  胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。   一开始是一团相同的细胞,随着增殖不断地改变形状和功能,最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。  

单细胞脂质组学技术的机制及意义

  5月17日,清华大学精密仪器系质谱研究团队发文报道基于质谱的单细胞脂质组精细结构表征技术,实现了哺乳动物单细胞内脂质的大规模精细结构分析,解决了单细胞质谱领域长期面临的关键技术挑战。基于单细胞内多种类型脂质异构体的鉴定与相对定量,该团队实现了野生型非小细胞肺癌(HCC827)细胞群体中耐药细胞的

高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究

肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外,还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中,正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏,原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下,逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种

蛋白组学应用前沿:肝脏疾病研究进入后基因组时代

蛋白组学应用前沿:肝脏疾病研究进入后基因组时代

研究开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台

  单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空

“空间定位组学”和“4D组学”建起科学研究与疾病治疗的桥梁

  分析测试百科网讯 布鲁克一直以MALDI技术闻名全球,并已在成像领域占据领导地位;自去年推出timsTOF Pro创新组学系统后,在深度覆盖和高通量蛋白质组学分析中取得了突破性的进展,并且迅速和国内院校和企业开展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列,已和北京大学、清华大学、复旦大学、厦门大

我国在单细胞蛋白质组学研究获突破

  浙江大学化学系微分析系统研究所方群教授团队,联合北京大学医学部精准医疗多组学研究中心主任黄超兰教授团队,在单细胞蛋白质组学分析研究领域取得突破性进展。研究论文近日在线发表在美国《分析化学》杂志上。  黄超兰介绍,近年来,基于细胞群体内的蛋白质组学研究,已越来越难以满足对生命功能深入探究的需要。从

张奇伟张新荣团队合作开创分析单细胞空间代谢组新方法

  2021年10月4日,清华大学北京信息国家研究中心/医学院张奇伟教授(美国德州大学达拉斯分校客座教授)与清华大学化学系张新荣教授团队合作在Nature Methods杂志上在线发表论文:SEAM is a spatial single nuclear metabolomics method fo

Nature论述:单细胞基因组学揭开“免疫新世界”

  人类对生命的好奇,从来没有减退。一个多世纪以来,科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞,从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程,挖掘重要的细胞类型和信号通路。  但是,过去几十年,包括荧光抗体标记技术、DNA和RNA测序技术等在内的研究工具却不能解

单细胞基因组学:通往个体化医疗之门

  随着第二代测序技术的普及,单细胞测序迎来了迅猛发展。  近日,南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后,在科学网博客里写道:“这是一个非常令人激动的前沿学术会议,我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。”  他对《中国科学报》表示:“单细胞基因测序技术的突破,只是开了

IsoPlexis单细胞蛋白质组学检测服务即将启动啦!

  重磅消息来袭  你想要的单细胞  蛋白质组学检测服务即将启动啦!  单细胞蛋白质检测技术  传统的细胞分析通常包含数千个或更多的细胞,提供了一个总体平均值,掩盖了重要的细胞异质性,尤其是一些发挥重要作用的稀有细胞群体的意义,比如免疫细胞、肿瘤细胞、干细胞等均展现出广泛的异质性。  当前,随着单细

Agilent与Stemina-宣布代谢组学领域的合作

Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究   2010 年 5 月 24 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布,两家公司

Agilent与Stemina-宣布代谢组学领域的合作

Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究   2010 年 5 月 24 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布,两家公司