数字PCR在精准医学领域的十大应用

数字PCR是一种新的核酸检测和定量方法,借助微液滴或微坑,通过单个模板分子的PCR扩增,可实现不依赖于标准曲线和参照样本的准确、绝对定量。数字PCR使得反应更灵敏、结果更可靠、展示更直观,尤其适用于微量或痕量DNA检测与定量。下面我们就目前已经比较明确的数字PCR应用方向做个介绍。基因表达差异研究数字PCR可以提供比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表达分析;等位基因的不平衡表达;单细胞基因表达分析;外泌体核酸分子定量分析等。拷贝数变异(CNV)研究数字PCR直接读取阳性信号,通过泊松分布校正得到目标基因的绝对拷贝数,为拷贝数变异的研究提供了绝对的检测精度。采用数字PCR能够有效对二代测序(NGS)和微阵列比较基因组杂交(aCGH)等实验结果进行验证,并具有检测周期短、成本低、样本通量高等特点。低丰度DNA模板分子的精确定量由于绝大......阅读全文

数字PCR在基因表达差异研究的应用

数字PCR由于检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的绝对定量,因而可以提供比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表达分析;等位基因的不平衡表达;单细胞基因表达分析;外泌体核酸分子定量分析等。

数字PCR助力艾滋病疗法的开发

Bio-Rad公司于去年底推出了QX100微滴式数字PCR系统,市场反应不错。最近,Sangamo BioSciences公司的研究人员利用此系统产生了高度精确且重复的数据,离HIV功能疗法的开发又近了一步。 让我们听听Sangamo BioSciences资深科学家Gary Lee的评价。“QX

数字PCR在移植排斥监控中的应用

为了降低器官移植中移植物排斥导致的风险,数字PCR技术通过监测受体中移植器官供体的循环DNA水平来检测早期移植排斥。

数字PCR助力艾滋病疗法的开发

  Bio-Rad公司于去年底推出了QX100微滴式数字PCR系统,市场反应不错。最近,Sangamo BioSciences公司的研究人员利用此系统产生了高度精确且重复的数据,离HIV功能疗法的开发又近了一步。   让我们听听Sangamo BioSciences资深科学家Gary Le

数字PCR在肠道菌群分析的应用

数字PCR技术直接计算目的序列的拷贝数,对样品中的微生物实现了绝对定量,可用于微生物检测,以便进一步研究肠道菌群的结构、功能以及数量。

NaicaTM-crystal-微滴芯片式数字PCR系统

   导语:数字PCR技术是基于PCR技术发展起来的核酸检测和定量的最新技术,在众多应用中,在精准医疗方面的应用尤为突出。法国Stilla Technologies公司专注于开发新一代核酸绝对定量技术,其旗下品牌Naica TM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统具有高灵敏度、高精

数字PCR在基因型鉴定的应用

PCR也可以用于检测一个生物中是否存在某特定DNA序列,这被称为基因型鉴定。例如,基因型鉴定可通过发现样品中是否存在某种群特异性序列来判断样本的真实性。基因型鉴定还可用于法医分析判断在现场发现的DNA样品是否和嫌疑人的吻合,令凶手无处遁形。

crystal数字PCR如何实现的核酸绝对定量?

crystal数字PCR技术是一种核酸分子的绝对定量技术,原理是将PCR反应体系分配到大量微小的反应器中,在每个微反应器中包含或不包含 1 个或多个拷贝的目标核酸分子 (DNA 模板) ,进行"单分子模板"PCR 扩增。扩增结束后,通过阳性反应单元(通过终点荧光信号判断)的数目和统计学方法计

数字PCR在食品安全检测的应用

食品安全日益成为一个重要的公共卫生问题, 受到社会及国家的高度重视。食源性疾病、食品原料造假、转基因食品等逐渐呈现出普遍增长的趋势。食源性疾病是指通过摄食而进入人体的有毒有害物质等致病因子所造成的疾病。比如常见的食物中毒、肠道传染病、人畜共患传染病、寄生虫病等。食源性疾患的发病率居各类疾病总发病率的

数字PCR在病毒临床检测中的应用

概述2015年刚成历史,2016年已在眼前。就这样,年复一年间沧海成桑田。生命科学领域,新方法层出不穷,老方法不断升级,好不热闹。也如孔子的感叹:逝者如斯夫,不舍昼夜。就拿PCR技术来说,荧光定量PCR作为一种进行基因表达分析的技术,截至目前最大的应用市场是病原微生物的核酸体外诊断。展望未来,作为q

数字PCR技术更准确检测新冠病毒

  对于新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的检测,实时定量PCR一直是金标准。不过对于某些患者,qPCR的结果似乎每天都在变化,而且有不少假阴性。近期的研究表明,ddPCR检测能够减少假阴性结果,而Bio-Rad Laboratories公司也利用其微滴式数字PCR系统开发出新型冠状病毒的检测产品

数字PCR技术:从液体活检走向商业临床市场

2017年12月Bio-Rad BCR-ABL基因融合ddPCR检测试剂盒获得CE-IVD 认证(产品进入欧盟境内销售的通行证),这是基于ddPCR技术第一个获批的可用于临床检测的、基于血液样本的、用于监测慢性粒细胞白血病患者疗效的诊断试剂。在上周 JP摩根健康产业大会上, Bio-Rad CE

Nacia数字PCR在基因表达分析中的应用

华盛顿大学医学院儿科和加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院儿科的研究人员建立了一个稳定可靠的基于RNA磁珠提取和数字PCR的方法,可从粪便样本中检测与EE(热带肠病)关联的人mRNA,灵敏度可达20拷贝GAPDH mRNA/200mg粪便样本。已有报道表明病人粪便中存在人mRNA,可作为反应病人消化道病

数字PCR在肿瘤的液体活检中的应用

 肿瘤学研究是数字PCR的重要应用领域,该技术作为极为重要的工具,能够识别DNA突变(例如EGFR)、肿瘤患者用药监控、基因扩增检测、循环肿瘤细胞(CTC)特性研究、长链非编码RNA检测、液体活检中循环的核酸(cfDNA)和肿瘤细胞(CTC)的绝对定量等研究中。

数字PCR技术精确检测癌症基因组扩增

  来自斯坦福大学以及Bio-Rad的研究人员证实,数字PCR系统能够精确测定长期存放的癌组织样本中的癌症基因组扩增。该研究成果发表在《Translational Medicine》杂志上。   某些拷贝数变异(如基因组扩增)可能导致特定癌基因的过表达,推动癌症发展。靶定扩增的癌基因有望实现癌

数字PCR在糖尿病治疗中的应用

    数字PCR技术目前在糖尿病中的研究热点,通过定量检测非甲基化DNA的水平,对I型糖尿病β细胞死亡进行定量,从而监控病情发展。

数字PCR在肿瘤治疗的伴随诊断的应用

 常用体液来源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待检标本中的DNA,有正常脱落体细胞和病变脱落细胞两种来源,前者的量远大于后者。通过微液滴处理能在每个微液滴中有效减少正常体细胞DNA的干扰,实现肿瘤标记物的有效检测,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突变检测、乳腺癌/胃癌的HE

数字PCR在无创产前筛查的应用

 无创伤的产前诊断, 如21号染色体为3倍体的唐氏综合征、已知父母基因型的胎儿地中海贫血或胎儿遗传性耳聋基因检测等。目前无创检测标本来源主要为孕妇血液,而待检测的胎儿DNA受到母体DNA的干扰,影响了检测的准确性。数字PCR技术可以作为二代测序法的补充来进行无创伤产前诊断,从而提高工作效率、降低检测

数字PCR和HRM在肿瘤样本中的应用

摘要:Vogelstein和Kinzler(美国国家科学院院刊,1999年)第一次描述了Digital PCR(dPCR)的概念,一种在微量细胞群中(如原发性肿瘤组织)鉴定突变的方法。通过稀释样品DNA到一个单个分子水平,它可以把PCR自然模拟指数转化为数字信号。当PCR成功的扩增出这些单个

数字PCR在甲基化含量鉴定的应用

作为表观遗传学研究中重要的一个研究方向——甲基化程度分析,现阶段有不同的方法或技术来进行研究:如传统的亚硫酸氢盐处理后的克隆测序法、抗体检测法、定量PCR检测法等受限于方法学的问题,不能获得甲基化程度的精确定量,而数字PCR系统通过对样品的微液滴处理及目标分子的绝对拷贝数定量,为甲基化程度的精确定量

数字PCR技术能否终结核酸检测“灰区”?

郭永(清华大学供图)目前,新冠疫情仍在全球猖狂肆虐。虽国内新冠疫情防控卓有成效,但在西安、河南、天津、北京等地仍有确诊病例出现,特别是新冠病毒接连出现了德尔塔株、奥密克戎株等变异株,无疑让严峻的防疫形势“雪上加霜”。实时荧光PCR核酸检测被认为是新冠检测的金标准,但仍有亟须解决的问题,如单基因阳性、

NACIA数字PCR引物探针设计——Geneπ课堂

NACIA数字PCR用引物与普通PCR引物设计要求不同:普通PCR的目的是获得目的基因,对非特异性反应和引物二聚体要求不严格;而数字PCR引物跟real-time PCR引物一样对非特异性反应和引物二聚体要求严格。NACIA数字PCR引物及探针设计的总体原则v 先选择好探针,然后设计引物使其尽可能的

数字PCR新方法来测量端粒长度

近日,新加坡国立大学利用数字PCR技术,开发出一种新颖、快速的端粒测量方法—单端粒绝对长度快速分析法(SATR),可在临床环境中快速确定癌症和年龄相关疾病中的端粒酶异常,有助于临床医生更快地为患者进行诊断与计划治疗对策。相关研究日前已发表在《Science Advances 》期刊上。STAR分

数字PCR在-药物基因组检测的应用

  能够通过PCR技术实现药物基因组的检测,提高合理用药水平,具有通量较高,操作简单,仪器设备易普及等优点。    数字PCR冷知识:胎儿性别不是只有B超可以看出来,一只精通数字PCR的科研狗,也可以测出来。

基于EVAGREEN®方法的CRYSTAL数字PCR绝对定量检测

基于EVAGREEN®方法的CRYSTAL数字PCR绝对定量检测EvaGreen®是一种无致突变性、无细胞毒性的DNA结合染料,NaicaTM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统可兼容EvaGreen®染料进行的数字PCR实验分析。反应体系中游离的的EvaGreen®染料不发出荧光信号,但

你想要知道的数字PCR应用及前景

 一. PCR的发展历史  PCR技术自问世以来,在遗传病、病原体、癌基因等分子诊断领域和法医鉴定等方面发挥了巨大作用。第一代 PCR在进行扩增后通过凝胶电泳进行定性分析。  随着生物分子荧光技术的发展,1992年实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,

数字PCR在传染性疾病的检测的应用

 数字PCR技术因起高精密度、耐受能力强、高灵敏度等优点,逐渐被用于病毒载量分析的相关研究。如HIV抗逆转录病毒治疗过程中病毒残留量的监控;HBV耐药突变的检测;HCV的分子分型;抗甲氧西林金黄色葡萄球菌的院内感染监控;环境微生物不同功能基因之间的连锁分析等等。

数字PCR技术发现,癌细胞正在偷工减料

  美国Stowers医学研究所的研究人员近日在《PLoS Genetics》上发文称,癌细胞可能正在简化它们的基因组。它们减少了核糖体DNA(rDNA)的拷贝数,从而更容易增殖。  “尽管核糖体DNA对细胞功能很重要,但由于定位和分析的挑战,我们几乎不知道是什么在控制其拷贝数的稳定性,”研究人员称

LifeTech推出新一代数字PCR系统

  Life Technologies公司近日宣布推出QuantStudio™ 3D数字PCR系统,这是一款基于芯片的可扩展仪器,有望加速这一技术的普及。据Life Tech介绍,这款仪器价格优惠,流程简单,且手动操作时间极少。   QuantStudio™ 3D数字PCR系统的第一代芯片

数字PCR技术在DNA定量精准等领域的应用

数字PCR先进的数字PCR技术实现了样品中的单分子核酸扩增,从而使的DNA定量的精准度提高到了全新水平。Philip与Stilla Technologies的首席执行官兼联合创始人Rémi Dangla进行了交流,讨论了数字PCR技术领域的进展和挑战。Stilla Technologies公司总部位